KEGG   ORTHOLOGY: K14238
Entry
K14238            RNA       KO                                     

Name
tRNA-Sec
Definition
tRNA Sec
Pathway
ko00970  Aminoacyl-tRNA biosynthesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   00970 Aminoacyl-tRNA biosynthesis
    K14238  tRNA-Sec; tRNA Sec
 09180 Brite Hierarchies
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K14238  tRNA-Sec; tRNA Sec
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
 Transfer RNA
  K14238  tRNA-Sec; tRNA Sec
Genes
AQU: tRNA-Trp
CCP: ChcroMt42(trnW(uca))
SCE: tW_UCA_Q(tW(UCA)Q)
AGO: AGOS_ErgofMt14
KLA: KllafMt19(trnW)
VPO: VapofMt14(tRNA-Trp)
CGR: CaglfMt20
DHA: tRNA-Trp
CAL: CaalfMt32
YLI: YalifMt51
NCR: NCU16209
PAN: PoanfMt77(trnW(uca))
MTM: MYCTH_t46
FGR: GizefMt43
ANG: Asnift08
PNO: SNOGt23
ECO: b3658(selC)
ECJ: JWR0081(selC)
ECD: ECDH10B_3840(selC)
EBW: BWG_4183(selC)
ECOK: ECMDS42_3092(selC)
ECE: Z5086(selC)
ECS: ECs5538(selC)
EOI: ECO111_tRNA081(serC)
EOJ: ECO26_tRNA086(serC)
EOH: ECO103_tRNA83(serC)
ECOO: ECRM13514_4668(selC)
ECOH: ECRM13516_4448(selC)
ECG: E2348C_tRNA_68(selC)
ELH: tRNA-Sec
ECP: ECP_3764
ECOS: tRNA-Sec
EOC: CE10_4226
EBR: ECB_t00063(selC)
EBL: ECD_t00063(selC)
EBE: B21_04472(selC)
ECI: UTI89_C4211(selC)
ECC: c5576(selC)
ELO: tRNA-Sec
EKF: KO11_t23697(selC)
EAB: ECABU_c41250(trnU)
EDJ: ECDH1ME8569_t0062(selC)
ELW: ECW_t3935(selC)
ELL: WFL_t23340(selC)
ELC: i14_t032
ELD: i02_t032
ELF: LF82_s2112(selC)
ECOJ: P423_20335
STY: STYt069
STT: t3768
STM: STM3751(selC)
SEO: STM14_4517(selC)
SEV: tRNA-Sec
SEY: tRNA-Sec
SEJ: STMUK_3737(selC)
SENI: CY43_19460
SPT: SPA3602(selC)
SEK: tRNA-Sec(selC)
SEI: SPC_t059
SHB: SU5_t87
SENS: Q786_18345
SED: SeD_A4138
SEG: tRNA-Sec
SEL: SPUL_t063
SET: tRNA-Sec
SENA: AU38_18240
SENO: AU37_18430
SENV: AU39_18435
SENQ: AU40_20535
SENL: IY59_18875
SEEP: I137_18295
SENB: BN855_t059
SENE: IA1_18235
SBG: tRNA-SeC_p_(tRNA-SeC(p))
SBZ: A464_R139
SFL: SF4518
SFX: S4071(selC)
SFV: SFV_3871
SFE: SFxv_5261
SSN: SSON_3745
SBO: SBO_3719
SDY: SDY_4579
ECLX: LI66_00510
ECLY: LI62_00925
ECLZ: LI64_00590
CSK: ES15_3931
CTU: CTU_R01040(tRNA)
KPN: KPN_04020
KPU: KP1_6124
KPP: A79E_0093
KPR: tRNA-Sec(tRNA-Sec)
KPJ: N559_t001
KPNU: LI86_00460
KPE: KPK_0076
KOE: A225_5702
EAR: tRNA-Sec
CRO: ROD_t74
CAMA: F384_19880
EBT: EBL_c00610(trnU)
EBF: D782_0055
YPE: YPt_70
YPK: yt073
YPH: YPC_4546
YPA: YPA_r104
YPN: YPN_r108
YPM: YP_t70
YPD: YPD4_t69
YPX: YPD8_t73
YPW: CH59_1986
YPJ: CH55_2712
YPV: BZ15_3672
YPL: CH46_1020
YPS: YPTB_RNA_54(tRNA-SeC(p)1)
