Clostridium chauvoei: BTM20_10875
Help
Entry
BTM20_10875 CDS
T05083
Name
(GenBank) DNA repair helicase
Organism
cchv
Clostridium chauvoei
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF3427
ResIII
PLDc_2
Helicase_C
DEAD
SWI2_SNF2
PP_kinase_C
Helicase_C_2
AAA_22
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATD55706
LinkDB
All DBs
Position
complement(2352474..2355371)
Genome browser
AA seq
965 aa
AA seq
DB search
MRKALEDLITTSTVKDLNEIDMKEIIEEQYFVKNKLIVNSKKGDLLKELKLSLQKCKNFY
FSVAFINFSGVQLLLDSFKELEERGVKGKIITSTYLNFTEPKALERLKGFNNIDLKIFIA
DNENGFHTKAYIFENEENYKIIIGSSNITQRALKSNVEWNVMVISKKETEFVQEVLDEFN
YLWGETCFIDNEFLDKYKSFINTIKQGENKNLINFNDYKIIKPNLMQEKALENLKRLRSF
KENRALVIAATGTGKTYMSAFDVMNFNPKKLLFIVHREDILRSAAKTYISLCKNKNIKIG
FYTGNIKDESVEYLFATSQTMERHLKNFKRDEFQYIIIDEAHHSTSPTYEKILSYFSPKF
LLGVTATPERCDDGNIFEVFDNNVALEIRLHEALENDLIVPFHYFGITDIESCNLDKVNL
DNISEVSKKLMINKRVDFIIEKMNFYGFDGEYQKTIGFCISKEHANYMATEFNKYGIESI
SLTGDDSINKREEVIKRIQDNNDPLKVIFTVDIFNEGVDIPAINQILMLRPTNSPIVFIQ
QLGRGLRKYSDKNFLTVIDFIGNHNKAFLIALALKGSRYYDKDSLKVAVSTEFIDIPGCT
NIQMDRISKERILEQLNTENFNSLKYLKDEYNEFKALIGGKIPYSLMEYIKYDGAPDPLK
FINYQKTYQGFLAKVEKNSSIEEVLIDKEFFNILKEFSNKLPIKRPYEFAIIKYLINHSN
ITVEIAIGQISKYLDSVNKNTILHSFKTLNQDFYDSAQKNNNIKLFNYENNTLIKLLPFE
RILQNKQYRCIIEDLINYGLVRYEKQFGSKNYGNPFLKLYEQYQMVDIALLSNYEKIHSS
FRGSGLITNGREYFLFVDLHKEKSIKESINYKDEFIDNKNFQWQTPNSTSKSSERGKNII
FNKEREINLHLFVRKYKEIDKVTQSYIYIGKSNSINYKGEKPITINLELENKVPENLYIE
LTKKV
NT seq
2898 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaaaagctttagaagatttaattacaacatcaacagtaaaagatttaaatgaaata
gatatgaaggagataattgaagaacaatattttgtgaaaaataagcttatagtaaattcg
aaaaagggagaccttttaaaagaattaaagttaagcttacagaaatgtaagaatttttat
tttagtgtagcttttattaattttagtggtgtacagcttcttttggattcttttaaagaa
ttagaagaaagaggagtaaaaggtaaaataattacttctacatatttaaattttactgag
cctaaggcattagaaagattaaagggctttaacaatatagatttaaagatatttatagcc
gataatgaaaatggatttcatactaaggcatatatttttgagaatgaagaaaattataaa
attatcataggatcatctaatattacgcaaagagcattaaaaagcaatgtggaatggaat
gttatggttatttctaaaaaagaaactgaatttgttcaagaagttttagacgagtttaat
tatttatggggtgaaacatgttttatagataatgaatttttggataaatataagagtttt
ataaatacaataaagcaaggagaaaataaaaatttaattaattttaatgattataaaata
attaaacctaacttaatgcaagagaaagcattagaaaatttaaagaggttgaggtcgttt
aaagaaaatagggcattagttattgcagccacaggaacagggaaaacatatatgtctgca
tttgatgtaatgaactttaatcctaaaaaattattattcatagtacatagagaagatatt
ttgcgtagtgcagcaaaaacatatataagtttatgtaaaaacaaaaatataaagataggt
ttttatacaggaaatattaaagatgaatctgttgagtatctttttgctacctctcaaact
atggaaagacatttaaaaaattttaaaagagatgaatttcaatatataattatagatgag
gcacatcatagtacaagtccaacatatgaaaaaattttaagttatttttccccaaagttt
ttattaggtgtaacagctactccagagagatgtgatgatggaaatatttttgaagtgttt
gataataatgttgctttagagataagattacacgaagcattagaaaatgatttaatagta
ccatttcattattttggaataacagatattgaaagttgtaacttagataaggtgaattta
gataatatttcagaagtatctaaaaaattgatgataaataaaagagtagattttataata
gaaaaaatgaatttctatggttttgatggagagtatcaaaagacaatagggttttgtata
agtaaagaacatgcaaattatatggcaactgaatttaataaatacggtatagaaagtatt
tcattaaccggagatgattcaatcaataaaagagaagaggttataaaaaggattcaagat
aataatgatccattaaaagttatatttacagtagatatttttaatgagggggttgatata
ccagctattaatcaaatattaatgttaagaccaactaattcaccaattgtatttattcag
cagttaggaagagggctaagaaaatatagtgataaaaatttcttaactgttattgatttt
attggtaatcataataaggcttttttaatagcattagctttaaaaggtagcagatattat
gataaagatagtttaaaggtagctgtttcaactgagtttatagacataccaggatgtact
aatatacaaatggatagaatatcaaaggaaaggatattagaacaattaaatactgagaat
tttaatagtttaaaatatcttaaagatgaatataatgaatttaaagcacttataggagga
aagattccttatagcttaatggagtatataaaatatgatggagcaccagatccactcaaa
tttataaattatcaaaaaacatatcagggttttttagctaaggtagaaaaaaattccagt
atagaggaagtcttaatagacaaagaattttttaatatccttaaagaattttctaataag
ttaccaataaaaagaccatatgaatttgcaataataaagtatttgattaatcatagcaat
ataacagtagaaattgctatagggcaaatatctaaatatttagattcagtaaataaaaat
acaattctacatagttttaaaacattaaatcaagatttttatgattcagcacaaaaaaat
aataatattaagttatttaattatgaaaataataccttgattaaattattgccatttgag
agaatattacaaaataaacagtatagatgtataattgaagatttaataaattatggactt
gttagatatgaaaaacaatttggaagtaaaaattacggaaatccttttttaaaattatat
gagcaataccaaatggtagatatagcattattatcaaactatgaaaaaatccatagttcc
tttagaggatcaggacttataactaatggacgagagtattttttatttgtagatttacat
aaggagaagtcaattaaagaaagtataaattataaagatgaatttatagataataaaaac
tttcaatggcaaactcccaatagtacttctaaaagttcagaaaggggaaaaaatataatt
tttaataaagaaagagaaattaatctacatttgtttgttaggaaatataaagaaatagat
aaagtaacacaatcttatatttatattggaaagagcaatagtattaattataagggagaa
aaaccaattacaattaatttagaattagaaaataaagtacctgaaaacttatatattgag
cttacaaaaaaagtttaa
DBGET
integrated database retrieval system