Vagococcus intermedius: OL234_00690
Help
Entry
OL234_00690 CDS
T09229
Name
(GenBank) NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein
Organism
vie
Vagococcus intermedius
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Epimerase
GDP_Man_Dehyd
RmlD_sub_bind
NAD_binding_4
Polysacc_synt_2
3Beta_HSD
DapB_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WEG73457
LinkDB
All DBs
Position
132751..133716
Genome browser
AA seq
321 aa
AA seq
DB search
MKKVLVTGSLGQIGSELVYRLRQENGMDSVIATDIRSIEGSPVCEEGIFEVLDVTDYDKF
LDLAKKNDVDTIIHLAALLSATAEARPAFAWNLNMTGLMNGLEIARELDTKFFAPSSIAA
YGPDSQADNTPQDDIMHPTTMYGVTKVAGELLADYYHTKYGVDTRSVRFPGLISYKVEPG
GGTTDYAVDIYYEALKTGSYKSFIAEGTSMDMMYMDDAIEAIIKLMTADADRLVHRNAFN
ITAMAFTPEEIAASIKKVMPEFEMGYDVDPVRQGIAESWPNSIDATCAKDEWDFAPKFDL
DGMTKEMLEKLTVKLKAEGKI
NT seq
966 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaagtattagttaccggttcattaggccaaattggttcagaattagtttatcgt
ttgcgtcaagaaaatggaatggatagtgtcattgcaacagatattcgttcaatagaagga
agccctgtttgtgaagaaggtattttcgaagttcttgatgttacagactatgataaattt
ttagatttggctaaaaaaaatgacgttgatactattattcacttagcagccttattatca
gcaactgctgaagcacgtccagcctttgcttggaatcttaatatgactggtctaatgaat
gggttagaaattgctcgcgagttagatactaaattctttgctccgtcatcaattgcggct
tatggtccagattcacaagcagataatacaccgcaagacgatattatgcacccaacaacg
atgtatggtgtgactaaagttgctggtgaattattggcagattattaccatactaaatac
ggtgtggatacacgttctgtacgtttcccagggttgatttcttataaagttgagccaggt
ggtggtacgactgattacgctgtagatatttattatgaagcacttaaaaccggttcttat
aaatcgtttatcgcagaaggtacgtcaatggatatgatgtatatggatgatgcgattgaa
gctatcatcaaattgatgacggcagatgctgaccgtttagtccaccgtaacgcctttaat
attacggcaatggcctttacaccagaagaaattgcagcgtcaattaaaaaagttatgcca
gaattcgaaatgggttatgatgttgatccagtccgtcaaggaattgccgaatcatggcca
aattcaattgatgcaacctgtgccaaagatgagtgggattttgcacctaaatttgatcta
gacggtatgacaaaagaaatgttagaaaaactgacagttaaattaaaagctgaaggtaaa
atttaa
DBGET
integrated database retrieval system
