Thermococcus barophilus: TERMP_02179
Help
Entry
TERMP_02179 CDS
T01377
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
tba
Thermococcus barophilus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_S8
PPC
CARDB
fn3_5
NPCBM_assoc
Kre9_KNH
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADT85153
UniProt:
F0LMD0
LinkDB
All DBs
Position
1969579..1975266
Genome browser
AA seq
1895 aa
AA seq
DB search
MNKRTVSLLIVLLMILSAIPVALPVTLVSAENTPQVTHTITKVNAVAKEPEKTAPPITKI
EPELLKILEGKVTVNVPEVNGEKLLPIHIVALSSIDSKLKGIQIVGKREIAGMVVYLALV
PIKEEYKKVLLKIASLPEVEAVTRTNPFEPVGTFEEPDAKNSITTKTIQIRIPEIRRKID
LSKLEKFSVKKLKLPEIMKLREKSPLRRGELKITERESLNIENPIKPADYFAIYHHGSWN
TWLNLGITGAGVNVAVIDSGVDFGNPDLQDAYAVETNPSSPYYGWPIAFSGHSMIWYLLF
NYTFPTYIYSWYADTSIELPYFLVYGNVSIGYKGNFTTVFTSMSLANIENDAERAAFINE
TLAWMGVTNSSKILLVDDDGGWTLDEFYTAALDILGLNYTVYEVPYGSSGPNATVLSQYD
AVIWFTGDTYQYTLTQNDTANLMAYLNNGGKLWLISQDLLEELPLNDTFVTDYLHVAGVD
PDYPVPTIIKMANNTYKAKSIYYGFYGSLTDAFADFVFPDNESQVLAVGYEAIVGIQWID
PDTGNVTQITYMKFPMNETLGVPTKSGIFHFGFHPDIALWVDWNGGYIIVADPENATKYD
TVYADITPMLVDAGSITLEYLDFNEDSGHTKDNPVIQVDFWDTFNDRFGQDGYADLSGGL
IYFIADGVNPIPYEDVVSSNWGLPMPIPENGDLVAFMIGNVYVAGGDHGTLCAAAVGARG
RTFYGLTFGNAIGAKIIAEGSLYQGGSWIDYVFFAVEGYDGIPGTGDEALVVSNSYGASS
VIAKGYTWDDRFLYWITHFYAPQVSFFFAAGNGGPGYGTVTSEGASPGVITVGAAVEFGY
RALFGYDDGPWGYELANYGDVVWFSNRGPNALGQVDPDVLAVGAYALGSLPLNEVGDGFW
ASDLWAGTSLATPMAAGIAALVYEAYYSAHGTWPTAEEVKEILMSTTKNVNHDVFSQGAG
FLDAYRAVQAALNLDGIIVSPSMWQAGETEYPAFANVIYPGDSASHVFEVRNMNVSASKD
VEVSAEVFQKIGEVEFNVTGNSWYMYRIDPFIPNGTDLMKITLYFDYDYFDTERDYSADA
FPWFRVWDVTYVYDPESNTTVPTFNLLTQSLNEGTSISATLGNPLQKFHDGLYVQIRDVL
RYYGKTDTYPAKLKLEFYKRVPWDWVAINTTTLTVPANGTATFMATVTVPLNASYGVYEG
AIYLKYDRYETTIPVSVVVASPTPNFEFGGNTNASGLYDNSNVYGQFDWSWRYESGDWRL
FYFNVSNAHNMTNAYLIADVSWDGIPTDINLHLLGPAEDGSLLPFSAIWPGIFGPYTLAE
IGRSIDGYVGAGMFKLFTTSGTSREVIAAPASPGLHALWLHNVLFDGKQSYRTFSGKIGM
ASVTPGTWMESINSTEGKKSFIVHLPSSFGMLKATAAGLTAPIIYKDKLAPPTGSADYYT
VTVKDATKLSITLTSLWDDLAGVDLDLYVYYNGQLVGASYTSTADEGVIIQLPASGTYTI
EVYSWNNPTTNATYDLKILAIEQGDLQVESIKEIADGVYNVTVSYTMSSDKFENANTFYG
TIYFGYDAAPMLIEVPVTLYKTTPEIIEEFGTVVIMQPYDLSLNLVPNEEIAEIGTTYTL
TTFVSNYGPYDATEAVVNLYKDGELIDQVKLPEFAKGEVYKVEFNVPIDDAELHEYMVVL
ESPYDEESNVVYVKGVDKVEFSTYNTGNATVTSSFGGYAEITSTDVTNRKITITVDGDHG
AVATLLINLPKDLHYYSVHVTDADLLSKELLTTPNSHILKVRIKLHSPATVNVDYMTTGE
ALQEMNFVWYMLYQRYSMKFNELYNKSIELGIDNETLQEALHYKELAEESYKEAWKFGNP
LQGYIRSLPYMRKAYLNIKRAVEILSKAIEEAESS
NT seq
5688 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaaggacagtgagtcttctaattgtattgttgatgatcctttcagcaattcca
gtagctttgccagtaacgttggtgagtgccgagaatactccacaggtcactcacacgata
acaaaggtgaacgctgttgcaaaagaaccagagaaaacagcaccaccgataactaaaata
gaaccagagttgcttaaaattcttgaagggaaagtcactgttaatgttccagaggtcaat
ggagaaaaactgttgcctattcatatagtagcattatcaagtatagactctaaattaaag
ggaatccaaattgttggcaaaagagaaatagcagggatggtagtgtatcttgctttggtt
