Candidatus Thiothrix anitrata: J8380_09895
Help
Entry
J8380_09895 CDS
T07878
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K23127
cyclic-di-GMP-binding protein
Organism
tani
Candidatus Thiothrix anitrata
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FlgD_ig
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QTR48618
LinkDB
All DBs
Position
1893244..1894914
Genome browser
AA seq
556 aa
AA seq
DB search
MDVLTMATATVSEYQSIPLSEGKAREWVAALPLADPGETTRRLFHGLVDLNRRAVPPQTR
LAIGESLRPVVDMVLENLQRHLVARAFPLTQKSQKIFELAQSLMLEFAGLWQVTALDILT
RKEGNKKQLQQAIYQALDYMGRVLLLTYSVYARTRETLWHDIHHLYLLAVENAVDQIKCR
DPSPGAPTIEARYVQMNLLALVKPYCLRQGEVERVMHYFITHTALVRISGDAGDDVSVNA
PVAMLNSDEPAVLMPVSDLPLSPTVRVLHLSALIAAMDASIRQLDKVGASVLVLHEGLSR
NLAKRMIFHLTTVRNRSFNRFPKKETIGMVTRMGDVLKVVQETSMQEVDSAEEDMLFNVF
VSGDYASEDDVKHAVAAQVEEQAGARIQTWQVLNSSVGGYGLCWNGKEESGARVGEIVAL
RDLTKESSVWMIGVIKWMEFMRGTGLCCGVELLSTKAMMLTVQQVLNRELRQKLPVQGLM
LPSIAGVRPDPALVLPAYMFQVGDDVRLEFAEREERVRLVLLDECMGVFAYFRFTTLMEQ
PEADDEDDFTALWQSL
NT seq
1671 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggacgtattaactatggcaacagcaactgtttccgaataccagagtattcccttgtcg
gaaggtaaagcgcgtgagtgggtggcagcgttgccgctggctgatcccggtgaaaccacg
cgccgcttgttccacggtttggtggatttaaaccgccgtgccgtgccgccgcaaacccgt
ttagccattggtgagtcattgcgcccggtggtggatatggtgctggaaaatctgcaacgg
catttggtggctcgcgcttttccattgacccaaaaaagccagaaaatctttgagttagcc
caatccctgatgctggaattcgcgggtttgtggcaagtgaccgcgctcgatattctcacc
cgcaaggaaggtaacaaaaagcagttacaacaggcgatttatcaagccttggattacatg
gggcgggtgttgttgctgacgtattcggtgtatgcgcgtacccgtgaaaccctgtggcat
gatattcaccatttgtatttattggcggtggaaaatgccgttgatcaaatcaagtgtcgt
gaccccagccccggtgcgccgacgattgaagcgcgttatgtgcaaatgaatttgttggcg
ttggtcaagccttattgtttgcgtcaaggcgaggtcgaacgtgtgatgcattatttcatt
acgcatacggctttggtacgtatttccggtgatgcgggtgatgatgtgagtgtgaatgcc
cctgttgccatgctcaacagtgatgaacccgcagtgctgatgccagtgagtgatttgccg
ttatcgccgacagtacgggtgctgcacttgagtgcgttgattgcggcgatggatgccagc
attcggcaattggataaagtcggtgcgtcggtgttggtgttgcatgagggtttgagccgt
aatctggcaaaacgcatgatttttcatttaaccacggtgcgtaatcgcagttttaatcgt
tttccgaaaaaggaaacgattgggatggtgacgcgtatgggggatgtgctcaaggtggta
caggaaaccagtatgcaggaggtggatagcgcagaggaggatatgctgtttaatgtgttt
gtttctggtgattacgcttcagaggatgatgtgaagcacgcggttgctgcacaagttgag
gagcaagcaggggcgcggattcaaacttggcaagtcctgaacagtagtgttggcggttat
ggtttgtgttggaacggcaaggaggaatccggggcgcgggtcggggaaattgtggcgttg
cgtgatttaaccaaagaatcttcggtgtggatgattggtgtgattaagtggatggagttt
atgcgcggcacgggtttgtgttgcggagtggaattgctatccaccaaggcaatgatgttg
acggtgcagcaggtgttgaaccgtgagttgcgtcagaaattgccggtgcaaggtttaatg
ttgccgagtattgccggggtgcgtcctgatccggcgttggtgttgcctgcgtacatgttt
caggtgggcgatgatgtgcgtctggagtttgcggagcgcgaggagcgggtgcgtttggtg
ctgttggatgagtgtatgggggtgtttgcgtattttcgttttactaccttgatggaacag
cccgaagcagatgatgaagacgattttaccgcactgtggcagtcgttgtag
DBGET
integrated database retrieval system