Chryseobacterium indologenes: CEQ15_14310
Help
Entry
CEQ15_14310 CDS
T04932
Name
(GenBank) RHS repeat-associated core domain-containing protein
Organism
cio
Chryseobacterium indologenes
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF6443
RHS_repeat
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASE62583
LinkDB
All DBs
Position
complement(3149665..3153489)
Genome browser
AA seq
1274 aa
AA seq
DB search
MKKIIVGFNLLFVAGISFAQTNLSTNENYVYSKTCMDEDCTKKSESVQYFDGLGRPIQSI
AIKATPLGRDVVLPVEYDALGRQAKSYYPVPQNGSQNGALYANPLANAPAAGYGNEKIYT
EKKYDNLFAGRVSQVIPAGNTWSQKPVGLGYGTNIDGEVRKYSVTTTWVDGRTETAISGP
VFYAANQLGKNTVTDPDGNTGTEFKNGKGETILVRKNDGAQNVDTYYLHNEYGQLVYVIP
PMAVTGTAPDQATLDNLCYQYRYDGQGRLVEKKVPGRGWDYMIYDAQDRPVATQDANLRE
KGQWLYTKYDKFGRVTFTGINSGGGRSAEQIIATAYGSNNVSRTSSVFFNREGMDVYYDP
NSTYPVAGWVKLLLINYYDTYPAYSFNPPFPSSVLGKTVISDTGNAVVNTQAMPTLSFVK
NIEDDNWTKNYAYYDAEGRLISTYTINHLGGYSRIENELDFAGVTKQTKIYHKRLSGDKE
MVIAQSFDYDGQNRMIRHRHQVGGQAVEILAENAYNELSQITNKKVGNGLESIDYQYDIR
GALTKINDPVALGTKLFGYELKYQNPAYTNIAPGKSNGNISEIDWKSASDGVLKRYSYTY
DPLNRLKDAIYTEPNTTNPYNNYYNEYATYDLNGNIKTLKRNAFPITGTTATQVDDLVYK
YTGNRLDKVIENALNDTGYEGGNNTIDYDLNGNMINMKDKGIQKMGYNLLSLQNQLSISS
TNGAGKVSNTNIDHIYRADGAKLRKISVQQAYMGLPRTQTTDYLDGFQYTNIDNGQGCRT
CKTESAYEEQAYTKIIGPVFPGGPLWTLDFIPTAEGFYSFTENRYIYQYKDHLGNVRVSF
TRNSAGAPEITGTNNYYPFGLNHIGGSNMSPFSNYHSYKFGGKELQETGMYDFEARMYMP
DLGRWAVIDPMAEAMRRYSPYNYAFNNPISFIDPDGMQPRQFSMPTDTRPDAPSTWINPN
WLGRGGAEFGSIDTGYSGGGGGASMSAEGLINTAFNLGSGTWFNTKFGLENGNGILLGYD
GGYKSLNSNYEEGGIGAIVTTIEVNITGKGKSYNWNLGDNYLPNILAMGMAFNQSLAGFN
YQNGGGRLDPMIGVRNDGPIRYMGGAGDPWGIYEGIGMVISGSDKSNMKYAALPFLIMTR
NTDDALKLLAVEKSILKEEAKAISKNAVAKNGTLNAGPFAGEGLVAKNGKSRNFTVDERK
VINEQGYSLGCHTCGQKSPGTKSGNFILDHQPANALIPSGWPQTFYPHCRFCSSSQGGII
GGMKKQGVLPKISN
NT seq
3825 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaattatagtaggattcaatctcttgtttgtagcaggaatttcctttgcgcaa
accaacctcagcactaatgagaactatgtctacagtaaaacctgtatggatgaagactgt
actaaaaaatcagaatccgtacagtattttgatggattgggaagacccatccagtcgata
gccattaaagcgacccctttgggaagagatgtggtactgcctgtggaatacgatgccttg
ggaagacaggctaaaagttattatcctgttcctcaaaacggaagtcagaacggggcactt
tacgccaatccattagccaatgctccggctgcgggctatgggaatgaaaaaatttatacg
gaaaaaaaatatgataacctgtttgcaggccgtgtcagccaggtcattcctgccggaaat
acatggtctcaaaagcctgtaggcctgggatacggaaccaatattgacggcgaagtcaga
aaatatagcgtaaccactacctgggtagacggcaggacggaaaccgctatttccgggcct
gttttttacgctgccaatcaattgggaaaaaatacggtaaccgatcccgacggaaatacc
ggtacggaatttaaaaacggaaaaggagaaaccatcctcgttagaaaaaatgacggggca
caaaatgtagatacctactatctccacaatgaatacggacaactggtctatgtcattcct
ccgatggccgtaacgggtaccgctcctgatcaggccacattggataatctctgttaccag
tatcgctacgacggacaggggaggttggtagagaaaaaagtccctggaagaggctgggat
tatatgatctatgatgctcaggacagaccggtagccactcaggatgccaacttaagagaa
aaaggacaatggttgtacactaaatatgataagttcggaagagtaacatttaccgggata
aattcaggtggaggaagaagtgctgaacagattatagccaccgcgtatggtagcaataat
gttagtagaacttcatctgttttctttaaccgggaaggaatggatgtatattatgatcct
