Tetrahymena thermophila: TTHERM_00241480
Help
Entry
TTHERM_00241480 CDS
T01020
Name
(RefSeq) ABC transporter B family protein
KO
K05658
ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 1 [EC:
7.6.2.2
]
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
Pathway
tet02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tet00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
TTHERM_00241480
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
tet02000
]
TTHERM_00241480
04147 Exosome [BR:
tet04147
]
TTHERM_00241480
04090 CD molecules [BR:
tet04090
]
TTHERM_00241480
Enzymes [BR:
tet01000
]
7. Translocases
7.6 Catalysing the translocation of other compounds
7.6.2 Linked to the hydrolysis of a nucleoside triphosphate
7.6.2.2 ABC-type xenobiotic transporter
TTHERM_00241480
Transporters [BR:
tet02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB1, 4, 5 subgroups
TTHERM_00241480
Exosome [BR:
tet04147
]
Exosomal proteins
Exosomal proteins of other body fluids (saliva and urine)
TTHERM_00241480
CD molecules [BR:
tet04090
]
Proteins
TTHERM_00241480
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
RsgA_GTPase
AAA_29
AAA_21
AAA_22
ABC_ATPase
AAA_18
Zeta_toxin
AAA_15
DUF2200
DUF815
SbcC_Walker_B
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7828325
NCBI-ProteinID:
XP_001024874
TGD:
TTHERM_00241480
UniProt:
I7MAH9
LinkDB
All DBs
AA seq
1346 aa
AA seq
DB search
MVKEDSNSQSNVSFSNLFYLVSKKDSLQLIGGLVCTLLNGAVQPIFCWLQGEVAYVFSSS
NTPSQVYDKAVVTLYYFIIFGVVSFILSTLMMYFCVQFGENQAIKFRQEYYKKLISQDVS
YFDMINSNELSTKMASDCFKIQQAIGEKLCLFLYFSSIVVGTIALAFIRGWQLSLICSII
IPINLLVVNTITKITQKSVKENSSIMQVAGGVTEQTLGNIRTVKSLQGEKHESQKYSELI
QNALQKKFRFNFVSGISIGLQSMFYFLNYTLPFWVGSIFIERGVFNDNMGRPYDASDINA
IFSCILIGGLRLNMAINSYKVFYEAKVACADILKVLKSIPLIKQNEQGIKINREDVKGEI
VFENVSFSYPSRKQQNLLNNASFSVLPQKKTAIVGKSGCGKSTILQLIEHFYEPDQGRIL
LDGTNLKDFNLSSLRNCMGFVTQEPFLLATTIRENLRYAKPDATEEEMIQALKQVNIWEF
VEKLDNKLDSFVGNSGSQLSGGQKQRICIARAILRNPPILLLDEATSALDCKNEVQVQAA
LDQASIGRTTIVVAHNLQTIKNADQIIVIDQGEVIEQGSHEQLISQQGYYYKMHNKDDKN
NKTDSQQSQSQSDSSSSGDSSPLENISPIPLFQNHLNDHKSFNCTKNTLPTSNDLRQSHL
KSKDQELTTINTLTNYDEKSAMQINDDKKKFHLFFNTSPQPDPQAKLIQRQQRVEQIKNS
NILSITTKSKKLTATPKFFNEQKEESFVQVEEQNITKDQKMTTSQILKRLFSYDKKILLN
LFIGMLFSVGNGLTYPLCGLILGKLVPVILDSDRSDITSQINVYCLYLTLLGFFELASTI
FQQYFTSKAAQKTSLILRKDLFNKFLKMPIAWYDQPENNSSSLSLSIQQSCDTIHSFIQS
TFAYNIQAFVSILAAVLIAFFGDWKTSLIGIAIVPFYLLSFINYALKIGQLAVTCHKSSM
STVGLINESACNIRTIKSFGSSELLIENFIQKLQKNVDNIKKQAISCGIAIGFTNMLVFF
FFGATFFGGAFFFKNKTSSIEGLMISIECLIISANGLGKSAFFLGDGKSAIAMAKKIFSN
LDSKDEFQSNQGKQVIKQTVGQIEFQNVSFSYPERKDQLILKNISFKIPAKSKVAFVGTS
GAGKSSIIQLLQRFYSNYSGKILLDGIELRKYDLDNYRSKFGSVQQEPLLFNGTIKENIQ
YNQDVNFEQIKEAAIKANALQFIQELSKDGMDGFEKQVGIKGNKLSGGQKQRIALSQLIL
RNPQIVLFDEATSALDSNNEQIILNSIEQTFREQTIVNVAHRINVIKNCDIIFMLDQGKI
VEQGTFEQLIEQKSHFYKLIQNSQLN
NT seq
4041 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtaaaagaagatagcaattctcaaagcaatgtttctttttcaaatcttttttattta
gtttctaaaaaagattcattgcaacttataggtggattagtttgtactcttttaaatggt
gctgtatagccaatattttgctggctctaaggtgaagttgcctatgtattctcttcaagt
aacactcctagctaagtttatgataaagcagtagttaccttgtattacttcattatattt
ggtgtagtttcttttatactctcaaccttgatgatgtacttttgtgtttaatttggtgaa
aattaggctattaaatttagataagaatactataaaaagctaattagtcaggatgttagc
tatttcgatatgattaactcaaatgagttatcaacaaaaatggctagtgactgctttaaa
atctagcaagcgataggagaaaaactttgcttatttttatatttttcaagcatagtagtt
ggtactatagcacttgcttttattagaggatggcaactctcacttatatgttctattata
ataccgattaatttattggtagttaatactattactaagatcactcaaaagtcagtcaaa
gaaaactcatctattatgcaagttgcaggaggagttacagagtaaactcttggcaatata