ccaataaaagaggaatacaaaaaagttctcctcaaaatagcatcattacctgaggttgaa
gcagttaccaggacaaacccgtttgagccggtgggtacatttgaagaaccagacgctaag
aatagcataacaaccaaaacgatacagatcagaattccggaaattaggagaaagatagat
ctatcaaaattagagaagttctcggttaaaaagctcaaacttccagagattatgaagctg
agagagaaaagccccttgagaagaggagaattaaagatcacagaaagggaaagcctaaat
attgaaaacccaataaaaccagcagactactttgcaatctatcaccatggttcctggaat
acatggcttaacttggggattactggagctggagttaacgttgctgttatagacagcggc
gttgactttggaaatccagatctacaagacgcctatgccgtggagactaatccatcctct
ccatactatggctggccaatagcgtttagcgggcactcaatgatatggtacttgctcttc
aactacacgttcccaacatatatctattcgtggtatgctgatacctctatagagcttcca
tacttcttggtatatggaaatgtcagcatcggctacaagggcaactttaccacagtattc
acgtcaatgagcttggccaatattgaaaatgatgcagaaagagcggcattcattaatgaa
actctggcatggatgggagttacaaactccagcaaaatcttgcttgttgacgatgatggt
ggatggacccttgatgagttttatacagcagctcttgacatcttgggattaaactacaca
gtatatgaagtcccttatggtagcagcggtccaaatgcaaccgttttaagtcaatatgac
gccgttatatggttcactggggatacctatcaatatacactgacccaaaacgatacagca
aacttaatggcatacttgaacaatgggggtaagctttggcttataagccaagacttgctt
gaggagcttccgttaaatgacacctttgtaacagattatctccacgttgctggtgttgac
ccggattatccggttccaacaataataaagatggcaaataatacctacaaagctaagtca
atatactatgggttctacggaagccttacagatgcatttgctgattttgtatttccagat
aacgaatcacaagttcttgcagtgggatatgaagcaatcgtcggtattcagtggattgat
ccagacacaggaaatgtgacccaaataacttacatgaagttcccaatgaatgaaaccctt
ggagtcccgacaaagagtggaatattccactttggattccacccggacattgctctctgg
gttgactggaatgggggctatatcattgtagcggatccagagaacgctacaaaatatgat
acagtttatgctgacataacacctatgctcgtagatgcaggaagcataaccttggagtat
cttgacttcaatgaggattctggtcatactaaggataatcctgttatacaggttgacttc
tgggacacatttaatgacaggtttggccaggatggatatgctgatctttcaggcggacta
atatacttcatagctgatggagttaatccaatcccatatgaagatgttgtttcatcaaac
tggggacttccaatgccaattccagagaacggtgacttggtagcattcatgataggcaat
gtctatgttgccggtggagatcatggaacattatgtgctgctgctgtaggggcaagaggt
agaacattctatggtctaacatttggtaatgccattggtgcaaagataattgcagaaggt
tcactctaccagggaggaagctggattgattatgtgttctttgctgttgagggctatgat
ggaattccaggaacaggagatgaggcattagtagttagcaacagctatggtgcttcatca
gttattgccaaaggatacacatgggatgacagattcctctactggataacacacttctat
gctccgcaggtaagcttcttcttcgctgcaggaaacggtggtccgggttacggaacagtt
acaagtgagggagcttcgccaggagttataacagtaggagcagcagttgaatttggttat
agagcactctttggatatgacgatggaccttggggatacgagcttgctaactatggagac
gtcgtatggttctcaaacagaggtccaaatgcccttggacaggtagatccagatgtctta
gctgtcggtgcctatgctctcggaagccttccactaaatgaagttggagatggtttctgg
gccagcgatctctgggcaggaacgagcttagcaacgcctatggctgcaggtattgctgct
ttggtgtatgaagcatattattcagctcatggaacatggccaacagcagaggaggttaaa
gagatactcatgagcactaccaagaacgtcaatcatgatgtcttcagtcagggtgcagga
tttctggatgcctacagagctgtgcaggcggcattaaacttggatggaataattgtgtca
ccatcaatgtggcaagcaggagaaacagagtatccggcatttgcaaatgtcatttatcca
ggagatagtgcttcacatgtctttgaagttagaaacatgaacgtatcagcatcaaaggac
