Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0274121
Help
Entry
DDB_G0274121 CDS
T00245
Symbol
abcA4
Name
(RefSeq) ABC transporter A family protein
KO
K05643
ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 3
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
ddi02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
DDB_G0274121 (abcA4)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ddi02000
]
DDB_G0274121 (abcA4)
Transporters [BR:
ddi02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCA (ABC1) subfamily
ABCA1, 2, 3, 4, 7, 12, 13 subgroups
DDB_G0274121 (abcA4)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
ABC2_membrane_3
AAA_21
SMC_N
Rad17
AAA_29
AAA_23
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8619342
NCBI-ProteinID:
XP_643915
dictyBase:
DDB_G0274121
UniProt:
Q555Z5
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(3872948..3877884)
Genome browser
AA seq
1615 aa
AA seq
DB search
MESIKNQLIPLLKKNWTLKGKSKIKLLLEILLPLISIGILFGILYLSMIITRDFKERPAS
GFAFDIAHTKQLLIGSNGGLNSDQRNILDNLKLQVSIQHPEFSNDYINRCFVEFKDIESM
DEYFHDPFNYRGVMGGVWFPDDSFNGNTIKYSIRVDSDFTHDNTQQFQDREDSQIYLRHY
FTQIQTGVDQAILLTNQIAIPIFATGQRFPNPYISFWEKWTDGRKLILLNTGGVFITASL
FATLFTLITNIVIEKETKILEGMKTMGLNSFAYYISNSIISLITLLSSTLLVSIILSASQ
LVHHVKWITLILILIPYSITLLLIAFILCKFFTKSKYAGLMAFLIVLLLSGIGIIIGRFN
ISPTLKLLSCLFSPIAISVANYVWCYKDLIVFKEVDINVNMVNEYEIIGMLVFDIFLYIL
ILWYLDNVITGEYGIPKKWYFFLTKNYWRKNKKSNINNNGVFDVEATSCNRNSSYNEKNF
EKIEHQLERPTISIRNLRKEFKTGDGNRIAVNDLSIDMYKNRIHSFLGPNGSGKSTTLSM
LTGMIEPTSGDALINGFDIRNNIDEIRKHLGVCPQSDIIWEQLTVMEHLEFYAALKGFTN
SNQRKVEATKIALEVGLGEKLNAPAGTLSGGQKRKLCLAIAFIGPNSDIILIDEPTSGLD
ASNRRLIWDFILKYRENKTIILVSHYLEECDILSNTISIIANGELKCNGSSLFLKNRFGV
GYLLTISKEHNSINNSNLTKTISDIIFNHIPKGSLLSDAGTELCFRLPNESIGNFSNLFK
ELDDRKKQLSIENYGISITTLEEVFLKIISNSETNPNFNQSVLNTALKTNSSGIKSYQQL
KGLLIKRVKTSRKDIKSFVLSILIPILILAGGLILYKNMRTIDIYNTVTQPLILDFNVYG
KSVTPVSIDKVNETMTSLFDNSIGHSDRTTLVPYDELHDYLIHHYFGVPGALYFDFRYFK
NVKFLHYNVFFNKDYLHALPIYINFVDSEILRSVTGKRIQTTSLPFEHIQSPLEVASLDV
NFVAIVFFIILTLASFSLIAASHAGNISHERSTRVKRLLYISGLRKSIYWLSNLIWDYLQ
TFILVIFLTIVIIAVDDKFRTHFDLYISGVVLFTFSIIPLSYLMSFKFSSHGKAVGAIFA
IHFGVGLIFTVISFILRVWAIKENSISFQFLTDIIEYCFYAISPFFCFSKILAIVTKFPG
VSRVDQSFIDYWSFHFGLLPNAILFLHCIVWITWILLIDYSSEIKGKFTISKLFSNSPIP
DSNEDSDVSNERIIVKQLLDNNTNGGSGNVYPIIFNNLYKKFNSVGNYKSKIAVYNSTLA
IPTGQTFGLLGLNGCGKSTTLGMISGEISPTGGKIKLNGYDLIKNRNDALTSIGYCFQFD
ALIGLLSAREQLELYCRIKGVDESKIKDTVNAFIQMMDLESISNSNTSGYSGGNKRKVSL
SIACIGSPSILLLDEISCGVDACVKRFMWNVLMELKKNKAIILTTHSIAECQAVCDKLTI
MKDGKLQALGSNQHIKDKFGSGYSIEVKFKKEYLENGVELFLQSFPSASLIDNQHALSAS
