Xiphophorus couchianus (Monterrey platyfish): 114150191
Help
Entry
114150191 CDS
T05908
Name
(RefSeq) protein crumbs homolog 2-like
KO
K16681
protein crumbs
Organism
xco
Xiphophorus couchianus (Monterrey platyfish)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
Laminin_G_2
Laminin_G_1
EGF_CA
Insulin_TMD
EGF_2
DL-JAG_EGF-like
EGF_MSP1_1
EGF_3
DUF4264
TMEM154
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
114150191
NCBI-ProteinID:
XP_027882287
LinkDB
All DBs
Position
8:27209638..27230912
Genome browser
AA seq
1469 aa
AA seq
DB search
MELGKVHLNLKTLLLTMMMFKWGTLCSATSEKCLSAPCQNGATCVDTMDDYACICTREGV
LYMGKNCDELYDGCSFVPCDNCTSTPGTREYHCICPDGLTGDNCTEEVDECQSNPCSEPR
SLCVDQLYGYFCRCPAGYGGQDCRTHVTDCIDKPCMNNGTCELRPNGFECRCAAGFRGRT
CEEDVNECLSEPCQNGAICIDGVAEYHCFCVPGFQGHNCEIDINECASQPCENNATCINE
KDHYECECMVGFTGVNCETELDECDSHPCQNGATCHDLTGMYSCECLVGFDGVNCEVDVD
ECASQPCQNGAFCHDMVNSYECDCSDTGFEGEHCEVDIAECASDPCQHGATCIEEVNGYV
CLCWPGYEGANCEVDIDECAEQPCQNGGECFERSDPSHWELDWELRFSDAAGYICQCQGG
FAGENCSINIDECESEPCQNGGACEDKVNGYVCVCPIGFLGELCELNIDECESQPCQNGG
WCEDGRGSYTCHCPEAEPGDLPLGGDHCEVKLYGCVGHKCQNGASCLPTLEEGKHSHTCL
CPHGFYNEQCSTRTTFSLSTPGFIHIQIAFKEKVRREVEHRGHQGLGLQLRFRTTLPNML
IFYRGDLDNYLFLEIVNGGLHAKAFSEESELDVTFAGLVSDGAWRDVHVFLDNGSLFLTL
KGPDCDRDGCTVNDGDDGEPPFQPSQAFTDVYIGGAPNYLLELSLSGAGFLGCIEDLMID
SKPILPQSLPEDQDFELGCSKTEWCKPDPCNGHGHCVDLWTSYQCDCFRPFHGESCSEEY
LSWTYSHEDTVSFSSYDLEESHGSNFRVSFLLKSLKPDGLLFQLRRPHAEDEGEAYFSIY
LRMGRVFVSSLPDSSPLTAPVFVTTGEKQLLSVEVKHTHVMFDHAGLNYGIGEIPEVAVR
SGDKAYVGGLPEGWDAAEWGGHFKGCLQDFRLDDAHLDPGGWSSPDEIVYISSETGNLKE
GCISDDACKTKPCQNGGECTVTFNDFTCSCSEEYTGKNCQTRVWCVSNPCAHGGLCVDLP
NGYECLHNATFESNPVQYSPGGSLAGPIADIYMELRTRSENAVLLRASWGSNLLVVGILD
SSVWVEIQTDSSIKSLTLKGLRHVTDGRWHRVNVSMADWKRKSSPWVITVDGITDATSKQ
ERTGSLSFLNKKGALLAVADSFTGCLGAVRLGGIYLPFADDHKAPQPSQFHIVGKPNVHL
GCSSAPVCDSGPCLNGATCEDLFNKFGCVCDTGWEGELCEMDTDDCASQPCVYGSCKDYL
AGYECRCDPGYTGTLCDGDTDECALHPCEHGGTCQDGVNMYTCVCPTDYSGPRCQWDYPP
LQCDTDVQCANDGICRDGLWGANCTCMPGFTGSRCELELDECNSNPCRNGGSCLDRFNMF
VCECPAGYSGPLCDVNKEAHKQGIPWLMVVIPLLCLCVVVLLIGATFMLLTARKKRQSEG
AYSPSAQELAGARLEMDSMLKVPPEERLI
NT seq
4410 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagctgggaaaagttcatttgaatttaaagacacttctgctgacaatgatgatgttc
aagtggggaactctctgctcggccacatcagaaaaatgcctgtctgcgccttgccagaac
