Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0280459
Help
Entry
DDB_G0280459 CDS
T00245
Symbol
abcC15
Name
(RefSeq) ABC transporter C family protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
AAA_29
DUF1344
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8622569
NCBI-ProteinID:
XP_641188
dictyBase:
DDB_G0280459
UniProt:
Q54VC1
LinkDB
All DBs
Position
3:3386881..3391295
Genome browser
AA seq
1436 aa
AA seq
DB search
MIKKIKNIINKIINFFSTIYILCKIYLYYNIKNRYEAYNILSVYGDDDFFNKPCPEDSSN
WKDKLTFKWVERIIFVGFFRAPLNLNDISDLPSSLKVENTAPLLKDIIFNDSTIPLIKHI
YSKFLPRNYIATGLFVFVSVFSFITPLILKNFLSYVEKIDEQKHIYIGIIQCFLLFLSSF
INMASQQYSYWFGFKTSLEVKGALETIIFEKMTKLSNLSKKNYNIGSMLNLMSVDTDFFQ
YFFCHYYIEIFLFPIQILSLLGFLIYVIGIAGFVGFLVMLITIPLSSFLGTQISKNLSTS
MGYADTRISLTGELINGIKFLKQYAWEKMFCERIEEQRKLQLKYLYIRIIYWVLVQIVTQ
ASSGLVLVSTFTTYTLLGYEVSLEIAFTSITILQNLRRPIESLPDCLHKFISLIASAKRI
ETFLQSSELQNQPFIHNQSGLNDILIRNINFNWNEHNLKLKNNKNNQNNNQNKRSIILSS
GEQFEITNDFTFDGIDIQDDNYDYEKEYKINYNNNEEEENFMTDCLLKIKPLIKDRRLQQ
QQADYQDLLSINLPPPPSENVDFKAPKGLLTIISGGVRSGKTSLASGLLGEICKAVDKSS
PDSVNSILSTIQQPFLQSTSFRENILFGKPMNMERYIKVIEACCLAPDLLAMGEGKDLTE
IGERGINLSNGLKHRIQLARALYADSDCYILDEILSSVDPEIANYIFQHCIKGMMKGKTV
ILVTHQIQFISSADHVVVVDNGVLIQGTYLELLRMGIDFEMILKEKENRIEKQIVQLQED
EDYYEEVEILDFTMNNNNNNNNNNNNNNSNFNGNNKLKRSSISLPKGISIESIISKDFDQ
TTIEKAKLFVQEDRNKGDPGWIIYKKYIRMGSSISFFIFTCIIYLTSQIILLLSDYWLQS
WASHDRLNVSEPTDVHYLLIYLAYIGGFVFTLGVRYLLIAKITFGSAETLHRSLLKSIIR
APLTFFEQNPVGRILNRFGKDISDIDILLLDCFSDVLYCGACLVTSIGIIIYISPYIAIP
FVILIAINYIFQLFYNYSVLELKRIQSISRSPVYSLLSEVYNGLTTIRSFGQQERFFNMM
KDNININLRVFFYNFAVSRWIGIRVEFLSAIVVLMSALFSIFNDNPGLSALGVTTALGIT
FNLNWFMRQFGELESRINSVERVQSYISIPKEKETNEDEFIQTGFIWPSRGEIEFKNVEI
RYRPNSIATLRNFSMKINAQERIGIIGRSGSGKSTIGMSLFRMIECSSGSILIDGDDISQ
IDLKRLRSSIGIVPQDPFIFSGSIRLNLDPFDQFTDNEIWEALSKVKLKKMVSTMPMKLE
SLVQGGDGLTIGNKQLLCLCRAILRNSKIVLFDEATNSIDFQTTRLIKQTIEENFKDCTI
LTIAHNIDTILDSDKIAIIDEGELIEFDTPLNLIKDSTSRFSKLIKLNNNQKNKLN
NT seq
4311 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatcaaaaaaattaaaaatataataaataaaataataaactttttttctacaatatat
atattatgtaaaatatatttatattataatattaaaaatagatatgaagcatataatatt
ttatcagtatatggagatgatgattttttcaataaaccatgtcctgaagattcatcaaat
tggaaagataagttaacatttaaatgggttgaaaggataatatttgttggattttttaga
gcacctttaaatttaaatgatatttcagatttaccaagtagtttaaaagttgaaaataca
gcaccacttttaaaagatataatattcaatgattcaactatacctttaattaaacacata
tattcaaaatttttaccaagaaattatattgcaactggtttatttgtttttgtttctgta
ttttcttttataacacctttaattttaaaaaattttttaagttatgttgaaaaaattgat
gaacaaaaacatatttatattggtataattcaatgttttttattatttttaagttcattt
ataaatatggcatctcaacaatatagttattggtttggatttaaaacatcattagaagtt
aaaggagcattagaaactataatatttgaaaagatgacaaaactttcaaatttatcaaaa
aagaattataatattggttcaatgttaaatttaatgtcagtggatacagatttttttcaa
tatttcttttgtcattattatatagagatatttttatttccaattcaaattttatcatta
ttaggttttttaatttatgtaattggtatagctggttttgtaggatttttagtgatgtta
attacaattccactttcatcatttttaggtacacaaataagtaaaaatttaagtacatca
atgggatatgcagatacaagaataagtttaactggtgaacttattaatggaattaaattt
ttaaaacaatatgcatgggagaaaatgttttgtgaaagaattgaagaacaaagaaaatta
caattaaaatatctttatattagaattatttattgggtattggttcaaattgtaactcaa
gcatcatcaggtttagtattggtttcaacttttacaacctacactttattgggttatgaa
gtatctttggagattgcattcacatcgattacaatcctacaaaatcttagacgtccaatt
