Zunongwangia profunda: ZPR_0351
Help
Entry
ZPR_0351 CDS
T01216
Name
(GenBank) tonB-dependent Receptor Plug domain protein
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
zpr
Zunongwangia profunda
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
zpr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
zpr02000
]
ZPR_0351
Transporters [BR:
zpr02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
ZPR_0351
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
EF-hand_5
EF-hand_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADF50710
UniProt:
D5BDW9
LinkDB
All DBs
Position
355952..359110
Genome browser
AA seq
1052 aa
AA seq
DB search
MISDKMIKKYVQEGKIYFPAIEFIAKVKLAFLFVFFLGLLSKSSEISALNLQESRIDITG
TVVDSESVPLPGVNILVKGTSKGVTTDFDGNFSIEDVPEDAVLVFGFLGFDTQEVPVNSR
TIIKVVMEAAIGALDEVMIVGYGGTVKRSDVTGSVSQVEVEQLKDIPGGSVESLLQGRVA
GLQITTSSQAPGAGASVRIRGGSSLRGSNSPLLVVDGFPIGDAGNLQQINPADIESIEIL
KDASASAIYGSRGANGVILVTTRNPKNGKTVINVRQQTTVSQFTSELNLWRNPVLLAQLS
NESRINGGFPPLYIGEVASTGLYYPSVQELQNGDWPHNVRWDDIVFRDTPINNSTTIDVS
SSNEKTNFSFSGNYFTEQGVYIEDDYSKFNYNLNVDHKLYDNFRITFSSIGSKGKRNNNG
GLAYWRSPIIPVYDENGDYYLTNNNDFNHPIALTENRVNKNKTIDFLSFLGLEWDIIPSL
KLTSRLNYKFGNSISDQYFPKTYTEAGEFNNGVASIGNYQAETIISETFANYNKTFGVHK
LGVTAGFSYQNDVIRTSNLGASDFVNEVLQNENLGAGNPERNTVGNNLIETELVSGIFRV
NYEFREKYLFTFTSRADGSSKFGENNKWAIFPSGAIGWKAGEENFIKELEIFDLLKFRAS
YGISGNQGISPYQTLSRYGVSEYYNNGNWVTVIGPGYEVGRTGQGGIEVLWGGIPNPDLK
WETTAQVDFGVDMGFFNDRLQVIFDYYEKHTDDLLQERILPISSGFDRMWVNEGSIANKG
IELTLDGTLIQSNDFTLGATAIFYRNRNEVTGLGSTTESGNLIDPNTGMEFRFSGNSLAM
FRAFPNLLAVGQPVNVFYGYKTDGIVQNLEEGVSAGLEGDLAQPGEFKYVDVNGDGVISV
DDRTIIGDPNPDFTASFNLSLNYKKFDASIFFNGVFGNDVLNTQSFNQPSNQPLRWTPDN
PTNSFPSLRDGRQVEFSDWWIEDGSFVRIQNLNLGYSFEIDSLVSARVFVNATNLYTFTK
FDGYDPEVGGDGIYWGGYPRLRQGTIGLTLTF
NT seq
3159 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatttctgataaaatgataaaaaaatatgttcaggagggaaaaatttattttcctgca
attgagtttatagcaaaagtgaagcttgcttttttgtttgttttctttttaggtcttttg
agtaaatcttcagagatctcggctttaaacttgcaggagagccgtattgacataactgga
acggttgtagattctgaatcggttccattgccaggagtaaatatacttgtaaagggaaca
agtaagggggtaaccacagattttgacggaaatttttctattgaagatgtgcctgaagat
gctgttctagtatttggtttcttgggatttgatacgcaagaggttcctgtaaattctagg
acaattattaaggttgttatggaagcagcaattggagctttggatgaggtgatgattgtg
gggtatggaggtactgttaagcgtagtgatgttacaggttctgtttctcaggttgaggta
gagcaattaaaagacatacctggtggatcggtcgaatctcttcttcaggggcgggtagct
ggacttcaaattacaacttcatctcaggctccaggtgcaggggcttctgtaaggatccga
ggtgggagttcacttcgcggatctaattctccactcttggtagttgatgggtttcccatt
ggagatgcaggtaaccttcaacaaataaatcctgcagatattgagtctatcgaaatttta
