KEGG   Vibrio scophthalmi: VSVS12_01641
Entry
VSVS12_01641      CDS       T04650                                 
Name
(GenBank) Clumping factor
Organism
vsc  Vibrio scophthalmi
SSDB
Motif
Pfam: Cadherin_5 HemolysinCabind Peptidase_M10_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: ANS85408
UniProt: A0A1B1NNX0
LinkDB
Position
1:1790264..1795018
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DBGET integrated database retrieval system