Tenacibaculum jejuense: TJEJU_0569
Help
Entry
TJEJU_0569 CDS
T05041
Name
(GenBank) Protein of unknown function precursor containing LLR domains and a C-terminal secretion signal. Putative adhesin
Organism
tje
Tenacibaculum jejuense
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_4
LRR_8
LRR_1
Por_Secre_tail
MVL
Ig_3
Ig_2
I-set
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
SNR14349
UniProt:
A0A238U565
LinkDB
All DBs
Position
TJEJU:571926..579095
Genome browser
AA seq
2389 aa
AA seq
DB search
MKTKLLLLLFVVIFWGAQGQVSQAEREALIAFYNATDGDNWTNNTNWDTDPNGTSDVSTW
HGVTVSIVNGQQHVIRLILNDNNVVGELPDFNGFSELRRLELAKNSITGELLVTKFPENM
EIIQLRENNLSGAFPDFTRFNNLILLVLNENMLTGVISEDLFPVGVSTISIGENPMISGT
LDFSLFTLGAINIKNTGISFLKIPSTISSPNSINISETPNLAYLEAFNPNSFITLSSSRF
DLGLRIVMHDQADRTALPNLQEREVLKKLFIDDNYTYGSTVKNGVNDNEWIAMKVINGET
RVTEIHIAQKNINDVMPSDINVFTELFYLNLTSYGLQGIAPELGSLLKLEQLYLNGNLIS
SLPEDFYDLVNLKILNVSNNQIPSLSDRLGNLTALEQLNFSSNNIDEIPSSVGNLVNMKT
LQFQNNQITLLPPELGNLTLLTLMRGFNNEIASIPSEFGQLTLLQFLDLSSNSISNTPVE
FSNLTELETLYLNNNDLQVIAGLGGFTKLKFLRLHENRLGEDNAIFDTKLPANIGDLSLL
QELTLHDNQLKELPNTIGSLTLLSELPLQNNRLESLPTGIGSLSGLKILKLQNNQLTALP
VEIGNLSSLEDLNITNQTSANAGTIYHLTSLPATITNLTSLKNFEASSNRIEGDIDLSNS
LALDYLGFFGNRISGLKLGKAPFSIQTTSNPNLSCIEVPSDQVNNWKSTALTNSIISIDN
GVDFSDNCSGFRVPQLEREALIAFYNATGGGTDWTGQFWNTDPNSLSNVGAWNGVTTAVI
NGQKHVVKLEVRNSRLNGFIPSEIKNLTELVELNLGVFNGRGNLIEIKPEIGELTKLERL
DLRGHILPAIPTEIGNLSSLTYLDVSNNSLTSLPAGIGNFTVLEELSITSQNNVNTGEKT
LTTLPDEIGNISSLKQLYLQDNKLTSLPNTIDGLVVLEQLNLGDSSGRGNELSSLPASIG
NLNTLKILNIEYNRLTSLPEEIGNLSNLENFSIANQVTFDGGTTYYLTSLPLSINNLSSL
INFNASGNRIEGGVDLSNIMTLTSLNLTDNRISDLKLGKAPFFSQLSSNPNLTCIEVPSS
EVNNWETTAATSSTVTVDNGVAFSDNCIGFRVPQLEREALIAFYNATGGGTDWTGQFWDT
DPNSLSNVGAWEGVTTEIVNGQKHVVKLELRSSRLNGFIPSEIKNLTELVELNLGVFNGR
GSLTEIKPEIGELTKLERLDLRGHILPTIPTEIGSLSSLIYLDLSNNSLTSLPAGIGDFA
VLEELRITGQNNVNTREKTLTILPDEIGNITSLKQLYLQDNKLTSLPNTIDGLIALEQLY
LGDGSGRGNELSSLPATIGNLNALKILDIEYNRLTSLPEEIGDLSNLENLSVANQVTFDG
GTTYYLTSLPLSINNLSSLTNFNASGNRIEGDLDLSNLLSLTRLVLTDNRITGLKLGKAP
FSARLSVNPNLTCVEVPASEVSNWETSPSNTVSIDNGVAFSDNCTGFRVPQLEREALIAF
YNATSGGTDWTGQFWGTDPNSLSNVGAWEGVTTEIVNGQKHIVRIDLSNRRLNGFIPSEI
KNLTELVELNLGRFNGRGNLTELMPEIGELSKLTRLDLRGNNISSLPTEIGNLSSLTYLD
LSNNSLSSLPVGIGNFTVLEELLITEQNDLSTREKTLVSLPNEIGNILSLKKLDLRINKI
NSLPVSIGNLANLEELYVQNNELIELPTTINNLLNLKNLRVEFNQISGDLDLSNLTVLNE
LKLEYNTIENLKINIAPTAFGSSNFGRFSLLRNACGCVEVPSDELVSWQLSGFNEQNSVL
DNGVVYSDNCSGVTNNSISDLEREALIALFNATDGNNWRNDLTGSYNGVLWDSDITQKVN
VGAWFGVTTAVINGQKHVTKIELNSNLLKGELPAEIGNLSQLKIFKMSSNAISLIPAEIG
MLINLEQLTLSSQIDPITNQNVLTRLPAEVNNLSLLKHLDVQGNDIEGNLDFSNLVNLTS
LQVSSNEITGLRIGISPQVFDNQFDFDGGFSRSFSFSNAYLNCIAVPQTTISDWENSRFA
