Cyanobacterium stanieri: Cyast_0561
Help
Entry
Cyast_0561 CDS
T02377
Name
(GenBank) diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)
Organism
csn
Cyanobacterium stanieri
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
PAS_9
PAS_3
PAS
PAS_4
PAS_8
GAF_2
GAF
DUF6353
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFZ46539
UniProt:
K9YI58
LinkDB
All DBs
Position
632354..636025
Genome browser
AA seq
1223 aa
AA seq
DB search
MYLLWSLILSLFAINIILTYVVIKQRNNSIILKHKLDLKSYQLLSFEEKNNFLQQESDYQ
KLIADELKKIDLIDSPYYYIELIKNISSLLDVSHSYYFEYLPRDNKFKLKYSTGLNKQQY
PHTVCNIHDNELGFLWSSEETHLIFEKLKNEKRFKFNFSVDEYNLNSGAIFTVVHPYSDE
KIGIVGFYSEEENIFNELEINLINSYIHFLQQNRIHLDKNNTLDLLDKGVNFILNGLVIL
DATKVDYPIIYVNDCFLNITGYQKDDVLGKNYSSLFHQNSSEYGLENLTSAIARGKETNV
IIKNYRQTGELYWSEVYLYPICKQKKLTNFIIIERDVTQEYNYQSSFDISSHQSRYFEEK
LQEINEIQYDLNQDLTTNLSQCLSYACEILGMQIGVVMEVSEYKSLIIGQYFSFSDQLFF
DNEYSLMHILSREICTIKDTIYNGYSTHFNSLTNDNFINNLSVTSYLATPIWINGSIYGT
IHLFDIDNNVHYFREQKYLLEAIAHSIAKAIIAEEKELEKEYIRVALEESQERLKGVLFS
LEDVIWSIHPQTLQLIYINTAATNLYECELSLFFQKRCFWLELVHPEDKERVKDYYSKIL
NIAIFDQDSNSHDIEYRIISCNGEEKYVRDRAYLVFDNYKKLIRIDGIITDITKKNLTQK
ALKKSERELQLIFELAPIGMMITNKKGVIQKTNNSLCQLLNYSSTELINQNEKILYHPDD
VSKNYFFLESILKDTQQQYSQERRYISKNGTVIHTMVDITILRNARGEILQLIQQIVDIS
QIKNMQEQMLHDSMYDSLTGLANRFLLMDRLAQTLKRCDRNPHELCAILLIDIDNFKKVN
DSMGHNIGDQLLSIIASKIISCVSEKDTVARVSGDEFVILLEELESPNQARKVAENIINI
CDTDYYLENHYVASSVSIGITLSSIGYENAEQMIRDADLTMHEAKTVGKNCYQLFKPIMH
KELVQKLQLESYLRKALENNELELFYQPIINLKTSQVAGFEALIRWFHPELGFISPVKFI
PLAEENGLIVSLGDWIFRTAAFQAKQWQDKYPQLNLSVAINVSSKQLLEHDFLGKIDRCV
AQTGVNPLLLKLEITESVLMDNFQTAKYILDNIQTRHLKISLDDFGTGYSSLSYLHALPF
NTLKIDRAFIESINREHERNAIVEAIVSLAHNLSLDVVAEGIELPIQEEILKEIGCDYGQ
GYYYAKPMSASLADSFIEQWNSR
NT seq
3672 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtacttactttggtctttaattttatctttatttgctattaacattattttaacttat
gttgtcatcaagcaaagaaataatagtattattttaaaacataaattagatttaaaatct
tatcaattattatcctttgaggaaaaaaataattttcttcagcaagaatctgattaccaa
aaattaattgcagatgagttaaaaaaaattgacctcatagacagtccatattactatatc
gaattaatcaaaaatattagtagtttattagatgtatctcacagctattattttgaatat
ttacctagagataataaattcaaattaaaatactctacaggcttaaataaacaacagtat
ccccatactgtttgtaatattcacgataacgaattaggctttttgtggtcttctgaagaa
acacatttaatttttgaaaaactaaaaaacgaaaaaagattcaagtttaatttttcagtg
gatgaatataatttaaactcaggggcaatttttactgtggttcatccttatagtgatgaa
aaaattgggatagttggattttatagtgaggaggaaaatatttttaatgagcttgaaatt
aatttaattaatagttatattcattttttacaacaaaatcgcattcatcttgataagaat
aatactcttgatttgcttgataaaggggttaattttatccttaatggattagttattctt
gatgctactaaagttgattatcctattatttatgttaatgattgttttttgaacataact
ggttatcaaaaagacgatgttttaggaaaaaattattcatctctttttcatcaaaattct
agtgagtatggtttagaaaatttgacaagtgcgatcgcccgtggaaaagaaactaacgtt
ataattaaaaactatcgtcaaactggggaactatattggagtgaggtttacttatatcct
atttgtaaacaaaaaaaattaactaactttattattattgaaagggatgtcactcaggaa
