Brassica oleracea (wild cabbage): 106343463
Help
Entry
106343463 CDS
T04124
Name
(RefSeq) nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form-like isoform X1
Organism
boe
Brassica oleracea (wild cabbage)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Extensin_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
106343463
NCBI-ProteinID:
XP_013638138
LinkDB
All DBs
Position
C5:13098490..13105148
Genome browser
AA seq
2086 aa
AA seq
DB search
MYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPPYIYSSPPPP
PYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPPMYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPLPPYYSPSPKV
DYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPPYIYGSPPPPPYYSPSPK
VDYKSPPPPYVYSSPPPPPMYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPP
YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPPYIYGSPPPPPYYSPSPKVDYKSPPP
PYVYSSPPPPPMYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPP
PYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPPYIYGSPPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPP
PPPMYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPK
VDYKSPPPPYVYSSPPPPPYIYGSPPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPPMYSPS
PKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPP
PYVYSSPPPPPYIYGSPPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPPMYSPSPKVDYKSP
PPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPP
PPPYIYGSPPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPPMYSPSPKVDYKSPPPPYVYSS
PPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPPYIYGS
PPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPPMYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSP
SPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPPYIYGSPPPPPYYS
PSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPPMYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKS
PPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPPYIYGSPPPPPYYSPSPKVDYK
SPPPPYVYSSPPPPPMYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYS
SPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPPYIYGSPPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVY
SSPPPPPMYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYS
PSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPPYIYGSPPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPPM
YSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYK
SPPPPYVYSSPPPPPYIYGSPPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPPMYSPSPKVD
YKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVY
SSPPPPPYIYGSPPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPPMYSPSPKVDYKSPPPPY
VYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPPY
IYGSPPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPPMYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPP
YYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYRAYKSPPPPYVYSSPP
PPYYSPSPKPAYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKPVYKSPPPPYVYNSPPPPYYSPSPKV
VYKSPPHPHVCVCPPPPPCYSPSPTPYVYHSPPPPPYYSPSPKHAYKSSPPPYVYSSPPP
PYYSPTPKHAYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKPTYKSPPPPYVYSSPPPPPYYSPSPKV
EYKSPPPPYVYSSPPPPPYYSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPPYYSPSPKVEYKFPPPP
YVYSSPPPPPYYSPSPKVEYKSPPPPYVYNSPPPPPYYSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPP
