Bibersteinia trehalosi USDA-ARS-USMARC-189: F543_1810
Help
Entry
F543_1810 CDS
T03018
Name
(GenBank) Autotransporter adhesin
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
btrh
Bibersteinia trehalosi USDA-ARS-USMARC-189
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
btrh00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
btrh02000
]
F543_1810
Transporters [BR:
btrh02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
F543_1810
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YadA_stalk
YadA_head
YadA_anchor
ESPR
DUF4261
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHG83045
LinkDB
All DBs
Position
176615..185482
Genome browser
AA seq
2955 aa
AA seq
DB search
MNKVFKVVWNAATQTWVAVSELQRAKGKTKSKSLANPVLMAISAVGVGATMIGGVSAAVH
VNDTASNYVLAADGTGSSIPAYIIQGVNVTGTVPPNYGHLTVYGTDISLGSQFTPAWSAL
VGNNISATGADKILYGNNISSDSFAQSPAVAIGRNLTLTGAAAMSDDQTGYNSAGESVLI
GHDLSGRANNVLVGTNLTTTEATTVVVGILSETQGARTTAFGYVAKALGAGATALGTSVT
AASQGDVAIGDNSNTTGSGYGKVAIGYATTASGQESTAVGRLANATATYATALGSYSCAT
AVQSVAIGTVARANGENGAALGAYNTVNADRGTAVGSNNQISTGSNRSTSVGTQNNIYNW
SPNSTAVGNSLNIFGESNTLLGSNASAMYVSNSVGIGTNINAGSSSVIAMGHNTNATGSQ
SIAIGCSTTASGINSIAFGSDANAIEMGSVAIAAHATATGRETIAIGLGANATHTTNLAD
IEGGFVADATGDEQGDLVPSIAIGAHSNATSSNAIAIGTNSNATGNRAIGLGAGTNATGN
RSIALGWLTVTEGNRSSAVGASASVTGDYASAVGTGATVSGTSAGAFGAYSNVMGNNTYV
LGSNISVATEGSVVLGNNSAASTATNVTTATVNGVTYTGFAGNANIAAGDYVSIGAAGEE
RQIKNVAPGDISANSTDAINGSQLYLVAAEAARHSVVAAGANISSVTTSTATNGATVYTV
NAIDTNTQASVSSDDGSVTISQSTNSNGTTNYDLSFTDNDTVTSVSYGRTYNTSSAANAP
INVTTSVIDGVTNYAVNVLTTPLIISQSGATSVSTSRNNQLMNASQISAAINNSGFQVST
GTADFMGGSGTQEGASYQTLVTPGDQLIFNAGNNLVISQSADRRVTYGLNPDLQINSITI
DPNISSQDAGINMGDTKISNLANGTNASDAVNLSQLNASKTFVQKGNHTSVSSTTNTDGS
TNYIVNADNIIVTSADSSVTVTPTSTTNADGTLTYTYDLAVGAVEIDNYFHVNNGSNSGG
DSATNLGGVGVSAGATALNSLAAGINTVATAYAATAMGYAATASNNNTVAIGSLATASAA
EATTVGYNSTASGQNASAFGSDTTASGVSSLAVGTGSTASADSAVAIGNDANAIAQSAVA
IGESANATGNYSTAVGDSSTASGLRSAAFGIDANATAESALAAGDSAISSGYRSNAVGFN
AQATEAEANAFGSNATATANSSVALGTSATATAVNAVAVGDSAAASIDGSVALGNNSTTS
NAVPTSSATVNGISYSGFAGSSPVSVVSVGSVGAERQIQNVAAGQVSADSTDAINGSQLY
LVAEEATKKSIVAAGENISSVTTSTLTNGSVVYTVNAIDTNTQASVTSTDGTVLVSASTN
ANGTTNYDLSVDIPTFENGTETTISTNENGSLVINVNTGSLNNNANGSVVADTTNGNIAT
VTDVANAINNSGWNTTLSDGSSAQINPGDTLNYVNGTGTTANVSQNADGSYSVSYDVNTA
NTTTVTNGKVEAPTDGASYVNATTLVETINSAGWNLFQETAEDANLKDTVTAGDNVVFAN
GTNTQVNVTNEGNTTTISYSVEGDLTNITSITNNNGSTSISLGNNTVNVNNATVSNVANG
TNATDAVNLAQLNASKVAVEAGNHTTISTTTNADGSTTYTVNANHTVVEAGTNVQLSSST
DGNGLTTYNVSVAGDLTNITSITNNAGNTITVGNGTTITNTNGTAAVDPNSNATDIATIG
DIVNTINNVSWTVAGNGADVEKITAGEVVNFVDGNNTVAVVTANATTGGADVTYHVEGDL
TNITSISNNNGTTISLGNNTVNVNNATISNVAEGVNGTDAVNVNQLNSSIASVTWKVTGN
