Shewanella vesiculosa: KDH10_000579
Help
Entry
KDH10_000579 CDS
T08322
Name
(GenBank) serine/threonine protein kinase
Organism
svm
Shewanella vesiculosa
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
ABC1
APH
Kdo
Kinase-like
EndoS_Ig-like
RIO1
Seadorna_VP7
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UJL43306
LinkDB
All DBs
Position
665574..667562
Genome browser
AA seq
662 aa
AA seq
DB search
MDKSKTPNNLAEDKTVIAGLDNSENNANKVNLIGKCFKNRYLIESKIGHGGMSDIYRAKD
LYLESLNVSEPFVAIKVLLPQLSDIPEAQQVLIKESVQTQKLSHPNIIRVYDVDTDDGFH
FMVMEWLDGESLDQVIKRSKPMGINFKGSMKIIDQIASALSYAHHQGIVHTDLKPSNIFL
TRQGNIKVFDFGVAKNLQQREDRYALAEVDQDSSLTGYTPAYASFEQLTGEDACAEDDIF
AFSCISYELLTSKHPYQRVAANEVDVTKNKLVKPKHISMSLWPTLKKGLALKKAQRASSI
DQIISTLHRKTWPILTAIAAGTILVIGGFQIQQYYQVQLDNLNNKVAITNKAKSEVQAFE
FIPASDLLARIDSIPESKSIIKNGLLKTHQSEVLDIVEQRIASLPKSDNGLYQDYVKIAE
VINDIERFYPDSVRLLQMKNQAERSKQLVVDALSERLSLLLSQARYNEQGTNNIKAIVDG
LSFVEPNYVYLASNEEYTLYASTFDSALKKHDINQISELITTGENVFANYPEAKSLIAYG
AQLKVAVKALNEYHNATAKGKTVDYPYDAAEIYYRDTFEQLTARLEAIDDPKDLHEFDKE
VRDLATNLPDDFDPLLTLDKRLAASFLRQANVYLEKQYLKTARELFARGNEMYERLNGVQ
RL
NT seq
1989 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataagagtaaaacaccaaataacttagctgaagacaaaactgtcatagcaggatta
gacaattctgaaaataatgctaacaaagttaatttgattggcaaatgtttcaaaaatcga
tatttaattgaatcaaaaattggtcatggaggtatgagtgatatataccgtgccaaagac
ctgtacttagagtcgttaaatgtcagtgagccatttgttgcaataaaggtattattgcct
cagttatctgatatacccgaagctcaacaagtcctgattaaagagtcggtgcaaacccaa
aaactctctcatccaaatatcatccgagtgtatgatgttgatactgatgatggctttcac
tttatggtcatggagtggttagacggtgaatcattagaccaagtcattaaacgttccaaa
ccgatggggattaatttcaaaggatcaatgaaaatcattgatcagatagcttcagcctta
tcgtatgcgcatcatcaaggtattgttcatacagatttaaaaccatcgaatattttcctg
actcgccaaggtaatattaaagtcttcgattttggtgttgcaaaaaacttgcaacaaaga
gaagaccgctacgcacttgctgaggtagatcaagactcatcattaacaggttacactcca
gcatatgctagctttgaacagctaactggcgaagatgcttgtgcggaagatgatattttt
gctttttcatgcattagctatgaactgcttacaagtaaacatccctatcagcgtgtcgca
gcaaatgaagttgacgttaccaagaataaattggtcaagccaaagcatatcagcatgtct
ttgtggcctacactcaaaaaaggcttggcactcaaaaaggcgcaacgagcatcatcaatt
gatcagataatcagcactttacaccgtaaaacttggccgattttaactgccattgcagca
ggtactattttggttattgggggatttcaaattcaacaatactatcaagtgcaattagat
aacttgaataataaagtggcgataacaaataaggcaaaaagtgaagttcaagcatttgag
tttatcccagcttcagacttattagcccgaattgacagtattcctgaatctaaaagcatc
attaaaaatggtctattaaaaacacatcaatcagaagtgttggatatcgttgaacaacgt
attgcttccttacctaaaagtgataatggcctctatcaggattatgtaaaaatagctgaa
gttattaatgatatagagcgtttttatcctgattcagttcgtttgctgcaaatgaaaaat
caagctgaacgaagtaaacaattggttgttgatgctctgtctgaacgtttgagtctttta
ttatctcaagctcgttataacgagcaagggaccaataatattaaggctattgttgatgga
ctaagctttgttgagcctaattatgtatatcttgctagtaatgaagaatatacgctctat
gcaagcacctttgatagtgcattaaaaaaacacgatattaatcaaattagcgaacttatc
actacgggtgaaaatgtgtttgcaaactatcctgaagctaagtctttaattgcctatggt
gcacaattaaaagttgccgtaaaagcattgaacgaatatcacaatgcgactgcaaaaggc
aaaactgttgattatccgtatgacgccgctgagatttattatcgggatacatttgagcaa
ttaaccgcaagactagaagcgattgatgatcccaaagatctacatgaatttgataaagaa
gtaagagatcttgccacaaatttacctgatgattttgatcccctactgacgcttgataaa
cgtctcgcggcgtcatttttacgccaggcaaacgtgtatctagaaaagcaatatctgaaa
actgccagagagttatttgctcggggtaatgaaatgtatgaacgtcttaatggtgttcaa
cgtttatag
DBGET
integrated database retrieval system