ggggccacctgtgtggacaccatggatgattatgcttgtatctgtaccagagaaggtgtg
ctgtacatgggcaaaaactgcgatgaactttacgatggctgctcctttgtgccatgtgac
aactgcaccagtaccccgggaacgagggaataccactgcatatgcccggatggactcaca
ggagacaactgcaccgaggaggtggacgagtgtcagagcaacccttgctccgagcctcgt
tctctgtgtgtggaccagctgtacggatacttctgcaggtgtccggctggatacggaggt
caggactgcaggacgcatgtgaccgactgcatcgataaaccttgcatgaacaatggtacc
tgcgagctccgaccaaatggctttgagtgccgctgtgcagcagggttcagagggaggacc
tgtgaggaagacgtgaatgagtgtttatcggagccctgtcagaacggcgccatctgtatc
gacggagtggcagagtaccattgtttctgtgtgcccggctttcagggccacaactgtgaa
atagacattaatgagtgtgcttctcagccatgtgagaacaatgctacctgcatcaacgag
aaggaccactatgaatgtgagtgcatggtgggcttcacaggagtcaactgtgaaactgaa
ttagacgagtgcgactcccatccctgccaaaatggagccacctgccatgatttgactgga
atgtactcttgtgagtgcctggttgggtttgatggtgtcaactgtgaggttgatgtagat
gagtgtgccagccagccctgtcagaatggagccttctgccatgacatggtaaacagctat
gaatgtgactgcagtgacacagggtttgagggcgaacactgtgaagtggatattgccgag
tgtgcctcagatccctgccagcatggtgccacgtgtatagaagaagtcaacggatatgtt
tgtctttgttggccaggttatgaaggagcaaattgtgaagttgacattgatgagtgtgct
gagcagccctgtcagaacggtggcgagtgttttgagcgctcagatccttctcactgggag
ctggactgggagctcaggttttcagacgcagccggctacatctgccagtgtcagggaggt
tttgcaggagaaaactgttccatcaatatagatgaatgtgaatctgaaccatgtcagaac
ggaggcgcttgtgaggataaagtcaatggctatgtctgtgtgtgccctattggattctta
ggtgagctgtgtgagttgaacattgatgaatgcgagagccagccctgtcaaaatggtggc
tggtgtgaagatggcagaggatcgtacacctgtcactgtcctgaagctgagcctggcgac
cttccattgggaggtgaccactgtgaggttaaactctacgggtgtgttggccacaaatgc
cagaatggagccagctgtcttccaactttggaagagggaaagcacagccacacgtgttta
tgtccgcatggcttctacaatgaacaatgctccaccagaacaacgttctcactgtccacc
cctgggttcattcatatccagattgctttcaaagaaaaagtccgcagggaggtggagcac
cgtggtcaccaaggtttggggttgcagcttcgcttccggacaaccttacccaatatgttg
atcttctacagaggagatctggataactatcttttcctggagattgttaacggtggtctt
catgcaaaagctttttctgaagagtctgaattggatgttacatttgctggcctggtgagt
gatggagcctggagggatgttcatgtgtttttggataacggaagtctattcttgacccta
aagggtcctgactgtgacagagatggatgcacagtcaatgatggtgatgatggggaacct
cctttccagccctctcaagccttcactgatgtttacatagggggagcaccaaattacctt
ttggagctctctttaagtggtgcaggattccttggatgtatcgaagaccttatgattgac
tcgaaacctatcctaccccaatcacttccagaggatcaggattttgagttgggctgttcc
aagacggagtggtgtaaaccagatccctgtaatgggcacggccactgtgtggatctgtgg