FELPNPPNNPIKLSSIFSNIEQSLKFILDDYSVSQTSIEQIFIKLTKNSITNIDN
NT seq
4848 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaatcaatcaaaaatcaattaattccacttttaaaaaaaaattggacattaaaagga
aaatcaaaaataaaactattattagaaattttattaccattgatatcaattggtatttta
tttggtatattatatttatcaatgattattacaagagattttaaagaaagaccagcaagt
ggatttgcttttgatattgcacatacaaaacaattattaattggatcaaatggtggatta
aatagtgatcaaagaaatatacttgataatttaaaattacaagtttcaattcaacatcca
gaatttagtaatgattatattaatagatgttttgtcgaatttaaagatattgaatcaatg
gatgaatatttccatgatccatttaattatagaggtgtaatgggtggtgtatggtttcca
gatgatagtttcaatggaaatacaattaaatatagtatacgagttgattcggattttaca
catgacaatacacagcaatttcaagatagagaagattcacaaatttatttaagacattat
ttcacacaaattcaaactggagttgatcaagcgattttattaaccaatcaaattgcaata
ccaatattcgcaactggccaaagatttccaaatccgtatatttcattttgggagaaatgg
accgacggaaggaaattaatacttttaaatacgggtggtgtgtttattactgcatcatta
tttgcaacattgtttacattgataacaaatattgtaattgaaaaagaaactaaaatatta
gaaggtatgaaaaccatgggtttgaatagttttgcatattatatttcaaattctattata
tcattgattacattattatcatcaactttattagtttcaattatactatcagcatcacaa
ttagttcatcatgtaaaatggataactttaatattaatattaataccatactcgataaca
ttattattaattgcatttattctatgtaaattttttacaaaatcaaaatatgctggatta
atggcatttttaatagtattattattatctggtattggaattataattggtcgttttaat
atatcaccaactttaaaattattatcatgtttattttcaccaattgcaatttcagttgca
aattatgtttggtgttataaagatttaatagttttcaaagaagttgatataaatgttaat
atggtaaatgaatatgaaattattggaatgttagtttttgatatctttttatatattctc
attttatggtatttagataatgttataactggtgaatatggtattccaaagaaatggtat
ttctttttaacaaagaattattggagaaaaaataaaaaatcaaatattaataataatgga
gtgtttgacgtggaggcaacttcatgtaatagaaatagttcatataatgaaaagaatttt
gaaaaaattgaacatcaattagaaagaccaacaatttcaattagaaatttaagaaaagaa
tttaaaactggtgatggtaatagaattgcagttaatgatttatcaattgatatgtataaa
aatcgaattcattcatttctaggtccaaatggtagtggaaaatcaacaacacttagtatg
ttaactggtatgattgagccaacatctggtgatgctttaattaatggatttgatattagg
aataatatagatgaaattagaaaacatttaggagtttgtccacaatctgatataatttgg
gaacagttaactgtaatggaacatttagaattttatgcagcattaaaaggttttacaaat
tcaaatcaaagaaaagttgaagctacaaaaatagcattagaagttggattaggtgaaaaa
ttaaatgcaccagctggaactctatcaggtggtcaaaaacgtaaactttgtttagcaatt
gcattcatcggaccaaatagtgatataatattaatcgatgaaccaacatcaggtttagat
gcatcaaatagaagattaatttgggatttcattttaaaatatagagaaaataaaaccatt
attctagttagtcattatttagaagaatgtgatattctatcaaatacaatttcaattatc
gcaaatggtgaattaaaatgcaatggatcaagtttattcttaaagaatagattcggtgta
ggttatttattaacaatttcaaaagaacataattcaattaataattcaaatttaacaaaa
accattagtgatattatatttaatcatataccaaaaggttcattattatctgatgccggt
actgaattatgttttagattaccaaatgaatcaattggaaatttttcaaatttatttaaa
gaattagatgatagaaaaaaacaattatcaattgaaaactatggtatttcaattacaaca
