Candidatus Cloacimonas acidaminovorans: CLOAM0879
Help
Entry
CLOAM0879 CDS
T04769
Name
(GenBank) putative Glycogen debranching enzyme, archaeal type
Organism
caci
Candidatus Cloacimonas acidaminovorans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GDE_C
GDE_N
Glyco_hydro_100
Glyco_hydro_63
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAO80754
UniProt:
B0VHD9
LinkDB
All DBs
Position
complement(1018086..1020125)
Genome browser
AA seq
679 aa
AA seq
DB search
MMSNYFMETHHHEWILTNRRGGYALGTGNLINQRKYHGLLVSSDSKFNRLHLVAGIEEKV
EWRGEFFHLDSNNYSNCIYPEGFLHLVKPWLRPYPIFLYSALPHQNDILILKEIMMDEST
NTTLVKYTNLGHHLLHFELHPKFTMIPHHELNKPGTLDFLNFITEIETPDKFTRFSVQRQ
DNNIKLYGALLSGEVIPNRYVYYNVFYPWEVMSGYEGIGDQITLFQLGFDLRVGQSNYLL
FSDTAIEDAKTLIERIENRYADLPKPLDYPYAPDKNDTLLNTLDYNDNIIFPYDNYLKIL
EFALKDFLANDDIVAGFPFYGAWGRDTMVVVNALLHCPNQLETVEKILNKYRSYLKNGLI
PNMIAESGRETNYDSVDSTLWYIILLWKLGKRKQTVKYWKDVIALTEEIITGILHNEFHP
FSVRYDGLIELHPDFAHGTWMDVRIDGKAITPRNGAPVEINALWYNALCSYEAMCLAYCQ
KSRKKYQAKEEFVQLKELVKQSLQKFYQDGYLADRIVGEELIMEIRPNAIIALALPWQAF
SQEILQQVLERSFKELYTNYGIRTLSPNDIRFHKKYYGTQKERDLAYHNGSVWAWLLGPF
CGLYERAYKGIKTKEEIIEALTSFISTFRNSFMKGHIASIAEIWDGDAPHFPKGAPAQAW
SVAALYNIENYILFLQEGK
NT seq
2040 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgatgagcaactattttatggagacccatcatcatgaatggattctaactaaccgtaga
ggcggttatgctttaggaacaggaaatttgattaaccagcgtaaatatcacggtttactg
gttagcagcgacagtaaattcaatcgccttcatttggtggctggtattgaagaaaaagtt
gaatggcgaggagaattttttcacctggacagcaataattacagcaattgtatatatcct
gagggttttctgcatttagtaaaaccttggttgcgtccctatccgatatttttgtattca
gctcttccccatcagaacgatattttgattctgaaagagataatgatggatgaatccacc
aatacaactttggtgaaatataccaatttgggtcatcatcttttgcattttgagcttcat
cctaagtttacgatgattcctcatcatgagctcaataaacctggcactttggatttcttg
aattttattacagaaattgaaactccggataaattcactcgttttagtgttcagaggcag
gataataatataaaactttatggtgctttgctttcaggtgaagttattcccaatcgctat
gtttattataatgttttttatccctgggaagtgatgagtggttatgaaggcattggtgat
cagataactctttttcagcttggttttgatttgagggtgggacaaagcaactatcttctt
ttcagtgatacggcaattgaagatgccaaaactctcattgaaaggattgaaaatcgttat
gcagaccttcccaagccgttggattatccttatgctcccgataaaaatgatacccttttg
aataccttggattataacgataatattattttcccgtatgacaattatcttaaaatcctg
gaatttgccctgaaggattttttagccaatgacgatattgtagccggctttcctttttac
ggtgcttggggaagagatacaatggttgtggtaaatgctctcttacattgtcccaatcaa
ctggaaacagtggaaaaaatccttaataaatatcgtagctaccttaaaaatggtctgatt
cctaatatgattgcagaatccggcagggaaacaaattatgatagtgtagattctacttta
tggtatatcatcctgctgtggaaattgggtaaacgcaagcaaacggttaaatactggaaa
gatgttattgccttaacggaagaaatcataaccggcattttgcataatgaattccatccc
tttagtgtgcgttacgatggtttaattgaattgcatcccgattttgctcatggcacatgg
atggatgtgcggatagatggaaaagcgataactcctcgtaatggagctccagtagaaatt
aatgccctctggtataacgctttatgttcttatgaagctatgtgccttgcctattgtcag
aaatcccgaaaaaaatatcaggcaaaagaagaattcgtccagttgaaagagctggtaaaa
caatccctgcaaaagttctatcaagatggctatctggcagatagaattgtaggtgaagag
cttataatggaaattcgtcccaatgcaattattgctcttgccttgccctggcaggcattt
tctcaggaaattctacaacaggttctggaacgcagttttaaagagctatataccaactat
ggaatccgcaccttgagtccaaatgatatccgttttcataaaaaatattatggaacacag
aaagaaagagaccttgcttatcataatggcagtgtttgggcttggctgttaggtcctttt
tgcggattgtatgaaagggcttataaaggtataaagaccaaagaagaaataattgaagcc
ctcacttcctttatttccacttttcgcaacagttttatgaaaggacatattgcatccatt
gctgaaatctgggatggagatgctccccattttcctaaaggagcaccggctcaggcatgg
agtgtagctgccttatacaatattgaaaattacattctttttctgcaggagggtaaatga
DBGET
integrated database retrieval system