Sulfurimonas denitrificans: Suden_0927
Help
Entry
Suden_0927 CDS
T00298
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
tdn
Sulfurimonas denitrificans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FecR
TbpB_B_D
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABB44205
UniProt:
Q30S26
LinkDB
All DBs
Position
961873..965619
Genome browser
AA seq
1248 aa
AA seq
DB search
MSFIFRIFILSLLFGYSLLFASIGSVSLLKGEASLEREGTVLGVKNGMNLEERDSIKTTK
GSQIQLIFTDKTVITLGSESHFKVDEYLSEGSNPKAKFKFNQGTFKTITGRIGKSAPENF
TLETKTATIGIRGTVIGGNVPQSSSAPDTIICLGGRITATSLQTGVTVNLPTGTVTVVPV
SGPPSPPRQATPQDIAQFNESLGTPPPSNSPAESSNSPQDGGGSSAAQNGAPATQGDEGG
FQSPAGNAPAAAPQTFSPTAAAAAQQTNQQNSTQGGVVENLSQGLGVPVGQIQQQIASNN
PTPPTVVTPPPPVEPTPPPVVPTPPPVEPTPPPVIPTTPPVVTPPSNGSGGGYTPPPHPA
SYTTLFSNMSASNGASSTVLFPENVTKTMLFDATNRLWVSSDNAYIATTSVDGNFSYINS
ELANAQKMYIKSQDYENPVLFKSFPSDSGASGYVEGLSGLKPIASTWHELVTSAKGVMNQ
NFSDVIKYEENSHYDTRKWNYNTNLKIFNELYYIEDDWTSINSYAALYSDISNNDTIYQN
SLSSALSDYMNGANFYIHGVPEANQNIKSYGTLQDGGKWYFIYNNVNSDFNNTVSVYGTL
PITDAVAVSSDSNSVPFMQTTTDYPIYIVDRSGSKEMYSIKNFDSISNDMFNYVNNHFLE
INTDYVTVDGSNITYTHLSPEYQQNVYLFYKIDDNGTLVEDARNGKMVNPITGNVLHVYT
NYHTPTVDNGTMVVGDFAFGVIDNPLMNNEIFPTPTDVNNTISYGNGIFSNDLNMTTPAV
GANYRKLAIEKALWSDKPVDAKVYVYSDYGTNLANRDFDELYNTGTFIKFPSSGNGIMME
SYFDVLEEKSGSTVVKNYFTGSITTGRVVADGTDNKIVFKHFESLGGVTTSDSVDVTNHN
FYLFNENAQFINADNGGLDNNKAGTEKYNWLAHEEVNAASSETLNVGLMKKVTDSSDVNL
FKGVTDYNTSFATGAMKGFIIGADTSTTPNIWMGDITTFNINPIEGGELNITVAANNLGI
TTPISMADLSQTNSAEAIPSSSYLGEDMQAMIIESKTVNGKTYDFAMATLPDKVEATGKY
SYQNDYTSWGYWVATEKAPTAGGSYAQGYWVAGYETPVSSIPTSTTYNYSGNILGTITHG
TMASPILLDETNSFKAAIQFGATNPITITEMKFNTKDLGAVTGIGTATTPSNSIIDNTFS
GTHTNGTTALDFKGKFFGPAAEAIGGAWSGTFNNAALSGTGVFKGVKE
NT seq
3747 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcttttatttttcgtatatttattttatctttgttgtttggctactctttgctcttt
gcatcaataggaagtgtttcactacttaaaggtgaagcttcactagagagagagggaaca
gttttaggtgtaaaaaatggcatgaatcttgaggagagagatagtataaaaactactaaa
ggctcgcagatacagcttatttttacagataaaacagttatcactctaggaagtgagagc
cattttaaagtagatgagtatctaagtgagggaagtaaccctaaagcaaagtttaaattt
aatcaaggtacttttaaaaccataactggacgcattggaaaaagtgctccagagaacttt
acgcttgaaactaaaactgctaccattggaattagaggaactgtcataggtggaaatgtt
cctcaatcatcatcagcacctgatactattatctgtttaggcggacgaatcacagcgaca
tcacttcaaacgggagttacagtaaatctgccaactggaacagtaacagtcgtcccagtg
agtggacctccctcgcctccaagacaggcaacgccgcaggatatagcacagtttaacgaa
agcttaggaacgccacctccatctaattcacctgcggagagttcaaactctccacaagat
ggcggcggttcatctgcagcgcaaaatggggctccagctacgcaaggtgatgagggcgga
tttcaatctccagctggtaatgctccagcagcagcaccacaaacattctctccaacagct
gcagcagctgcacagcagacaaatcagcaaaattcaactcaaggtggagttgttgaaaat
ttatcacaagggttaggtgtgcctgtagggcagattcaacaacaaattgcttcaaataat
ccaacgcctccaactgttgttacccctccaccgccagttgagccaactccaccgccagtt
gttccaacacctccacctgttgagccaactccaccgccagttatacctactacaccacca
gtagttactcctccatcaaacggtagtggtggaggctatactccaccacctcacccagct