HSEENATVVGNGTVSFNDSDTITANVDGMNISFDVKAGELSSNANGTVSFSSSNGSVATV
DQVADAINNSGWQTTLSNGNTTVINPGNVVNYSNGTNTVANVTQDENGTISVSYDVAGDL
TNITSITNNAGNTITVGNGTTITNTNGTAAVDPNSNATDIATIGDIVNTINNVSWTVAGN
GADVEKITAGEVVNFVDGNNTVAVVTANATTGGADVAYHVEGDLTNITSISNNEGTTISL
GNNTVNVNNATVSNVANGTNATDAVNLAQLNASKAYVKAGNFTTVTSTSDANGTTYIVNA
EKTVVAEGDNVNITTTTTAEGLTTYTVNVAGELNNITTINNNGTTFTFGNGTTTVSDEGK
ANISTGANTTDVATIGDIVNTINNVSWTIAGNGINVDKITAGEVVNFVNGTNTVAVVTAN
ATTGGADVTYHVEGALTNITSIANNSGTQITLGDVNGNNTVNVNGATISNVSAGVNGTDA
VNLDQLNASKTYIDAGNFTTVTTTTNADGSTTYVVNAEKSVVEAGDNVNVTTTTTAEGLT
TYTVNVAGNLNNITTISNANTTLTVGNGETTVENGKAQVASNSNATDIATVGDIVNTLNN
ISWSVASTNVTGTNGETTYVANENSSISAGDTVSINAGQNIKISGSGDTFEIHTTDNVTF
VNTNVTGELNVDGNTTVNNFAVAPNSTVDMGGNRITNVGAGSNATDAVNVSQLNSTIAGV
QWKLTGNNDDANATTVGSQTVSFNDSASVKANVDGVNVSFAVKSGDISPVADGSVFADST
NGSVATVSDVANAINNAGWKTTLSDGNTTLITPSDVVNFNNGVGTTANVVTNANGGIDVS
FNVNKTALTVSDGNIANPDGSNVNSGAVVSPDTNNANHFVIAGDLANTLNSIGWNVNSTA
VEGSTGKVTEDSDSTATKVSAGNTVNINAGNNIEITRNGANVAIATSMTPTFNTVQVGGS
TGPVIGASEDGNVRIAKADGSAARITNVAPGVDGTDAVNVDQLKAGLGNVHNHIGKVDRN
LRAGIAGANAAAGLPQVYIPGKSMVAASAGTFKGQSAVAVGYSRASDNGKVILKLQGNAN
TRGDFGGSVGVGYQW
NT seq
8868 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaggtatttaaggttgtttggaatgctgcaactcaaacttgggtcgcggtttct
gagcttcaacgtgcaaaaggcaaaacgaaatctaaatcgttagcgaatcccgtattaatg
gcaattagtgctgttggcgtgggagcaacaatgattggtggggtgagtgcagccgttcat
gtcaatgatacagcttcaaattatgtattggctgctgatggaacgggtagcagtattcct
gcatatattatccaaggagtgaatgtaacagggacagttccaccaaactatggtcatctt
acagtttatggtacagacattagcttaggtagccaatttactcctgcttggagtgccctc
gtaggaaataatatttcagctactggcgcagataaaattctctacggtaataatattagc
tcagacagttttgctcagtctccagctgttgctattggtagaaatcttactttaactggt
gctgcggcaatgagtgatgaccaaacgggctacaatagtgctggagaatcagttttaatt
ggtcatgatttaagtggtcgcgcgaataatgtattggtgggtactaatttaaccactaca
gaagccacaacggttgttgtgggtattctttctgaaacccaaggtgcgagaacgacagca
tttggttatgttgctaaagctttaggtgctggggctactgcacttggtacttcggtaaca
gcagcgagtcaaggggatgtagctattggcgataattcaaatactactggtagtggttat
ggaaaagttgcaattggttatgcaacgacagcatctggtcaagagagtacggcggttggt
cgtttagctaatgcaacagcaacttatgctactgcattagggagttactcttgtgctaca
gctgtgcaatccgttgcgattggtacggtggctagagcaaatggtgaaaatggtgcagcg
ttaggggcttataatactgtaaatgcagatcgtggtactgcagtaggaagtaacaatcag
ataagtacaggtagtaatcgttcaacatccgtaggtactcagaataatatttacaattgg
tctccgaactctactgctgtgggtaatagtttaaatatttttggtgaaagcaatacatta
ttgggttcaaatgcttctgcaatgtatgtatccaattcagttgggattggtacgaatatt
aatgcaggtagtagttctgttattgctatggggcataataccaatgctacaggaagccag
tctattgcaatcggttgttctactacagcaagtgggatcaattcgatagcttttggttct
