Candidatus Thiothrix anitrata: J8380_10260
Help
Entry
J8380_10260 CDS
T07878
Name
(GenBank) tandem-95 repeat protein
Organism
tani
Candidatus Thiothrix anitrata
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_9
Cadherin_5
Cadherin_4
DUF1566
Cadherin_3
CARDB
TSP_3
PrkC-like_PASTA-like
TSP3_bac
GMP_synt_C
CshA_repeat
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QTR48682
LinkDB
All DBs
Position
1972233..1977011
Genome browser
AA seq
1592 aa
AA seq
DB search
MLTTSNLSKPLSRAEAAILLDVFLYKQKPTYKQDMSDYPKAFADADETASYFSSVERLAY
FKGSQDTETVLSKENTLLRPLDKTLRQEFVKMVVQGLDIKINSGSSYIGGFSDFNLIKGT
WTERYFNTAVGAGFIFGNNNNLEPTKALIIQDALYILARAKGKFSYSGNGFEDPSAFDDT
KHLSQTIGFDYEPSNYLSNAKPIDITAVKTLTTTTTDAAKCGVSSGSNYKVLEVSATIDT
STQVREYYWWATNFGYFKEYMGDKKFKKVCFFPAAVAPQGNYQITVNGGDNIGYVDQYSV
AISPAAFSYTGQGVPVDKPTNQIADIQYKPLSTIMRTGNAYAIDLTPTVIEKTSVNLGVE
NVTVRLIAGSLDELVFAGQPDAGIVRFLVPDHAELYGKDVKLRIELNTQQIQGVKVTETI
RYLPKFVIGGVVFNAGIDHNATSIKVGNETIALNENNEFYTELDATNEITGLKIQVNSDS
VTNSFDQKIIELTYGSPKLFVDFYGENRTDSDSDGVIDAADNCPQIANANQADTDWDGIG
NVCDSDDDNDGMPDEWETKYGLNPLDVSDAESDKDSDGISNLNEYKNGTNPTQKDGQTPD
LQISDAQFSASIQAGKSLTVSLQVKNVGNGLAAASTLEIWLSSDNVLNEKTDPILASMTI
SALTAGKTEFKSVVVTVPSTSRGVQYLLMKADSKGTVSEINEPNNLVKKQISISNSQPVA
YAATETLNEDTAKSMTLKATDAENNILTYTIVGQPTHGKITVPGSDGKITYTPNANYYGT
DILTFKVNDGGSDSKTMAVSINIKAVNDAPTVTAQTLKIPRNLRKKILLQGKDIEDGNKL
TYSIKTKPTQGMLGTLVGNKVRYTPKKGYVGKDSFSFVVKDSGGLSSTVAVVSITVTATN
NLPVAKPQTVALSEDKQVSVTLVGTDVDQDKLTYTVVDKPLNGTLGSLSVDKLTYTPKVN
YSGSDAFTFKVNDGNADSPVAKVTLNVAAVNDAPTVTAQTLKIPRNLRKKILLQGKDIED
GNKLTYSIKTKPTQGMLGTLVGNKVRYTPKKGYVGKDSFSFVVKDSGGLSSTVAVVSITV
TATNNLPVAKPQTVALSEDKQVSVTLVGTDVDQDKLTYTVVDKPLNGTLGSLSVDKLTYT
PKVNYSGSDAFTFKVNDGNADSPVAKVTLNVAAVNDPPTAVAQPIMVFKDALFAITLVGT
DIEDAADKLVYAIATQPTKGKLGVLAGNKVTYTPNKGYTGKDSFTFKVTDTGKAVSATAT
VSIKVVAQPNISSITPLVGRVGQTVTLNISGTNLPTTIVANIAAQTVGCSKTKATATAAT
FTCPLNTAGSQALAIKTKANGGVIISGGTATFVVSPKSSATGKLNDTGITLCGDYAYGNS
GKHNNNVSCSLLTDADGDPVPLGQDGTSGRDVTNNDDSDGHAGFSFTKISNTGAELPNSA
TEWSCVKDNVTGLMWEIKTDDGELHDKDWTYSWYEPDGTKNGGNAGKQNGGSCGGSQCDT
YGFVQAVNAVGWCGYKDWQIPNKMDLYSIVSNDRSAPAIDTTYFPDTGAYDGFWSSSPSY
ADHAYSIQFAIGREGSGAKSNFSSVRLVRGGQ
NT seq
4779 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctaaccacttctaacttatcaaagccgctatctagggctgaagcagcaattttgttg
gatgtcttcttatataagcaaaagcccacctataagcaagatatgtctgattatcccaaa
gcttttgcagatgctgatgaaacggcgagctatttcagttcagtggagcgtttggcctat
