Thermodesulfobacterium geofontis: TOPB45_0656
Help
Entry
TOPB45_0656 CDS
T01547
Name
(GenBank) Radical SAM domain protein
Organism
top
Thermodesulfobacterium geofontis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Radical_SAM_N2
Radical_SAM
DUF2344
B12-binding
DUF2150
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEH22758
UniProt:
F8C4X4
LinkDB
All DBs
Position
655275..657599
Genome browser
AA seq
774 aa
AA seq
DB search
MLKEYPEEVLFSIKKPSRYLGKEPFFPYKDWEKTKLKICLGYPDLYEVGRSHLGINILAG
IINEIPEYLCDLVYAVSPDMEAELKKRKIPLLSYNYRKPLKEFDVIGLSYAYELLITGIF
QILELSYIPFKAEERKVSDPVVLGGGPCCGNPEPIASLFDAIVIGDGEEVVLEILKVIEN
WKKEKLDRETLWENLKNIEGVYVPIFKNSVKRRIYLFKNSIPFLYSIPVIPLSHDRVSLE
ISRGCTRACRFCSAGFYYRPVREKTSEEIVSFAKKAFELTGYREASLMSLSAGDYSSLEK
LIDLLEREFYAYSQREYVFSLPSLRVGSLNPKILNFLKKGRTSTITLAIEAASERLRRVI
NKKIEIEELYKDLELAFKFGFKKIKLYFMIGLPTEEEKDLEEIVKFYKNLKRTFKGLEIT
ISTSIFVPKPHTPFQWERQITIEEALEKIKYLKSELKKNFKSHQPEQSFLEGIIARGDRR
LYFYLEEVFKRGARLDSWKEYFNFSLWETTAYELCLELKDYLRERDLKEELPWEHIDLGI
KKEFLLKEKEKAYQEIYTEDCRWGSCSNCGVCKGEIKNYLSEKEEGEKKLVTISNIIKNP
DETFWYEIYYDKIGVSKFLSQLEILRLIELVLRRKKIPLSYTQGFNPKPKFVCGPALPVG
IEAKNEFLGLGLREKVSEESLKGIEIYEGLILKEVKFRGKEKPSPPIRKTYYLLYPLKEI
SFELKSTKNLELKFLGSFYTAIPYKNEISFLKLLKEEFNIDEPFKYFRIIKSYI
NT seq
2325 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaaagaatatccagaagaagttttattttctataaaaaagccttcaagatattta
ggaaaggagcccttttttccttataaagattgggaaaaaactaaattaaaaatttgtctt
ggttatcctgatctttatgaagtaggaagatctcatcttggaataaacatacttgcaggg
attattaatgagatacctgagtatttatgtgatcttgtatatgcagtttctccagatatg
gaagctgaactaaaaaaaagaaagataccccttcttagttataattatagaaaaccttta
aaagaatttgatgtgatcggattaagttatgcttatgaacttttaataacaggaatattt
caaattcttgaactttcttatataccctttaaagcagaagaaagaaaagtttcagatcca
gttgttttaggtggcggtccctgttgcggaaatccagaacctatagcttctttgtttgat
gctatagtaataggagatggagaagaggttgttcttgagattttaaaagtaatagaaaat
tggaaaaaagaaaaacttgatagagaaactttatgggaaaatttaaaaaatattgaaggt
gtctatgttcccatttttaaaaattctgtaaaaagaagaatttatctttttaaaaactct
attccctttttatattctattccagttattcctctttctcatgatagagtttctcttgaa
atttcgagaggttgtacaagggcttgtcgattttgttctgctggattttattatcgcccg
gtaagagagaaaacttccgaagaaattgtttcttttgctaaaaaagcttttgagctaaca
ggctatagagaagcatctttaatgagcctttctgcaggtgattattcttcacttgagaaa
ctgatcgatcttttggaaagagaattttatgcttattctcagagagaatacgtattttct
cttccctctcttagagtaggaagtttaaatcctaagatacttaattttttgaaaaagggt
agaacctcaaccataaccttggctattgaagctgcttcagagagattaagaagagtaatt
aataaaaaaattgaaatagaagaattgtataaagatttagaacttgcttttaaatttggt
tttaaaaagataaagctttatttcatgatagggcttcctactgaagaagaaaaagattta
gaagaaatagtaaaattttataagaatttgaaaaggacttttaaagggcttgagattact
atttcaacttcaatttttgttcctaaacctcatacaccctttcagtgggaaaggcaaata
actatagaagaagctttggaaaagataaaatatcttaaaagtgaattaaagaaaaatttt
aaatctcatcaacctgaacaaagttttcttgaaggtatcatagcaagaggggataggaga
ctttatttttatcttgaagaggtttttaaaagaggtgcccgtttagattcttggaaagag
tattttaatttttctttgtgggaaactacagcttatgagctttgtttagagcttaaagat
tatctaagagaaagggatttaaaggaagaacttccttgggaacatattgatttgggtata
aaaaaagaatttcttttaaaggagaaagaaaaagcttatcaagaaatttatacagaagat
tgcagatggggttcttgtagtaattgcggagtttgtaagggggagattaaaaattatcta
agtgaaaaagaggagggagaaaaaaaattagtaactatttccaatattattaaaaatcct
gatgaaaccttttggtatgaaatttattatgataaaataggggtttccaaatttctttct
cagcttgagatattaaggttaatagagcttgtattaagaagaaaaaaaatacctctttct
tatactcaaggatttaatccaaaacctaagtttgtatgtgggcctgcacttcccgttggt
attgaagcaaaaaatgaattcttaggattgggattaagagaaaaggtctctgaagaatcc
ctaaaaggaatagaaatttatgaaggacttattcttaaggaagttaaatttagaggcaaa
gaaaaaccctctcctcctataagaaaaacttattatttactatatcctcttaaagaaatt
tcttttgaactcaaatctacaaaaaatttagaacttaaatttttaggctccttttatact
gcaataccctataaaaatgaaatttcttttttaaagcttcttaaagaagagtttaatata
gacgagcctttcaaatattttcgcataatcaaatcctatatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
