Clostridium bornimense: CM240_1256
Help
Entry
CM240_1256 CDS
T03165
Name
(GenBank) HMG-I and HMG-Y, DNA-binding
Organism
clt
Clostridium bornimense
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Mu-transpos_C
Gp49
DUF2461
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CDM68420
UniProt:
W6SFG2
LinkDB
All DBs
Position
rep1:complement(1399801..1401948)
Genome browser
AA seq
715 aa
AA seq
DB search
MYCSLNVNSLIKINEDEKEIHRILWVSEDADAVFLINIFDKSWPHEVKLSDFAIDIKENR
VKFITNEIYNRVINANELSQKDINKRNKAFNVIMEFYQYIGEPNIFITSERNKYMNKVIE
KHEISRRTAEDYIKRYWKRGMTPNSLLPDTYKCGGKDKNKAAGELKRGRPRVHGENNGIN
VDENIKKIFRTSINRFYNNQNKNSLTTAYYLMLKEYFSEKIINGKENSELIIKDRKNIPS
LAQFRYWFHKERDLKKEITSRNGGRVFFQKHSAVLNTVNDLVVGPGMEYQIDATIGDVYL
VSRFNKEWIIGRPVIYIVIDTYSRLVTGINVTLEGPSWVGAMGALANAMTGKVQFCKEYD
IEIEEDEWPCKYIPYSIIGDRGEIAGFNADYLTDNLGIKVSNTPPYFAQWKPIVEQHFRL
LNLKTKPLMPGAINPDFRLRGAKDYRYDAILNIKEFTKVVILSILYHNNHNVLKGYRREK
GMIQEDVLPIPINLWNWGIKNKSGTLKTASEDFIKLSLMPRDKATITEKGIKFKGIFYSS
VTAIKEGLFEIARSKKSGRIRIDVAYDPRNLNNIYWLDRSGEKYEKCFLLKKEYRYLDKT
IEEIEYLRKKELLMLKNIEVDEVEKRINLIEEIEMVVNKAREEAKDIKLNSSNLIGIRAN
RNAEKIVCRKEDAFVIEDSVTMESANIIQYPKLEDGEDEDMMLLRNKQKGEKLNE
NT seq
2148 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtattgtagcttaaacgtaaatagtctgataaaaataaatgaagatgagaaggagata
catagaattttatgggtttcagaagatgcagatgcggtttttttaataaatatatttgat
aaatcgtggccccatgaagttaagttatctgactttgctatagatataaaggaaaatagg
gttaaattcattacaaatgaaatttataatagagtaattaatgcaaatgagttaagtcaa
aaggatataaataagagaaataaggcttttaatgttattatggaattttatcaatatata
ggagaaccaaatatatttataacatctgaacgtaataaatatatgaataaagttatagag
aaacatgaaattagtagaagaacagcagaagattacataaaaagatattggaagcgtggg
atgactccaaattcattacttcctgatacttataaatgtgggggtaaagataaaaataaa
gcagcaggagaattaaagagaggtagaccgagggtacatggtgaaaataacggaattaat
gtagatgaaaatattaaaaagatttttagaacatcaattaacagattttataataatcaa
aacaaaaactcacttactactgcttattatttaatgttaaaagagtatttcagtgaaaaa
ataataaatggaaaagaaaatagtgaattaattattaaggatagaaaaaatataccatca
ttagctcaatttagatattggtttcataaggagcgagatttgaagaaagaaattacaagt
agaaatggtggaagggtattttttcaaaaacatagtgctgtacttaatactgttaatgat
ttagtagtagggccaggcatggaatatcaaattgatgctactattggtgatgtatattta
gtttcaaggtttaataaagaatggataataggtagacctgtaatttatattgttatagat
acatattctcgtttagttactggaattaatgttacattagaaggaccatcatgggttgga
gcaatgggagcattagcaaatgctatgactggaaaagttcaattttgtaaggaatatgat
attgagatagaggaagatgaatggccatgtaagtatattccttattcaattataggagat
agaggagaaatagctggttttaatgcagattatttaacagataatttaggaattaaagta
tctaatacacctccatattttgcccaatggaaacctattgtagaacagcattttcgatta
ttaaacttaaaaactaaaccattaatgccaggtgctataaatccagactttagattgcgt
ggtgcaaaagattataggtatgatgctattttaaatataaaagagtttactaaggtagtt
attttatccatcttatatcataataaccataatgtattaaagggatatagaagagaaaaa
ggaatgattcaggaggatgttcttccaataccaatcaatttgtggaattggggaataaaa
aataagagtggtacattgaaaactgcatctgaagactttattaaacttagtttaatgcca
agagataaagcaactataacagaaaaaggaattaaatttaaaggaattttttatagctca
gtaactgcaataaaggaaggattatttgaaattgctcgttcaaagaaaagtgggagaatt
agaatagatgtagcttatgatccacgaaatcttaataatatttactggttagataggagt
ggagaaaagtatgaaaaatgctttttattaaaaaaagaatatagatatttagataaaaca
attgaagaaattgaatatcttaggaaaaaagaattattgatgcttaaaaatatagaagtt
gatgaagttgagaagagaataaatttaattgaagaaatagaaatggtagtgaataaagca
agggaagaagcaaaagatattaaattaaatagttctaaccttataggaataagagcaaat
agaaatgcagagaaaattgtatgtagaaaagaagacgcttttgttatagaagatagtgta
acaatggaatctgcaaatataatacaatatcccaaattagaagatggagaagatgaagat
atgatgttattaagaaataaacaaaaaggagaaaaattaaatgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
