Bacteroides ovatus: Bovatus_02468
Help
Entry
Bovatus_02468 CDS
T04113
Name
(GenBank) TonB-dependent Receptor Plug Domain protein
Organism
boa
Bacteroides ovatus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CarbopepD_reg_2
Plug
CarboxypepD_reg
STN
FecR_C
Big_1
CooC_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALJ47093
LinkDB
All DBs
Position
complement(3019146..3022700)
Genome browser
AA seq
1184 aa
AA seq
DB search
MKNNSQTRNKSKYLTNIGFRFLLLCILLTSHLPKISAEDGFMLLQSTDVTLNLTNVSLET
LFKTLEKKSNYVFFFKEDVLQKNEKVTVKAQNESVVSILNRILPPKQLTYTVKGRQVIIV
RLPQKEEKKAEVPVEIKEYTVKGTVVDASGQPLPGVNITVQGTTNGVTTDLSGGFTLRIR
DGKRVLLVASYIGFSTRKVWVSGETNSLKIMLEESSASLNEVVVVGYGTQKKLNLTGAVT
TASGEILENRPIANIAQGLQGMVPNLNITFNSGQPNEAAKINIRGNTSLNGGNALILVDG
VEISDLSLINPQDVESVSVLKDASAAAVYGARAAFGVMLVTTKKGNRNQKTRVTYNNNLS
WSSPARLPEMPRSDVWARMWNKAYEYDTPGGYYFNEKFMEKLDAHIADPEHNPAILVDTE
GIQNPNYSPSNPGWAYVGNTDWLSEFYQKSAFMQQHNVSLSGGTERNNYYASIGFKDQSG
IFRYGNDFYKRFNLAFNFDTKLTSWLDVSFATRMSNIKNDEPYMDNGGSSSQTWYYEVYR
MFPTLSIFLPNGDFAGMYLNSGNYNVIGKMALAGRNKKETWDQWYIGRFDLHPLKGLSIK
GDYSWNRYSTVQKFHRKEIKQTFPEGGPEWIVETPNYVKNYNSNNIYHAINVWAEYKTSF
NDVHNISVMGGYNQEEKTYANTSYTMTDLYDNELPISDLAINYKENAEGADIWRVQGAFF
RLNYDYRSKYLLEVNGRYDGSSKYAKDDRWAFFPSASIGWRISEEKFFEPLSKVVDNLKL
RASVGALGNQITNGYHDYMSILSGKVLTNYMMDGKMVNALNIPSLPSVVTWEKVVTKDLG
LDWSLFNNRLMGTFDFYVRDTKDMVRSVTLPAVLGTSGGKENIADMRTTGWELELTWKDR
IKNVLGSPMDYSLTVGLSDYQAEITKYDNPNGSLASGMYYEGQKLGEIWGYVTDGYIMDD
FEAAKMNYVQKYISSKWYPGDIRYKDLNGDGMIDQGNRTLANPGDQKVIGNSTPRYRFNL
QGGIGWRGFDIRAIFEGVGKRDMWTSSDIFWGFSRGIYNSCVTQYHIDNIWTYENPTAYY
PRLNANGNKRSKQIQTKYLQNAAYIRLKDITLSYTLPKSWLTKMKMEQVRIYVSGMNLWE
KTGLPPFMTPDIVDQITDNSLSSENSGKEYAFMRSYSFGINITF
NT seq
3555 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaataactctcagacaaggaataaaagtaaatatttaaccaatattggttttcga
tttttacttttatgcattcttttaacgtcccatttgccaaagatctcggcagaagacggg
tttatgctacttcaatccacggatgtaacgttaaatctgacaaatgtctctttggaaacc
ctgtttaaaacactggaaaagaaaagtaattatgtcttcttctttaaagaagatgtcttg
cagaaaaatgaaaaagtaacagtcaaagcacaaaacgagtcggttgtgtctattttgaat
agaatattaccccctaaacaactgacatatacagtaaaagggagacaagtgattattgtc
cgccttccccaaaaagaagaaaagaaagcagaagtaccggtagaaatcaaagaatatact
gtaaaaggaacagtggttgatgccagtggacagccgttgccgggtgtaaatattacggta
cagggaacgaccaatggtgttaccacagatctgtccggtggatttacgttacggataaga
gatggtaagcgtgtcttacttgttgcttcttatataggttttagcacaagaaaagtctgg
gtatccggtgaaactaattctttgaaaataatgcttgaagaaagttcggcgtctttgaat
gaagtcgtggtagtaggatatggtacacagaaaaagctgaatctgacaggagccgtgaca
actgcttccggtgaaatccttgaaaaccgccctatcgctaatattgctcagggtttgcag
ggaatggttcccaatctgaatattactttcaatagcggtcaaccaaacgaagcagccaag
attaatattcgcggaaatacctctttgaatggcgggaatgctttgattttggtcgatgga
gtggaaatctccgacctgtcattgattaatcctcaagatgtggagagtgtgtcagtgttg