QRNPEIVWGQDCTAYNNVPNEEINALVDMYNSLDGGNWTNNQNWTGVLNRAIMNSPFNAT
KWQGVTTEIVNGGKHITRISLSNNNLTGTLPESLGGLSELKYLDLSFNNLENNLPPSLNQ
LTQLETFLIPFNKLEGDIPDLTNITSLNNFNIDNNKFQFGDFEDEFSIYNTFTQFLYETQ
ANVSEDETIELTDTDYRLEAQVSGNNNVYQWYKNGSPITGANEASYDILNPSSADDGTYY
CQITNTIVTGLTLRTGTVTATFDTTLSIENEELKNFIVLYPNPTNGILNIDVSNNISIRR
LDVFSITGVKVKSIDKVTEKLNIQDLPSGVYMINIQSTQGRIVKRLIKR
NT seq
7170 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaacaaaattacttttacttctttttgttgtgatattttggggggcgcaaggccaa
gtatcgcaagcagaaagagaagctctaatagcattttacaatgctacagatggagataat
tggacaaataacacgaattgggatactgatcctaatggtacttcagatgtttctacttgg
catggagtaactgtttcaatcgtgaatggacagcaacatgtaattcgcttgatactaaat
gacaacaatgttgtaggagaattacctgatttcaatggtttttcagagttaagacgctta
gaattggcaaaaaatagtattacaggagaattactagtgactaaatttccagaaaatatg
gaaattattcagttaagagagaataatttgtctggtgcttttcctgattttactcgattc
aacaatttaattcttttagtattaaatgagaatatgcttacgggtgtaatttcagaagat
ttatttcctgttggagtgtctaccataagtataggagaaaatcctatgatatctggaaca
ctagatttttctttatttactctcggagccatcaatattaaaaatacaggtattagtttt
cttaaaatacccagtactatttcttctccaaacagtattaatatttctgaaactccaaat
ctagcttacttagaagcttttaatcctaatagctttataacattatcgagttctcgtttc
gatttaggtctacgaattgtaatgcatgatcaggcagatagaacagcattgcctaattta
caagaaagagaagtattaaaaaagttatttatagatgataattatacttatggaagcaca
gtaaaaaatggagtgaatgataatgaatggattgccatgaaagttataaatggtgaaaca
agagtaactgaaattcatattgcacaaaaaaatattaatgatgtgatgccatctgatatc
aacgtgtttacagagttgttttatttaaatttgacaagttatggtttacaaggtattgct
cctgaattaggaagcctattaaaactcgaacaactgtacttgaatggcaatttaatttct
tcgttacctgaagatttttatgatttggtgaatctaaaaatattaaatgttagtaacaac
caaattccttcactgtctgatcgtttaggaaacttaacagctttagaacaacttaatttt
agttctaataatattgatgaaattcctagttctgttgggaacttagtcaacatgaaaact
ttacagtttcaaaataatcaaattacattattaccaccagagttaggtaatcttacatta
ctaactttaatgcgaggttttaacaacgaaattgctagtattccttcagaatttggacag
ttaacattactacaatttttagatttatcgtcaaatagcatttcaaatacaccagtagaa
ttttcaaacctaacagagttagaaacgctatatttaaataataatgatttacaggtaatt
gcaggtttaggtggttttacaaaattgaaatttttaagactacatgaaaatagattaggt
gaagataatgcgatttttgatactaaacttcctgctaatattggtgatttatcattacta
caagagttaacacttcatgataaccagttaaaagaattaccaaatactattggcagctta
acattgttgtcagaattaccattacagaataataggttagagagtttacctactggaata
ggaagtttaagtggacttaaaatattaaaattacagaacaatcaattaacggcattacct
gtagaaattggaaatttatcttctttagaagatttaaatattacaaatcaaacaagtgct
aatgctggaacaatttatcatcttacaagtttaccagctactataactaatttaacaagt
ctgaaaaatttcgaagcaagttcaaatcgtatcgaaggtgatatagatttaagcaacagt
ttagctttagattatctgggattttttggtaaccgtataagtggattaaaattagggaaa
gctcctttttctatacagacaacatctaatccgaatttaagttgtattgaagttccctct
gatcaagtgaataattggaaaagtacagctcttacaaatagtattataagtattgataat