gatgcaaatgcaatagaaatgggtagtgtagccattgctgcgcatgcgactgcaacaggg
cgtgaaactattgcgattggtcttggtgcaaatgcgacacatacaacaaatttggctgat
atagaaggtggtttcgttgcagatgctacaggtgatgagcagggtgatttagttccttct
attgcaattggtgcacattcaaatgcaacatcgtctaatgccatcgcgattggcactaat
tcgaatgccacaggtaaccgtgctattggtttaggtgcgggtactaacgccacggggaat
cgttctattgcattaggttggttaactgtgacggaagggaatcgtagtagtgcggtaggt
gctagtgctagcgtaacgggcgactatgctagcgcagtgggaactggcgcaacagttagt
ggaacaagcgcaggagcatttggtgcatattctaatgtaatgggtaataacacctatgta
ctaggctcgaatattagtgtagcaacagaaggttctgtcgtgttggggaataattctgct
gcatctacggcaacaaatgtgactactgcaacggttaatggggttacttatacaggtttc
gcgggtaatgcgaatattgctgcaggtgactatgttagtattggtgccgctggtgaagaa
cgccaaattaaaaatgttgcaccaggcgatatttctgccaattcaactgatgctattaat
ggctcacagctctatttagtggcagcagaagcggcaagacattctgttgttgcagctggt
gcgaatataagcagtgtaacaactagcacagcaacaaatggcgcaacagtttataccgta
aatgcgattgacactaacactcaagccagcgtttcttccgatgatggttcagtaaccatt
agccaaagtacaaatagtaatggtacaactaactatgatttatcgtttacggataatgat
accgtgacgagcgtaagctatggtcgtacttacaatacttcaagtgcagcaaatgcacca
atcaatgtgaccacttcagttattgatggcgtaaccaactatgctgtaaatgtgctaacg
acaccattgattatttcacaatcaggtgcgacatctgtttcgactagtcgtaataaccag
ttaatgaatgcgagccaaatttcagcagcaatcaacaattctggtttccaagtttcaacc
ggtactgcggattttatgggcggtagtggtacacaagaaggagcttcttaccaaactttg
gtaaccccaggggatcaattgatctttaatgcggggaataatttggtgattagccaatca
gcagatcgccgtgttacttatggcttaaatccagatcttcagattaacagcattaccata
gacccaaatatttcatcgcaagatgcaggtattaatatgggtgataccaagatttctaat
cttgccaatggtactaatgcaagtgatgcagtaaatttaagccaattaaatgcaagtaaa
acctttgttcaaaaaggcaaccacaccagtgttagcagtacgaccaatacagacggctca
actaactatattgtgaatgctgataatatcatcgtaacttcagcagatagctccgtcact
gtgacaccaacttcaactactaatgcagatggtacgctaacctatacttatgatttagcg
gtaggtgcggtagaaatagataattatttccatgtaaataacggttctaatagtggtggc
gatagcgcaactaacttgggtggtgttggcgtgagcgctggcgcaacggcattgaattct
cttgctgctgggattaatactgttgcaactgcttatgctgcaacagcgatggggtatgca
gcaacagcaagtaataataacacagtggctattggtagcttggcaacggctagcgctgca
gaggcaaccactgtcggttataactcaacagcctctggccaaaatgcctctgcatttggt
tctgatacaacagcctcaggagtgagctcattagcggtaggtacgggttcaacagcaagt
gcggatagcgcggttgcaattggtaatgatgctaatgctattgcacagagtgcagtagcg
attggggaaagtgcaaatgcgacaggcaattattcaacagctgttggtgattcatcaact
gcaagtggtttacgttctgctgcatttgggatcgatgcaaatgcaacagcggagtcagca
ttagctgcgggtgattctgcaatttctagtggttatcgctcaaatgcggtaggctttaat
gcacaggctacggaggcagaagcgaatgcatttggttcaaatgcaaccgcaacagctaat
agctccgttgcattaggtacaagtgctacggcaacggctgtcaatgcagtagcagtgggt
gattcagcagctgcaagtattgatggttctgttgctcttggtaacaattcaaccacttct
aatgctgtgccaacttcttcggcgacagtaaatggtattagttatagtggttttgcaggc
agttccccagttagtgttgtgagtgtgggatcagttggagcagaacgccaaattcaaaat