tataattatcaatcttcattcgatatttctagccatcaatctcgatattttgaggaaaaa
ttacaagaaattaatgaaattcagtatgatttaaaccaagatttaacaactaatttatca
caatgtttaagttatgcctgtgaaattttgggaatgcaaataggagtagtcatggaagta
tctgaatataaatctttgataattggtcaatatttttctttttcagatcaactatttttt
gataatgaatattctttgatgcacattctatctcgagaaatctgcacaataaaagatact
atttataatggttattctactcacttcaattctcttactaatgataattttatcaacaat
ttaagtgttacgagttatttagcaactcccatctggattaatggctcaatttatggcaca
attcatttatttgatatagataataatgttcattattttagagaacaaaaatatctttta
gaggcgatcgcccatagtatagcaaaagcaattattgcagaggaaaaagagttagaaaaa
gaatatattagagtcgccctagaagaaagtcaggagagattaaaaggagttttattttcc
cttgaggatgtcatttggtcaattcatccgcaaacattacaactaatttatatcaacact
gccgccaccaatttatatgaatgtgaactatcattatttttccaaaaaagatgtttttgg
ttagagttagtccatcccgaagacaaagaaagagtcaaagattattatagtaaaattttg
aatattgccatcttcgatcaagatagcaatagccatgatatagaatatcgaattatctcc
tgtaatggtgaagaaaaatatgtcagagatagggcttatttagtatttgataactataaa
aaactgatcagaattgacggcattattaccgatattaccaagaaaaatttaacccaaaaa
gccctcaaaaaaagcgaaagagaattgcaattaatttttgaactagcccccattggtatg
atgattaccaataaaaaaggagtaattcaaaaaactaataattctctctgtcaactactt
aattactcctccacagaattaattaatcaaaatgaaaaaatcctttatcatcccgatgat
gtatccaaaaattattttttccttgaaagtatcctcaaagacactcaacaacaatacagc
caagagagaagatatatcagcaaaaatggcaccgtaattcataccatggttgatattacc
attctcagaaatgctcgaggagaaatcttacaactcattcagcaaatcgttgatatttct
caaataaaaaatatgcaggagcaaatgcttcatgatagtatgtatgacagcttgactggt
ttagccaatcgtttcttgttaatggatagacttgctcaaactctcaaaaggtgcgatcgc
aacccccacgaattatgtgccatactgttgatagatattgataatttcaaaaaagttaac
gatagcatggggcataatattggtgatcaactcttatcaattattgctagtaaaattatt
tcctgtgtcagtgaaaaggataccgttgcccgtgtcagcggagatgaattcgtcattctc
ctcgaagaattagaatctcccaatcaagccagaaaagtagctgaaaatatcattaatatt
tgcgataccgactattacttagaaaatcactatgtagcatcatcagtaagcattggtatt
acattaagttccattggttatgaaaatgccgaacaaatgatcagagatgctgatttaacc
atgcacgaagccaaaacagtgggcaaaaattgttatcaactatttaagcccatcatgcac
aaagaattagtgcaaaaattacagctagaatcatatctcagaaaagcattagaaaataat
gaactagaacttttttatcagcccataattaatctcaaaacatcacaagtggcaggattt
gaagccctaatccgttggtttcatcccgaattaggttttatttcccctgtcaaattcatt
ccccttgccgaagaaaacggtttaattgtctctttgggggattggatttttcgcaccgcc
gcttttcaagcaaaacaatggcaagataaatatcctcagcttaatttgtccgttgcgatt
aatgtatctagtaagcagttattagagcatgactttctgggaaaaatagatcgttgtgtg
gcacaaacaggggtaaatcccctcttactaaagctagaaattaccgaaagtgttttaatg
gataactttcaaacagcgaaatatatccttgataatattcaaactcgccacctcaaaatt
tcccttgacgattttggcacaggttattcttcccttagttacttacacgctttgcctttt
aatactctcaaaattgatcgtgcttttattgaatcgattaatcgtgaacacgaaagaaat
gctattgtggaagccattgtatctcttgcccataatttatcccttgatgtggtggcagag
gggattgagttacccattcaggaggaaattttaaaggaaattggttgtgattatggtcag
ggttattattatgctaaacccatgagcgcttctttggcagattcttttattgaacagtgg
aacagtagatga
DBGET
integrated database retrieval system