ggagtagattttagcgataattgttcaggttttagagtgccgcaattagagcgtgaagct
ttaattgcattttataatgctacaggtggaggtacagattggacaggtcagttttggaat
acagatccaaatagtttgagtaatgttggagcctggaacggtgttaccacagcagttatt
aacggacaaaaacatgttgtaaaattagaggtaagaaactctcgtttaaacggtttcata
ccttcagaaattaaaaacttaactgaattagtagaattaaacttaggagtgtttaatgga
agagggaatctaatagaaataaaaccagaaattggagagttaacaaagctagaacgatta
gatttaagaggtcatatcttacctgctatacctacagaaataggaaatttatcaagtcta
acatatttggatgtttccaacaattcattaacgagtttaccagcagggattggtaatttt
actgtattagaagagttaagcataacaagtcaaaataatgtaaatacaggtgagaaaacg
ttaactactttaccagatgagattggtaatatttcaagtttaaaacaattgtatttacaa
gataataaactaacatcattgccaaatactattgatggattagtagttttagaacagtta
aatttaggtgatagttctggtagaggtaatgagttatcaagtttaccagcttcaatagga
aatctaaacactcttaagattctaaatatagaatataataggttaacaagcctacctgaa
gaaataggaaatttatctaatctagaaaattttagcattgcgaaccaagttacttttgat
ggaggaacaacatactacttaacaagtttacccttatccataaacaatttatcaagctta
ataaactttaatgcttctggtaatcgaatcgaaggaggtgtagacctaagtaacattatg
actttaacgtctcttaatcttaccgacaatcgtatttctgacttaaaattaggtaaagct
cccttcttttcacaattgtctagtaatcctaatttaacttgtattgaagtaccttcttca
gaagttaataattgggaaacaacagcagcgacttcaagtacagtaactgttgataatggc
gttgcttttagtgataattgtataggatttagagtgccacagttagaacgtgaagcttta
attgctttttataatgctacaggtggaggtacagattggacaggtcagttttgggacact
gatccaaacagtttaagtaacgttggtgcctgggaaggagtaactacagaaattgttaat
ggacaaaaacatgttgtaaaattagaattaagaagttctcgtttaaacggtttcatacct
tcagaaattaaaaacttaactgaattagtagaattaaacttaggagtgtttaatggaaga
ggtagtttaacagaaataaaaccagaaattggagagttaacaaaactagaacgattagat
ttaagaggtcatatcttacctactatacctacagaaataggaagtttgtcaagtttgatc
tatctagatctttctaacaattcattaacgagtttaccagctgggattggtgattttgct
gtgctagaagagttaagaataacaggtcaaaataatgtaaatacaagagaaaaaacatta
acgattttacctgacgagattggtaatattacaagcttaaaacaattatacctacaagat
aataaattaacatcactgccaaatactatagatggattaatagctttagagcagttatat
ttaggagacggctctggtagaggtaatgagttatcgagtctacctgctacaattgggaat
ctaaatgctcttaaaattctagatatcgagtacaacagactaacaagtttacctgaagaa
attggggatttatctaacttagaaaatttaagtgttgcgaatcaagttacttttgacgga
ggtacaacgtattacttaacaagtttaccgttatctataaacaatttatcaagtttaaca
aattttaatgcttctggtaatcgaattgaaggtgacctagatttaagtaatcttctttct
ttaacacgtttagtccttactgataataggataacaggtttaaagttagggaaagctcct
ttttcagcaaggttatctgtaaatcctaatttaacttgtgttgaagttcctgcttcagaa
gtcagtaattgggaaacctctccaagtaatacggtaagtatagacaatggtgttgctttt
agtgataattgtacaggatttagagtaccgcagttagaacgtgaagctttaattgctttt
tataatgctacaagtggaggtacagattggacaggtcagttttggggtactgatccaaac
agtttaagtaatgttggtgcttgggaaggagtaactacagaaattgttaatggacaaaaa
catatcgtaagaatagatctttcaaatagaagattaaatggttttataccttcggaaatt