aaagatgcttctgccgctgctgtttatggtgcacgtgctgccttcggtgtgatgcttgtc
actacaaagaaaggaaatcgtaatcagaaaacgcgggtgacctataataataacctttca
tggagttcaccggcccgtttaccggaaatgccccgttcggatgtatgggcgcgtatgtgg
aataaggcatacgagtatgatactccgggtggatattactttaacgaaaaatttatggag
aaactcgatgcacatattgccgatccagaacacaatcctgcaatcttggtcgataccgaa
ggcattcagaatccaaattatagtcctagcaacccgggatgggcctatgtgggcaacacc
gattggttatctgagttctatcaaaagtcggctttcatgcaacaacataatgtgagcctt
tcgggtggaaccgaacgtaacaattactatgcttctattggtttcaaagaccagtcgggt
atttttcgctatggaaatgacttttataagcgcttcaatttagcgttcaatttcgatacg
aaactaactagttggctggacgtgagttttgctacccgtatgagtaatattaagaatgat
gaaccttatatggacaatggtggtagcagttctcaaacttggtattatgaggtatatcgt
atgtttcctacactctctatctttttacctaatggtgattttgcaggtatgtatctcaac
agtggtaattataacgttattggaaagatggctttagccggacgtaataaaaaagagact
tgggaccaatggtacatcgggcgtttcgatttacatccattgaaaggactatctattaag
ggcgattactcttggaatcgttattctactgttcagaaattccaccgtaaagaaattaag
caaacttttcctgagggcggtcctgaatggattgtagagactcccaattatgtgaaaaac
tataactcgaacaatatttaccatgctatcaatgtatgggccgagtataaaacttcgttc
aacgatgttcataacatttcggtaatgggggggtataaccaagaggagaagacttatgct
aatacttcatataccatgactgacttgtatgataacgagttgcctatttccgacttagcc
atcaactataaagagaatgctgaaggtgcagacatctggcgtgtacagggggctttcttt
cgcttgaactatgattatcgctctaaatatctacttgaggtaaatggtcgttatgacggc
tcttctaagtatgctaaagacgatcgttgggcgttttttccttcagcctctattggttgg
cgtatttcggaagaaaaattctttgaaccactttccaaagtagtagacaatttgaaactt
cgtgcctctgtaggtgctttgggtaatcagataactaacggctatcatgactatatgtct
attctttctggtaaggtgttgaccaactatatgatggatggtaaaatggtcaatgcgttg
aatattccttctttgcctagtgtagtgacttgggagaaggttgtgacgaaagacttgggt
ttggactggtcattgttcaacaatcgtttgatgggtacattcgatttctatgtacgcgat
accaaagatatggtacgttcggttacactgcctgccgtattgggtacttcgggtggtaaa
gagaatattgctgatatgcgtaccactggctgggagttggaattgacgtggaaagatcgt
attaagaatgtattgggaagtcctatggactattcgcttaccgtaggtttgtccgattac
caggctgagataaccaaatacgataaccccaacggttcgttggctagtggtatgtattat
gaaggacagaaactgggtgaaatctgggggtatgtgactgatggttatattatggacgat
tttgaagcagccaaaatgaactatgtacagaaatacatttcttctaagtggtatccgggc
gatattcgctacaaagacttaaatggtgatggcatgatagaccaaggtaatcgtacattg
gccaatccgggtgaccaaaaggtgataggtaactctactcctcgatatcgttttaatttg
caaggaggtattggttggcgtggtttcgatatccgtgctattttcgaaggggtgggtaaa
cgcgatatgtggacaagtagtgatatcttttggggattctctagaggtatctataactct
tgtgtaacccaataccatatcgacaatatttggacctatgaaaatcctacagcttattat
cctcgtttgaatgctaatggcaataaacgtagtaagcagattcaaactaaatacttacaa
aatgcggcatatatccgcttgaaagatattactttgagctatactttacccaagagttgg
ttgaccaagatgaaaatggagcaggtacgtatctatgtaagtggtatgaatttgtgggag
aagaccggtttgcccccatttatgactcctgatattgtagatcaaataactgataacagc
ttgtctagcgagaacagtggtaaagaatatgcatttatgagaagttattcattcggtatt
aatataacattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