PSYYSPSPKVDYKSPPPPYVYTSPPPPAYSPSPKAEYKSPPPPSYY
NT seq
6261 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtattcgccatctcctaaagtggattataaatccccaccacctccttacgtctacagc
tcaccaccaccgccatactattcaccttctccaaaggtggattacaaatctccaccacct
ccttacgtgtatagctcgccaccaccaccaccctacatatacagttctccacccccacca
ccatactactcaccttctcctaaggtagactacaagtctccaccacctccttacgtatac
agttctcctccacctccaccaatgtattcgccatctcctaaagtggattataaatcccca
ccacctccttacgtctacagttcaccactaccgccatactattcaccttctccaaaggtg
gattacaaatctccaccacctccttacgtgtatagctcgccaccaccaccatattactca
ccttctccaaaggtggactacaaatctccaccacctccttatgtctacagctccccacca
ccaccaccatacatatacggttctccacccccaccaccatactactcaccttctcctaag
gtagactacaagtctccaccacctccttacgtatacagttctcctccacctccaccaatg
tattcgccatctcctaaagtggattataaatccccaccacctccttacgtctacagctca
ccaccaccgccatactattcaccttctccaaaggtggattacaaatctccaccacctcct
tacgtgtatagctcgccaccaccaccatattactcaccttctccaaaggtggactacaaa
tctccaccacctccttatgtctacagctccccaccaccaccaccatacatatacggttct
ccacccccaccaccatactactcaccttctcctaaggtagactacaagtctccaccacct
ccttacgtatacagttctcctccacctccaccaatgtattcgccatctcctaaagtggat
tataaatccccaccacctccttacgtctacagctcaccaccaccgccatactattcacct
tctccaaaggtggattacaaatctccaccacctccttacgtgtatagctcgccaccacca
ccatattactcaccttctccaaaggtggactacaaatctccaccacctccttatgtctac
agctccccaccaccaccaccatacatatacggttctccacccccaccaccatactactca
ccttctcctaaggtagactacaagtctccaccacctccttacgtatacagttctcctcca
cctccaccaatgtattcgccatctcctaaagtggattataaatccccaccacctccttac
gtctacagctcaccaccaccgccatactattcaccttctccaaaggtggattacaaatct
ccaccacctccttacgtgtatagctcgccaccaccaccatattactcaccttctccaaag
gtggactacaaatctccaccacctccttatgtctacagctccccaccaccaccaccatac
atatacggttctccacccccaccaccatactactcaccttctcctaaggtagactacaag
tctccaccacctccttacgtatacagttctcctccacctccaccaatgtattcgccatct
cctaaagtggattataaatccccaccacctccttacgtctacagctcaccaccaccgcca
tactattcaccttctccaaaggtggattacaaatctccaccacctccttacgtgtatagc
tcgccaccaccaccatattactcaccttctccaaaggtggactacaaatctccaccacct
ccttatgtctacagctccccaccaccaccaccatacatatacggttctccacccccacca
ccatactactcaccttctcctaaggtagactacaagtctccaccacctccttacgtatac
agttctcctccacctccaccaatgtattcgccatctcctaaagtggattataaatcccca
ccacctccttacgtctacagctcaccaccaccgccatactattcaccttctccaaaggtg
gattacaaatctccaccacctccttacgtgtatagctcgccaccaccaccatattactca
ccttctccaaaggtggactacaaatctccaccacctccttatgtctacagctccccacca
ccaccaccatacatatacggttctccacccccaccaccatactactcaccttctcctaag
gtagactacaagtctccaccacctccttacgtatacagttctcctccacctccaccaatg
tattcgccatctcctaaagtggattataaatccccaccacctccttacgtctacagctca
ccaccaccgccatactattcaccttctccaaaggtggattacaaatctccaccacctcct
tacgtgtatagctcgccaccaccaccatattactcaccttctccaaaggtggactacaaa
tctccaccacctccttatgtctacagctccccaccaccaccaccatacatatacggttct
ccacccccaccaccatactactcaccttctcctaaggtagactacaagtctccaccacct
ccttacgtatacagttctcctccacctccaccaatgtattcgccatctcctaaagtggat
tataaatccccaccacctccttacgtctacagctcaccaccaccgccatactattcacct
tctccaaaggtggattacaaatctccaccacctccttacgtgtatagctcgccaccacca
ccatattactcaccttctccaaaggtggactacaaatctccaccacctccttatgtctac
agctccccaccaccaccaccatacatatacggttctccacccccaccaccatactactca
ccttctcctaaggtagactacaagtctccaccacctccttacgtatacagttctcctcca
cctccaccaatgtattcgccatctcctaaagtggattataaatccccaccacctccttac
gtctacagctcaccaccaccgccatactattcaccttctccaaaggtggattacaaatct