ttcaaaggcagccaagacactgaaacggtattgagcaaggaaaataccttgttaagacca
cttgacaagacactacgtcaagagtttgtgaaaatggtagtacaaggtttggatataaag
ataaactcaggcagttcctatattggcggattttctgatttcaatctgatcaaaggcaca
tggacggagcgttactttaatacagcggtaggtgcaggttttatttttggaaataataac
aatttagaaccaacaaaagcactgatcattcaagatgcactgtatatcttggcaagggca
aaaggtaagtttagttacagtggcaatggctttgaagacccgtcagcgtttgatgatacc
aaacacttgagccagactatcggctttgattacgagccatctaattatctatcaaatgca
aaaccgattgacataactgctgtcaaaacactaaccaccaccacaacggatgcagcaaaa
tgtggcgttagtagcggctcaaactacaaagtgctggaagtttctgcaactatagatacc
tctacgcaggtgcgtgaatattattggtgggcgacaaactttggttatttcaaagagtat
atgggtgataaaaaattcaagaaggtatgttttttccccgcagcggttgcacctcaaggc
aactatcaaataacagtcaatggcggggataacattggctatgtcgaccaatattctgtt
gcaatctcccccgcagcgttctcatatacaggccaaggtgtgcccgtcgataagccgacc
aaccagattgcagacatccagtacaagcccttgtccactatcatgcgcactgggaatgcc
tatgctattgacctgacccccacagttattgagaagacatccgtgaatttgggtgtggaa
aacgttacggtgcgtttaattgccggtagtttggatgagttagtctttgccgggcaacct
gatgcagggatcgtaaggtttcttgtaccggatcatgccgaattatatggcaaggatgtc
aaactgagaattgagcttaacactcaacaaatccaaggtgttaaggtgacagaaaccata
cgctacttgccaaaatttgtaataggtggcgtggtttttaatgctggcattgaccataat
gcaacttcgatcaaggttggaaatgaaaccattgccctgaacgaaaacaatgaattttat
acggaactggacgcgactaatgaaatcacggggctaaaaatacaagtcaacagcgatagt
gttactaatagtttcgaccaaaaaatcattgagttgacatatggcagccctaaattgttc
gttgacttctatggagaaaaccgtactgacagcgacagtgatggtgtaattgatgcggcg
gataattgcccacaaattgcaaatgcaaaccaagccgatacagactgggacggtataggt
aatgtttgtgatagcgatgatgacaatgacggtatgccagatgaatgggaaaccaaatac
ggcttgaacccgttggatgtcagcgatgcagaatcagataaggatagtgatggtatttcc
aatctgaacgaatataagaatggcacaaatccaacacagaaagatggtcaaactcccgat
ttacagatttctgatgcacaattttctgccagtattcaagctggaaagtccctcactgtt
tcgctgcaagtaaaaaatgtaggcaatggcttagcggctgcctctactttagaaatatgg
ttatcctcagataacgtgttgaatgaaaagacagatcctattttagcttcaatgacaata
tcagcactcacagcgggaaaaactgaatttaagtccgtagtggttacggttccttcaacg
tctagaggtgtacaatatctgctgatgaaagccgacagcaaaggtactgtgagtgaaata
aatgaacctaataatctcgttaagaaacagatttcaatctcaaatagtcagcccgttgct
tatgcggctactgaaacacttaatgaagatactgcaaaaagtatgactctaaaagcaacg
gatgcggaaaacaacattctgacctataccatcgtcggacagccgactcatggtaaaata
acagtaccgggcagcgacggaaaaatcacgtataccccaaatgccaattattacggaaca
gacattcttacttttaaagtgaatgatggtggttcagattctaaaactatggcggtcagt
atcaacataaaagctgtgaatgatgctcctaccgttactgcacaaacgctgaaaataccg
agaaatctgaggaaaaaaatccttttacaaggcaaagatatagaagatggtaataaactc
