Phocaeicola dorei HS1_L_1_B_010: EL88_19405
Help
Entry
EL88_19405 CDS
T03262
Name
(GenBank) membrane protein
Organism
bdo
Phocaeicola dorei HS1_L_1_B_010
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
CarbopepD_reg_2
TonB_dep_Rec
CarboxypepD_reg
STN
CooC_C
Big_1
DUF3237
FecR_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AII65187
LinkDB
All DBs
Position
complement(4342180..4345746)
Genome browser
AA seq
1188 aa
AA seq
DB search
MKNYFSVQLLWMIKSCRLILNKTPLPMKLSVLFLICSLSMTYAAESYAQKTMISLEVRNE
TVGTVLEKLKKESGFDFFFNNKHVDLKRIVSVSANNNNIFKILDQIFAGTNVKYSVLEKK
IILSTEIVQGIQQGQIKATGIVKDANGEPIIGANVIVKGQSTGTITDIDGRFVLDTPKDA
VLQITYIGYVSQEVKVSGKKELNVVLKEDTETLDEVVVVGFGTQKKVNLTGAVGLATAKE
LESRPVTSATQALQGLVPGLQISTSTGELDKTADISIRGTGTIGEGSSGAPLILIDGMEG
DLNTVNPQDIENISVLKDAAASSIYGSRAPFGVILVTTKSGKKGKTNVNYNNSFRISTPI
NMPEMMDSYTFANFMNSGSLNQGGGLIFTEDLMQEMLNWQAAGGGSTGGVKASSNGQWGK
PEYDPFTTAWANTNWYDEVYKSSTFSQEHNVSLNGGSDIVAYYASFNYLDQGGLLKAGDD
GLQRYNVTAKINTNLTPWLKFNYSTRFTRNDVWRPTSFNSSFYDQLGRATWPNLPVKDPN
GYYLDNGWTNPVQNLFEGGKRNAQTDRLYQQASLIIEPIKNWTTHVEFNYSIKNSSVKET
SLPVYNHDIEGNVINTNKDSYLYQDQTKENYLNLNIYSEYFHSFNNVHNTKIMLGFQTES
MQQEFSSTQKYGIMIGGMPYFDITTGLDGKGNVKATKANGNGKRWKTAGFFGRLNYDYMG
RYLAEINMRYDGSSRFRRGSRWQWSPSFSLGWNIAQEKFWESLTDIANTLKLRVSYGELG
NQNTTAWYPTYRDMILKSSNGTWLQDSQKPNTAEPGDLVSNSLTWEKVRTWDVGFDYGFF
NNRLTGSFDYYIRYTDGMVGPAPELPFTLGTSAPKTNNCNLRTNGWELSIGWRDRLNNGL
GYSATFTLSDAKTIVTSYPSNATNTIGLNKYVEGREIGEIWGLQTIGIAKSEEEMQAHLS
SLPKGGQEAIGSKWSAGDIMYRDLNGDGKISKGASTLDDHGDLKVIGNSTPRYFFGIDLN
ADWKGFDVRFFFQGVMKRDYWGKDNFCGYLFGVRGDKDIWHARGLVEHQNYFRAQAIGID
GHELPANLDAYYPRPVFKEGAKNQETQSRYLQDASYIRLKNFQLGYTLPAKWMKNIGLTK
CRVFVSGENLWTGTSLSSLFDPETISGGNGGNAYPLSSTWSFGLSLTL
NT seq
3567 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaattattttagcgtccaattattatggatgataaagtcgtgtaggttaatctta
aataaaactccattacctatgaaactaagtgtactctttttaatctgttcgttaagtatg
acttatgcggcagagtcgtatgcgcaaaagaccatgatcagtcttgaagtacgtaatgaa
acagttggcactgtgttggaaaagctgaaaaaagaatcggggtttgatttcttcttcaac
aataaacacgtagatctgaaacgtattgtatcagtttcggcaaacaacaataatatattc
aagatactagaccagattttcgcagggacgaatgtgaagtattcagtgcttgaaaagaaa
attattctttctactgagattgtgcaaggaatacagcaaggacaaattaaggcgacaggt
attgtaaaagatgcgaatggcgaaccgataatcggtgccaatgtcatcgtaaaaggccag
tcaacaggtacaatcacagatatagacgggcggttcgttctggatactccaaaagatgcc
gttttacagattacatacatcggatatgtttctcaagaagtgaaagtttctggaaagaaa
gaacttaatgttgtattaaaggaagatacagaaactcttgatgaagtggtcgttgttgga
tttggtacgcaaaagaaagtgaatctgacaggagctgtagggcttgctacagctaaagag
ttagaatcgcgtcctgtaacctcagctacacaagccttgcaaggactggtaccaggtttg
cagatatcaacaagtacgggtgaactggacaagaccgcagatatcagtatccgtggtaca
ggaactattggcgaaggttctagcggtgcacctcttattctaattgacggaatggaagga
gatttaaatacagtcaaccctcaagacatagaaaatatttctgtattgaaagatgctgcc
