Temperatibacter marinus: QGN29_04235
Help
Entry
QGN29_04235 CDS
T09370
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
Organism
tmk
Temperatibacter marinus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec
Plug
OMP_b-brl_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WND03581
UniProt:
A0AA52EKA5
LinkDB
All DBs
Position
complement(938301..941354)
Genome browser
AA seq
1017 aa
AA seq
DB search
MISKKHKAFRSMLMGSVMLTPMMLAANATAQDADEDDKDDVEEITVTGIRASLKSARDMK
RNADTAVDTISASDVSTLPDLSVAEALARVPGVVVQRFGLGASDGDFPSPEGGDNLIRGL
QLVRSEFNGRDAFSANGGRSLDFGTVPPELIGSVEVFKNSSADLIQGGIGGTINLRTLEP
FDRSGRIAVVTVDGTYTDLRDEFTPDISVVLGDRWEVSSGEVGLLGSFSTSELKSSLEGF
QIGQLLPIDLDGQTVAVPGGFQLRTNEVDRSRDSYYLAGQWRNEEGNLEVTAKYSRIENT
VTSDERTLEWFSDGEMWFQTGPTGDYTTTPFSSNGLAQCNGSNDPTPSNPTCEMTQSVSA
LFESGVVSNGLRDWTGSRGANFTNLGIHQEEKSMTDDLSINIKWMPTEQLFVNIDAHKTS
ASFDMSRLWAGTRFYSDFELNADLDDPRVRLVVDPDNNPQARGGLTPAYNGDLSDPVNSF
LLFAADEFQDNEGDMFAIKGDVQYDFDNDSWFESVKFGARYAERDQVNRSAGLNWAALAP
SWGGGLLPMNALATPGFETVDFSNFFGGGVVTGDNTEVVFANRELLSDYDAFVQMVDTDP
LITPDWNPLRRDGQVDWSRGTIGDIVEKTTDFYVRLDMGNEFDNGMSLDANVGLRYTKSS
VSGQGQLDYNDITDDDARTLAPQTTAFFDQESIDRSGQFSNVGYWLPSLNVKWNVSETSL
IRFAGSKQITRPNISQLRSSQVAVGALRYIVDEDTDPPTVTDVVPNLINIYGGNPNLEAI
ESWNFDLGYEYYFGEQDSFTFSLFYKDISNNIIYGSQTLETVTLDGQEVAIVYNGDLNQD
EATIKGFEVAYQQFFTHLDGFLGHLGVQANYTYIDAKTDAPLPIVDADGDGTPDSFERIF
RYGVNDYLGLSKHTANLIGIYQDDKLEVRLAYNWRSSHLSSYRDFVTGNPIIQQDRGYLD
GSIKYELNDMMQLRVQVANILNTRAKADQQIDADGQTFGRTAFLGDRRIKAGIRFKF
NT seq
3054 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattagtaaaaaacacaaggcatttcgttcaatgctgatgggttcagtaatgctgact
ccaatgatgcttgcagcaaatgcgaccgcacaagatgcggatgaagatgataaagatgat
gtggaagaaattaccgttactggtattcgtgcatcgttaaaatcagcaagagacatgaag
cgtaatgcggatacagctgtggatacgatttctgcatctgacgtgtcaacactgcctgat
ctatctgttgctgaagccttagcacgtgtacctggcgttgtggttcagcgctttggtctg
ggtgccagtgatggcgatttcccatcacctgaaggcggcgataaccttattcgtggccta
cagcttgttcgctcagaatttaacggccgagatgctttctcagccaatggtggccgctct
ttagattttggcactgttccgcctgaattgattggatctgtagaggtattcaaaaactct
tcagcagatcttattcaagggggtatcggtggtacgattaacctgcgcacactagagcca
ttcgaccgttctgggcgtattgctgttgtgactgttgatggtacatacacagacttaaga
gatgagtttacacctgatatcagtgttgtacttggtgatcgctgggaagtcagtagtggt
gaagttggccttcttgggtctttctcaacatcagagctgaagtcttctcttgaagggttc
caaattggtcaattgttaccaattgacctagatggtcaaacagtcgcagtgcctggtggt
