Terrisporobacter hibernicus: JW646_05140
Help
Entry
JW646_05140 CDS
T07658
Name
(GenBank) Ig-like domain-containing protein
Organism
tem
Terrisporobacter hibernicus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_2
Peptidase_S8
Big_6
aBig_2
HZS_alpha
Invasin_D4
BetaGal_ABD2
Peptidase_S8_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UEL48837
LinkDB
All DBs
Position
complement(1058258..1062184)
Genome browser
AA seq
1308 aa
AA seq
DB search
MREKFYKIISLLLSITFLCPSITYGNKKEVSTYKEDEILVAFKDSVKEKKAYSIAENLDS
NVVEKNKEDNYYIVKIDDDVSVDEAIDKFEKNDSVKYVQPNFIYNLEEDNKITTNDPLSQ
YHINQINLDKAWSLIDEKSQNIKVAVIDTGVDPTHRDLVNNIDSAVDAMNDFKPLSKDTA
NHGTHVSGIIAAQCDNNLGVAGAAYNKADLMVINVFQRVNYKNIVYTSDLIRGYNYAVEH
GARVINMSLGRIGIDEHYDYILEDAINNAKDKGVVTVSSAGNECSSEPHYPSDFEACISV
TATNQNDKFDYTYSNYGPQKDIAAPGTNIRSTTPKDTYGYNSGTSMASPIVSGVVALMLS
KSPSLNVEEIKNILYSTAVDLGKEGRDDEYGWGRINPYEAMLKVSKGIVSSTDISLDKKE
ININKGDKTTIKGSLTPKNTTDIISWSSSDDSIAEVDDKGVIKGISVGDVVITAKSTSTV
KATCKVSVKSPLEKIKLNKSSETLNKGGKSKLQVTYNPEDTTDSKEVAWTSSDENIVKVN
DKGEVIGVNPGSAIVTAKVGDLQSSCKFTVLSPLLDINLDYQDISLQKGTSEKLTLNYNP
VDTTDNKNVSWISSDENVVTVDETGSISAMSTGTAQITATVNNKKSTCNVKVEDNNSVKL
NMSSISINKNKEVKLKALDEFNNEIRENISWSSSNKSVADVDNTGKVMTKSQGSTIITAK
IGDLTLYCTVNVLSPLSSINLEDKYVTLNRDKERQLNLNFSPIDTTDNKEVVWTSSDKSI
VSVSKEGIIKGLKSGKAVITAQVGNLLSSCEVNVKSPLINIFMDKEKLQVNRSESEQLNI
TYNPIDTTDSKDIVWTSSDENIATVDDNGNVKGISLGNVIISAKVGDKTAKSIVKVVAPI
RSIGLNKKEITLENPNEETLTPIFYPNDTTDDKNVKWKSLDENIAIVDKNGKVTPIGSGI
TVIEATSSNNMVARCTVTVNMKLLSIEFPQKEAEIYVGDNYIQQLNFNPSSIKSDNIEWY
TSNPDVATVDGNGRITGKSKGRCEIIAKVEDLKATFKINVLLKQINKFTVNSAITDSSRT
IIKGSGEVGFNIRAYINNKQIGSSSKVKSDGTYILSIPAQKPSSKITVKISKSGYSTKIK
SIYNKTKFINKLEVNSIKTSHTKIKVKGSAGATVKVYVNGKQIGKSSTIKKDKTFELTIP
KQKPTTNVEIKMSKKGYVTQYVRKKVLKVFTANFTINKVKNTHTKITGRGSKNSNIKIYD
KSKLIGKGRVNEKGYYSIKIPKQKPNKKITVKMSKDGYATLLKTIIVK
NT seq
3927 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagagaaaaattttataaaataattagtttattgctaagtataacttttctttgtcca
agtattacatatggaaataaaaaagaagtttctacttataaagaagatgaaatattagta
gcatttaaagattctgtaaaagaaaaaaaggcttattccattgcagaaaatttagatagc
aatgtagttgaaaaaaataaagaagataactattatattgtaaaaattgacgatgatgtt
agtgtagatgaagccatagataaatttgaaaaaaatgatagtgtgaaatatgttcaacct
aattttatatataacttagaggaggataataaaataactacaaatgatccgcttagtcag
tatcacataaatcaaattaacttagataaagcatggtcattaatagatgaaaaatctcaa
aatataaaagttgcagttattgacacaggagtagatccaactcatagggatttagttaat
aacatagatagtgcagtggatgctatgaatgattttaagccgttgagtaaagatacagct
aatcatggtacccatgtttcgggaataatagctgcacaatgcgataataacttaggggta
gcaggtgcagcatataataaagcagacttaatggtaataaatgtttttcaaagagtaaat
tacaaaaatatagtttatacaagtgatttaattagagggtacaattatgctgtagaacat
ggtgcgcgagttattaatatgagtttagggagaattggtatagatgagcattatgattat
attttagaagatgctattaataatgcaaaagataaaggtgtagtaacagtttcttctgct
gggaatgaatgctcctctgaacctcattatccttcagattttgaagcgtgcatatctgta
acagcaacaaatcaaaatgataaatttgattatacatattcaaactatggtcctcaaaaa
gatatagcagcgccaggtacaaatattagaagtacaacgccaaaggatacttatggatat
aatagtggaacatctatggcaagcccaattgtaagtggggtagttgctttaatgctctct