ccaccacctccttacgtgtatagctcgccaccaccaccatattactcaccttctccaaag
gtggactacaaatctccaccacctccttatgtctacagctccccaccaccaccaccatac
atatacggttctccacccccaccaccatactactcaccttctcctaaggtagactacaag
tctccaccacctccttacgtatacagttctcctccacctccaccaatgtattcgccatct
cctaaagtggattataaatccccaccacctccttacgtctacagctcaccaccaccgcca
tactattcaccttctccaaaggtggattacaaatctccaccacctccttacgtgtatagc
tcgccaccaccaccatattactcaccttctccaaaggtggactacaaatctccaccacct
ccttatgtctacagctccccaccaccaccaccatacatatacggttctccacccccacca
ccatactactcaccttctcctaaggtagactacaagtctccaccacctccttacgtatac
agttctcctccacctccaccaatgtattcgccatctcctaaagtggattataaatcccca
ccacctccttacgtctacagctcaccaccaccgccatactattcaccttctccaaaggtg
gattacaaatctccaccacctccttacgtgtatagctcgccaccaccaccatattactca
ccttctccaaaggtggactacaaatctccaccacctccttatgtctacagctccccacca
ccaccaccatacatatacggttctccacccccaccaccatactactcaccttctcctaag
gtagactacaagtctccaccacctccttacgtatacagttctcctccacctccaccaatg
tattcgccatctcctaaagtggattataaatccccaccacctccttacgtctacagctca
ccaccaccgccatactattcaccttctccaaaggtggattacaaatctccaccacctcct
tacgtgtatagctcgccaccaccaccatattactcaccttctccaaaggtggactacaaa
tctccaccacctccttatgtctacagctccccaccaccaccaccatacatatacggttct
ccacccccaccaccatactactcaccttctcctaaggtagactacaagtctccaccacct
ccttacgtatacagttctcctccacctccaccaatgtattcgccatctcctaaagtggat
tataaatccccaccacctccttacgtctacagctcaccaccaccgccatactattcacct
tctccaaaggtggattacaaatctccaccacctccttacgtgtatagctcgccaccacca
ccatattactcaccttctccaaaggtggactacaaatctccaccacctccttatgtctac
agctccccaccaccaccaccatacatatacggttctccacccccaccaccatactactca
ccttctcctaaggtagactacaagtctccaccacctccttacgtatacagttctcctcca
cctccaccaatgtattcgccatctcctaaagtggattataaatccccaccacctccttac
gtctacagctcaccaccaccgccatactattcaccttctccaaaggtggattacaaatct
ccaccacctccttacgtgtatagctcgccaccaccaccatattactcaccttctccaaag
gtggactacaaatctccaccacctccttatgtctacagctccccaccaccaccaccatac
atatacggttctccacccccaccaccatactactcaccttctcctaaggtagactacaag
tctccaccacctccttacgtatacagttctcctccacctccaccaatgtattcgccatct
cctaaagtggattataaatccccaccacctccttacgtctacagctcaccaccaccgcca
tactattcaccttctccaaaggtggattacaaatctccaccacctccttacgtgtatagc
tcgccaccaccaccatattactcaccttctccaaaggtggactacaaatctccaccacct
ccttatgtctacagagcatacaaatcaccaccaccgccatatgtgtacagttctccccca
ccaccatattactcgccttctcccaagcccgcttacaaatctccaccaccaccatatgta
tacagctccccacctccaccttattactctccttcaccaaaacctgtatacaaatcacca
ccaccaccatatgtttacaactctccaccaccaccatactattcaccatcacctaaggtg
gtatacaaatctccaccacacccacatgtttgtgtttgtccacctcctcctccatgttac
tctccttctccaacaccatatgtttaccattctccacctcccccaccttattactcgcct
tcacctaaacatgcatacaaatcctcaccaccaccgtacgtctacagttccccaccacca
ccgtactactcccctactcctaagcatgcatacaaatctcctccaccaccatacgtttac
agctccccaccaccaccatactactctccttcccctaagcccacatacaaatctcctcca
ccaccgtatgtctatagctctccacccccaccaccgtattactccccttctccaaaggtt
gaatacaaatctcctccaccaccatatgtttacagctctccacctccaccaccgtattac
tctccttctccaaaggttgagtacaaatctcctccaccaccatatgtttacagctctcct
ccccccccaccgtattattctccttccccaaaggttgaatacaaatttcctccaccacca
tatgtctacagctctccacccccaccaccatattattctccttctccaaaggttgagtac
aaatctcctccaccaccatatgtctacaactctccacctccaccaccatattactctcct
tctccaaaggttgagtacaaatctcctccaccaccttatgtctacagttcaccacctcca
ccatcgtattactctccatcaccaaaggttgactacaaatcgccaccaccaccatatgtc
tacacatctccaccaccaccagcatactctccatctccaaaggccgaatacaaatctcct
cctccaccttcgtattattaa
DBGET
integrated database retrieval system