YPO: BZ17_2695
YPY: YPK_R0001
YPQ: DJ40_2520
YPU: BZ21_3243
YPR: BZ20_2218
YPC: BZ23_3517
YPF: BZ19_3355
YEN: YEt082(selC)
YEW: CH47_3613
YET: CH48_1579
YAL: AT01_2577
YFR: AW19_3351
YIN: CH53_1660
YKR: CH54_2439
YRO: CH64_2496
SRL: SOD_c00660(trnU)
SMAF: D781_0076
EBI: tRNA-Sec(tRNA-SeC(p))
PLU: tRNA-Sec(tRNA-SeC(p))
PAY: tRNA-Sec
PMR: tRNA-Sec
PSX: DR96_1201
ETR: ETAE_t090
ETD: ETAF_3322(trnU)
ETE: ETEE_t035
HIT: NTHIT0036
HIE: R2846_1623(trnU)
HIZ: R2866_1766(trnU)
HIK: HifGL_t2
HIA: H733_1782
HAP: HAPS_1588
HPAS: JL26_08915
HPAK: JT17_07470
PMP: Pmu_15690
PMUL: DR93_171
MHX: MHH_c06060(trnU)
MHAE: F382_07775
MHAM: J450_07255
MHAO: J451_08195
MHAL: N220_00295
MHAQ: WC39_00015
MHAY: VK67_00015
APL: APL_2059
APJ: APJL_T063
XCP: XCR_t001
SMZ: SMD_3452(tRNA-seC)
DKO: I596_1986
PPR: PBPRB1541(tRNA-Sec_(TCA))
PAE: PA4802.1
PAEV: N297_4969
PAEI: N296_4969
PAEP: PA1S_26105
PAEM: U769_26360
PAEL: T223_26555
PAEG: AI22_07900
PAEC: M802_4967
PAEO: M801_4834
PPU: PP_t75
PPUT: L483_02605
PMON: X969_00895
PMOT: X970_00885
PSTT: CH92_00895
SON: SO_t002
TNI: TVNIR_t04
AHA: AHA_2507
ASA: ASA_1807(trnU)
AVR: B565_t054
BMAI: DM57_07590
BCJ: tRNA-Sec(BCAMr1023)
BCT: GEM_4772
BDL: AK34_4439
BUB: BW23_4752
BGU: KS03_5045
BGP: BGL_2c17740(trnU)
BPLA: bpln_2gt05
BFN: OI25_5113
PPNO: DA70_08280
PPNM: LV28_22365
PPUL: RO07_16770
PSPU: NA29_20410
PAPI: SG18_15595
BHO: D560_1719
BHM: D558_1710
HYB: Q5W_12450
RGE: RGE_t0120
NDL: NASALF_012(trnW)
CJE: Cjp26(tRNASeC)
CJB: BN148_p26(tRNASeC)
CJU: C8J_t0031
CJM: CJM1_1443
CJS: CJS3_1847
CJEJ: N564_01492
CJEU: N565_01529
CJEN: N755_01531
CJEI: N135_01590
CJQ: UC78_1431
CFV: CFVI03293_1879(selC)
CLA: CLA_0367(selC)
CLR: UPTC16701_0362(selC)
CLM: UPTC16712_0364(selC)
CLQ: UPTC4110_0363(selC)
CLN: UPTC3659_0383(selC)
CLL: CONCH_0367(selC)
CCF: YSQ_01405
CCY: YSS_08000
CCOI: YSU_01420
CCOF: VC76_07410
CAJ: CIG1485E_1721(selC)
CIS: CINS_0351(selC)
CVO: CVOL_0357(selC)
CPEL: CPEL_0370
CHYO: CHH_1443(selC)
CHV: CHELV3228_1735(selC)
CCUN: CCUN_1436
COJ: CORN_0373
CCOR: CCORG_1459(selC)
ABU: Abu_1523
ATP: ATR_0893(selC)
ACRE: ACRYA_1080(selC)
AHS: AHALO_0986(selC)
AMYT: AMYT_1102(selC)
AMAR: AMRN_2006(selC)
ACAA: ACAN_2044
APOC: APORC_1537
HBV: ABIV_1045(selC)
SHAL: SHALO_2611
SULJ: SJPD1_2531
GSU: GSUR016
DEU: DBW_2755
DDE: Dde_R0029
DGG: DGI_0303(trnU)
DFL: DFE_t0058
LIR: LAW_01234
DPS: tRNA-SeC_p_(tRNA-SeC(p))
DSF: UWK_00806
DTO: tRNA-Sec(tRNA-SeC(p))
ADE: Adeh_R0028(tRNA-SeC(p)1)
MXA: MXAN_4472
SME: SMa0022(selC)
OAH: DR92_3638
OCG: OCA5_c28040(trnU)