ttccagctgcgtacaaacgaagttgatcggagtcgtgacagttactatcttgcgggtcaa
tggcgcaatgaagagggtaaccttgaggtaacagcgaaatattctcgaattgagaataca
gttacgagtgatgagcggacacttgagtggttctctgatggtgaaatgtggttccaaacg
ggccctacaggtgactatacaacaacacctttctcttctaatggtctcgcacagtgtaat
ggttctaacgatccaacaccgtcaaatccaacttgtgaaatgacacaatcagtttctgct
ttgtttgaatctggcgtggtttctaacggtcttcgtgactggacaggttctcgcggtgcg
aactttacaaatcttggtattcaccaagaagaaaaatcgatgactgatgatctgagcatc
aacatcaaatggatgccgacagagcagctttttgttaatatcgatgcacacaaaacatcg
gctagctttgatatgtcacgcctatgggctggaacacgcttctattctgactttgaattg
aatgctgatcttgatgatcctcgtgtccgtcttgttgtcgatccagacaacaacccacaa
gcacgcggcgggttaacacctgcatacaatggcgacctttcggaccctgttaactcattc
cttctttttgctgcggatgaattccaagacaatgaaggcgatatgttcgcaatcaagggt
gatgttcaatatgatttcgacaacgacagttggttcgagtctgtgaaatttggtgcgcgc
tatgcggaacgtgatcaagtgaaccgctctgcaggattgaactgggctgcacttgcacca
tcatggggcggcggtcttctgccaatgaatgctctcgcaacacctggctttgaaactgta
gatttctctaacttctttggtggcggcgttgttacaggtgacaatactgaagttgttttt
gcaaatcgtgagctgctttcagactatgatgccttcgtgcaaatggttgatacagatccg
ctaattacgcctgattggaatcccctgcgccgtgacggtcaagtggactggtctcgcggt
acaattggtgacatcgttgagaaaacaacagacttttatgttcgcttagatatgggcaat
gagtttgacaatggtatgtctctcgatgcaaacgttggtctgcgctatactaaatcctca
gtgagcggccaaggccagctggattataatgacattacagacgatgatgcgagaacacta
gcacctcaaacaactgctttcttcgatcaagagagtatcgatcgtagcggtcagttcagt
aatgttggctactggcttccatctttgaacgttaaatggaatgttagcgaaacttcgttg
attcgttttgccggaagtaagcagattacgcgtccaaatatttcacagcttcgctcaagc
caagtggcagttggtgctcttcgctacattgtagatgaagatactgatccaccaacagtc
actgatgtggtacctaacctcattaatatttatggtggtaaccctaatcttgaagcgatt
gaatcgtggaactttgatttaggctatgagtattacttcggtgagcaagatagctttact
ttctctttattctataaagacatctcgaacaacattatctatggttctcaaaccttagaa
actgtaacacttgatggtcaagaagtagcgattgtttacaatggtgatttgaaccaggat
gaagcaacaattaaagggtttgaggttgcctatcagcaattcttcacacaccttgatggt
ttcttgggacacctaggtgttcaggcgaactatacatatattgacgcgaaaacagatgca
ccgcttccgattgttgatgcggacggtgacgggacacctgatagttttgagcgtatcttc
agatacggtgtgaatgactatctaggactttctaagcatactgctaacctgatcggtatt
tatcaggatgacaaacttgaagtccgtcttgcctataactggcgctcatcgcatctcagt
tcttatcgtgacttcgtgacaggtaacccaattatccagcaggaccggggataccttgac
ggatcgatcaaatatgaactgaatgatatgatgcagcttcgtgttcaggtggctaacatc
ttgaatacaagagcgaaagctgatcagcaaattgatgctgatggtcaaacatttggccgg
accgctttcttaggcgatcgtcgtattaaagcgggtattcgcttcaagttctaa
DBGET
integrated database retrieval system