Lachnoclostridium phytofermentans: Cphy_0342
Help
Entry
Cphy_0342 CDS
T00619
Name
(GenBank) transcriptional regulator, AraC family
Organism
cpy
Lachnoclostridium phytofermentans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HTH_18
HTH_AraC
GGDEF_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABX40729
UniProt:
A9KST5
LinkDB
All DBs
Position
432371..434707
Genome browser
AA seq
778 aa
AA seq
DB search
MEEKQGSINYKKQIFIIIMTGALLPVILLALYFYYTYIHEVSDKIDLSNAKALEQVRNKV
ENVTETMQLNYMSSLWKGDYVVKEDSIDWFMKNIVSYSDYSNLKKVQDELLGATYLRIYI
NSFYFINFSTGWVLTSNGMYPLNEVVNQEQLYDLFYTGMSDCKWTYLSIENEGKGNRVIK
SDYITLAIKAPLNLKSPNCLLLVNLSSVGFERLLRNSLSSGKLTVFDAQGKLLFTEHKEV
SEFLDEYIKEHNTTIESLVERRDELSKKSGFNLNFSYSGANGWLYVSSYDPAIVTREASS
IIITAGLLILFMMTLIFLFSVVGSRTIYRPVSQLVTNLRNIEEIEEVAGQKENEFKFIGK
RINRLVDSKNDMKELIQVQQKQLKELFVLRLLKGEVREENIESNLKNFGFEKMRYISMIT
ISVSSKVIEEDWDYTKQDMIKISIVENMPEFISDQLLFPTVTNSNVILCTITRELKEELE
AASIELIRHLTDYIVMESGYHANFGISQPFDSLMKFRQAYNESLEAVKNNETLNRENTIC
EQQNFIFYSDIANSNSNNYTYELILEKEMKAAVDECDKEKAFLLADTFINHMAESGAVLN
ELHFYLHRFMVAVILVATDAGISVNDILGHGSVNVFLQFNQLSDLDKIRSFYKHNIISPV
IKQLSTFRRSNSDLVLDKIVKLVRETSSDITLTECADQLGYHPSYIWKIMKSKINMTFTD
YVTIQRLEIAKKMLLETDKSVAEIAEQLKYTNAQNFIRFFSKHVGTTPGKFRLMDRNS
NT seq
2337 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaggaaaaacaaggtagcataaactataaaaagcaaatattcataattattatgaca
ggtgcattattgccggtaattttattggccttgtacttttattatacctatattcatgaa
gtgagtgacaaaatcgatttatcgaatgccaaagcgttagaacaagttaggaacaaagta
gaaaatgtaacagagacgatgcaattaaactacatgtcttccctttggaagggtgattat
gtagtgaaagaggattctatcgattggtttatgaaaaacattgtttcttacagcgattat
tctaatttaaagaaagtacaggatgaactcttaggtgcaacctacttaaggatctatatc
aatagtttttattttattaatttctcaactggttgggttttaacaagcaatggtatgtat
cctttaaatgaagtggtaaatcaagaacaattgtatgatcttttctatactgggatgagt
gactgcaagtggacatatctaagtatagaaaatgaagggaagggaaatcgtgttattaaa
tccgactatattacgctagcgattaaggctcctctcaaccttaaaagcccaaattgcttg
ttgttagttaatttaagtagcgtagggtttgaaagacttcttagaaatagcttaagcagt
ggaaaattgaccgtttttgatgcacagggaaaactcttattcacagagcataaagaagtt
tcagaatttcttgatgagtacataaaagaacataatacaacaatagaatccttggtagaa
aggcgagatgaacttagtaagaagagtggttttaatttgaacttctcctattctggagcc
aatggatggctttatgtatccagttatgatccagctattgtgactcgtgaggcaagttct
attataataactgccggactcttaatactatttatgatgacacttatttttcttttctct
gtcgtaggttctcgaacaatttatcgtccagtatctcagttggtaacaaatctaagaaat
atagaggaaatagaagaggtagcaggacaaaaagagaatgaattcaaatttatcgggaaa
cgaattaatcgattagttgattcaaaaaatgatatgaaagaattaatacaggttcaacaa
aagcagttaaaggaattgttcgtccttcgtctattaaaaggagaagtaagagaagagaat
attgaatctaatttaaaaaactttggattcgaaaaaatgagatatatttcaatgattacg
attagtgtttcatcgaaagtaatagaggaagactgggactatacaaaacaagatatgata
aaaataagtatcgtggaaaacatgccggaatttattagtgaccagcttttatttcctacc
gttacaaattcaaatgtaattctttgcacaattacgagagagttaaaagaagaacttgaa
gcggcatcaattgaattgattcgccaccttaccgattatatcgtgatggaaagtggatat
catgcaaactttggcatcagccaaccttttgacagccttatgaaattcagacaggcttat
aatgaaagtttagaagcggtcaaaaataatgaaaccttaaatagagaaaataccatatgt
gagcagcaaaactttatattttattctgatatagcgaatagtaactcgaataactatacc
tatgaacttattttagagaaagagatgaaggcagcagtggatgagtgcgataaagagaaa
gcatttttattggcagatacttttattaaccacatggcagaaagcggtgctgttctaaat
gagcttcatttttatcttcatcgattcatggtagcagtaatattagtagcaacagatgcc
ggtatttcggtaaatgatattttgggtcatggatcggtaaatgtatttttgcaatttaat
caactttcggatttagataaaattcgaagcttttataagcataatattatttcaccggtg
attaaacagttaagtacattccgaagaagtaattctgatcttgtattagataagatagtt
aagttggtgagagaaacctctagcgatatcacattaacagaatgtgcagatcaactgggg
tatcatccaagttatatttggaagattatgaagagtaaaattaatatgacgtttaccgat
tatgtaacaatacaaagacttgaaattgcgaagaaaatgctattagaaacggacaaatcg
gtagcagaaattgcagaacaattaaaatacaccaatgcacagaactttatacgttttttt
agtaaacatgttgggacaacaccgggaaaatttagactgatggacagaaattcataa
DBGET
integrated database retrieval system