gtagcagcagggcaagtctcagcagattcaacggatgcgattaacggttcgcaactgtat
ttagtggcggaagaagctacgaagaaatccattgtggcagcgggtgagaatatcagtagc
gtaactacctcaaccttaaccaatggttctgtggtttataccgtaaacgcaattgatacc
aatacgcaagccagtgtgacatcaacggatggaacagtgcttgtgagtgctagcaccaat
gcaaatggcactacaaattatgatttaagtgttgatattccaacttttgaaaatggcact
gaaacaacaattagtacgaatgaaaatggtagcctggttattaatgtaaacacaggttct
ctaaacaataatgcaaatggttcagttgttgcggataccacaaacggtaatatagccact
gttacagatgtagcaaatgcaattaataattctggctggaataccactttaagtgatggt
tcttctgcgcaaattaacccaggagacacgcttaattacgtaaatggtacgggtactaca
gcaaatgtaagtcagaatgctgatggatcatattctgtaagttatgacgttaatacagca
aacacaacgacagtaaccaatggtaaagttgaagcaccaacagatggggcgagttatgta
aatgcaacgactttagtggaaacgattaatagtgcaggttggaatcttttccaagaaaca
gctgaagatgcaaacttaaaagataccgttacagcgggcgataatgttgtgtttgcaaat
ggcactaatacgcaagtcaatgttactaatgaaggtaataccacaacgattagctacagc
gttgagggagacttaaccaatatcacatcaattaccaacaataatggcagtacgagtatt
agcttaggcaacaacaccgtaaacgtaaacaatgcaacggttagcaatgtagcgaatggt
acaaatgcaacagatgcggtgaatttagcacagctaaatgcaagtaaagtcgcggtagaa
gccggtaaccataccacgatcagcacaacaaccaatgctgacggttcaacgacctatact
gttaatgcaaaccacacagtagtggaagcaggcacaaacgttcaattaagcagtagcacg
gatggaaatggcttaactacctataatgtaagtgtcgcaggtgatttaaccaacattaca
tcaatcacgaacaatgcaggtaacaccattacagtgggtaacggcactacaatcaccaat
accaacggcacagcggcggtagatccaaactcaaatgcgaccgacattgcgacgattggt
gacattgtgaatacgattaacaatgtaagctggacagtagcaggtaacggtgcagacgtt
gagaagattactgcgggtgaagtggtgaactttgtagatggtaacaacaccgtagcggtg
gtgactgcaaatgcaaccacaggtggcgcggatgtgacttaccatgttgagggtgactta
acgaacattacgtcaatcagcaacaacaatggcacaaccatcagcttaggcaacaatact
gttaacgtaaacaatgcaacgattagcaacgtagcagaaggtgtgaacggcacagatgcg
gtgaacgtgaaccaattgaacagctcaattgcaagcgtgacctggaaggtaacgggtaac
cacagcgaagagaacgcaactgttgtaggtaatggcacagtgagcttcaacgactcagac
acgattacagcgaatgttgatggcatgaacatcagctttgatgtgaaagcgggtgagtta
agtagcaatgcgaatggaacagtaagcttcagtagctcaaacggctcagtagcgaccgta
gaccaagtagcagatgcgattaacaactcaggctggcaaaccacattaagcaatggtaat
acgaccgtaatcaatccaggcaatgtagtaaactacagcaacggaacaaacacggttgcg
aacgtgacgcaagacgagaacggtacaatcagcgtgagctatgatgtggcaggtgattta
accaacattacatcaatcacgaacaatgcaggcaacaccatcacagtaggtaacggtact
acaatcaccaataccaacggtactgcggcggtagacccgaattcaaatgcgaccgacatt
gcgacgattggtgacattgtgaatacgattaacaatgtaagctggacagtagccggtaat
ggtgcagatgttgagaagattactgcgggcgaagtggtgaactttgtagatggtaacaac
accgtagcggtggtgactgcaaatgcaaccaccggtggtgcggatgtggcttaccacgtt
gagggtgacttaacgaacattacgtcaatcagcaacaacgaaggcacaaccattagctta
ggcaacaatactgttaacgtaaacaacgcaacggttagcaatgtagcgaatggtacaaat
gcaacagatgcagtgaatttagcacaactaaatgcaagcaaagcttacgtgaaagcgggt
