Arthrobacter citreus: HPK19_06615
Help
Entry
HPK19_06615 CDS
T06606
Symbol
shc
Name
(GenBank) squalene--hopene cyclase
KO
K18115
sporulenol synthase [EC:
4.2.1.137
]
Organism
acit
Arthrobacter citreus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
acit00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09191 Unclassified: metabolism
99980 Enzymes with EC numbers
HPK19_06615 (shc)
Enzymes [BR:
acit01000
]
4. Lyases
4.2 Carbon-oxygen lyases
4.2.1 Hydro-lyases
4.2.1.137 sporulenol synthase
HPK19_06615 (shc)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SQHop_cyclase_C
SQHop_cyclase_N
Prenyltrans
TED_complement
Pec_lyase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QKE72493
LinkDB
All DBs
Position
complement(1281918..1283783)
Genome browser
AA seq
621 aa
AA seq
DB search
MDLDNIVIQNIEERIKRLRNRQEENGSWEFVFEGALLTDSFMILLMKDLGYENNQLIDGI
IDRIINLQHPNGAWKLYEDEKNGNLTATVQAYIALLVSKKYTKDHTSMKKAEKFIRENGG
IKKTHFMLKMILAIHGLIDYPKLFYFPMSYFLLPDKMPLSLFDLSNYARVHLVPMILCIN
KRFKVKLEDDLNIDNLLEDSEMEWFNEERGTFYQFILEEGKKLASYPLYFHQKGYEKAER
FILDRIETNGTFYSYASSTFYMVYALMALGYEVSSSVIQNALQGLLSYATNTDAGLHIQN
SRSKVWDTALLSYAIQEAGYSSNDPSVSKSIHYLISKQQDLIGDWSVHAKNLSPGGWGFS
DVNSFIPDNDDTGAVLRALSRSAMDQPNFQESWLKGVHFLLGLQNGDGGWGAFEKNVTNK
WLTHLPIENAKDAIIDPSTPDLTGRILEFIGNYTSISNDDPIVKKAADWLFKNQKSNGSW
YGRWGICYLYGTWAAITGLRAVGVSKNHEAIKKAEKWLVSIQNVDGGWGESGFSTVKGSY
IPLKYSTPSQTGWAIDALLTIRNKDDEVIKRGINYLVSQNEISNKALSYPTGLGLPGQFY
INYHSYNEIYPLLALAHFKNS
NT seq
1866 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggacctcgataatattgttattcaaaatattgaagagcggatcaaacgtttgagaaat
agacaagaagaaaatggatcatgggaatttgtgtttgaaggagctttattaacagatagc
tttatgattttacttatgaaggatctaggttacgaaaacaatcagttaattgatggaatt
attgatcgtattatcaatcttcaacatccgaatggggcgtggaaattatatgaggatgaa
aaaaatggcaacttaactgcaaccgtacaagcttacatcgctttattagtctcaaaaaag
tatacaaaagaccatacgagtatgaagaaagctgaaaaattcattcgagaaaatggtgga
ataaaaaaaacacattttatgcttaaaatgattcttgccattcacggtttaattgactat
ccaaagttgttttactttccaatgagctattttttattacctgataaaatgccattaagt
ttatttgatttaagtaattatgctagggttcatttagtgcctatgattctatgtattaat
aaacggtttaaagtgaaattagaagatgatctaaatattgataatcttttagaagacagt
gaaatggaatggtttaacgaagagcgggggacattttatcaatttattcttgaagaaggg
aagaagcttgcttcctatcctttatattttcatcaaaaaggctatgaaaaggctgaacga
tttattttagatcggattgaaacaaatggaaccttttatagctatgctagttctacattt
tatatggtttatgctttgatggctttaggatatgaagtttcatcttccgtcattcaaaat
gcactacaaggactcctttcatatgcgacgaatacagatgctggacttcatattcaaaat
tcacgatcaaaagtttgggatactgctttattgtcatatgcaattcaagaagctggttat
tcaagtaatgatcccagtgtttcaaagtctattcattacttaatttctaaacaacaagat
ttgattggtgactggtcagtacacgctaaaaatttaagccctggtggctggggattttct
gatgtgaattcatttataccagataatgatgatacgggtgccgttttgagggcactatca
agaagtgcaatggatcaaccaaactttcaagaaagttggttaaaaggcgttcatttttta
cttggattgcaaaatggcgatggtggttggggagcattcgaaaaaaacgtaacgaataag
tggctaactcatttaccgattgaaaatgcaaaagatgcgattattgatccttctactcct
gatttaacagggcgtatattggagtttattggcaactatacatcaatttctaatgatgac
ccaattgttaaaaaagcagctgattggttgtttaaaaaccagaaatcaaatggtagttgg
tatggtagatggggaatttgttatttatatggtacgtgggcagcaattactggtttaaga
gctgtgggggtttctaaaaatcatgaagcaattaaaaaagctgagaaatggttagtttcg
attcaaaatgtggacggaggttggggagaatcaggattttcaacggttaaaggttcttat
attccattaaagtatagtacacctagtcaaactggctgggcaattgatgccttactgaca
attcgaaataaagatgatgaagtgattaaaagagggattaactatttagtttctcaaaat
gaaatttctaataaggcgctatcatatcctacaggacttggactaccaggtcagttttat
attaattatcatagctataatgaaatctaccctttactagcattagcacactttaaaaat
agttaa
DBGET
integrated database retrieval system
