Virgibacillus sp. SK37: X953_04055
Help
Entry
X953_04055 CDS
T03219
Name
(GenBank) multidrug ABC transporter ATP-binding protein
KO
K24708
ATP-binding cassette, subfamily B, putative efflux pump [EC:7.6.2.-]
Organism
vir
Virgibacillus sp. SK37
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vir00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
vir02000
]
X953_04055
Transporters [BR:
vir02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
X953_04055
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
RsgA_GTPase
ABC_ATPase
AAA_29
AAA_16
ABC_membrane_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIF42542
UniProt:
A0A075JMF2
LinkDB
All DBs
Position
758646..760403
Genome browser
AA seq
585 aa
AA seq
DB search
MSSVKQYMKFVKPYKWKIVATILIGIIKFGIPLLMPLILKYVIDNIINAEGLSSPEKTTN
LLWLMGVSFVVFLVLRPPVEYIRQYLAQWVGNKILYDIRDRLFDHLQKLSLKYYSKTKTG
EIISRVIHDVEQTKTFVITGLMNVWLDLVTILIAIGIMMTMDVGLTLVAIILFPFYGFSI
KYFYGRLRRLTRERSQALAEVQGHLHERVQGVPVTRSFALEDYEQKQFSYRNENFLDRAL
KHTSWNAKTFAVTNTITDLAPLLVIAYAGYQVIHGNLTLGTMVAFVGYMERVYSPLRRLI
NSSTTLVQSIASIDRVFELLNEKYDVVDKKDAKKLTNVEGHVDIENVSFRYDEEELEVLN
NVTLHVRAGETIAFVGMSGGGKSTLISLIPRFYDVTKGAIKVDGNDVQHVNARSLRNNIG
MVLQDNTLFSESIAMNIRMGNPDATDEEVISAAKAANAHEFIESLPYGYDTFVGERGVKL
SGGQKQRIAIARVFLKNPPILIFDEATSALDLESEHTIQEALEKLASERTTFIVAHRLAT
ITHADRIVLIENGEIVEVGSHEELMRKQGGYYNLYQVQHLDDGTN
NT seq
1758 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcagtgtaaagcaatacatgaaatttgtaaagccatataagtggaaaatagtagct
actatattaattggtattattaaattcggaataccgttattaatgccgctcatacttaaa
tatgtaatcgataatattattaatgcagaaggattaagctccccagaaaaaacgacaaac
ttattatggttaatgggtgtatcctttgtcgtgttccttgttctgcgtcctcctgtagag
tacatacgacaatatctagcacaatgggtaggtaataaaatcctttatgatataagggat
agactctttgaccatctgcaaaaacttagtttgaaatattactctaagacaaaaaccggg
gaaattatttccagggtaatacatgatgtcgaacaaacgaaaacttttgttattaccgga
ctaatgaacgtatggctggacttagtaacaattctcattgcaattggtattatgatgaca
atggatgtaggcttaaccctcgttgcaatcatactatttccattctatgggttttccatt
aagtatttctatggcagattaaggcggcttacccgtgaaagatcacaggcacttgccgag
gtgcaaggacatttacatgaacgtgtccaaggtgtaccagtcaccaggagctttgcactg
gaagattatgagcagaagcaattcagttaccgaaatgagaacttcctggatagagcattg
aaacacacgagttggaatgcaaagacatttgctgttaccaatacaattactgaccttgct
ccattactggttattgcatatgcgggctaccaggtcattcatggtaacttaacattaggt
acaatggtagctttcgttgggtatatggaaagagtatacagtccacttcgtcggctgatt
aactcgtcaactacacttgtacaatctattgcttccattgaccgtgtttttgaattactt
aatgaaaaatacgatgtggtagacaaaaaggatgcaaaaaaacttacgaatgtagaagga
catgtagatattgaaaatgtttcctttcggtatgatgaggaagagcttgaagttctgaat
aacgttacattgcatgtgagggcaggagaaacaattgcatttgttggtatgagtggtgga
ggaaaatcaacattaattagtttaattcctcgtttttatgatgttaccaaaggtgcgatt
aaagtagacggaaatgatgtgcaacatgtaaatgcacgctctttgcgtaataatattggc
atggtattacaggataatacgttatttagtgaatctattgctatgaatattcggatgggt
aatccggatgcaacagatgaagaagttatctctgctgctaaagctgcgaacgcccatgaa
tttattgaaagtcttccatatggttatgatacgtttgttggggagcgaggggttaagtta
tctggtggtcaaaaacagcggattgccattgcacgtgtatttctaaaaaatccgccaatt
ttaatttttgatgaagctacctctgcacttgatttagagagtgaacatacaattcaagag
gcgttggaaaagcttgcttctgaaaggacaactttcattgttgctcaccgacttgcaacg
attacacatgctgacagaattgtacttattgaaaatggggaaattgtagaagttggttcc
catgaagagttaatgcgcaagcaaggtggatattataatttataccaagtgcagcacttg
gatgatggtacgaattaa
DBGET
integrated database retrieval system