Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-NL: SFBmNL_00469
Help
Entry
SFBmNL_00469 CDS
T03243
Symbol
selB
Name
(GenBank) Selenocysteine-specific translation elongation factor
KO
K03833
selenocysteine-specific elongation factor
Organism
aso
Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-NL
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aso00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03012 Translation factors [BR:
aso03012
]
SFBmNL_00469 (selB)
Translation factors [BR:
aso03012
]
Eukaryotic type
Elongation factors
SFBmNL_00469 (selB)
Prokaryotic type
SFBmNL_00469 (selB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GTP_EFTU
SelB-wing_3
SelB-wing_2
GTP_EFTU_D2
MMR_HSR1
SRPRB
DUF2671
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AID44378
LinkDB
All DBs
Position
461564..463465
Genome browser
AA seq
633 aa
AA seq
DB search
MKNIILGTAGHIDHGKTSLIKCLTNIDTDSLEEEKRRGISINLGFAFFDLPCKIRVGVID
VPGHEKFIKNMIAGSVGIDIVLLVIACDDSIKPQTREHIDILSFLNIDKGIIVLTKRDLV
DDEWYEFIKSEIKNELKGTFLENSVVVGFSSKTRDGYDELVNEIERLIDYDDYKSSDGIF
RMPIDRCFSLSGFGTIVTGTIMSGKISLNESIFIYPSGIECKVRNIQVYEENKKEAFSGQ
RCAINLSNVKKEIKRGDVVSTNASLALSYMIDCRFYSVKNLSKDILNGQRVRFLHGTSEV
MGRIHILDKENIGKNSEAYVQIHLEKPILCLKDDRYVVRMYSPVLTIGGGYIINPLAKRI
KDNNVKYLEEVKIKEKELNEEYLALLIENDKNYIIDIKYICKNYLLLEDEILDKFDILVS
NGILIDFHDGNNRYFIHKNNLDKIYLEIKNILTEYHSKNKFRIGFLKEELRGKLNLKEFK
PKIYMLILNYFEDMGYIKSTSKYISLSDFKIELSNDINKMIDGIINEYKESKFVPPKIKD
LENKFDCKDFMEVHYYLEEIGVLYKVNSEMYVLREDFISARDRIINFIAKNGFIDLNLAK
ELLNSNRKYSVFFLEHLDQLKITVRKDNIRVLF
NT seq
1902 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaaaaatattatattaggtacagcgggacatattgatcatgggaagacctcgcttata
aaatgtttaactaatattgatactgattcattagaagaagagaaaagaagaggaatatct
ataaatttgggatttgctttttttgatttgccatgtaaaattagggtaggagttatagat
gttcctggacatgaaaagtttattaaaaatatgatagcaggttcagttggaattgatata
gttctcttagttattgcttgcgatgatagtataaagcctcaaactagagaacatatagat
attttaagttttcttaatattgataagggaataattgtcctaactaaaagagatttagtt
gatgatgagtggtatgagtttataaaaagtgaaataaaaaatgaattaaaaggtactttt
ttagaaaattctgttgttgtggggttttcatctaaaactagagatggatatgatgaactt
gttaatgaaatagaaagattaattgattatgatgattataagagttctgatggtatattt
aggatgcctattgataggtgttttagtttgagtggttttggaactattgtaacaggaact
ataatgtctggtaaaattagtttaaatgagagtatatttatatatccatctggtattgag
tgtaaggttcgtaatattcaagtttatgaggaaaataaaaaagaggcattctcaggtcag
aggtgtgcaataaatttatctaatgttaagaaggaaataaaaagaggagatgttgtatca
acaaatgcttcattagctttaagctatatgatagattgtaggttttattcagttaaaaat
ttaagtaaagatatattaaatggccagagagtacgttttctccatggaactagtgaagta
atgggtagaatacatattttagataaagaaaatattgggaaaaattctgaggcttatgtt
caaattcatttagagaaacctattttatgtttaaaggatgatagatatgtggttagaatg
tattctcctgtattaacaattggtggggggtacattataaatccattagctaaaaggatt
aaagataataacgtaaaatatttagaagaagttaaaataaaagagaaggagctaaacgaa
gaatacttagcattattaattgaaaatgataagaattatataattgatattaaatatatt
tgtaaaaattatttattattagaagatgaaatcttagataaatttgatatcttggttagt
aatggtatattgattgattttcacgatgggaataatagatattttattcataaaaataat
ttagataagatttatttagaaattaaaaatatacttactgaatatcattctaaaaataaa
ttcagaattggttttttaaaagaagaattaagaggtaaattgaatttaaaagaatttaag
cctaaaatttatatgcttatacttaattattttgaagatatgggatatataaagtctaca
tcaaaatatatttcattgagtgattttaaaatagagttatcaaatgacataaataaaatg
attgatggaattattaatgaatataaggagtctaagtttgtaccacctaagattaaggat
ttagagaataagtttgattgtaaggattttatggaggtacattattatttagaggaaatt
ggagttttatacaaagttaattcagagatgtatgttttaagggaagattttatatctgca
agagataggataattaattttatagcaaaaaatgggtttattgaccttaatttggcaaaa
gaacttttaaattctaacaggaaatattctgttttttttcttgaacatttagatcaatta
aagataactgtaaggaaagataatattagggttttgttttga
DBGET
integrated database retrieval system