aaaaacttaactgaattagtagaattaaacttaggaaggtttaacggtagagggaattta
acagaattaatgccagagattggagagttaagtaaacttacgcgtttagatttaagagga
aataacatctcaagtttacctacagaaataggaaatttatcaagtttaacatatttagat
ctttctaataattcgttatctagtttaccagttggtattggaaattttactgtgttggaa
gagttgttaataactgaacaaaatgatctcagtacacgagagaagacattagtctcgtta
cccaatgaaattggtaatattcttagtttaaaaaagctagatttaagaataaataaaatt
aacagtttaccagtatctattgggaatctggcaaatttagaagaattgtatgttcaaaat
aacgaattaatagagttgccaactaccattaataacttattaaatttaaaaaatttaaga
gtagaatttaaccagatatctggcgatttagatttaagtaatctaactgttttaaatgag
ttaaaattagaatataatactattgaaaatttaaaaatcaatattgcacctacagcattt
ggaagttctaattttggtagattttctttattgagaaatgcttgtggttgtgtggaagta
ccaagtgacgaattagtgtcttggcaattatctggttttaatgagcaaaacagcgttcta
gataatggtgttgtatattcagataattgtagtggtgttaccaataatagtatttcagat
ttagaaagagaagcgttaatagcactatttaatgcgacagatggaaataattggagaaat
gacttaacaggttcatataacggagtactttgggattcagatataactcaaaaagtaaat
gttggtgcttggttcggtgtaactacagctgtgataaatggacaaaaacatgtaactaaa
atagagttaaactctaatttacttaagggagaattgccagctgaaattggaaatttgagt
cagttaaaaatatttaaaatgtcaagtaatgctatttcactaattccggctgaaatagga
atgttaattaatttggagcagttaactttaagtagtcagattgatccaattacaaatcag
aatgtattaactaggcttcctgctgaagtaaataatttaagtttattgaaacatttagat
gtccaaggaaatgatattgaaggaaatttagatttttccaatctcgtaaacctaacatca
ttgcaggtaagttctaatgagattacaggactgagaattggtatttctccacaagttttt
gataatcaatttgattttgatggaggtttttcaagatcgttcagtttttctaatgcatat
ttaaattgtatcgccgttccgcaaacaacaatttcagattgggaaaattcacgatttgca
caaagaaatcctgagattgtttggggacaagattgtactgcatacaacaatgttccgaat
gaagaaataaatgctttagttgatatgtacaattccttagatggaggaaattggacaaac
aaccaaaattggactggagttttaaatagggctattatgaattcacctttcaatgcaact
aaatggcaaggagtaactacagaaattgtaaatggagggaaacacattactagaattagc
ttaagtaacaataacctcacaggaactttacctgaaagtttaggaggcttatcagaacta
aaatatttagatttaagctttaacaatctagaaaataatctgccgccaagtttaaatcaa
ttaacgcaactagaaacatttttaattccttttaataagttggaaggagatattccagat
ttaaccaatatcacttcactgaataattttaatattgataataataagtttcaatttggt
gactttgaagatgaattttcaatttacaatacatttactcagtttctatatgaaacacaa
gctaatgttagcgaagatgaaacaattgagctgactgatacagattatcgattagaagct
caagtatctggaaataataatgtatatcagtggtataaaaatggatcgccaataacagga
gctaatgaagctagttacgatattttgaatccttcttctgctgatgatggaacttattat
tgtcaaattacaaacactattgttacaggattgaccttaagaacaggaacagttacagct
acatttgatactactttaagtatagagaatgaagagttgaagaactttattgttttatat
ccaaacccaacgaacggtattcttaatattgatgtttcaaataatattagtataagaaga
ttagatgttttttcaataacaggagtgaaagtaaagtctattgataaggtaacagagaaa
ttaaatattcaagatttgccatcaggagtgtatatgatcaatattcaatcaactcaagga
agaatagtaaaacgattaattaaaagataa
DBGET
integrated database retrieval system