aatagtacttatcctgtggctggttgggtaaaactgctattaatcaactattatgatacc
tatccagcctacagttttaatccgccttttccatcttctgtgttaggaaaaactgttatt
tctgatacgggaaatgcagtggtaaacacacaggcaatgcctaccctcagttttgtcaaa
aatattgaggatgataactggacaaaaaattatgcgtattacgatgctgaaggaagattg
ataagtacatacactatcaatcacctaggtggttatagcagaattgaaaatgagctggat
tttgcaggtgtaacaaaacagaccaaaatatatcacaaaagactgagtggtgataaagaa
atggtcattgcccaaagttttgattatgacggacaaaacagaatgatcagacatcgtcac
caggtaggagggcaagctgtggaaatactggctgaaaatgcctataatgaattgtcacag
atcaccaacaaaaaagtaggaaatggtctggagagtatcgattatcagtatgacattcgt
ggggctcttacgaaaatcaatgatccggtagcattgggcactaaactgttcgggtatgaa
ctgaaataccagaacccggcctacaccaatattgctccgggaaaaagcaatggaaatatc
tctgaaatcgactggaagtctgcttcagacggcgtattgaaaagatattcttacacctat
gatccgttaaacaggttaaaagatgccatatatacagaacccaatacgaccaatccgtat
aacaattattataatgaatatgcgacttatgacctgaacggaaacatcaaaaccctgaaa
aggaatgcttttccaataacaggaactacagccactcaggttgatgacctggtgtataag
tataccggaaaccgtttggataaagtcattgaaaacgcattgaacgacaccggatatgaa
ggcggaaataatacgattgactatgacttgaacggaaatatgatcaatatgaaggataag
ggaattcagaagatgggttataatctgttaagtcttcagaatcagttatctatttcatca
accaatggggcaggaaaagtgtctaacacaaatattgatcacatctatagagcagacgga
gcaaaactccgaaaaatatctgttcaacaggcttatatgggactacccagaacgcaaacc
acagattatctggatggctttcagtataccaatatagataacggacaaggatgccgtacc
tgtaaaactgaaagtgcctatgaagagcaggcctataccaaaattattggtcctgttttc
cccggtggacctttatggacattggattttatccctaccgcagaaggcttttatagtttc
acggaaaaccgttatatttaccaatacaaagaccatttaggtaatgtaagagtaagtttc
acaagaaacagcgcaggcgctcctgaaattaccggaaccaacaactactatccatttggg
ctcaaccatattggaggcagtaacatgtccccattctctaattatcattcttacaagttt
ggaggtaaagaactccaggaaacaggaatgtatgattttgaagcaagaatgtatatgcct
gatctaggaagatgggccgttatagatcctatggcggaagctatgagaagatattctcct
tataattatgcgtttaataacccgataagctttatagatccggatgggatgcaacctcgt
cagttttcgatgcctacagataccagacctgatgctccctcaacttggatcaatcctaat
tggttaggaagaggaggtgctgaatttggatctatagacacaggatacagtggtggcgga
ggcggtgcttcaatgtctgctgaaggattgattaataccgcttttaatttaggatctggg
acgtggtttaatacaaaatttggtttagagaatggaaatggtattttattaggatatgat
ggtggttacaaaagtcttaattccaactatgaggaaggcggtattggcgcgattgttact
accattgaagttaatatcactggaaaaggaaaatcttataattggaatttaggagataac
tatcttccgaatatcttagcaatgggaatggcatttaatcagtcccttgcaggatttaat
taccagaatggaggcggaagacttgatcccatgataggggtgagaaatgatggtccaatc
aggtatatgggaggagcaggtgatccttggggaatttatgaaggaataggaatggttatt
tctggttctgataagagcaatatgaagtatgccgcattgcctttcttaataatgacaaga
aatacagatgatgccttaaaattattagctgtagaaaaaagtattcttaaagaggaagct
aaagcgatttcaaaaaatgcagttgctaaaaatggaacattaaatgctggacctttcgca
ggtgaagggctagtagcaaaaaatgggaaaagtagaaattttactgttgatgaaagaaaa
gttattaatgaacagggatatagtttgggttgccacacatgtgggcaaaaaagtccagga
actaaatcgggtaattttattttagatcatcaacctgcaaatgctttaatcccaagtgga
tggcctcaaaccttttaccctcattgtagattttgcagctcaagtcaaggtgggattatt
gggggaatgaaaaaacaaggtgttttaccaaagataagtaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
