Xenorhabdus griffiniae: QL128_04925
Help
Entry
QL128_04925 CDS
T09400
Name
(GenBank) autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein
Organism
xgr
Xenorhabdus griffiniae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PATR
Autotransporter
AC_1
Pertactin
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WMV73378
LinkDB
All DBs
Position
1094430..1100057
Genome browser
AA seq
1875 aa
AA seq
DB search
MKIYERIVLRIALRVVLFISGMNVNAIAVASSCGPSISDAETEPCNLSSGDNLIINKGAS
INAPKGLAHGFDHYGLKYSAVNVGENNNLASKTLVGNIENNGTLQGSSGVTVTYTGSVEK
LLNHGTISGGVSGAVWVSGRINTLDNDGSINASNDSNSLNAIQIQPASGPSDDGKYGFID
TIKNREKGSLCKGMSHCTPSIDGISVETATLKTLDNYGILKSQKNNILSNLATFDIDVGG
NVGTFNNNGTVTGLYHGVLIRGGGYLENLNNNSGSKGITADQDAIQVTGQGMAELDINPQ
IRPSKIKQITNASLLYGKKNGIHIDDKGVIDTITNLDGGVIKGDQFSIKNNGTITNDIQN
SGAIGGNVELGSASLYMSGPHATLEGNVSGAKNSIVTIGGKGVTTENLDLTYIHHMNIGK
VSILSGSTLRLGDGHKTGSVSSNIDNQGNLYFNPSDKAIYDHIISGTGAVHQMGSSTTIL
TGANPYTGETKIESGTLQLGDKGTAGSIDKTSKVTIGQDGVLAFDRTNPTLFAVDIEGDG
SLRQQGIGDLTLTGNVTTGKPITVTSGKLRFGDGNTIGKLSLAGIDNKGAVVVAGTKNSV
VTLDGEISGTGTLEIAGGKAIITSDSNYSGQTSIGNGATLQLGHGGTTGNLTKSDILNKG
TLALNLSGTSNFDGVISGSGHIDKIGAGVTRLSSDSLAFTGSTRVESGTLVVDGQLGTTT
STFNVKNGGEVNGTGIIGGTATIESGGHLTGKQGDTLTFSKDLILNSGANVDISLGAKGV
SAPALFDVHGDLTLAGTLNVTDLGGLAAGEYDIFHYGGTLTDNGMTLTGGKPDSFSLGTN
RNHEVHLINTGGMILNYWDGADISKHNNNAIDGGDGIWQVGGNDNWTSKTGDSNASWKNT
DQFAIFSGTAGTVQVDNSGGNVTVNGMQFSADGYKITGASLTLENDKTGSAKIRVGTGNK
STAGRVATIESTLTGSATLETTDDGTLVLKGENNYTGGTKVTRGVLQIGDGGTQGSISGD
VVTGSKGTLAFDRSDAVTFGGNITGEGKLIQNGKGTLALTGTNAHSGGTTVTQGVLQIGD
GGTQGSISGDVVTGSKGTLAFDRSDAVTFGGNITGEGKLIQNGKGTLALTGTNTHSGGTT
VTQGVLQLGDGGTQGSISGDVVTGSKGTLAFDRANAVTFGGNITGEGKLIQNGKGTLALT
GTNAHSGGTTVTQGVLQLGDGGTQGSISGDVVTGSKGVLAFDRADAVTFGGNITGEGKLI
QKGKGTLALTGTNIHSGGTVIRHGILQIGDGHNSGTLTGLVESGEGTKLVFNRADQMAFS
GSLKGQGQMVQAGNGITLLTGINNYTGSTEVQKGTLRQGSEGAFSADSSYTIGQHGKLDM
GGFNTTISALNNSGTVLAGGDDKAVGRTLVITGNYSGNNGTVSLSTVLEGDNSKTDRLVV
NGSTSGTTHLMIKNVGGAGAPTKEGIKVVEVKGTSDGTFSLVGDYSYKGEPAVVVGAYAY
RLHKNGIDNLDGNWYLRSSLTSPKPNPDPLPKPQQLYHAGVSVYEAYGRVLQTLNMPESL
HGRVGGREDKLRGVNSFRTTADEGSTDDRINPSLSNGTWGRMTASYGRLSPRITTSGAGD
ITYNMARAQIGIDGRFYENDHGSVVGGGFLQYSNINANVGSVHGEGKIRANGYTIGATGT
WYGNNGFYLDGLTQLTYFENDLDSKTASRQLGNNKSALGYALSLEAGQRFDLTPKWSLTP
QVQLVHSAISMNDFHDTFGAKIRFDQSRNMKLRMGATIDYSQKWHDDQGKAEKAANLYGL
FNLRQELLGRNDAVDVANVAFHGGNDRTWGETGIGGSYSWKDNQSVVYGQTSVNTSLNNF
DSYELSAKIGLRVTW
NT seq
5628 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagatatacgaacgcattgtattgcgaatagcccttagagtggttttatttatttct
ggaatgaatgttaatgcaatagcggttgcatcatcatgtggtccttcaatttctgatgct
gagacagaaccctgtaatctgtcaagtggtgataatcttattatcaataaaggtgcatcg
attaatgcccctaaagggttagcacatggatttgatcattacggtctaaaatacagtgca
gttaatgtcggagagaacaataatctggcatcaaaaactttagttggtaacattgagaat