acttacagcatcaaaaccaagccaacacaagggatgctggggactctggtggggaacaag
gtgaggtatacgccgaaaaaaggatacgtgggaaaagacagcttcagctttgttgttaaa
gattccggcggcctatcctccactgtagcggtagtcagcattacagtgacggctaccaat
aaccttccagtagctaaaccgcaaacggtcgcattatctgaggacaaacaggtgtccgtt
actttggtgggaacagatgtggatcaggataaactcacgtatacggtagtggacaagccg
cttaatggtacattagggtcactgagtgttgacaagctcacctatacacctaaagtcaat
tacagtgggagtgatgcctttactttcaaagtcaatgatggcaatgccgattcacctgtg
gcaaaagttacattaaatgtagcggctgtgaatgatgctcctaccgttactgcacaaacg
ctgaaaataccgagaaatctgaggaaaaaaatccttttacaaggcaaagatatagaagat
ggtaataaactcacttacagcatcaaaaccaagccaacacaagggatgctggggactctg
gtggggaacaaggtgaggtatacgccgaaaaaaggatacgtgggaaaagacagcttcagc
tttgttgttaaagattccggcggcctatcctccactgtagcggtagtcagcattacagtg
acggctaccaataaccttccagtagctaaaccgcaaacggtcgcattatctgaggacaaa
caggtgtccgttactttggtgggaacagatgtggatcaggataaactcacgtatacggta
gtggacaagccgcttaatggtacattagggtcactgagtgttgacaagctcacctataca
cctaaagtcaattacagtgggagtgatgcctttactttcaaagtcaatgatggcaatgcc
gattcacctgtggcaaaagttacattaaatgtagcggctgtgaatgatccgccaactgct
gttgctcagcctatcatggtgttcaaggatgctttatttgccattactctggtagggaca
gacattgaggatgctgccgacaagctggtttatgctattgctacccagccgaccaaaggc
aaactgggggttcttgcgggaaacaaggtcacgtacacaccaaacaagggttacacagga
aaggatagctttacctttaaggtgacagatacaggtaaggctgtttccgctactgccacg
gtaagcattaaagtcgtggctcagcccaacattagctctataacccctctggtcgggcgc
gtaggtcaaaccgtgacgcttaatatatccggcactaacttacccaccaccattgtggca
aatattgcggcacagacagttggttgtagcaagacgaaagcaacggcaactgcggccact
ttcacttgcccgttgaatacggcgggtagtcaagctctggctatcaaaacgaaagcgaac
ggcggagtgatcatcagtggtggcactgccactttcgtggtgtccccaaaatcgtctgca
actggcaagctcaacgacacgggcatcacgctttgtggggattacgcttacggtaatagc
ggcaaacacaataataatgtgtcttgctcattacttactgatgctgatggcgaccccgta
cctctggggcaagatggtacgtctggacgtgatgttaccaataatgatgatagtgatggt
catgctggtttcagctttactaaaattagtaacacaggcgcggaactacccaactctgcc
accgaatggtcatgcgtgaaagataacgtgactgggttgatgtgggaaatcaagaccgat
gatggtgagctacacgataaagactggacatattcttggtacgagccggacggaacgaaa
aatggcggcaatgcaggtaagcagaatggtggttcatgtggtggtagccaatgtgatact
tatggctttgtgcaagcagtcaatgcagtgggctggtgcgggtataaggattggcagatt
ccaaataagatggatttatattccatcgtcagtaacgaccgttccgctcccgcgattgac
actacctactttccagacacgggtgcatatgatggattttggtcatcgtctccttcatat
gctgaccacgcatatagcatccaattcgctatcggtcgcgaaggttcgggtgctaagagc
aatttttcgagtgtccggttagttcgtgggggacagtaa
DBGET
integrated database retrieval system