gcatcatccatctatggttcccgtgcccccttcggggtcattttggtaacaaccaaatcg
ggcaaaaaaggaaagaccaacgtaaattataacaacagtttccgtatatctactccaata
aatatgccggaaatgatggactcttatacatttgccaatttcatgaacagtggttctctt
aaccaaggtggcggacttatctttaccgaagacctgatgcaggaaatgttgaattggcaa
gccgctggtggaggcagtacgggaggagtcaaagcttcatccaacggtcaatggggtaag
cctgaatatgacccgtttacaacagcttgggcaaacactaactggtatgatgaagtttat
aaatcttcaaccttttctcaagaacataatgtcagcctcaacggaggaagtgatattgtt
gcctattatgcttccttcaattatttagatcaaggaggtttgttaaaagccggtgatgac
ggacttcagcgttataatgtgacagctaaaatcaataccaatctgactccatggttaaaa
ttcaactacagcacacgctttacacgcaatgatgtatggcgtcctaccagctttaacagt
tctttttatgatcagctgggaagagctacttggcccaatttaccggttaaagatcccaat
ggatactatcttgacaatggttggaccaatcctgttcaaaacctgtttgaaggaggaaag
cgcaatgcgcaaacagaccgtctttaccagcaggcttctttaatcattgaaccaataaag
aattggactacccatgtagaattcaactacagtataaaaaactcttcagtaaaagaaact
tctcttcctgtttataaccatgatatagaaggaaatgtgataaatacaaataaagattct
tacctttatcaagaccagacaaaagagaattacttgaatttgaatatttatagcgagtac
ttccattcttttaacaacgttcataacacgaaaattatgcttggtttccaaaccgaaagt
atgcaacaggaattttcatccacacaaaaatatggtatcatgatagggggcatgccttat
tttgatatcacaaccggattggacgggaaaggtaatgtcaaggcaactaaagctaacgga
aatggtaagaggtggaaaacagctggtttcttcggccgtttaaactacgattatatgggt
cgctatttagcagaaatcaacatgcgttacgacggttcttcccgtttccgtcgaggaagt
cgctggcaatggtctccttcattctctttaggctggaacatcgctcaggaaaaattctgg
gagtcgctgacagatatagccaacacattaaaattgcgtgtttcttacggtgaattgggc
aaccagaatactacagcatggtatcctacctatcgtgacatgatactaaaatcatctaat
ggaacatggttacaagacagccaaaaacctaatacagcagaaccaggtgatttagtcagc
aactctttaacatgggaaaaagtccgtacttgggatgtcggttttgactatggtttcttc
aataaccgtctgacaggtagttttgattactacattcgttatacagacggcatggtggga
cctgcccctgaacttccttttacactaggtacctctgcccctaaaaccaataactgtaat
ttgaggacaaacggttgggaattatctatcggttggagagaccgtttaaataacggattg
ggatatagtgctactttcaccctttcagacgctaagactattgtcaccagctatccaagc
aatgccactaacactattggtttgaacaaatacgttgaaggacgagaaataggtgaaatc
tggggattgcaaacaataggaatagctaaatctgaagaagagatgcaagctcatctatct
tcattacccaaaggagggcaagaagcgattggttccaaatggtctgccggtgatattatg
tatcgtgatttgaacggtgacggaaaaatatctaaaggtgccagcacactagacgatcat
ggcgatttgaaagttattggtaacagcactccccgatatttctttggtattgatctaaat
gcagattggaaaggctttgatgttcgttttttcttccaaggagtaatgaaacgggattat
tggggaaaagataatttctgcggttatctatttggtgtaagaggagataaagacatttgg
catgcccgtggcttggtagaacatcaaaattatttccgcgctcaggcaataggtatcgac
ggacacgaacttccggcaaacctagatgcttattatccacgacctgtattcaaggaaggc
gctaaaaaccaagaaacccaaagccgttatttacaagatgcatcctatattcgtttaaag
aatttccaattgggttatactctcccagccaaatggatgaaaaatataggattgaccaaa
tgccgtgtgttcgtttccggagaaaatctttggaccggaacatcattgtcttctctgttt
gatccggaaacaattagtggcggtaatggtggtaatgcttatccgttatcaagcacctgg
tcttttggcttaagtttaacactttaa
DBGET
integrated database retrieval system