KEGG   Clostridium botulinum A ATCC 3502: CBO3439
Entry
CBO3439           CDS       T00533                                 
Name
(GenBank) sigma-54-dependent transcriptional activator
Organism
cbo  Clostridium botulinum A ATCC 3502
SSDB
Motif
Pfam: Sigma54_activat PAS Sigma54_activ_2 PAS_9 PAS_8 PAS_4 HTH_50 PTS-HPr PAS_10 GdpP_PAS AAA_5 AAA_2 AAA dCache_1 HTH_8 PAS_7 AAA_16 Sigma70_r4 AAA_7 HTH_1
Other DBs
NCBI-ProteinID: CAL84999
UniProt: A5I7G4
LinkDB
Position
3680267..3682276
AA seq 669 aa
MYKNNIVVPINNGIHTRIAAMIVHKATEIKNKYGLDLYIKRMDSREPLAISMLALISLKI
KQHEIIEISCNSDSSKAESAVLELCNFINYDISKENPTSKLDDIIEENTIAYDQIFTNIP
IGILVIDKNSKITMANDYSLKIIGYSLKDILGKNIKDIIPSSELPDIIKNKCYHKGKTQY
MDNRILITNRSPIYFNDKILGAISVFQDISELVGIKELNEKFKKILEASHDLICFVDEDG
KIIYVNPSYKKHFSINSKDIIGKDIKESHPNSLIMEVFNTKRPKENVIYNKDNINIISTI
EPIFIDNEFKGVISISKTVDELRDLTLKLTESEEKLMYYKNELTRHLPLSSSFKSIIGWN
SSLKDCLSIAEKASKSTSTVLVRGESGTGKEIIANAIHDNSPRKNRSFVRVNCAAIPENL
LESELFGFEKGAFTGAIKKKPGKFNIADGGTIFLDEIGDLPISMQVKLLRVLQEKEFESI
GGIKTQRVDVRIIAATNRNLEDMIKNNTFREDLYYRLNVLNISLPPLRHRKQDINLLVEH
FINKINPKLNKNIAGINKEALLKLQQYDWPGNIRELENIVERAMNMCDKSIITVKDLPFY
ISNNSFDDSYNFTINEDNLKTLEEYEKEIITLAMKKYKSFNRAGKALGVTHRTVSLKCKK
YNISSEIYK
NT seq 2010 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtataaaaataatatagtagttcctattaataatggcatacatacgagaatagctgcc
atgatagttcataaagctacagaaataaagaataaatatggtctagacctctatataaaa
aggatggattctagagaacctttagctattagtatgttagctctgatttctttaaaaata
aaacaacatgaaataatagaaatatcctgcaatagtgattcttctaaagctgaaagtgca
gttttggaattatgcaattttatcaattatgacatatcaaaggaaaatcctacatcaaaa
ctagatgacattatagaggaaaacactatagcctatgatcaaatatttactaatattcct
ataggtatattggtaatagataaaaatagcaagattaccatggctaatgactattcatta
aaaattataggatattctttaaaggatatattaggtaaaaacattaaggatataatacca
agttctgagttgcctgatataattaaaaataaatgctatcataaaggtaaaacacaatac
atggacaatagaatattaataaccaatagatcccctatatattttaatgataaaatttta
ggcgctataagtgtatttcaagatatttctgaacttgtaggcataaaagagctaaacgaa
aaatttaaaaaaatattagaagcctctcatgatttaatttgttttgtagatgaggatggt
aaaataatatatgttaatccctcctacaaaaaacatttttctataaattctaaagatatt
attggtaaagatataaaagaatcccatccaaatagtcttataatggaggtatttaatact
aaaagaccaaaggaaaatgtaatctataataaagataatataaatattatatctactata
gaacctatttttattgataatgaatttaaaggtgtaatttctatatctaaaactgtagat
gaattaagagatctaactttaaaacttacggaatctgaagaaaaacttatgtactataaa
aatgaattaaccagacatcttcccttaagttcttcctttaagtctataataggttggaat
agttccttaaaagattgcttatccatagcagaaaaagcttctaaatcaacttctactgtt
cttgttagaggagaaagtggcaccggaaaagaaattatagctaatgctatacacgataat
agtcctagaaaaaatagatcttttgttagagtaaactgtgcagccataccagagaatctt
ttagaaagtgaactttttggttttgaaaaaggagcctttacaggagctataaaaaagaaa
cctggtaaatttaatattgcagatggaggtacaatctttttagatgaaataggtgatcta
cctatttctatgcaggtaaaactgttaagagttcttcaagaaaaagagtttgaaagtata
ggaggaatcaaaactcaaagggtagatgttagaataattgctgctactaatagaaactta
gaagatatgattaaaaataataccttcagagaagacctttattatagactaaatgtttta
aatatatctttgccccctcttcgtcatagaaagcaagatataaatcttttggtagaacac
tttataaataaaattaatcctaaacttaataaaaacatagcaggtataaataaagaagcc
cttttaaaattacaacagtatgattggcctggaaatatacgcgaattggaaaatatcgtt
gaaagggctatgaatatgtgtgataaatctataataactgttaaagatttacctttttat
atatctaataactcttttgatgatagctataactttactataaatgaagacaacttaaaa
acactagaagaatatgaaaaagaaataattactttagctatgaaaaaatacaaaagtttt
aatagggcaggtaaagccctaggcgtaactcacagaacagtgtctctaaaatgtaaaaaa
tataatataagttcagaaatttataaatag

DBGET integrated database retrieval system