agaacagttaaaagtctttaaggagaaaaacatgaatcataaaaatactcagaattaatt
taaaatgctcttcaaaaaaagttccgttttaatttcgtttcaggaatttcaataggactt
taatcaatgttttactttctaaattatactcttcccttttgggttggttctattttcatt
gaaagaggagtattcaatgataatatgggcagaccatacgacgcatctgatatcaatgca
atattttcttgcattttgattggtggattaagactcaatatggcaatcaatagctataaa
gttttttatgaagcaaaagttgcatgtgcagatattctgaaagtcttgaaatctattcct
cttattaaataaaatgaataaggcataaaaatcaacagagaggacgttaagggagaaatc
gtctttgaaaatgtttctttcagctatccttcaagaaaatagtaaaatttactaaataat
gcatctttttctgttttaccacaaaagaaaacagctattgtaggcaaatcaggatgtggc
aaatctacgatattatagcttatagagcatttttatgagccagattaaggaaggattctt
cttgatggtacaaatttaaaggatttcaatttaagctcacttagaaattgcatgggcttt
gtcacgcaagagccatttttacttgcaactactattagagaaaatctaagatatgccaag
ccagatgctactgaagaagaaatgatttaagctttaaaataagtaaatatttgggaattt
gttgaaaagcttgataataagttagatagttttgttggaaattctggatcttagctttct
ggaggttagaagcaaagaatttgtattgcaagagcaattttgagaaaccctccaatttta
cttttagatgaagccactagtgctttggattgtaaaaatgaagtctaagtgtaggctgct
ttagattaagctagtataggtagaacgactatagtagttgctcataatttataaacaatt
aaaaatgctgattaaattattgttattgattaaggggaagtaattgaataaggttctcat
gaataactaatttcttaataaggctactactataaaatgcataataaggatgataaaaat
aataaaactgattcataataaagctaaagtcaaagcgatagctcttcatctggtgattct
tctcctttagaaaatatatcaccaattcctcttttctagaatcacttaaacgaccataaa
tcatttaattgcactaaaaatactctacctacatcaaacgatttacgttaaagccaccta
aaaagtaaagattaagaattgactactataaatactttaaccaattatgatgagaaaagc
gcaatgtaaataaatgatgataaaaagaaatttcatttattttttaatacctcaccgtag
ccagatccttaagctaaactaatacaaagacaataaagagtagaataaattaagaatagc
aatattttatcaattacaactaagtctaaaaaattaactgcaacacctaaattttttaat
gagcaaaaagaagaatcatttgttcaagttgaagagtagaacattactaaagattaaaaa
atgacaactagctaaatattaaaacgtctattttcatacgataaaaaaattttattgaac
ttattcattggaatgctcttttctgtaggtaacgggttaacatatccattatgtgggtta
attttaggaaaactggttcctgttattcttgattcagacagatcagatatcacctcttaa
ataaatgtctactgcttatatttaactcttttaggattttttgaactagcttcaacaata
ttttaataatattttacatctaaagctgcctaaaaaacatcgttaatccttcgcaaagat
ctttttaataaatttttaaagatgcctattgcctggtatgattaacccgaaaataactca
agttctttatcattaagtatccaacaaagctgcgacacaattcactcatttatataatcc
acttttgcttacaatatttaggcatttgtcagtattttagcagctgttttaattgctttt
ttcggagattggaaaacaagcttaatcggtatagctattgtgcctttttatctccttagt
tttatcaattatgcacttaaaattggctaattagcagtaacttgccataagtcctctatg
agcacagttggcttaattaatgaatcagcttgcaatataagaactattaagagtttcgga
agcagtgaactcttaattgaaaattttatttaaaaactttaaaaaaatgtggataatata
aagaaacaagctatttcttgtggtattgctattggatttactaatatgcttgtctttttc
ttttttggtgcaacatttttcggaggagcattcttctttaaaaacaaaacatcatctatt
gaaggtcttatgatttctatagaatgtttaatcatatctgctaatggattagggaagagt
gcctttttcttgggagatggtaaaagtgcaatagcaatggcaaaaaaaatatttagtaat
cttgactctaaagatgaattctaatctaatcaaggaaagcaagttataaagtagactgtt
ggttagattgaattctaaaacgtttctttctcttatcctgaaagaaaggactaactcatc
ttaaaaaatatttcattcaaaatacctgcaaaatctaaagttgcttttgtgggtacttca
ggagctggtaaatcatctataatttaattactctagagattttacagtaattattctgga
aaaatactccttgatggcattgaattgagaaaatatgatttagacaactatcgttcaaaa
tttggttcagtataataagaacctcttttattcaacggtactataaaagaaaacatttag
tacaactaagatgttaactttgaataaataaaagaagcagctataaaagctaatgctctt
taatttatttaagaactctctaaagatggaatggacggatttgaaaagtaagttggtatt
aaaggaaataaactaagtggaggataaaaataaagaattgctttgagttaacttatccta
agaaatccctaaatagtactctttgatgaagctactagtgctcttgattctaataacgaa
taaattatcctaaattcgattgaataaacatttagagagtaaactattgtaaatgttgct
cacagaattaatgtaataaaaaattgtgatataattttcatgcttgatcaaggaaaaata
gtagaataaggtacattcgagcaactgatagaataaaaatctcatttttataaactaata
taaaattcttaattgaactga
DBGET
integrated database retrieval system