aaatcaccgtctttaaatgtggaagaaattaaaaatatactatattctactgctgttgat
ttgggaaaagaaggaagagatgatgagtatggatggggaagaataaatccttatgaagcg
atgctaaaagtaagtaaaggaattgtaagttctactgatataagtttagataagaaagaa
ataaatataaacaaaggagacaaaacaacaattaaaggaagcttaactcctaaaaataca
acagatataataagttggtcatcttcagacgattctatagcagaggtagatgataaggga
gtaattaaaggcataagtgttggagatgtagtaattacagcaaaatcaaccagcacagta
aaagctacatgtaaagttagtgttaaatctcctttagaaaaaataaaattaaataaaagt
agtgaaactttaaataaaggtggaaaaagtaagttacaagttacatataatccagaagat
accactgacagcaaggaagttgcttggactagttctgatgaaaatattgtaaaagttaat
gataaaggtgaagtcattggtgtaaatccaggaagtgcaatagttacagctaaagtcggt
gacttacaatcatcctgtaaatttacagttttatcacctcttttagatataaatttagat
tatcaagatataagtttacaaaaaggtactagtgaaaaacttactttaaattataatcca
gttgatactactgacaataaaaatgtatcctggattagttcagatgaaaatgtagtgaca
gttgatgagactggcagtataagtgctatgagtactggcacagcacaaattactgccaca
gttaataataaaaaatctacatgtaatgttaaggtagaagataataattctgtaaagtta
aacatgagtagtatttctataaacaaaaacaaagaagttaaattaaaagctctagatgaa
tttaacaatgaaataagagaaaatataagttggtcatcttcaaataagtccgtagcagat
gttgataacactggaaaagtaatgacaaagtcacaaggtagtacaattattactgcaaaa
ataggagatttaaccttatattgtactgttaatgtattgtctcctctttcaagcataaat
ttagaagacaaatatgtaacattaaatagagataaagaaagacaattaaatttaaatttt
agcccaatagatacaacagataacaaagaagtagtatggacaagttcagataaaagcatt
gtaagtgtcagtaaagaaggtataattaaaggtcttaaatcagggaaagcagttataact
gcacaagttggaaatttactatcttcctgtgaagtaaatgtaaaatcacctttaattaat
atttttatggataaagaaaaattacaagtaaataggtcagaaagtgagcaattaaatatt
acttataatccaattgacactacagacagtaaagatatagtatggaccagctcagatgaa
aatatagcaactgtagatgataatggaaatgtaaaaggaatttccttaggaaacgttatt
atcagtgcaaaagttggagataagactgccaaaagcattgttaaagttgtagcgcctata
agaagtataggattgaataaaaaggaaattacattagaaaatcctaatgaggaaacatta
acaccaatattttatcctaatgatactacagatgataaaaatgtaaagtggaagagttta
gatgaaaacatagctattgtagataaaaatggaaaagtaacacctataggaagtggaatt
actgtaatagaagctacaagttccaataatatggtagctagatgcactgtaacagtaaat
atgaaattattatccatagaatttccacaaaaagaagcagagatatatgtaggtgataat
tatattcaacaactaaactttaacccaagtagtataaaatccgacaatatagagtggtac
acatcaaatccagacgtagctacagtagatgggaatgggaggattacaggcaagtctaaa
gggcgttgtgaaatcatagcaaaggtggaagaccttaaagcaacatttaaaataaatgta
ttattgaaacaaataaataagtttactgtaaatagtgctataacagattcctctagaact
ataattaaaggaagtggtgaagtaggatttaatattagggcatatataaacaataagcaa
attgggtcaagttctaaagttaaatcagatggaacatatattttaagtattccagcgcaa
aaacctagtagtaaaatcacagtaaaaattagtaaaagtggatattcaactaaaataaaa
tctatttataataaaactaaatttatcaacaaattagaagtaaactcaataaaaactagc
catacaaaaataaaagtaaaaggatctgctggagcaacagtaaaggtttatgtaaatgga
aaacaaataggaaaatcatcaacaataaaaaaggacaaaacctttgaacttaccattcca
aaacaaaaacctacaactaatgttgagataaaaatgagtaaaaaaggatatgtaacacaa
tatgtgagaaaaaaagttttgaaagtatttactgctaactttactataaataaggtgaaa
aatacacatacaaaaattactggtagaggttcaaaaaactcaaatataaaaatttatgat
aaaagcaaattaataggcaaaggtagagtaaatgagaaaggttactatagtattaagatt
cctaagcaaaaaccaaataagaaaattacagtaaaaatgagtaaggatggatatgcaact
ttattaaaaactataatagtaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
