Amphimedon queenslandica (sponge): 100638010
Help
Entry
100638010 CDS
T02284
Name
(RefSeq) laminin subunit gamma-1-like
Organism
aqu
Amphimedon queenslandica (sponge)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Laminin_EGF
Laminin_B
CREPT
Laminin_II
AAA_lid_12
DUF724
SNARE
COG6_N
DUF211
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100638010
NCBI-ProteinID:
XP_019854276
UniProt:
A0A1X7UHN7
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2092 aa
AA seq
DB search
MYLLTVLLFSSLVLNSSPQCIPSESVTTPSGDLTLGRLLNISSECSGGYCPNGILLPCTS
NSSGLISDDNTDTMWISEVDPDLPVTITLDLTNLMILHDINIQWESPTPSSMILERSSDY
GLNWSVYRYWSTDCSSDFNMSSISVYDTDIMNTTDPICTDTDLADYPGSEVSFSVYSHCF
SDPSYQLVTNVRLSILNVTAATNATNDTDCGAFVAISELSLNGSCHCNGRAENCQPLGTE
TNHTNKVYSGCECASSYKGTHCQQCQDEYYDISSGCTKSCSCNEMGSTNKSCDSVTGQCY
CKTGVTGDKCNETANGYYFRALDHNIAEAEYGQLSMGITGYYPIDTALRYTGKGLVRIPA
TGGTVGLSMTVDKTGPYSVILRYTTTIDIDSVFVSIQSSRNVTQSLDCVNQSQPIPTSYN
STMLTLLSLQGYNPNTRVHCFEEGITYNITVNYYPTTGHEWMLDSVVLSPDQTDYINSLP
IVQMFSTITCLTLIAELENPQYCHPHVFNLSLLFYGEVYECGSPNSIGITGDTCDPYGGS
WGCSSNYTGTLCTDCSNGYYNNTNGRCIECPFLCNSTGSINVACDTDTGSCVCKDNVIGE
ECDSCPSSNHVFSSSGCIDTCNCTYGSCNVTNGDCICPPNVMGDQCESCDDYHYSISDAG
CIACECNPRGSLSLSCDNVTGQCDCKDAAVGTQCNDCPTNGHYKTVGSDQSLCLPCFCFN
HSQTCQPDSSNYIQGNVQSNFTELCPLNMDCTDGWTFNDDNNTFNNPDSLSYTIFGDASP
VFIAPDRYHDDYHLSYGLNIIINIQLTSTSQRIDSFIWINGSGLTIVHKMIVEGNQITVP
LVESYWRLGEDYDSSNTSTPYQFISVLTNITDIRFSAKFTDNMYIEINYFQGFRIQTIDR
RNTSIDPGADYTVGHCECPAGHTGVFCDECMNGYYRPSGVLLDLCIPCNCNGHADSCDPA
TGVCINCTGNTEGDQCQSCSTGYSGTDCSQCDNGYYNESNTCIKCDCNGNTDPSLFPSCN
ASTGQCINCLNNTTGDKCQTCLPGYYGDVINSKPCEPCECNINGTQSVDNPCIPGIPFET
CVCKPFVTGAHCTTCIDGYYGDPINGIDCLQCPCPTEENSHSSSCHEGAGGVVCNNCEDG
YTGDRCEICADGHYGNATIGLCSNCTCNDNFDISLGSSCDKTTGHCSGCTNNTEGTQCQF
CITGYYGNVEMKVPCKSCSCNLNATISGVCDRSTGVCWCKEHVSPDSGCNTCIPGYYGNP
ANGGDCFPCSCNNRSSTCYLGNDGSGICDDCSTGYAGDQCEECSDGYFMEDNGTCSRCNC
NGNIDPALPGLSCNSSTGVCLQCLYNTTGEQCEECSNGYYGNPANGTPCQKCNCSASGTL
RCDTKTGDCICHPNITGPDCSECMDTLWGSPDEGCRPCNCCTNNTKCDKETGQCPCYDIT
LDRTCCDCIHGYYNYSITGCTACDCGMLSESAQCNSTGHCQCLPEGTGTKCDSCQTGFTG
IAPNCTECDDCHFIWSDTLSSLQLNITDLSTRILTILHYYEGYTQSDISSVINNISMTLT
MSEELLMQQSIDTKIFNNITAILTEIINNYTSLMNDISLLNPTIMDANATLRLAEQYIQN
ITSSGYQNYTITEIHPSLVSLNNTLNLLLGQSMNQSLLLEEYRDEVISLMNLVLALQGNA
SMEEEAILNANITSHTAQAMVDSTRSFIKNISVINDTLLDIEEDVRNIEIDINASDTSYT