aatggaactttgcagggatctagtggagtcacagtaacttacactggttctgttgaaaag
ctactcaatcacggaacaataagtggaggagtgtctggagccgtttgggtttctggtcga
ataaacacgttagataatgatggttcaattaatgccagcaatgactctaactcattgaat
gcaatacaaatacaacctgcgagtggcccatctgatgatggtaaatatggattcatagat
accatcaaaaatcgggagaaaggatcattatgtaaaggaatgtcgcattgtacgccatct
attgatggaatatctgttgaaactgcaacacttaagacactcgataattatgggatactg
aaatctcagaaaaataacattctatctaatctcgcaacgtttgatatcgatgttggcggt
aatgttggcactttcaataataatgggacagtaactggcctctatcacggcgttctgatt
cgaggtgggggatacctcgaaaacctgaataataactccgggagtaaagggatcacggct
gaccaggacgcaattcaggtcactgggcagggtatggctgaattggatattaatccccag
atcaggccgtctaaaattaaacaaattaccaatgcttccttgttatatggaaagaaaaat
ggaattcatatcgacgataaaggcgttattgataccatcacgaatttggatgggggtgta
ataaagggagaccaattctctataaagaataatggcaccattactaacgatattcagaat
tcaggtgcaattggtggcaatgtagagcttggcagtgccagcctttatatgtctggtcca
catgcaaccttggagggcaatgtgtctggggcgaaaaattcaattgtcactataggggga
aaaggagttacaacggaaaatctggatcttacctatatccaccatatgaatattggcaag
gtcagtatattatccggcagcacgttgcgtctgggtgacggacataaaacaggaagtgtt
tccagtaatattgataatcagggaaatctttatttcaatcctagtgataaagcgatttat
gaccacattatcagcggaacaggtgctgttcaccaaatgggtagcagtacaaccattttg
acgggggcaaacccctataccggtgagacaaaaatcgaatcgggtactttgcaacttggt
gataaaggaacagcgggaagcattgataagacttccaaagtgacaatcgggcaggacggt
gtactggccttcgaccgaacaaatcccactctctttgccgttgatattgaaggcgacggt
tcccttcgccaacagggtataggtgatttaactctgaccggtaatgtgaccacgggtaaa
ccgatcacagtgacatcaggcaaattgcggtttggtgatggcaacactataggcaaactc
tcgctcgccggaatcgacaacaaaggcgcggttgtcgttgccggtacgaagaacagtgtg
gtgacactcgatggtgagataagcgggacaggcactttggagatcgccggcggcaaagct
atcataaccagtgacagcaactactcgggccagactagcattggcaatggcgcaacgtta
cagctcggtcatggtggaacgaccggaaacctgaccaaaagcgatatcttaaacaaaggc
actctggcactcaatttgagtggaacaagcaactttgatggtgttatttctggaagtggt
catattgataaaattggcgctggcgtaacgaggctaagttcggattccttggcttttaca
ggatcaacgcgtgttgaaagtgggactcttgtcgttgacggccagctgggcacaacaacc
tcgaccttcaatgttaaaaatgggggagaggttaatggtacgggcatcattggcggcacg
gcaacgatcgaaagcggcggtcaccttacaggcaaacaaggtgatactctgacatttagc
aaagatcttattctcaatagcggcgcaaatgtggatatttcgctcggggcaaagggtgtc
tccgcgccggcattatttgatgttcatggtgatctgacactggcaggaacgcttaatgtc
acggatcttggcggattagcagcaggtgaatacgatatatttcactatggcggcacctta
accgataacggaatgacgctcactggtggaaaaccggactcattctctctcggtacaaat
agaaaccatgaagtccatctcatcaatactggcggcatgatcctgaattattgggatggt
gctgacatcagtaaacacaacaataatgccattgatggtggtgatggtatttggcaggtc
ggtggaaatgataactggacgtcaaaaacaggagattccaatgccagttggaaaaacact
gaccagtttgccattttctcagggaccgcagggactgtgcaggtagataatagcggcggc
aatgtcactgtcaatggtatgcagtttagcgccgatggttacaaaatcactggggcttcc
ctgactttagaaaatgataaaacaggcagtgccaaaattcgtgttggaacgggtaataag
tcaactgctggtagggttgccacgattgaatcaaccctgacgggttcggctacacttgag
acaacggatgatggtacgttggttttgaaaggtgagaataattataccggcggcacgaaa