OCO: OCA4_c28030(trnU)
AZC: AZC_trnSec12(trnSec)
MOR: MOC_t0013
HCI: HCDSEM_062(trnW)
HCC: HCTETUND1_174(trnW)
HCD: HCTETUND2_182(trnW)
HNE: HNE_2487
CPF: CPF_2120
CPR: CPR_1834
CBO: CBOt089(tRNA_SeC(p)(TCA))
CBA: CLB_2999
CBH: CLC_2871
CBY: CLM_3369
CBL: CLK_3901
CBB: CLD_1570
CBI: CLJ_B3231
CBF: CLI_3027
CLJ: CLJU_c27280(trnU1) CLJU_c27690(trnU2)
CLD: CLSPO_c30650(trnU)
EAC: EAL2_c11840(trnU)
STH: STH5472
PTH: PTH_t032
HMO: HM1_0934
AWO: Awo_c08180(trnU)
SAY: TPY_T036
TPZ: Tph_c00510(trnU)
CAD: Curi_c19340(trnU)
MGE: MG_504
MPN: MPNt23
MPM: MPNA_t23
MPJ: MPNE_0476
MPB: C985_0415
MGA: MGA_trna24(trsp)
MGH: MGAH_trna24(trsp)
MGF: MGF_tRNA30(trsp)
MGN: HFMG06NCA_trna24(trnW)
MGS: HFMG95NCA_trna24(trnW)
MGT: HFMG01NYA_trna24(trnW)
MGV: HFMG94VAA_trna24(trnW)
MGW: HFMG01WIA_trna24(trnW)
MGAC: HFMG06CAA_trna24(trnW)
MGAN: HFMG08NCA_trna24(trnW)
MGNC: HFMG96NCA_trna24(trnW)
MGZ: GCW_01310(trnW)
MMYM: MMS_A0756
MML: MLC_6486
MCP: MCAP_0645
MLC: MSB_A0660
MLH: MLEA_006210(tRNA-Sup-1)
MMO: MMOB9100
MHY: tRNA-Trp1
MHJ: MHJ_t15
MHP: MHP7448_t15(MHPtRNA-Trp-2)
MHYO: MHL_3585
MAT: MARTH_R21
MCD: MCRO_0679
MHR: MHR_t008
MHH: MYM_0254
MHS: MOS_364
MHV: Q453_0283
MHA: HF1_t18
MHF: MHF_0250
MSS: MSU_0369
MPF: MPUT_0189
MPV: PRV_02325
MOV: OVS_01180
MGJ: MGM1_1610
MYT: MYE_03270
MHYV: MHSN_02680
MPU: MYPU_TRNA_TRP_2(MYPU_TRNA_TRP_2)
MSY: MS53_t6
MAA: MAG7325
MAL: MAGa8490
MFR: MFE_07740(trnU)
MBH: MMB_t33
UUR: UUt22
UPA: UPA3_0536
MFL: Mflt029
SMIR: SMM_t32
SMIA: P344_06290
MAO: MAP4_t35(trnU)
MAVI: RC58_17400
MAVU: RE97_17435
MAV: MAV_0419
MMI: MMAR_5533(selC)
MMAE: tRNA-Sec-1 tRNA-Sec-2(selC)
MSHG: MSG_00149
MVQ: MYVA_0951
CAR: cauri_t20
CSP: WM42_0405
CPHO: CPHO_07960
CAMG: CAMM_08615
GPO: GPOL_c42360(trnU)
SHY: SHJG_t01
SHO: SHJGH_t1
BLIN: BLSMQ_3909
MPH: MLP_t0030
NDK: I601_3994
PSIM: KR76_07175
SEN: SACE_8034(tRNA-SeC_(p)(TCA))
AMD: AMED_R31
AMM: AMES_R31(tRNA-SeC(p)-TCA)
AMZ: B737_R31
AMQ: AMETH_R52
PSEE: FRP1_20080
MIL: ML5_R0058
ASE: ACPL_8392
ACTN: L083_R43
TRO: trd_0897
ATM: ANT_t0480
BPO: BP951000_0322(tRNA)
AAE: aq_t16
HTH: HTH_t19
DDF: DEFDS_t07(trn_SeC)
CTHI: THC_1032
MJA: MJ_t03
MMP: RNA_50(tRNA-SeC1)
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Reference
PMID:9023104
  Authors
Lowe TM, Eddy SR
  Title
tRNAscan-SE: a program for improved detection of transfer RNA genes in genomic sequence.
  Journal
Nucleic Acids Res 25:955-64 (1997)
DOI:10.1093/nar/25.5.955
  Sequence
[sce:tW_UCA_Q]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system