DLDTDIQMLNNKINNLMTQLNTLSGLSEGLYISAKVLKQQSYNSVVSVGALMASANAAMD
DAQSLIMMINKAQDGVMNSTIKLVESDELATNISSLELPSLSSATELAANINSSIIPDSD
ITDLLTDANNSVVAAMEALEGAMNTSAMVTDLEYKVSNLTNNIKETRRRLESAEQTHNET
NRNIESINTTLREVNETVQSVPDTYTLSETAKDKERDLTQGETVLQAASMNATSLNNAVQ
QILSNVTSEQMLMESIAVNVSSVKDEAMLRVNASMTALNKTDELTESAQQLNNTANTVKL
QRLKSLLAEYQSKVVEAQAVRSKIGQLQNELKTMTADFTEAMERYKRCYKTP
NT seq
6279 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtatcttttgactgttctcttgttttcttctcttgtattaaactcaagtcctcaatgc
attcccagtgagtctgttaccactcccagtggggacctgacactaggtaggctcctgaat
atatcttcagagtgttcaggaggttattgtcctaatgggattctactaccttgtacaagc
aacagttctggcctcattagtgatgataataccgacaccatgtggatatctgaggtcgat
ccagaccttcctgttactataacacttgacctgactaacctcatgattctgcatgacatt
aacatccagtgggagagccctacccctagcagcatgatactggagagatcaagtgattat
gggctcaactggagtgtctatcgctactggtctactgattgtagcagtgattttaacatg
agttcaatatcagtgtatgatactgatataatgaataccactgatccaatatgcactgat
acagatcttgcagattatcctggatcagaagtttccttttctgtctattcccattgtttc
tctgatcccagttaccaattagtcactaacgttagactatcaattcttaatgtcactgca
gctactaatgctactaatgatactgactgtggagcattcgttgctatatctgaactgagt
ctcaatggatcttgtcattgcaatggacgtgctgaaaactgtcaaccattaggaacagaa
actaatcataccaacaaagtgtactcaggttgtgaatgtgcttcaagttataaagggact
cactgtcaacaatgccaagatgagtattatgacattagttctggatgcactaagagttgc
tcatgcaatgaaatgggatccactaataagtcctgtgactctgttactggtcagtgttac
tgtaaaactggagttactggagacaagtgtaatgaaactgcaaatggctactactttaga
gcattggatcacaacattgctgaagctgaatatggccaactatccatgggtatcactggt
tactatcctattgatactgcattacggtatactggtaaaggattagtgagaatccctgct
actggaggaacagtaggtcttagtatgacagttgataagacaggaccttattcagtgata
ctgagatacactactactattgatattgattccgtatttgtatcaattcaaagttcaagg
aatgtaacacaatctcttgattgtgttaatcaatctcagcccattccgacatcatataac
tcaacaatgctaacattactcagtttacaaggctacaatcccaacactcgtgtacactgc
tttgaggaaggaataacttataatataacagttaattattatcctactactgggcatgaa
tggatgctggactcagtagtcttaagtcctgatcaaactgactacattaatagtttgccc
attgttcaaatgttttctactataacttgcttaacattaattgctgaacttgaaaatcct
caatactgtcacccacacgtctttaacctgtctctattattctatggagaagtttacgag
tgtggatcacctaacagtattggcattactggtgatacctgtgatccatatggaggtagt
tggggctgttcatcaaattacactggtactttatgtactgattgttccaatggatactat
aataatactaatggaagatgcatagagtgtccatttctttgcaacagcactggatccatt
aatgttgcatgtgacactgatactggatcatgtgtttgtaaagacaatgtaattggagaa
gaatgtgattcctgcccttcatcgaatcacgtattcagttcctctggttgcattgatact
