Thalassolituus oleivorans MIL-1: TOL_0896
Help
Entry
TOL_0896 CDS
T02529
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
Organism
tol
Thalassolituus oleivorans MIL-1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec
OMP_b-brl_3
CarboxypepD_reg
CarbopepD_reg_2
Plug
CooC_C
EMC7_beta-sandw
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CCU71332
UniProt:
M5DQ75
LinkDB
All DBs
Position
958109..961072
Genome browser
AA seq
987 aa
AA seq
DB search
MKPTRVLLTAASSLLASNLMAGEAVFYVTEDGNAMRDIAVSVNGQKQLVNSAGFATFDIP
AGAHQVELSQFGEWLGEFNFDTASSEENAEVQVDIVGGEAMPEVKVYLPGQVDAMAVGQI
AGALMSDETGGPVSGARIAIEGTDQAVMTDDNGEFAFELPRGEYALTIAHPNYGKRDVSG
LRVMSGVTTGVNMTMSLSGNGVIEEVVAVGSYIPSTATAQERDSSAVLDSIGSEQMARFG
DSSAASALKRVAGVSLVGGQFAVVRGLQGRYISSTLNGGLMPSTDPMRRDVPLDLFPSSV
LGGINIQKSFTPDMPGDTTGGVIMMTTKDLPDGPTSKLSATIGMNSRTTFSDVNGYEGGS
TDYLGLDDGTRELPSIVDSATNSGQDSLNYCNFSGCVTPAEGASLGQSFDHIYNVDQIQA
KPEKAISYSFGDVKDSGFGFYGAMQYKDKWEARHDGRTDDLGVTGTYERSKRKVDTTGYF
VAGYEDEAMLVTSKTMLLRKSDNTTRTSSEYDSNNDQQTDQATLQWVERQFLAQHFAGEH
YFGEHELDWRMNYGQTKRDEPDRRTYSYINGVLIPSTIERRFSELTEDSLEIGGDYTFDT
MISGETGLTLKAGAMISTKERTVEVARIGIDKPSSSTLDMTQSIESIVNDDSFSAGNLLI
QTRTAATDSYEATDDIFAFYGSAGIDLTSVQLLAGARMESSEQVLSYPNSTTLDNNLKSD
EILPMASANFIVSEDMQVRIGVSQTLSRPGITERSQSVQYDPETDEQIFGNPNLQVSKIS
NLDLRAEYYFSEEENLSFAVFSKDITDPIERSIPDGSGSAADGSTFRNEDSASVQGLEID
FRKMIVDSDYWSSFISGNISWVDAEVNLSEDTARFEGKDSRRLQGQSEYLANLQFGFDHL
STGQNLTLLVNYAGDRIFKASRSLSPEMEEGRVVVDLVYQYEANDNLTVKAKAGNITDAV
TRYTRDDTEIERYFEGTDISASVEYLF
NT seq
2964 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaccaactcgagtgctgctaactgcagcgtcgtctttgctggcttcaaatcttatg
gcaggcgaagccgtcttttatgtaacggaagacggcaacgctatgcgcgatattgccgtt
agcgtaaatggtcagaagcaactagtgaatagtgctggtttcgcgacattcgacattcct
gccggtgctcatcaagtagagctgtctcaatttggagaatggttgggcgaatttaatttc
gacacggccagcagcgaagaaaatgctgaagttcaagtcgacatcgtcggtggcgaagcc
atgccagaggtcaaagtatatttacctggtcaggttgatgcgatggccgtcggccagatc
gctggtgctttgatgtctgatgaaaccggtggcccagtgagcggcgcgcgtattgccatt
gaaggcacggatcaagcggtaatgaccgacgacaacggtgagttcgcgtttgaacttcct
cgtggtgaatatgcattaacgattgctcatccgaattacggcaagcgcgatgttagcggt
ctacgcgtgatgagcggagtcacgactggcgtcaacatgaccatgagcttgtctggcaat
ggtgtaattgaggaagtcgtcgcggttggttcgtatattccttctactgcgaccgcccaa
gagcgtgattcctctgcggtattagattctattgggtctgagcaaatggctcgttttggc
gattcctcagcggcttctgcgttaaagcgtgtagcaggtgtgtcattggttggtgggcaa
