Clostridium carboxidivorans: Ccar_22555
Help
Entry
Ccar_22555 CDS
T03979
Name
(GenBank) cell wall-binding protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
cck
Clostridium carboxidivorans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cck00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cck02000
]
Ccar_22555
Transporters [BR:
cck02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Ccar_22555
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CW_binding_2
Big_5
GARS_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKN33455
UniProt:
C6PXS7
LinkDB
All DBs
Position
4983376..4987521
Genome browser
AA seq
1381 aa
AA seq
DB search
MSKKSTKALASATLMSLVLTTALSAGPVQAAQGKVTRTSGTDRYATAASVAKENWKDGSQ
DVVLVSGEGYADAVSASALAKKLNAPILLTSKDALSSDTQDALNQLKPKNVYVVGGEGSI
STAVRDELKKNNYSLVELGGSNRYETNAKVAQKLVDLGVKADEVIMVGGEGFSDALSVAP
VAAAKGQILLLGLNNADYMKSVVDFVKNNNSKVTVVGTENVINSSIYNQVNATSRVNGGS
DRFDTNLKVLSSFKDTLKMDKLYVASAQENSRDDGYADALVASALAGKVAAPLVLTDKDG
STATSNAIKYIKDNATTKTDLNVIGGTGVVSQNVEDQINKAVSPDNPVTDATVKSVEVVS
LNQIKVSFNTKIDTDSAEDVTNYKIDGTQLTQTKADGSDPSVAVDENSAVAKSTDDDTAV
LITLAKPRKQSDSVTFTVKKAVLDADKNNTVASTDQPLTFKDTENPTLKNVNVEGNSQLT
VEFSEAVNMKTLDSLKDKFKIDGKSISNYGINSTYSELKDHITVSSSIATPATWANKVMF
YFDSQLEPGNHTLTISTGDGNTTGNVGTLSDAGGFSFQEQDKAFTVDTMSTAPVPTKVEE
TKSGEIHITFDRSMDVQTVKNTGNYKVNGKSLADINGAYIKTDNDDKLIKLKHVSDGTIK
TGANTLDISDDVKDAFGNTVPKDTRKSFDDVKDETKPTVSKIEVIDSETVRVKFSKDVDY
QYAHNLSNYTLKDDKGIDITSHIKGVYSTVGESDTGNTDTYNIKLWKFKATMEQAKGIAV
QPGDESEDWRLTSNKYNLTIKNIRDTASTPNVMEDYAYTINDAADTIAPKGTGIYAKMRG
TGDKDKVVVYFSESMDASTLTNKDNYQFINGEGDSKSLPADTNITTGGDNKSAILEFPSS
YHVKTGGKITTGTTNDVSAVTVFNVKDTSGNKLDGTAYNNDNRIDEAKAGATVKDNTIRT
FYDTDDAGDLKIAVQFTRAISSITDSDVTFGGVVPSSHSLSGDTVTFKFDKNQKATAADL
AKAAAANPGSSIVKADGIHYANGLVNKTPTKIELVKAQGNGLKFDVTATSTNTSDETGAK
LCVGEDGAKLTLTDSQAKVYNNDARPRTTCYDDDTADFWTATKDNNGGKVYVTFDTPLDN
SNTDADSFVFMGLNGTQIKADSATISGNTVIFNFKNDKNYATAFSGSLDIHAQSTAGFMA
QRDVNGEKSVYKASSDDTDTKTISVTDNTTTQQATIEQAGTAIVGKTVVVASLATGLDPA
QYDITVNGTKLTYSATSGKYTATIDGTFTVADLQAKTVVTKIETPTPGTMPAATVEQAGT
AIVGKTVAVVSLPAGTDCTKYVVTVNGTALTYNATSGKFTGTVDGTFTIADLQAKTVVSA
K
NT seq
4146 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaaaaaaagtacaaaggcacttgcaagtgctacacttatgtccttagttttgact
acagctctatcagctggtccagttcaagctgcacaaggaaaggtaacaagaacaagtgga
actgacagatatgcaacagcagcttcagttgctaaagaaaattggaaagatggaagccaa
gatgtagtattagtatctggtgaaggctatgcagatgcagtaagtgcttcagcattagct
aaaaaattaaatgcacctatacttttaacatcaaaggatgcattaagttctgatactcaa
gatgcattgaatcaattaaaacctaagaatgtgtatgtagtaggtggagaaggttcaatt
tcaactgcagtaagagatgaattaaagaaaaataattatagccttgtagaattaggcgga
tctaacagatacgaaactaatgcaaaggttgctcaaaaattagttgacttaggtgtaaaa
gctgatgaagttatcatggtaggtggagaaggtttctcagatgcactatcagtagctcca
gtagcagcagctaaaggacaaattcttttattaggattaaacaatgctgattacatgaaa
tcagttgtagattttgttaaaaacaataactcaaaagttacagtagttggaactgaaaat
gttataaatagttctatctacaatcaagttaacgctactagcagagtaaatggtggatct
gacagatttgatactaacttaaaagtattatcttcattcaaagatacacttaaaatggac
aaattatatgttgcatcagctcaagaaaactcaagagatgatggatatgcagacgcttta
gttgcttcagcattagctggaaaagtagcagcaccattagtattaactgacaaagatggt
tcaactgcaacaagcaatgctataaaatatatcaaagacaatgctacaactaaaactgac
ttaaatgttattggtggaacaggcgttgtttctcaaaacgttgaagatcaaataaacaaa
gctgttagccctgataatcctgttactgatgcaacagttaaatcagtagaagtagtaagc
