Vitis riparia (riverbank grape): 117934025
Help
Entry
117934025 CDS
T07274
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At5g62370
Organism
vri
Vitis riparia (riverbank grape)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR_2
PPR_1
PPR
PPR_3
PPR_long
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
117934025
NCBI-ProteinID:
XP_034711511
LinkDB
All DBs
Position
16:complement(14720510..14729343)
Genome browser
AA seq
1003 aa
AA seq
DB search
MLKKGLKPRRLFFTPKKNLATCSPALDPPPSSAPTTEHHNKLCFTLTDRLIRRGVLSLGQ
QVVRRMIKQSPSVSDAILAVEFAAARGLELDSCGYGVLMRKLVGSGEHRFAEAVYRDYVI
ARGIIPDSETLNSMVICYCNLGKLEEAMAHFDRLFEVDSFPCKPACNAMLRELCARERVL
EAFDYFVRINDVGILMGLWCFNRLIDGLCDKGHLDEAFYMFDTMRERTGLPATIHLYKTL
FYGLCRQERVEEAELLVGEMESEGHFIDKMMYTSLIHGYCRGKKMRTAMRVFLRMLKMGC
DPDTYTYNTLIHGFVKLGLFDKGWILHNQMSELGLQPNVVTYHIMIRRYCEEGKVDCALT
LLNNMSSFNLTPSAHSYTVLITALYKENRLVEVEELYKKMLDSGVVPDHVLFFTLMQKQP
KGHELHLALKILQAIAKNGCNLDLCLLSTSATHSPTQDVEQEIECLLGEIVRRNFALADV
AFGIFISALCAAGKTDAALLFMDKMVSLGCRPLLSTYNSLIKCLFQERLVEDAKSLIDLM
QENGIVPDLATYLIMVHEHCNHGDLASAFGLLDQMNERGLKPSVAIYDSIIGCLSRRKRI
LEAENVFKMMLEAGVDPDAIIYVTMISGYSKNRRAIEARQLFDKMIEHGFQPSSHSYTAV
ISGLVKENMIDKGCSYLSDMLKDGFVPNTVLYTSLINQFLRKGELEFAFRLVDLMDRNQI
ECDMITCIALVSGVSRNITPVRRRWYHVKSGSARVREILLHLLHQSFVIPRENYLSFPRG
SPRKIKYFALNLMQKIKGSSFMPNLYLYNGIISGFCRANMIQDAYNHFELMQTEGVCPNQ
VTFTILINGHTRFGEIDHAIGLFNKMNADGLAPDGITYNALIKGLCKAGRLLDALSVSHT
MHKRGLFPNKSSYEKLLKCLCAGHLGVHAFKIFEEMLSHDYVPCWYNCNWLLCILCEEHR
WHEAHIVLDVMLKQRKYPDELTKRLLVEACNKKIFMIEENIWV
NT seq
3012 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgaagaaggggctgaagccgcgccgcctcttcttcacacccaaaaaaaatcttgca
acttgttctcccgcactagacccaccgccatcttcagcccccaccaccgaacatcataac
aaactttgctttaccctaactgaccgcctcattcgccgcggggtactgtcgttgggtcag
caagtggttcggagaatgatcaagcagtctccgtctgtttcagatgcaattttagccgtt
gagtttgccgcagcacgagggttggagcttgactcctgtgggtatggtgtgcttatgagg
aaactcgtgggttcgggtgaacaccgttttgcggaagcggtgtatcgtgattatgttata
gcaagaggtatcatccctgactcggaaacgttgaattctatggtgatctgttactgtaat
ttagggaaattggaggaagccatggctcattttgatagactatttgaagtcgattctttt
ccttgtaaacctgcgtgtaatgcaatgcttagggagctctgcgcccgagaaagagtcttg
gaggcgtttgactactttgttagaatcaatgatgttggaatacttatgggtctttggtgt
ttcaataggttgattgacgggttgtgtgacaaggggcacttagatgaagcattctacatg
tttgatacaatgcgtgaaagaactgggttgccagctaccattcatttgtacaaaacttta
ttttatggtctctgtagacaagagagggtggaggaggccgaattgcttgtgggagaaatg
