Chrysoperla carnea: 123299659
Help
Entry
123299659 CDS
T09255
Name
(RefSeq) rabankyrin-5
KO
K20129
rabankyrin-5
Organism
ccrn
Chrysoperla carnea
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ccrn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ccrn04131
]
123299659
Membrane trafficking [BR:
ccrn04131
]
Endocytosis
Rab GTPases and associated proteins
Rab associated proteins
123299659
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ank_2
Ank
Ank_4
Ank_3
Ank_5
FYVE
BTB
DUF6361
DUF3251
FYVE_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
123299659
NCBI-ProteinID:
XP_044737882
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(8539675..8583225)
Genome browser
AA seq
1126 aa
AA seq
DB search
MAQTEVTKLQQHLSLLKEEYTKLQSHCAEIERKYNLAAASAGELNETSFVARLLSSVALL
YGKTTYSDIKIKLNNQTFPAHRLILSARSDKWNEETLGKAKELDWSNLDESVAQTLLKWI
YTDSIDLSRDDDTLLLLMRTAHDYGLDGLVHRCEQTLISRAGVRNCVRFYTAAETISAKR
LEEHCSALISAHWDDLTGHDFEHMSGPLLYKMLKTKIKHVLHAAIRLNREDVVFLFLVEH
NNNLSTVINEWSPNGELPLDLALSTNQISIASNLIQNKADVNIRDERNDPLLLRAIRRND
IKSAIYLIEHGANVKLTSLNDMDTALHLLAAINTTDTADDTGEDEEIITKLIIEKGVNIN
AQNSKGYTPLHICMMCRNIQLAEILLAQSELDLSLKTYEDEHTALYFALLKDNDFTLAES
LIERGCIVNPIYSKNGDSLLHELARQCLSDAGNFIAQRAKDNINHVNRDGNTALHICCQH
GCHLFVQYLLIHGANPNIANNLGQSPLHIAVVKNHVNCIKAFIDHNKNYPENKCNLNLTN
ADGETAVGIALKESLDDLIPVLVKGGADVNIKNVNGLTLLHQAILKEDSTSALFLLENGA
DIDSTTGDNETPLQLAVHCRLPTVVEALCVRGVDMGRLDAQGSPALWAALSSDQEDIAST
LIRHGADPDCWGPGPGNCLQTLLHKAIDENMESAAVFLIQAGCDRDSPRRPGLNGEESDE
SKDKASPLHLCCTWGLEQVVQTLIEHGANVNSRDADMKTPLHIAIENQHPTIISLLLCHP
NIDLSLRDKNGLSPFATALTFRNNNAAQSILDRLPSAAEQVDGKGCNFLHTAIQKGDLES
VLFLLAVQVDVNSRVQDSNLTPSLHLAARAGNEMLVRSLILAGARPDDRDAHKQTALHAA
SDAGHAAIVSALLQNGADCDATNSDGDNALHIAVREGHLPVVRALLTESRLDAEAINLKG
RNPLHELCRCAKENAAAICELFLECMPEYPINQPDLQGNTPLLLAYIKGNGPLCRALVAA
HACMGAENKEGVTIFNYQVASKQLLHNLLDRLNQEAPWAEAEVCQECGNKFGFATRKHHC
RHCGRCLCGRCSDQEVPILKFGLNKPARVCQVCFQVLQNGSSRYVP
NT seq
3381 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctcaaactgaagtcacaaaacttcagcaacatctttcattattgaaagaggaatac
acaaaactacaatcacattgtgctgaaattgaacgtaaatataatttagccgcagcttca
gccggcgaattaaatgaaacaagttttgtagcgagattattgtcatcggtggcattactt
tatggaaaaactacttacagcgatattaaaattaagttgaataatcaaacattcccggca
catcgattaattttgagtgcacgatctgataaatggaatgaagagacgttagggaaagca
aaggaattggattggtcaaatttagatgaaagtgttgcgcaaacattattaaaatggatt
tatacagattccattgatttatcacgagatgatgatacgctcttattgttgatgcgtaca
gctcacgattatggattggatggtcttgtgcatcgctgtgaacaaactttaatttccaga
gcgggagtacgaaattgtgttagattttatacagcagctgaaacaatatctgcaaaacgt
ttagaagaacattgttcagcattaatatcagcccattgggatgacttaactggtcatgat
tttgaacatatgtctggaccattattatataaaatgttgaaaaccaaaattaaacatgtc
cttcatgcagccatccgattaaatcgtgaagatgttgtttttctatttctcgtcgaacac
aataacaatttatcaacggtcatcaacgaatggagtccaaatggtgaacttccacttgat