tgtaactgtacctatggatcttgtaatgttactaatggagattgtatttgtcctcctaat
gttatgggggatcagtgtgaatcttgtgatgattatcattacagcatcagtgatgctggc
tgtatagcttgtgaatgtaatccaagaggtagtctttctctatcttgtgataatgtcact
ggtcagtgtgattgtaaagatgctgctgttgggacacagtgtaatgattgccctaccaat
ggacactataagacagtgggtagtgaccagtctctctgtctgccttgcttctgcttcaac
cattctcaaacctgtcaaccagacagcagtaattacatacagggaaatgtacagtccaat
ttcactgaactttgcccattaaacatggactgtactgatggatggacatttaatgatgat
aataatacattcaataatccagatagtctgtcttataccatatttggtgatgctagtcca
gtgttcatagctcctgatagatatcatgatgattatcacttgtcatatggacttaatatt
ataataaatatacaacttaccagcacttctcaaagaattgattcttttatttggatcaat
gggtctggcctgactatagttcataagatgattgtagaaggaaatcaaataacagtacca
ttggtagagtcttattggagattaggagaagactatgatagcagtaacacatcaacacca
taccagttcatatcagtgttgaccaatatcactgatattaggttcagtgctaaatttact
gataatatgtacattgaaatcaattatttccaaggattcagaatccagacaattgataga
agaaatacttcaatagatccaggagcagattatactgtaggacattgtgagtgtcctgct
ggacacactggagtgttctgtgatgaatgtatgaatgggtactatcgtccatcaggagtg
ctgttggacttgtgcattccatgcaattgtaatggacatgctgacagttgtgatccagca
actggagtatgtataaactgcactggtaacactgaaggggaccaatgccagtcctgtagt
actggctattctggaacagactgcagtcagtgtgacaatggatactataatgagagtaat
acatgcataaagtgtgattgcaatggtaatactgatccatctttattcccttcttgtaat
gcgtccactggtcagtgcataaactgtctcaataatactacaggagataagtgtcagaca
tgtttacctggttactatggagatgtaattaactcaaaaccttgtgaaccttgtgagtgc
aatatcaatggtactcaatcagttgacaatccatgtattcctggcattcctttcgagact
tgtgtgtgtaaaccatttgttactggagcccactgcactacatgtattgatggttactat
ggcgacccgataaatggtatagactgtctccagtgtccttgccccacagaggagaacagt
cacagcagttcctgtcacgagggggctgggggtgtggtttgtaataattgtgaggatggc
tacactggggataggtgtgaaatatgtgctgatggtcactatggaaacgctacaattgga
ttgtgtagtaactgcacctgtaatgataattttgatatatcccttggatcatcatgtgac
aagaccactggtcactgttcaggctgcactaacaacactgaagggacccagtgtcagttc
tgtatcactgggtactatgggaacgttgaaatgaaagtaccttgcaaaagttgttcctgt
aacctcaatgctactatcagtggggtctgtgacaggagcactggtgtctgctggtgtaag
gagcatgtgtctcctgatagcggctgtaacacctgtatccctggttactatggtaacccc
gctaatggaggggactgtttcccttgctcttgcaacaataggagctcaacttgttacctt
ggaaacgatggaagtggtatctgtgacgattgttctacgggttatgctggagaccagtgc
gaagaatgttctgatggatactttatggaggacaatggaacatgcagcagatgcaactgt
aatggtaatattgatccagcgttaccaggactgtcttgtaactcttcaactggagtgtgt
ctccagtgcctctataatactaccggagaacaatgtgaagaatgttccaatggttactat