gttgaagtttctgcagaggtgttccagaagattggagaagttgagttcaatgtgaccgga
aattcctggtacatgtacaggattgatccgtttataccaaacggaacagacctcatgaag
attaccctttactttgactatgactacttcgatactgagagggactattcagcagatgca
ttcccatggttcagagtttgggatgtcacatatgtctatgatccagagtcaaatacaaca
gttcctacatttaacctgcttacacagtcacttaatgaaggaacatcaatctctgcaaca
ttaggaaatccattacagaagttccacgacggtttatatgtccagatcagagatgttctc
aggtactatggcaagacagacacttatcccgccaagctcaaactggagttctacaagagg
gtgccatgggattgggttgccattaatacaacaactctcacggtacctgctaatggaact
gcaacatttatggctacagtgactgttcctctcaatgcttcatacggagtctatgaaggc
gcaatctacctcaagtacgatagatatgaaacgacaattccagtgagcgttgttgttgca
tcaccgacaccgaactttgagttcggaggaaatacaaatgcgagtggtctctacgataac
agcaatgtctacggacagtttgactggagctggagatacgaaagcggtgattggaggttg
ttctactttaacgtctcaaatgctcacaacatgacaaatgcttacttaatagcagatgtt
tcatgggatggcattccaaccgacataaaccttcacctccttggccccgcagaggatggc
tccttgctaccgttcagtgccatatggccaggaatatttggaccatacacactggctgaa
attggaagaagcatagatggctatgtgggtgctggaatgttcaagctcttcacgacaagc
ggtacaagtagggaagttatcgcagcaccagcatcacctgggctccatgcattgtggctt
cacaatgtgctcttcgatggcaagcagagctacaggacattcagcggaaagattggcatg
gcatcagttactcccggcacatggatggagagcattaactcaactgaaggtaagaaatca
tttatagtccatctaccttcgtcatttggaatgctgaaggctactgcagccggattaaca
gcaccgataatctataaagacaaactcgcgccaccaactggatctgctgactactacaca
gttacagttaaggatgccacaaagcttagtataacgcttacaagcctgtgggacgacttg
gctggtgttgaccttgacctttacgtctactacaatggacagcttgtgggtgcatcctat
acatcaacagcggatgaaggagtcattattcaactcccagcatcgggtacatacacaatc
gaggtgtactcatggaacaacccgacaacaaatgcaacctatgacctcaagattcttgca
attgaacagggagatctacaggtcgagagcatcaaggagatagcagatggtgtttacaac
gttacagtcagctacactatgagcagtgacaagtttgaaaacgcaaatacattctacgga
acgatatacttcggctatgatgcagccccaatgcttatagaggttccagttaccctctac
aagacaaccccagagattattgaagaatttggaactgttgtgataatgcaaccatatgac
ctgtcattgaacttggtaccaaatgaggaaatcgctgagataggtacaacatatacactt
acaacattcgtatctaactatggcccatacgacgcaacagaggctgtggtaaatctttac
aaagatggagagcttattgatcaagtaaagctcccagaatttgctaaaggagaagtgtat
aaagttgagttcaatgttccaatcgatgacgcagaacttcatgagtacatggtagttctt
gaatccccatatgatgaggagagcaacgttgtttatgtaaagggagttgataaagttgag
ttctctacctacaatactggaaatgctacagtgacgtcttcattcggtgggtatgcggaa
ataacaagtactgatgtcacaaacagaaagataacaattaccgtggatggtgaccatgga
gcagttgcaacattacttataaatctgccaaaggatcttcactactacagtgtgcatgta
actgatgcagacctcctaagtaaagaactacttaccacaccaaactcacacatcttgaaa
gtcaggataaagcttcactcaccagcaactgtgaacgtggattacatgactactggagaa
gcattacaagaaatgaacttcgtttggtatatgctctaccagagatacagcatgaaattc
aatgaactctacaacaagagtattgaacttggaattgataatgaaaccctccaggaggca
cttcactataaggagcttgcggaggagagttacaaggaagcatggaagtttggaaaccca
ctccagggatacataagatcgctgccgtacatgagaaaagcatacctcaacatcaagagg
gcagtagaaatcctcagcaaggctatagaggaagctgaaagctcttga
DBGET
integrated database retrieval system