aacttcacgacagttacttcaaccagcgatgcaaatggcacgacttacattgtgaacgca
gagaaaactgtagtcgctgagggtgataatgtaaatatcaccacaacaacgacagcggaa
ggcttaacaacctatactgtaaatgttgcgggtgagttaaataacatcacaaccattaat
aacaacggtacaacctttacctttggtaacggcacaacgacggtgagtgatgaaggtaaa
gcaaatatctcaacaggtgcaaataccacggatgtggcaaccattggcgatattgtgaat
acgattaacaacgtaagttggacgattgcaggtaatggtatcaatgtagataaaattacc
gcgggtgaagtggtgaattttgtaaatggtactaacacggtggctgttgtgactgcgaat
gcaaccaccggtggtgcggatgtgacttatcacgttgaaggtgccttaaccaacattact
tcaattgcaaacaacagcggtacgcaaattactttaggtgatgtcaatggcaacaacacg
gtgaatgtcaatggtgcaactatcagcaatgtaagtgcgggcgtgaatggtacagatgcc
gtgaatttagaccaattgaacgcaagcaagacttacattgatgcaggtaacttcaccacg
gtaactacaaccactaatgcagatggttcaacgacttatgttgtaaatgcagagaaatcg
gtagttgaagcgggtgataatgtgaatgtgacgaccactacaacagctgaaggtttaacg
acttatactgtcaatgtagcagggaatttaaataacatcacaaccatcagtaacgctaac
acgacattaactgtgggtaacggagaaaccacggtagaaaatggtaaggcgcaagttgca
agcaattcaaatgcaacggatattgcaaccgttggcgatatcgttaatacgcttaacaat
ataagctggagtgtggcatcaactaacgtaacgggtactaacggtgaaaccacttatgtg
gcgaatgaaaattcaagcatcagtgctggtgataccgtaagtatcaacgcaggtcaaaac
attaagatcagcggttcgggtgatacatttgaaatccataccacggataatgtaaccttt
gtgaacacgaatgtaacaggcgagcttaatgtggatggtaatacaaccgtgaataacttc
gctgtcgcaccaaactcaacggttgatatgggtggaaaccgaatcacgaatgtaggcgcc
ggttcaaatgcaacagacgcagtgaatgtcagccaattaaacagcacgattgcaggcgtt
caatggaaacttactggcaacaacgatgacgcaaatgcaacaacggttggcagccaaacc
gtcagcttcaacgatagcgctagcgtgaaagccaatgtggatggcgtgaatgtcagcttt
gcggtgaaaagtggtgatatttcaccagtggcagatggttcagtatttgcagatagcaca
aacggcagcgtagcaacagtcagtgatgtggcaaatgccattaacaatgcaggctggaaa
acaacattaagtgatggcaacacaaccttgattaccccaagtgatgtggtgaacttcaac
aatggcgtgggtacaacagcgaatgttgtcacaaatgctaatggtgggattgatgtcagc
ttcaatgtgaacaaaacagcattaaccgtatccgatggcaacattgctaacccagacggt
tcaaacgtaaatagtggtgcagtggttagtccagatacgaataatgcaaatcactttgtg
attgcaggtgatttggctaacaccttgaactcaattggctggaatgttaattcaacagcg
gttgaaggttcaacgggcaaagtcacagaagatagcgatagcacagcaacgaaagtcagc
gcgggtaatactgtaaatatcaatgcgggtaacaacattgaaatcacccgtaacggtgca
aatgttgcaattgccacctcaatgaccccaaccttcaacacagttcaagtgggtggttct
actggccctgtgattggtgcaagcgaagatggtaacgtgagaattgcgaaagcagatggc
tcagcagcacgtattactaatgttgctccaggtgttgatggcactgatgcggtgaacgta
gatcaattaaaagcgggtctaggcaacgttcataaccatattggtaaagtggacagaaat
ctccgtgcaggtatcgccggtgccaatgccgcagcaggcttaccacaggtttatatcccg
ggtaaatcaatggttgcagcatcagcaggtaccttcaaaggtcaaagtgcggttgcagtg
ggttactcacgagcaagcgacaacggtaaagttatcttgaaactacaaggtaatgcgaat
acccgtggagactttggtggttctgttggtgtaggttatcaatggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