ggcaacccggcaaatggaacaccatgtcaaaaatgtaactgttctgccagtggtacatta
aggtgtgacactaaaactggagattgtatatgtcatccaaacattactggaccagactgt
agtgagtgtatggatacactgtggggatcacctgatgaaggatgcagaccatgtaactgc
tgtactaataatacgaaatgtgataaagagacaggtcagtgtccttgttatgacattacg
ttagacagaacttgctgtgattgtatccatggttactataattacagtattactggttgt
acagcttgtgattgtggaatgttgtcagaatcagctcaatgtaattcaacgggtcactgt
cagtgtctgcctgaaggaactggaacaaaatgtgattcttgtcaaactgggtttactggt
attgctccaaattgtacggaatgtgatgattgtcatttcatttggtcagacacactgtca
tcattgcagttgaacattactgacctctcaacaaggatactcactatactccattattat
gaaggatacactcagtctgatatcagtagtgtcattaataacattagtatgacactgaca
atgtctgaggaacttctgatgcaacaaagtattgatactaagatatttaataacattaca
gcaatactaactgaaattattaataattatacatcactgatgaatgatattagtctactc
aatccaaccataatggatgctaatgccacactgagactggcagagcaatacatacaaaac
ataacaagttcaggataccagaactacaccattactgagatacatcctagtttagtatca
ctgaacaacacactgaacctactgctgggacaaagcatgaaccaatcacttctattggag
gaatacagagatgaagtgatttcactgatgaacttggtactagcactacagggaaatgct
agtatggaagaagaggctattctcaatgcaaacatcaccagccacactgcacaagcaatg
gtcgatagtacaagatcttttattaagaatatatcagtaattaatgatacactgttggat
attgaagaagatgtgagaaatattgagattgacatcaatgcaagtgatacatcatatact
gatcttgatactgatattcagatgttaaataataaaattaacaacttaatgactcaactg
aacacactatcaggattaagtgagggactctatatatcagctaaagttttaaagcagcaa
tcatacaacagtgtagtatcagtgggtgcattaatggcctctgctaatgcagcaatggat
gatgctcagtcattaataatgatgatcaataaagcacaggatggtgtaatgaactctaca
atcaaactagttgaatctgatgagctggcaacaaacattagctcactagagttaccatca
ctctcttcagcaacagaactggctgctaacataaactccagcataataccggacagtgat
ataacagacctactcactgatgctaataacagcgttgtagcagcaatggaggcattagaa
ggagctatgaatacaagtgcaatggtaactgatcttgagtacaaggtcagtaatttgaca
aacaatattaaagagacaagaagaagattagagtcagcagaacaaactcacaatgagact
aacagaaacattgaatcaatcaacactacattaagagaggttaatgagacagtgcagtca
gttcctgatacatacacacttagtgagactgcaaaagataaagaaagagatttaacacaa
ggagagactgtactacaagctgcatcaatgaatgccactagtttaaataatgctgtacag
caaatattgagcaatgtaaccagtgaacaaatgttgatggagtctattgctgttaatgtg
agttcagtaaaagatgaagcaatgctaagagttaatgctagtatgactgcattgaataaa
actgatgagctcacagagtcagcacaacaactgaacaatacagcaaacactgtgaaacta
caaagacttaaaagtctgttagctgagtatcagtctaaagtggtggaggcacaagctgtt
cgtagtaaaataggacaactacagaatgagctgaagacaatgacagcagattttactgaa
gcaatggaacgatataagagatgctacaaaactccttga
DBGET
integrated database retrieval system