KEGG   Thomasclavelia spiroformis: NQ543_07590
Entry
NQ543_07590       CDS       T09467                                 
Name
(GenBank) endonuclease MutS2
  KO
K07456  DNA mismatch repair protein MutS2
Organism
tsf  Thomasclavelia spiroformis
Pathway
tsf03430  Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:tsf00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03430 Mismatch repair
    NQ543_07590
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:tsf03400]
    NQ543_07590
DNA repair and recombination proteins [BR:tsf03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    Mismatch and loop recognition factors
     NQ543_07590
SSDB
Motif
Pfam: MutS_V Smr MSSS AAA_22
Other DBs
NCBI-ProteinID: UWO88859
LinkDB
Position
complement(1597229..1599541)
AA seq 770 aa
MKNIYDTLEFNQIKNKVISFCVGNLAKDKITKLQPFDDLDDLKLNQKYLDQAMQLIYKYG
RLPIGYYNDIETLLSKANKDGMLFGEDFVQIVYLLNNVKEIINYLSDKELEENELIQLCN
QFILPKQLLKEINRCIDSSGNVLDSASKELRRIRRQILSIETNIRAKMEQIKVANKDYLS
QEAISSRNNHLVLPVKAGNKNSVKGIVHAVSATGSTMFIEPEVIVAMNNQLIHARDDEIK
EINRILMELSKQVKDNYDCLHENQELLVKVDVIFAKAGYGIQIDGVVPSINEDYANFSLI
KARHPLIDRDKVVANSIVLTSPKRILLISGSNTGGKTVVLKTAGLLSLMGLCAMAVPCNQ
ATIPMFDQICVDLGDEQSIEQSLSTFSSHMKRLVEITNEATEKSLVLLDEIGSGTDPKEG
QSIAEAILRYLHQVNPIIVASTHYSGLKEYAKNEEYILVAAVEFDQENMKPTYRLIEGSV
GNSYAIEISSRLGLKKEIVELAYQIKESSLTDSDKLLEKLQDELAQIQIQKDQLEALNHE
ATNKINKYNRLISNFEKQKDDLMEKAKKEANQLLEDSKQEIDLVVEDLKKQAVLKQHVVI
DAKRNLDLLKHEEKKVVNETNHVYQVGDIVKVLSANRQGEILSINRKGILTIDMSGLKLN
AKPEEVSFISKKVKPKKVKSNLKALRKSTNQSFELNIIGKRYEEAMALVDKFLDDALVNN
YSMVRIIHGMGTGVLRNGVRKLLDKNKYVVSYRDGGPNEGGLGATLVYFE
NT seq 2313 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaaacatatatgatacattagaatttaatcaaattaaaaataaagttataagtttt
tgtgtaggaaatttagctaaagataaaattactaaattacagccctttgatgatttagac
gatttaaaattaaaccaaaagtatcttgatcaagcgatgcagcttatttataaatatggt
cgtttaccaattggatactacaatgatattgaaactttattatcaaaagctaataaagat
gggatgttatttggtgaagattttgtacaaatagtttatttattaaataatgttaaagaa
ataattaattatttatcagataaagaattagaagaaaatgaattgattcaattatgtaat
caattcattttaccaaaacaactattaaaagaaattaatcgttgtattgatagtagtggt
aatgttttagatagtgctagtaaagaattacgtcgaatcagaagacaaatattatcgatt
gaaacaaatattagagctaaaatggaacaaattaaagttgccaataaagattatttatca
caagaagctatttctagtcgtaataatcatttggttttaccggttaaagctggaaataaa
aatagtgttaaaggaattgttcatgctgtttcagctactggttcgacaatgtttattgaa
ccagaagtgattgtagcaatgaataatcagttgattcatgctcgtgatgatgaaatcaaa
gaaattaatcgaattttaatggaactttcaaaacaagttaaagataattatgattgttta
catgaaaatcaagaattattagtaaaagttgatgtaatttttgctaaagctggttatgga
attcaaattgatggtgttgttcctagtattaacgaagattatgctaattttagtttaatt
aaagctcgtcatccgttgattgatcgtgataaagttgttgcaaatagtattgttttaact
agtcctaagcgaatattgttaatcagtggatcaaatactggaggaaagacagtagtttta
aaaacagctgggttattaagtttaatgggattatgtgcaatggcggttccttgtaatcaa
gcaacgattccaatgtttgatcaaatatgtgttgatttaggtgacgaacagtcaattgaa
caatcattatcaacattttcaagtcatatgaaacgtttagttgaaattactaatgaggca
actgaaaaatcgttagttttattagatgaaattggttcggggactgatcctaaagagggt
caaagtattgcagaagcaattttacgatatttacatcaagtaaatccaattatcgtagct
tctacacattattctggtttaaaggaatatgccaaaaatgaagaatatattttagtagct
gcagtagaattcgatcaagaaaatatgaaaccgacatatcgtttaattgaaggtagtgtt
ggtaattcatatgctattgagatttcttcaagattaggtttaaaaaaagaaattgttgaa
ttagcttatcaaattaaagaaagtagtttgactgatagtgataaattattggaaaagctt
caagatgaattagcccaaattcagattcaaaaagatcaattagaagctttaaatcatgaa
gctactaataagataaataaatataatcgtttaattagtaattttgaaaaacaaaaagat
gatttaatggaaaaagctaaaaaagaagctaatcaattattagaagattcaaaacaagaa
attgatttagtcgttgaggatttaaaaaaacaagcagtattaaaacaacatgttgttatt
gatgctaaaagaaatcttgatttattaaaacatgaagaaaagaaagttgttaatgaaaca
aatcatgtttatcaagtgggggatattgttaaagtattgtctgctaatcgtcaaggagaa
attctttcaattaatagaaaagggattttaacaattgatatgagtggtttaaaactaaat
gctaaacctgaagaagttagctttatttctaaaaaagttaaacctaaaaaagttaaatca
aatcttaaagcattacgtaaatcaacaaatcaaagttttgaattaaatataattggtaaa
cgctatgaagaagcaatggcacttgttgataaatttttagatgatgccttagtaaataat
tattcaatggtaagaattattcatggtatgggtactggtgttttaagaaatggtgtgcgt
aaattacttgataaaaataaatatgtagttagttatcgtgatggcggtcctaacgaagga
gggctaggggcaaccttagtatattttgaataa

DBGET integrated database retrieval system