Chroococcidiopsis thermalis: Chro_5327
Help
Entry
Chro_5327 CDS
T02360
Name
(GenBank) surface antigen (D15)
Organism
cthe
Chroococcidiopsis thermalis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ShlB
POTRA_2
Omp85
POTRA
OMP_b-brl
bPH_6
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFY90694
UniProt:
K9U8W6
LinkDB
All DBs
Position
5982087..5983931
Genome browser
AA seq
614 aa
AA seq
DB search
MERKFYNSFASLLIQITGGIGCISISFCLLTPSLNASPDPAVVARTNLQAQLPIAQTPPL
PAPPPRPQDVIPRSEPAPPELPTPAPLPPPEDLLQPPDAPPTPAPIPGKIPEKLTVKRFE
VTGSTVFSPQDFEKVLAPFTNRSLSFAELFQARTAVTQLYIDKGYITSGALIPPQAIQDG
VVKIQVVEGGLEAVNIQGTRRLRPSYIRDRIPQATPLNQQRLLEALQLLQLNPLIQNLSA
ELSAGTRAGTSVLDVTVKEADTFDTQIVLDNGRSPSVGSFRRRVQLNQANLLGFGDGLSF
AYSNTDGSNGIDGSYTIPVNAKNGAVSLNVGFTDSNVIEPPFDDLEIDGNSRYFELSYRQ
PILQSPNREFALGLTAARRESEISSDVLEEFDYPSSLLSPGADEDGDTRISAVQFFQEWT
QRNTREVFAARSQFNLGVGAFDATINSDAPDSRFFSWQGQAQWVRLLAPDTLFLLRTNIQ
IADDPLVPLEQFGVGGLESVRGYRQDALLSDGGLFASAELRIPVYRVPERQLTLQVTPFV
DFGTIWNEAGRSVDDLTPPEDEDTLVSVGLGLRFQLADTVTARLDWGIPLVDIEDRDRTW
QENGVYFSVNYSLF
NT seq
1845 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaacgtaaattttacaatagttttgcatccctcctcatacaaataacgggagggatt
ggttgtataagcattagtttttgtttactgactcctagtcttaatgctagccccgatccg
gcggtcgttgcacggacaaacttacaagcacaactcccaatcgctcaaactccccctctc
cctgcaccgcctccgcgtccccaagatgtaattccgcgctccgaacccgcgcctccagaa
ctcccgacacccgctcccttaccaccaccagaagatttattacagccacctgatgcacct
cccacacccgcacctataccgggaaaaattccagaaaaactaacagttaaaaggtttgag
gtgactggcagtacggtatttagcccccaagatttcgagaaagttttagctcccttcaca
aatcgatcgctgtcttttgccgaactgtttcaagcccgtactgctgttacgcaactatat
atagataaaggatatattacctctggggctttaattccaccccaagccatccaagacggc
gtagtgaaaattcaagtcgtcgaagggggattagaagcagttaacatacagggaacgcgg
cgattaagacctagttacattcgcgatcgcattccgcaagccacacccctgaaccaacaa
cgcctgttagaggctttgcaactgctacaactcaatcccttaattcaaaacctctcagcc
gaactttcagcagggactcgtgcaggtacgagcgtgctagatgtcactgtgaaagaagca
gatacctttgatacgcaaattgtattggataacgggcgatcgcctagtgttggtagcttc
cggcgacgggtgcaattgaatcaagctaatttactcggatttggcgatgggttgagtttt
gcatatagcaataccgacggtagcaacggcatagatggtagttatacaatccccgtaaat
gctaaaaatggcgcggttagcttgaatgttggatttaccgacagcaacgtgatcgaacct
ccattcgacgacctcgaaattgatggtaattcccgctattttgaactcagctatcgtcaa
cctatattgcaatctcctaatcgtgaattcgctcttggtttaacagcagcgcggcgtgaa
agcgaaatttcttctgatgttttagaagagtttgactatccttcctctttgctatcacca
ggcgcagatgaggatggagatactcgcatttcagccgtccaattctttcaggaatggacg
caacgtaataccagagaagtatttgcagcgcgatcgcaatttaatttaggtgtgggagca
tttgacgctacgattaacagcgatgctccagacagtcgcttcttctcctggcaaggacaa
gcgcaatgggtacggttgctggctcccgatactttattcctactccgtacaaatatccaa
attgctgacgatccgctcgtacctttagaacaatttggcgtaggtggactcgaaagcgtc
agaggctaccgtcaagatgcactgctatcagatggtggtttatttgcttcggcagaactg
cgcattccagtttatcgcgttcccgaacggcaattgacactacaagtcacgcccttcgtc
gattttggaacgatttggaacgaagctgggcgatcggtggatgatttgactccgcctgaa
gacgaagataccttagtatcggtaggcttgggattgcgctttcaactagcagacaccgta
actgctcgtctagattggggtattcccttagtcgatattgaagaccgcgatcgcacctgg
caagaaaacggcgtatatttttcggtcaattacagtttgttttaa
DBGET
integrated database retrieval system