gtgacgcggggtgttctccagataggggacggtggcacccagggcagcatttccggtgat
gtggtcacaggcagtaaagggacgctggcttttgaccgctcggatgccgtgacgtttggc
ggcaatatcaccggcgaaggcaaacttattcaaaacggtaaagggacgctggcgcttacc
ggcacgaatgctcattcgggcggcacgacagtgacgcagggtgtcctccagataggggac
ggtggcacccagggcagcatttccggtgatgtggtcacaggcagtaaagggacgctggct
tttgaccgctcggatgccgtgacgtttggcggcaatatcaccggcgaaggcaaacttatt
caaaacggtaaagggacgctggcgcttaccggcacgaatacgcattcgggtggcacgaca
gtgacgcagggtgtcctccagctaggtgatggcggcacccagggcagtatttccggtgat
gtggtcacaggcagtaaagggacgctggcttttgaccgcgcaaatgctgtgacatttggc
ggcaatatcaccggcgaaggcaaacttattcaaaacggtaaagggacgctggcgcttacc
ggcacgaatgctcattcgggcggcacaacagtgacgcagggtgtcctccagctaggtgac
ggtggcacccagggcagtatttccggtgatgtggtcacaggcagtaaaggggtgctggct
tttgaccgcgcagatgcggtgacatttggcggcaatatcactggcgagggcaaacttatt
caaaagggtaaagggacgctggcgcttaccggcacgaatatccattctggtggtacggta
attcgtcatggcattttgcaaatcggtgatggacataacagcggaacccttactggattg
gtcgaaagtggggaaggtacgaaactggttttcaaccgtgctgatcaaatggcattttcc
ggttccctaaaagggcaagggcaaatggtgcaggctggtaacggtataacccttctgacc
ggcattaacaactatacaggctcgacggaagtacagaaagggacgcttcgccaaggatca
gaaggggctttcagtgcagattcgtcttatacaatcgggcagcatggtaagcttgatatg
ggcggatttaatacgactatttccgctttgaataacagtggcacagtcttggcaggcgga
gatgacaaagccgtagggcgtacattggtgatcacaggtaactatagcggcaataacggt
acagtgagtttatcgaccgtgttggaaggcgataactcaaagactgacagactggtggtg
aacggcagcacatccgggacaactcatctcatgatcaaaaatgtcggcggcgcgggtgcg
ccgacgaaggaaggcatcaaggttgttgaggtgaaaggcacatcggacggtactttcagt
ttggttggtgattatagctataagggagagccagccgttgtggttggtgcctatgcttac
cggcttcataagaatggtattgataatttggatggaaattggtacctacgctcgtcgctg
accagtccaaaacccaacccagatcctctaccaaagccacaacaactctatcatgctggc
gttagcgtttacgaggcttatggacgagttttacagaccctgaatatgccagagtctttg
catggacgagttggcgggcgtgaggacaaactgcggggtgtgaatagtttcaggaccact
gctgacgagggtagcacagacgatagaataaacccatcattgtccaatggcacatgggga
cggatgacagcttcttacggcagattatctccccgtatcaccacatctggagctggcgat
attacctataacatggctcgtgctcaaatcggcatagacggccgcttttatgaaaatgac
cacggctcagtggttggtggtggtttcctgcaatattcgaatattaatgcaaacgtgggc
tccgtgcacggtgaaggtaaaatccgtgcgaatggttacacgataggtgcgacaggtaca
tggtacggcaataatgggttttatctggatggtttgactcagcttacctactttgaaaat
gatctggattcaaagacggccagtcggcaactggggaataataagtccgctctgggctat
gcgttgagtctggaagcagggcaacggtttgacttgaccccaaaatggtcgctgactccg
caagtacagcttgtgcattcagccatcagcatgaatgacttccatgacacatttggagcc
aaaatccgctttgatcaaagcaggaatatgaaattgcgtatgggtgcgacgatagactac
agccaaaagtggcacgatgatcagggcaaggctgaaaaagccgctaatctttacggcctg
ttcaatcttcgccaagagctgctggggcgtaatgacgcggttgatgttgcaaatgttgcc
ttccacggggggaatgaccgcacatggggtgaaacaggaatcgggggttcctacagttgg
aaggataaccagtctgtcgtctatggtcagacttctgtcaacaccagcctgaataatttt
gacagctatgaactgagtgcaaaaattgggctaagggtgacgtggtaa
DBGET
integrated database retrieval system