actagctaccagtgtgactgtttccgtcccttccatggggagagctgctctgaagaatat
ctttcatggacttacagccacgaggacacagtgagttttagctcctatgatttggaagag
agccatggaagtaacttcagagtgtcgtttttgctgaagtccttaaagccggatgggctg
ctgttccagctgagaagaccccatgcagaagatgagggggaggcctacttttccatctac
ctgaggatggggagggtttttgtcagctctctgcctgacagctccccgctgacagctcct
gtgtttgtgaccactggggagaagcagcttctctctgtggaagtcaaacacacacatgtg
atgttcgatcatgcaggactgaactacggaataggagagatccctgaggtggctgtccgg
agcggagataaggcttatgttggagggcttccagaaggctgggacgctgctgagtggggg
gggcattttaaaggctgcctccaggactttcgtctagacgatgcacatttggatccgggt
ggctggagcagccctgatgaaatagtttatatatcaagtgaaactggaaatttgaaggag
ggctgcatcagtgatgatgcctgcaagaccaaaccatgtcagaatggaggggagtgcacc
gtcaccttcaacgacttcacctgttcttgttcggaggaatacacagggaagaactgccaa
acacgagtttggtgtgtcagcaatccatgcgcccacggcggcttgtgcgtggaccttcct
aacggatatgaatgtttgcacaacgccacgtttgagagcaacccagtgcagtacagtcct
ggaggctccctggctggacccatcgctgacatctacatggagctgcggacccgatcagag
aacgctgtgctcctgagggcctcctggggctccaatctgctggtggtgggcatcctggat
tcctcagtctgggtggagatccagacggacagcagcatcaagtcgctgacccttaaagga
ctccgtcacgtgactgacggacgctggcaccgcgtcaacgtctccatggcagactggaag
cgcaaatcctccccctgggtcatcactgtcgatggaatcacagatgccaccagcaaacaa
gagcgcacaggaagcctgagcttcctcaacaagaaaggagcgttgttggctgttgcggac
agcttcactggctgtttgggtgcagtgaggcttggcgggatttatctcccctttgcagat
gaccataaagctccgcagccctctcagtttcacatagttggaaaacccaacgtgcatctg
ggctgcagcagcgcaccggtttgcgattctggtccctgtctgaacggagccacgtgtgaa
gacttgttcaataaatttggttgtgtgtgtgacacgggttgggagggagagctgtgtgag
atggacaccgacgactgcgcatctcagccctgtgtctacggcagctgcaaggactacctg
gctggctatgagtgccgctgtgaccccggttacaccggaacactgtgtgacggagatact
gacgagtgtgctcttcatccctgtgaacatggaggaacctgtcaggatggggttaacatg
tacacctgtgtgtgccccacggactacagcggcccccgctgccagtgggactatcctcca
ttacaatgtgacacagatgtccaatgtgcaaacgatggaatatgcagagatgggctctgg
ggagctaactgcacatgcatgccaggtttcacaggcagcaggtgtgaactggagcttgat
gaatgtaactccaacccttgtcggaatggtggctcctgtttggatcgcttcaacatgttt
gtatgtgaatgcccggcgggatacagcggcccgctctgtgatgtcaacaaggaggcccat
aaacaggggatcccgtggctgatggtggttatcccgctgctctgcctctgtgtggtggtc
ctgctcatcggcgccaccttcatgctgctcacagccaggaagaagcgccagtcagagggg
gcttacagccccagcgctcaggagctggccggagcccggctggagatggacagcatgctg
aaggtcccaccagaggagcgactcatctga
DBGET
integrated database retrieval system
