Shewanella woodyi: Swoo_0647
Help
Entry
Swoo_0647 CDS
T00676
Name
(GenBank) peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin
Organism
swd
Shewanella woodyi
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_S8
P_proprotein
PKD_4
PKD
DUF4625
Bact_surface_Ig-like
Big_13
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACA84943
UniProt:
B1KDE2
LinkDB
All DBs
Position
893830..896340
Genome browser
AA seq
836 aa
AA seq
DB search
MFNKLTPIALAIAGAITVSAAPVQAKVTQHEYVKDSILVVYKDNATKSERLSAQRLVRGS
IRDVNADGVDDKFANLMGGKLANLSLRSGSDVSKAIKMISQHPAVKYAEPNYVIKAVGTP
DDPSFASLWGMNNTGQDGGTADADIDAVEAWDISTGDTDVVVAVIDTGVDYNHEDLQGNI
WTNPNEIAGNGIDDDGNGVIDDIHGYSAIDDDGDPMDGNGHGTHVSGTIGAKGNNGVGVA
GVNWDVSIIGCQFLDAGGSGSTAGAIACIDYVTNLKVNHGVDVKASNNSWGGGGFSQALK
DSIESGGDAGILFVAAAGNGAYDNDASPSYPASYDSAAVMAVASTDRNDNMSGFSQYGLT
SVDIGAPGSAILSTTPGNNYSSFNGTSMATPHVVGAAALVWSINPDLTIDEMKQLLMDSG
DSNADLTGKTVSGARLNVATALDMADPSPSYRFTVTPSSQTIEAGSAASYDFSVGSVADW
DGTVALTVEVSPALDGVSLSTDSVMAGDNFTLDVMTAAATPWGDYTITVSGDDGAIQKSK
SVSLGILPQGIEDYPYSNDDPVSIPDNDSNGIVSTIEVADDLQVFGVTADVNITHTWSGD
LIVTLTSPEGTESVLHNRSGGSADDVVESWDLADFNGEMAMGTWTLSVSDNAAADLGTLN
SWGIIISGVGDTAPAAPVAGFDYSAEGLSVSFTNTSTDANDDIVSYSWDFGDMGTSTDMS
PSHTYASAGSYAVSLTVTDAEGNTDTANMNVDVFDNVITAEVLRAKLSRRGSALVDLTWD
GANGNSVDIYRDGEMVATTENDGRYRDRFTNAPASVEYTICETGSSLCSDPITAQF
NT seq
2511 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaataagttgacaccgatcgcgcttgccattgctggcgccattacggtatctgca
gcccccgttcaggctaaagtgacgcaacatgaatatgtgaaagactcaattcttgttgta
tataaagataatgccacaaaatctgaacgtctttctgcacagcgcttagtgcgcggttca
atacgtgacgtcaatgccgatggtgttgatgataagttcgctaatttaatgggtggtaag
ctggcaaatctatcactgcgttcaggatctgatgtatcaaaagcaattaaaatgatcagt
cagcatccagcagttaagtatgcagaaccaaactatgtgattaaggcggtaggtacgcca
gatgatccaagttttgcatcactgtggggaatgaacaatacaggtcaggacggtggaacc
gccgatgctgatattgatgcggtagaagcatgggatatttcaacaggtgataccgatgtt
gttgtggcggtgatcgatacaggtgttgattacaaccatgaagatcttcaaggtaatatc
tggactaacccgaatgagatagccggtaatggtatcgatgatgacggtaatggcgttatc
gatgatatccatggttacagcgctatcgatgatgatggcgatccaatggatggtaacggc
catggtacccacgtatcaggaactattggtgctaaaggtaacaatggcgtaggtgttgct
ggggttaactgggatgtgtcaattattggttgtcagttcttggatgctggtggttcaggt
tcgactgcaggtgcgatcgcatgtatagattacgtgacaaaccttaaagttaaccatggt
gttgacgttaaggcgagtaacaactcgtggggcggcggtggatttagccaagcgctaaaa
gactctatcgaatcaggtggtgacgcggggatcttatttgtcgcagccgcgggtaatggt
gcttatgataacgatgctagcccaagttatcctgcgagctatgactctgctgctgtaatg
gcggttgcaagtaccgatcgtaatgacaatatgtcaggtttttctcaatatggtcttaca
agtgttgatataggtgcacctggttcggctattttgtcgacgacaccgggtaacaactat
agctcatttaacggtacctcaatggcgacgccgcatgttgttggtgctgctgcattagta
tggtctattaaccctgacctcactattgacgagatgaagcaactgctgatggattcaggt
gattcaaatgcagacctaacgggtaaaaccgtgtcaggtgcacgtctgaatgtagcgaca
gctctggatatggctgatccatctccaagttaccgattcacagtcacgccatcttcacaa
acaatcgaagcgggctctgctgcaagttatgactttagtgttggcagcgtggcagattgg
gatggaactgttgcattgacagtagaagtttctccagcccttgatggtgtttctctatca
actgattctgtgatggctggtgataactttacccttgatgtcatgacggctgctgcaacg
ccttggggagattacaccattaccgtttctggtgatgatggagctatccagaagagcaaa
tcggtgtcattaggcattctgccacagggtatcgaggactatccatacagtaacgatgat
cctgttagtattccggacaatgactcaaatggtatcgtaagcacaattgaagttgctgat
gatctacaagtgtttggtgttactgctgatgtgaatattactcacacttggagtggtgac
cttatcgtgacactgacttcgccagaaggcacagagtctgtactgcacaaccgctctggt
ggcagcgccgatgatgttgtagaaagctgggatcttgcagactttaacggtgagatggcg
atgggtacctggactctgtctgttagtgataatgcagcagcagatttaggaacgcttaat
agctggggtatcattatctcaggtgtaggtgacacagccccagccgcgcctgtagctggt
ttcgattacagtgctgaagggttgagtgttagcttcaccaatacaagtacagatgcgaac
gatgatatcgttagctatagctgggactttggtgatatgggcacttcaactgatatgagt
ccatctcatacctacgcatcagcgggtagctatgcagtttcactaacagtgacagatgct
gaaggtaacactgatacagctaacatgaatgttgacgtatttgataatgtgattacggct
gaagtacttcgagctaagctatctcgtcgtggcagtgcgctagttgatctgacttgggat
ggagcaaatggcaactcagtagatatctaccgtgatggtgagatggttgcgacgacagag
aatgatggtcgttaccgtgatcgtttcacaaatgcacctgcatcggttgagtacacaatc
tgtgaaacgggttctagcctatgttctgatccaatcacagctcagttctaa
DBGET
integrated database retrieval system