aaagatgcttctgcatctgctatttatggttctcgaggtgccaacggtgtaattcttgtt
actactcggaatccaaaaaatggtaaaactgttataaatgttcgtcaacaaaccactgtt
tcccaatttacatctgagctgaacctttggagaaatcctgttttattagctcagcttagc
aatgaatcgagaataaatggaggtttccctcctttatatattggagaggtcgcttcaacg
ggtctttattatccttcagttcaggaattacaaaatggtgattggccgcataacgtaaga
tgggatgacatagtttttagagatactcctattaacaatagcaccacaattgacgtttca
agttcaaatgagaaaacgaattttagctttagcggtaattattttacagagcagggggta
tatatagaagatgattattcaaaatttaattataacctgaatgtagatcataaattgtac
gataatttcaggattaccttttcaagtattggttctaaaggtaaacgaaacaacaatggc
ggattagcttattggagaagtcctattataccagtttatgatgaaaatggagattattat
cttactaataacaatgattttaatcatccaatagcattaacagaaaatagggtgaataaa
aataaaaccattgattttctaagctttttgggactagaatgggacattattccttctctt
aaactcacttcaagattgaattataaattcggaaactcaatttcagatcagtattttcct
aagacatataccgaggcaggtgaatttaataacggtgttgcatctatcggaaactatcag
gcagagactattatttcagaaacattcgccaactacaacaaaacattcggagtacacaaa
ttaggcgtcacagcaggattttcgtatcaaaatgatgttatccgaacttccaatttagga
gccagcgattttgttaatgaagttcttcaaaatgaaaatttaggtgcaggaaaccctgaa
agaaatactgttggaaataaccttatagagacagaactggtctctggtatttttagagtg
aattatgaattcagggagaaataccttttcacatttacctccagagctgacggctcttct
aaattcggagaaaataataaatgggctattttcccatcaggagcaattggctggaaagct
ggtgaagagaattttattaaggaattagagatttttgacctactaaagttcagagctagt
tatggaatttccggaaatcaaggaatttctccatatcaaaccttaagtcgctatggggtg
agcgaatattacaacaatggaaactgggttaccgtaatagggccaggttatgaggttgga
agaacaggacaaggaggaatagaagtattatggggaggaattccaaatcctgatctaaaa
tgggaaaccactgcacaagttgattttggtgttgacatgggcttttttaacgatcggcta
caggtaatttttgactactatgaaaaacatactgatgatctccttcaggaaagaatttta
cctatctcgtcggggtttgatagaatgtgggtgaatgaaggttcaatagcaaacaaagga
atagaattgacacttgacggaactttaatacaaagcaatgattttactctaggtgccacc
gctattttttacagaaaccgtaatgaagttaccggtttgggtagcaccacagaatccgga
aatttaattgatcctaatacaggaatggaatttagattttcagggaatagcttagcgatg
tttagagcctttccgaatcttttagcagtcggccagccggtaaatgtattctatggctat
aaaaccgatggaattgttcagaatttagaagaaggggtttcagccgggttggaaggagat
ttggcacaaccaggagagtttaaatatgtagatgttaatggtgatggtgtgatttcggtt
gatgatcgaacaatcattggagatcccaacccggattttacggctagttttaatttaagt
ctaaattataaaaagtttgatgcaagcattttctttaatggagtttttggaaatgacgtc
ctgaatacgcagtcttttaatcaacctagtaaccagccattacgttggactccagataat
ccaactaatagttttccaagtttaagagacgggcgtcaagtagaattttctgattggtgg
atagaagatggctcttttgttcgcatccaaaacttaaacctaggatattcttttgagatt
gattctttggtatcagcacgtgtattcgtgaacgcaactaacctttacacctttacaaaa
tttgatggttatgatcctgaagttgggggtgatggtatttactggggaggttatcccagg
ttgagacaaggtacaataggtttgacattaacattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