ttggaagaagtatttttaaagataatttcaaattctgaaacaaatccaaattttaatcaa
tcagttttaaatactgcattaaaaacaaattcttcaggtattaaaagttatcaacaatta
aaaggattattaataaaaagggtcaaaacatctagaaaagatataaaatcatttgttctt
tcaattttaattccaattttaatattagctggtggtttaatattatataaaaatatgaga
actattgatatttataatacagttactcaacctttgatacttgattttaatgtttatggt
aaatcagttacaccagtttcaattgataaagttaatgaaacaatgacatcattatttgac
aattcaattggacattcagatagaactacattggtaccatatgatgaattacatgattat
ttaattcatcactatttcggtgttccaggtgcattatatttcgattttcgttattttaaa
aatgttaaattccttcattataatgtatttttcaataaagattatttacatgctttacca
atttatatcaattttgttgattcagaaattttaagatcagtaactggtaaaaggatccaa
acaacttcattaccatttgaacatattcaaagtccattagaagtggcttcattggatgtt
aatttcgttgcaattgttttctttattattttaacattggcttcattttcattgattgca
gcatcacatgcaggaaacatatcacatgaacgttcaactagagttaaaagattattatat
atttcaggtttaagaaaatcaatttattggttatcaaatttaatttgggattatttacaa
acatttatactagttatatttttaacaattgtaatcattgcagtagatgataaatttaga
actcatttcgatttatatattagtggtgttgttttattcacattttcaattattccatta
tcatatttaatgtcatttaaattttcatcacatggtaaagctgttggtgcaatctttgca
attcattttggtgttggtttaatatttacagttatttcatttattttaagagtttgggca
attaaagagaatagtatttcatttcaattccttactgatataattgaatattgtttctat
gcaatttcaccattcttttgtttttcaaaaatacttgcaattgttacaaaattcccaggt
gtatcaagagttgatcaatcatttatagattattggagttttcattttggattattacca
aatgctattttatttttacattgtatagtttggattacttggatacttttaattgattat
tcaagtgaaataaaaggtaaatttacaatttcaaaattattttcaaattcaccaattcca
gattcaaatgaagattctgatgtttcaaatgaaagaatcattgtaaaacaattattagat
aataatactaatggtggtagtggtaatgtttatccaatcatttttaataatttatataaa
aaatttaattcagttggtaattataaatcaaaaattgcagtttataatagtacattagca
ataccaactggtcaaacatttggattacttggattaaatggttgtggtaaatcaaccacc
ttaggaatgatctctggtgaaattagtccaactggtggtaaaattaaattaaatggttat
gatttgattaaaaatagaaatgatgcattaacttcaattggttattgtttccaatttgat
gcattaattggattattaagtgcaagagaacaattagaattatattgtagaattaaaggt
gttgatgagtctaaaattaaagatactgtaaatgcattcattcaaatgatggatttagaa
tcaatttcaaattcaaacacatccggttattctggtggtaataaaagaaaagtatcatta
tcaatagcttgcattggctcaccatcaattctattacttgatgaaatatcatgtggtgtt
gatgcatgtgttaaaagattcatgtggaatgttttaatggaattaaaaaaaaataaagca
ataatattaacaactcattcaatagctgaatgtcaagcggtatgtgataaattaacaatt
atgaaagatggtaaattacaagcattaggatcgaatcaacatattaaagataaatttgga
agtggttattcaattgaagttaaatttaaaaaagaatatcttgaaaatggtgttgagtta
ttcttacaatcattcccatctgcaagtttaattgacaatcaacatgctttatcagcaagt
tttgaattaccaaatccaccaaataatccaattaaattatcttcaatcttttcaaatatt
gaacaatcattaaaattcattttagatgattattctgttagtcaaacttcaatagaacaa
atatttataaaattaacaaaaaatagtattacaaatattgataattag
DBGET
integrated database retrieval system