ttaaatcaaatcaaagttagcttcaatacaaaaattgatacagattcagctgaagatgta
acaaactacaaaatagacggaactcaattaacacaaactaaagctgatggatcagatcct
tcagtagcagtagatgaaaacagtgcagtagctaaatcaacagatgatgatacagctgta
ttgataacacttgctaaaccaagaaaacaatcagacagtgtaacatttacagttaagaaa
gctgttttagatgcagataagaataatacagtagcttcaacagatcaaccattaacattc
aaagatactgaaaatcctacattaaagaatgtaaatgtagaaggaaatagccaattaaca
gttgaattctcagaagctgttaacatgaagactttagactcattaaaagataagtttaaa
atagatggtaagagcataagcaattacggaataaattcaacatattctgaattaaaagac
cacataacagtatcaagctcaatagcaacacctgcaacttgggcaaacaaagttatgttc
tactttgattcacaacttgaaccaggaaaccatacattaactatttcaactggagatggt
aatactactggtaatgttggaacattaagtgatgctggtggatttagtttccaagaacaa
gacaaggcatttactgtagatactatgagtacagcaccagtacctacaaaagtagaagaa
actaagagtggtgaaattcacatcacatttgatagatcaatggatgtacaaacagttaaa
aatacaggaaactataaagtaaatggtaaatctttagctgatattaatggtgcatacatc
aaaactgataatgatgacaaattaataaaattaaaacatgttagtgatggaacaataaaa
actggagcaaacacacttgatataagtgatgatgttaaggatgcttttggaaatactgtt
cctaaggatactagaaagagcttcgacgatgttaaggatgaaactaaacctacagttagc
aaaattgaagtaatagatagtgaaactgtccgtgtaaaattcagcaaagatgttgattat
caatatgctcacaacttatcaaactacacattaaaagatgataagggaatagatataact
agccatatcaaaggtgtatacagtactgtaggagaatccgatactggaaatacagatact
tataacattaaattgtggaaattcaaagctacaatggaacaagctaaaggaattgcagta
caacctggagatgaaagcgaagattggagattaacatccaataaatataacttaacaata
aagaacatcagagatacagcatctactccaaatgtaatggaagactatgcttatactata
aatgatgcagcagatactatagctcctaagggaactggaatctatgctaagatgagagga
actggagacaaggataaagtagttgtttacttcagtgaatctatggatgcatcaactctt
acaaacaaagataactatcagtttataaatggagaaggagatagcaaatcattaccagca
gatactaatatcacaactggtggagataacaaatctgctatacttgaattcccatcaagc
taccatgtaaagacaggtggtaagataactactggaactacaaacgatgtatcagcagtt
actgtatttaatgttaaggatacatcaggaaataaattagacggaacagcatacaacaac
gataacagaatcgatgaagcaaaagcaggtgctacagttaaggataatacaataagaaca
ttctatgatacagacgatgctggtgacttaaagatcgctgttcaatttacaagagcaata
agctcaattactgattcagatgttacatttggtggagtagtaccaagcagtcactcttta
agtggtgatacagtaacatttaaatttgataagaaccaaaaagctactgctgctgattta
gctaaagctgctgcagcaaatccaggttcaagcatagttaaagctgatggtatacactat
gctaatggcttagtaaataaaactccaactaagattgagcttgtaaaagcacaaggaaat
ggcttgaaatttgatgtaactgctacttctactaatacatcagatgaaacaggagctaaa
ttgtgcgtaggcgaagatggagctaaattaacacttactgatagccaagctaaagtatac
aacaacgatgctcgtccaagaactacttgctacgatgacgatacagcagatttctggaca
gcaacaaaagataataatggtggaaaagtatatgttacatttgatactccacttgacaat
agtaatactgatgcagacagctttgtattcatgggacttaacggaacacaaattaaagct
gacagtgcaacaatcagcggaaacactgttatattcaacttcaagaatgataaaaactac
gcaacagcatttagtggtagcttagatatacatgctcaatctacagcaggatttatggct
caaagagatgttaatggcgaaaaatctgtatacaaagcatcttctgatgatacagatact
aagactatcagcgtaactgacaatactactacacaacaagcaacaattgaacaagctgga
acagcaatagttggaaaaacagtagtagttgcatcattagcaacaggattagatcctgct
caatatgatataacagtaaatggaacaaaattaacttatagtgctacatcaggaaaatac
actgcaacaattgacggaactttcactgtagcagatttacaagctaaaactgtagtaact
aaaatagaaacaccaactccaggtacaatgccagcagcaacagttgaacaagctggaaca
gcaatagttggaaaaacagtagcagttgtatcattaccagcaggtactgattgcactaaa
tacgttgtaacagtaaacggaacagcattaacttataatgctacatcaggaaagttcact
ggaacagttgatggaactttcactatagcagatttacaagctaaaactgtagtatcagca
aaatag
DBGET
integrated database retrieval system