tttgcggtcgttcgtgggctacaaggacgctatatttcatcaacattaaatggcgggttg
atgccaagtacagatccgatgcgtcgcgatgtcccactagatttgtttccttccagcgtt
ctgggtggaattaatattcaaaagtcattcacaccagacatgccgggagataccaccggc
ggtgtgataatgatgaccacaaaagatttgcctgatggtccgactagtaagttaagcgcc
acaataggtatgaattcgcgcacgacctttagtgatgttaatggttatgaaggcggttcg
actgattatttaggtttggatgacggtacgcgtgaattaccaagcatcgtcgatagtgcg
actaatagcggccaagattcattgaattattgtaatttttcgggttgtgttacacctgcc
gaaggagcttctttaggacagtcttttgaccatatttataatgtcgatcaaattcaagct
aagccagagaaagcaatttcttattcttttggtgatgtaaaagattctggttttggcttc
tatggtgctatgcaatataaggataaatgggaagctcgtcatgatggtcgtactgatgat
ttaggcgtgaccggcacttatgaacgttcaaaacgtaaagtcgatacaacaggttatttt
gttgctggttatgaagatgaagcaatgcttgtaaccagtaaaaccatgctgttgcgtaaa
agcgacaatactactcgtacatcgtcagagtacgactctaacaatgatcagcagactgat
caggcgactttgcaatgggtcgaacgtcaatttttggcacaacattttgctggtgaacat
tattttggtgagcatgaattagattggcgtatgaattatggacaaactaaacgggatgaa
ccagatcgtcgaacctattcatatattaatggcgttctaatcccttcaacaattgaacgg
cgcttttctgaattaaccgaagattctcttgaaattggtggagattacacgttcgacaca
atgatttcaggtgagaccggtttaacgttgaaagctggtgcgatgatatctaccaaagaa
cgtacggttgaagtagcacgtattggtattgataagccatcgagttccacgttggacatg
actcaatccattgaaagtattgtgaatgatgatagtttttctgcgggtaatttgctgata
caaactcgtacagcagctacggatagttatgaagcgactgatgatatattcgctttttat
ggttctgcaggtattgatttgactagcgtgcagttactagcaggcgcgcgcatggagagt
tcagagcaagtattgagttatccaaacagcacgactcttgataataacttgaaatctgat
gaaattttaccaatggcatctgcgaactttattgtttctgaagatatgcaagttcgtatt
ggtgttagtcaaacattatctcgcccaggcattactgaacgttcacaatcagtgcaatac
gatcctgaaacggacgagcaaatatttggtaatccgaatttacaagtgtctaaaatttcc
aatttagatttgcgagcggaatactatttctccgaagaagaaaatctatcgttcgctgtt
ttttctaaggatattacagatccaattgaacgcagtatccctgacggttcgggatctgct
gccgacggttctactttccgtaatgaagattctgctagtgttcagggtctagaaatagac
ttccgtaaaatgattgtcgatagcgactattggtcgagctttatttcagggaatatatct
tgggttgacgcagaagttaatctaagtgaagacactgctcgtttcgaaggtaaagacagt
cgtcgattacaaggccagtctgaatatttggctaacttacagtttggttttgaccacctg
tcgactggtcaaaatttaacgttattagttaattatgcgggggatcgtatttttaaagct
tctcgcagtttatctccagaaatggaagaaggtcgtgtcgtagttgatttagtctatcag
tacgaagcgaatgacaatttaactgtaaaagcaaaagcgggaaatataactgatgcagtt
actcgttatacccgtgatgacacagaaatcgaacgctatttcgaaggaacggatattagt
gcaagtgtcgagtatctgttctaa
DBGET
integrated database retrieval system