Candida orthopsilosis: CORT_0D07300
Help
Entry
CORT_0D07300 CDS
T02488
Name
(RefSeq) Rav1 protein
KO
K24155
rabconnectin-3a
Organism
cot
Candida orthopsilosis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cot00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
cot04131
]
CORT_0D07300
Membrane trafficking [BR:
cot04131
]
Exocytosis
Small GTPases and associated proteins
Rab associated proteins
CORT_0D07300
Endosome - Lysosome transport
Acidification regulators
Rabconnectin-3 complex
CORT_0D07300
RAVE complex
CORT_0D07300
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Rav1p_C
WD40
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
14540104
NCBI-ProteinID:
XP_003869696
UniProt:
H8X6F2
LinkDB
All DBs
Position
4:1504384..1508616
Genome browser
AA seq
1410 aa
AA seq
DB search
MTITFIPGEVNKSSCSVVQSNWKNHHIIAYGSGNNLIITTATIQPTNKRPNPYNIDKDLQ
TIYLAKDPTAIDINHKNGVIAVAYDDKLIIYRPMNEYMAIPKWTLAIEFTVDTDVTSLEW
ACEEDELVIGGKQSLYLYHVAEQYGEFKLLQRWSSTQPGAVSNICISPNAKLIMTTSGPY
DRLVKVWTRMNYGDENSQFEVSYLVHPPGSHVVDFHWRRKSSKKSEKVLDGSMAHIRKMR
GYVNLNNDDSEVIYTWTSDYQFKAWASYESNGHNHISNWANLDLTSCFKGDGIRAVLIIE
NIYLQNSLIPLLKSSTSNLFDGLNLHDIDLLYVISNSGTARIYAVTNITQTPPTNIKFIP
IGEELDLEFGRNEFPHLDVRCEHDLSVEYIESNEFVTTHLKPVLIKGLSRLNNDERVKYL
SFLLHDRVKNTVRFEVIDFNRLLKSGSLGITLVNKYQGHVKSIRKLIRSNSLYSSKNVVL
SISNFAKHNYIWEPMIIEENGLNIMSITKRFRVELSGDGNSIWDAAIINDIEPPIGYKRR
HVVVVVEKLGKLSLWDCNGSINDDQPATKIDVVDCEERQPRAFVLTEYPGNTQYKKQYCI
IAVFEKDLIKAWNLVLTYHDDKIDAIKLQSQQIANLPQDEDIYQITRVDAFLNDNSKSLI
AVIDKEGLLKSYTLDYDTDQLSWVTMCSIPTNVKNPGKINGSTVINKFAVVDEYKRCLSI
WDTTQGVLEYEETFASKNGPVTDLDWTFINAASNENSTTNAILSVGFGRFVLLYTQLRYD
YTNKIPTYATIKKIDVSDYTSHEIGDSIWLDKGYLVIGCGNQFFIDDRWIKLGSSTIDST
IRQFMSGYVDKPQEEKRDKENIVYDISQLVRVLNGPLPIYHPQFLIQALFMSQIIPVQNI
LVKLFQALRQGQAIEWDLGIDFVHEIEKHLEPTSNGKIQPLQRRMSQTFNLDVFTKFNDE
LADLLSDKLMKVSLPLMTRHQQSTLLSVVAIVKELNKYSMTLDENGIRFMIGFKLFQLAT
KQKRLSMRDINWALHSDNKEVLLNSVETYYKNRLTWENVQQTGLAYWVKTDRLIKLVESV
ARNEFGESRDPSGLVSLLYLALRKKQILIGLWRIVNHEEKTKMLKFMNNDFTSPRWKSAA
LKNAFVLLGKHRYMDAAYFFLLADKPYDCCSTLATKVEDISLAIAVAKVYFGVQNIGKES
NDCLVQVMEKFVLPHAIQNGDRWSTSWVFWQMNDKQMAIQSLIKSPLQMIEQSGDRFKEL
RDVAVSSKGQSFLRDDPVLVLLFNDLRHRKVDYLKGSLNISSQQEFDFVVRVAMIYTRMG
CEYLALLLLRSWTFVQGQKYIGQANGVENGAKVENGFAQENGNAAPNLLNSYADAQPSPS
SPTHTSFKNKAPPPAQAFEEPDMSSFNFGF
NT seq
4233 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactatcacatttatcccaggtgaggtcaataaaagttcatgttcagtagtacaatcc
aattggaagaaccatcacattattgcctacgggtcaggtaacaatttgatcataactaca
gccactattcagccaaccaataagcgccccaacccatacaatatcgataaagacttacaa
actatatatcttgcaaaagaccccacagccattgatatcaatcacaagaatggtgttatt
gctgttgcatatgatgacaaacttatcatttacagacccatgaatgaatacatggccata
ccgaaatggacattagcaattgaatttactgttgataccgatgtcacgtctcttgaatgg
gcttgtgaagaggatgaattggtgattggtgggaagcaaagtctatatttgtatcatgtg
gctgaacaatatggtgaatttaaacttctacagcgatggagctcaacacaacctggtgct
gtatcgaatatatgtataagtcccaatgcaaagctcataatgactacaagtggtccatat
gaccgactagttaaagtatggacgagaatgaactatggtgacgaaaattctcaatttgaa
gtgtcatatttagtccacccaccaggttcgcacgtggttgatttccattggcgcaggaaa
tcaagtaaaaagagtgaaaaagtactagatggatccatggctcacattagaaagatgagg
gggtatgttaatcttaataatgacgacagtgaagtgatctacacctggacttcagattat
cagtttaaagcgtgggcgtcgtatgaatcaaacggacataatcatataagcaattgggcg
aatttggatctaactagttgctttaaaggagatggcattagagctgttctcattattgaa
aatatataccttcaaaacagcttgataccattgttgaagagctctacatctaatctattt
gatggactcaacttgcatgatattgatttattgtatgtcatttcaaattcagggacagct