ttagccctgtccacaaatcaaataagtatcgcaagcaatttaatacaaaataaggctgat
gtaaatatccgtgatgaacgaaacgatccgttactattacgtgcaatccgtcgtaacgat
attaaatccgcaatatatttaatagaacatggtgctaatgttaagttaacaagcttaaat
gatatggatacagctttacacttattagctgcaatcaacacaaccgatacggctgacgat
accggtgaagatgaagaaatcataacaaaactgattattgaaaaaggcgttaatatcaat
gcacaaaattcaaaaggttacaccccacttcatatatgtatgatgtgtcgaaatattcag
ttagcggaaattttgttagctcaatcagagcttgatttatcgttgaaaacatacgaggat
gaacatacagcgttatatttcgcactgttaaaggataatgattttacgttagctgaaagt
ttaattgaacgtggttgtattgtgaatccgatttattcgaagaatggtgatagtttatta
catgagctagcacgtcaatgtttatcagatgctggtaattttattgctcaaagagctaaa
gataatattaatcatgtaaatcgtgatggtaatactgccttacatatctgttgtcaacat
ggatgccatttatttgtacaatatttgttaatacatggagcaaatccaaatattgctaat
aatcttggacaaagtccacttcatattgctgttgttaagaatcatgtaaattgtataaaa
gcatttatcgatcacaataaaaattatccagaaaataagtgtaatttaaatttaacaaat
gccgatggagaaactgctgttggtatagcgttgaaagaatctttggatgatttaatacca
gttttagtcaagggtggagctgatgttaatatcaaaaatgttaacggtttaacattatta
catcaagcaatcttaaaagaggattctacttcagctttatttttattggaaaatggtgct
gacattgattccacaactggagacaatgaaactccactacaattagctgtccattgtcgt
ttaccaacagttgtagaagcactttgtgtacgtggtgtagatatgggacgtttagacgct
caaggctcaccagcactttgggccgcattgagctcagatcaagaggatattgccagtacc
cttattcgtcacggcgcagatccagattgttggggacctggaccaggaaattgtctacaa
actttattacacaaagcaatcgatgaaaatatggaatcagcagctgtatttttaattcag
gcaggatgcgatcgtgattcaccacgccgacctggtttaaacggtgaagaatcggatgaa
tccaaagataaagctagtccattgcatttatgttgtacatggggtcttgaacaagttgtt
caaacattgattgaacacggagcgaatgtgaattccagagatgctgatatgaaaactccc
ctacacattgcgattgaaaatcaacatccaacaatcatttcactgttactttgccatcca
aatattgatttaagcctacgtgataaaaatggattatccccatttgccactgctcttaca
ttccgtaataataatgcggcacaatcgatattagatcgtttaccgtccgccgctgaacaa
gttgatggaaaaggttgtaactttttacatacagcaattcaaaaaggtgatcttgaaagt
gtattattcttacttgctgtgcaagtcgatgtgaattcacgtgttcaagactcaaatctt
acgcctagtttacatttagccgcacgggctggtaatgaaatgcttgtgcgaagtttaata
ttagcaggtgcccgtccagatgatcgtgatgcccataaacaaacagctcttcatgccgca
tctgatgcaggtcatgctgctattgtttctgctctattacaaaatggcgcagattgtgac
gcaacgaatagcgatggtgataatgctttacatattgcagtgcgtgaaggtcatttacca
gtagtgcgtgcactattaactgaatctagattagatgctgaagccatcaatttaaaaggg
cgtaatcctcttcatgagctatgtagatgtgctaaagaaaacgctgctgcaatatgtgaa
ttatttttagaatgtatgcctgagtatccaataaatcaacccgatttacaaggaaatacc
ccattacttctagcctacatcaaaggtaacggaccactatgtcgtgccttagtcgctgca
catgcatgtatgggggctgagaacaaagaaggtgtcacaatattcaattatcaagttgca
agtaaacaattgttacataatttgttagatcgattaaatcaggaggcaccatgggctgaa
gccgaagtgtgtcaggaatgtggcaataaatttggctttgcaacacgtaaacatcattgt
cggcattgtggacgatgtttatgtggtcgatgttctgatcaagaggtaccaatattaaag
tttggtttgaataaacctgctcgagtttgtcaagtatgttttcaggtgttacagaatggc
agtagtagatatgtgccataa
DBGET
integrated database retrieval system