tcatatacgacactattttcaaatatgtctgcttcaaatggtgcaagttcaacagttctg
ttccctgagaacgtaacaaaaacaatgctctttgatgcaacaaatagactatgggtatca
agcgataacgcatatatagcaacaacatcagtagatggaaattttagctatattaacagt
gaactagctaatgctcaaaaaatgtatattaaatctcaagactatgaaaatcctgttttg
tttaaatcttttccaagtgattcaggggcaagtgggtatgtagagggtcttagtggatta
aaacctatcgcttctacttggcatgagttagttacaagtgctaagggtgttatgaatcaa
aatttttctgatgttataaaatatgaggaaaatagtcattacgatacaagaaaatggaat
tataatactaatttaaaaatctttaatgagctttattacattgaagatgactggacatct
ataaatagctacgcagcactttatagcgatatatcaaataatgatactatctatcaaaat
tctttaagtagcgccctgtcggactatatgaatggtgccaacttttacatccatggagta
ccagaagccaatcaaaatattaaaagctatggaaccctacaagatggcggaaaatggtac
tttatttataataatgtcaacagtgactttaataatactgtttctgtatatggaactcta
cctataacagacgctgtagctgtatcatctgatagcaatagtgtgccttttatgcaaaca
acaacagattatccgatttatatcgtagatcgctctggatcaaaagagatgtacagcatc
aaaaattttgatagtatctcaaatgatatgtttaattatgtaaataatcattttttagaa
ataaacactgattatgtaactgtagatgggtctaatattacttatactcatctatctcca
gaataccaacaaaatgtctatctcttttataagatagatgataatggcactttagtagaa
gatgcaagaaatggcaaaatggtaaatcctataacaggaaatgtattacatgtatataca
aattatcatacaccaactgttgataatggaactatggttgttggagattttgcatttggc
gtaattgataatccgcttatgaacaatgagatatttccaacgccaacagatgtgaataat
acaatatcttatggtaacggtattttttctaatgatttaaatatgactacacctgcagtt
ggtgctaattatagaaaattagctatagaaaaagcattatggagtgataaaccagtagat
gcaaaggtttatgtttatagcgattatggtacaaatttagcaaatagagattttgatgaa
ctatataacactggaacatttatcaaatttccatcaagcggaaatggcattatgatggag
agttattttgatgttttagaagaaaaaagtggttctaccgttgtaaaaaactactttaca
ggctccatcacaacaggaagagttgttgctgatggtactgacaataagattgttttcaaa
cattttgagagtttgggtggtgtaacaacgtcagattcagttgatgtaaccaatcataac
ttctatctctttaatgaaaatgctcagtttatcaatgcagataatggcggacttgataat
aataaagctggtacagaaaaatacaactggttagcacatgaagaggtaaatgcagcttcg
tcagaaactcttaatgttggacttatgaaaaaagtaactgatagtagtgatgtaaatctt
tttaaaggcgttactgactacaacacctcttttgctacaggagctatgaagggctttatc
ataggtgcggacactagtactacgccaaatatttggatgggagatattactacttttaat
ataaatccaattgaaggaggggaattgaatattacagtagcagcaaataacttaggaatt
acaacgcctatctctatggctgacctaagtcaaacaaatagcgctgaagccatccctagc
tcctcttatcttggagaagatatgcaagctatgattattgagagtaaaaccgtaaatgga
aaaacttatgactttgctatggctacacttcctgataaggtagaggcaacaggtaagtat
agctatcaaaatgattacacttcatggggatattgggttgcaactgaaaaagcacctaca
gcaggcggttcttacgctcaagggtactgggttgcaggatatgaaactccagttagttca
ataccaacaagtacaacatataactacagcggaaatattttaggtaccataacacatgga
acaatggctagtccgatattgctagacgaaactaactcttttaaagcagctattcaattt
ggagcaactaatcctataactattacagagatgaaatttaatactaaagatttaggtgct
gtaactggaattggaacagcaacaacaccatcaaattctataattgacaacactttttca
gggacacatactaatggaactacagcattagactttaaaggaaaattcttcggaccagct
gctgaggctatcggcggtgcatggagtggaacatttaataatgcagccttgagcggaaca
ggcgtatttaaaggggttaaagaatga
DBGET
integrated database retrieval system