aggatatatgccgtgactaatataacacaaacaccacccacaaacatcaaatttatcccc
attggtgaggaattggatcttgagtttggaagaaacgagttccctcatttggatgtacgc
tgtgaacatgacttgtctgtggagtatattgagtcaaatgagtttgtaacgacgcatttg
aagcccgtattgataaagggtttatcgcgattgaataatgatgagcgagtaaagtacctt
tcatttttacttcatgatcgagtgaaaaacacagtccggtttgaagttattgattttaat
agacttttgaaatcgggatccttgggtatcacattggtgaataaatatcaggggcatgtt
aaatctatcagaaagctaatccgatcaaattcgctttattcctcaaagaatgttgtgtta
tctatttccaatttcgctaagcataattatatttgggaaccaatgattattgaagagaac
ggattgaatattatgtccattaccaagcgattcagagtggaattgtcaggtgatggaaac
agtatatgggacgcggcaattataaacgatattgaaccacccattggctacaaacgacgt
catgtggttgttgtggttgaaaaattgggcaaattgagtctttgggattgtaatggttcg
ataaatgatgatcagccggctacaaagattgatgttgttgattgtgaagagagacaacct
agggcatttgttttgaccgagtatcctggaaatactcaatataagaagcaatattgcatt
atagccgtgtttgaaaaagatttgatcaaggcatggaatttggtgcttacatatcatgat
gacaaaattgatgctattaaacttcaaagtcaacagattgctaatttacctcaagatgag
gatatttaccaaattacgcgcgttgatgcgtttttaaatgataatagcaagagcttgatt
gccgttattgataaggaaggtttactaaaaagttacaccttggattacgatacagatcag
ctttcatgggtcacaatgtgcagcatccccaccaatgtaaaaaacccagggaagataaac
gggtccacagtaattaacaaatttgctgtcgttgatgaatacaagcgttgtttatcgatc
tgggatacaactcaaggggtattagaatacgaagagacatttgcttcgaaaaatggacca
gttacagacctagattggacttttattaacgctgcgtccaatgaaaactcgacgacaaat
gccatcttgtcggtgggatttggaagatttgtgttgctatacacgcaattgcggtacgac
tacacaaacaaaataccaacgtatgccaccatcaaaaaaattgacgtttctgattatact
tcacatgagattggcgacctgatttggcttgataaaggatatttggtgattgggtgtggg
aatcaattctttattgatgatcgatggattaaattgggttctagtactattgactcaaca
atacgacaatttatgagtgggtatgttgacaagcctcaggaggagaagcgcgataaggag
aatatagtgtatgatatttcacaattggttagagttttgaatggtccgttgccaatatat
catccacagttcctcattcaagcattgtttatgagtcaaattatacccgtacagaatatc
ttggtgaaattgtttcaagctttgagacaggggcaggcaattgagtgggacttagggatt
gattttgttcatgagattgaaaaacatttagagccaaccagtaatgggaaaattcaaccg
ttacagcgacgaatgtcgcaaactttcaacttggatgtgttcacaaagtttaatgatgaa
ttggccgatttgcttctggataaattaatgaaagtatcccttccattaatgacacgacat
cagcaaagtactttgttatcagttgttgccatagtcaaggaattgaataaatattcaatg
actttggatgaaaatggaataagattcatgattggatttaaattgtttcaattggcaacg
aagcaaaaacgtctttcaatgagagatataaactgggctctacattcagataataaggaa
gtattgttgaattcggtggagacgtattacaaaaatcgattgacttgggaaaatgttcaa
caaacggggttggcgtactgggtcaagacagatcgattgatcaaactagttgagtcggtg
gccaggaatgagtttggtgaatcccgtgatccttcaggcttagtgtcattgctttatttg
gcgttgcggaaaaagcaaatcttgattggattatggcgtattgtcaatcatgaagagaaa
accaagatgttgaaatttatgaataacgactttactagtccgagatggaaatcagccgct
ttgaaaaatgcctttgttctacttggtaaacacagatacatggatgctgcatatttcttt
ttgttagctgataaaccatatgattgttgtagtacattggccaccaaagttgaagatatt
tcattagctatagcggtggcaaaggtatactttggagtacagaatatcggtaaagagtca
aatgattgtttagttcaagttatggagaaattcgttttgcctcatgcgatccagaatggt
gatcgttggagtacaagttgggtattttggcagatgaatgataaacaaatggcgattcaa
tcattgatcaaatcgccattacaaatgattgaacaaagtggcgataggtttaaagagttg
cgtgatgttgctgtgtcatcaaagggacaaagttttcttcgcgatgatccggtacttgtt
ttgttatttaatgatttgagacatcgtaaagtggattatcttaaggggtcattgaatatc
tccctgcaacaggagtttgattttgttgttcgagtagcaatgatttatactagaatgggt
tgtgagtaccttgctttactacttttgagaagttggacatttgttcaagggcagaagtac
attggacaggccaatggtgttgagaatggagctaaagttgaaaatggatttgctcaagag
aatggaaacgcggcgccaaacttacttaattcatatgctgacgcacaaccttccccttcg
tcacctactcatacatccttcaagaataaggctccaccaccagcacaagcatttgaggaa
ccagacatgagttcattcaattttggattctag
DBGET
integrated database retrieval system