gagtccgaggggcactttatagataagatgatgtacacttcactcattcatggatactgc
aggggcaagaaaatgagaacagcgatgcgggtttttttgagaatgctgaagatgggttgt
gacccagatacttatacttacaacactttgattcatgggtttgtaaaacttggattattt
gataaaggatggatattgcacaaccagatgtcagagttgggactgcaacccaatgttgta
acttatcacattatgattaggaggtattgtgaagaaggaaaagtggattgtgctctgaca
cttttaaataacatgagtagtttcaatttgactcctagtgcccacagttatactgtctta
attactgcactttataaagagaacaggttagtggaagtagaagaattgtacaaaaagatg
ctggacagtggtgttgttcctgatcatgtactattttttacccttatgcagaagcaacca
aaagggcatgagcttcatcttgctctcaagatattgcaggcaattgccaagaatggatgt
aatttggatttgtgtttgctctcaacctctgctactcatagtcctacccaggatgtggag
caagaaattgagtgcctgcttggggaaattgtgagaaggaactttgctttagctgatgta
gcatttggtatttttatcagtgccttatgtgcagcaggtaaaaccgatgctgctttgctt
ttcatggacaaaatggtaagtcttggatgcaggcctttgctttccacttacaactccttg
atcaagtgtcttttccaggagaggcttgttgaggatgccaagtccctaattgatctaatg
caagagaatggcattgttcctgatcttgcaacttatttaattatggtacatgaacactgt
aatcatggggacttggcctctgcatttggtcttttggatcagatgaatgagaggggactg
aagcctagtgttgctatttatgattccatcatcggttgtctaagcagaagaaaaagaatt
ttggaagcagaaaatgtgtttaagatgatgcttgaggctggtgtggatcctgatgctatt
atctatgtcacaatgatcagtggctactccaagaatcgtagagctattgaagctaggcag
ttgtttgataaaatgatagagcatggctttcagccaagttcgcattcttatactgctgtt
ataagtggattagtgaaggaaaacatgatagacaagggatgctcatacctcagtgatatg
ttgaaggatggatttgtgccaaatacagtgctttacacctctctaatcaatcagttcttg
cggaagggagagcttgaatttgcctttagattagttgatttgatggatagaaaccagatt
gaatgtgatatgataacatgtattgcattggtcagtggtgtttccagaaatatcacccct
gtcagaagaagatggtaccatgtaaagagtgggtctgcaagggtaagagaaatattgctc
catttgctccatcagagctttgttatcccaagggaaaattatctaagctttcctcgtggt
tctccccgcaaaataaaatactttgcattgaatctgatgcaaaaaattaaaggctctagc
tttatgccaaatttgtatctctataatgggattatttctgggttttgtcgggcgaatatg
atccaggatgcatataatcattttgaattgatgcaaactgagggtgtatgtcccaatcag
gtgactttcactattcttattaatgggcataccagatttggtgaaattgatcatgcaata
ggattattcaataagatgaatgcagatggtttagctccagatggaattacatacaacgct
ctaataaaaggtctttgtaaggctgggcgactacttgatgcattgtcagtgtcacataca
atgcataaaagggggcttttccctaataagtcttcttatgagaaactactcaaatgtctt
tgtgctggtcatttgggtgttcatgccttcaagatatttgaagaaatgctttcccatgac
tatgtaccttgctggtataactgtaactggttgctttgcattttatgtgaagaacatcga
tggcatgaagctcatatagttcttgatgtaatgctaaagcaaagaaaatatccagatgaa
ctgacgaagaggcttctggtggaagcatgcaataagaaaattttcatgattgaggaaaat
atttgggtgtga
DBGET
integrated database retrieval system