gaatcacttccagattgtcttcataaattcattagtttaattgcatctgctaaaagaatt
gaaacatttttacaatcttcagaattacaaaaccaaccattcatacataatcaaagtggt
ttaaatgatattttaattagaaatattaattttaattggaatgaacataatttaaaatta
aaaaataataaaaataatcaaaataataatcaaaataaaagatcaattatattaagtagt
ggtgaacaattcgaaattacaaatgattttacatttgatggtattgatattcaagatgat
aattatgattatgaaaaagaatataaaattaattataataataatgaagaggaagaaaat
tttatgacagattgtttattaaaaattaaaccattaataaaagatagaaggttacaacaa
caacaagcagattatcaagatttattatcaattaatttacctccaccaccatctgagaat
gttgattttaaagcaccaaaaggtttattaacaattatctctggtggtgttagaagtgga
aaaacaagtttagcaagtggtttattaggtgaaatttgtaaagctgttgataaatcatca
cctgattctgttaatagtattttatcaacaattcaacaaccattccttcaaagtacatca
tttcgtgagaatattttatttggtaaaccaatgaatatggaacgttatataaaggtaatt
gaagcttgttgtttagcaccagatctattagcaatgggtgaagggaaagatttaactgaa
attggagaacgtggtataaatttaagtaatggtctaaaacatcgtattcaattggcaaga
gcattatacgctgattccgattgttatatattggatgaaattttatcatctgttgatcca
gagattgcaaattatatctttcaacattgtattaaaggtatgatgaaaggtaaaacagta
atattagtaacacatcaaattcaattcatttcatcagcggatcatgtagttgtagttgat
aatggtgtattaattcaaggaacttatttggaattattaagaatgggtattgattttgaa
atgattttaaaagaaaaagaaaatagaattgaaaaacaaatagttcaacttcaagaagat
gaggattattatgaagaggttgaaattttagattttacaatgaataataataataataat
aataataataataataataataatagcaattttaatggtaataataaattaaaaagatca
tcaatttctttaccaaaaggtatttcaattgaatcaataattagtaaagattttgatcaa
acgacaattgaaaaagcaaaattatttgtacaagaagatagaaataaaggtgatcctggt
tggataatttataaaaaatatattcgtatgggttcatcaatttcttttttcatttttaca
tgtattatctatttaacaagtcaaattatattattactttcagattattggcttcaatca
tgggcaagtcatgatagattaaacgtttcagaaccaactgatgtacattacctattgatt
tatttagcctatattggtggatttgtatttacattgggtgttaggtatttattaatcgca
aagattacatttggttcagcggaaactcttcatagatctcttttaaaatcaataattaga
gcaccattaactttttttgaacaaaatccagttggtcgtattttaaatagatttggaaaa
gatatcagtgatattgatattttattattggattgtttctctgatgttttatattgtggt
gcatgtctagtcacatcaattggtatcataatttatatttcaccctatattgcaatacca
tttgttattttaatagctataaattatatttttcaattgttttataattattcagtacta
gaattaaaacgtattcaatcaatttctagaagtcctgtttattcattattatcagaggtt
tataatggattaacaactattagatcatttggtcaacaagaaaggttctttaatatgatg
aaagataatatcaatattaatttaagagtatttttttataattttgctgttagtagatgg
attggtattagagttgaatttttatcggctattgtagtgttaatgtctgctttattttca
atttttaatgataatcctggtttatcagcattaggtgtaacaacagcattgggtataaca
tttaatttaaattggtttatgcgtcaatttggtgaattagaatcaagaattaactctgtt
gaacgtgtacaaagttatatatcaattccaaaggaaaaagaaaccaatgaagatgaattc
attcaaacaggtttcatttggccatcaagaggtgaaattgaatttaaaaatgttgaaatt
agatatcgtccaaattcaatagcaacactaagaaacttttctatgaaaattaatgcacaa
gaaagaattggaattattggtcgttcaggatcgggtaaatcaacaattggtatgtcatta
ttccgtatgatagaatgttcatctggttcaattttaattgacggtgatgatatttcacaa
attgatttaaaaagattaagaagttcaattggtatagtaccacaagacccgtttattttc
tctggtagtattcgtttaaatcttgatccattcgatcaattcactgataatgaaatttgg
gaagcattaagtaaagttaaattaaagaaaatggtttcaacaatgccaatgaaattagag
agtttagttcaaggtggagatggtttaaccattggtaataaacaattactttgtctttgt
agagcaatattaagaaattctaaaatcgtattattcgatgaagcaaccaatagtatagat
tttcaaactactcgattaataaaacaaacgattgaagaaaactttaaagattgtaccatt
ttaaccattgctcataatattgataccattttagatagtgataaaatcgctatcattgat
gagggcgaacttattgaatttgatactccattaaatttaattaaagattcaacttctaga
ttttcaaaattaattaaattaaataataatcaaaaaaataaattaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
