Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0280541
Help
Entry
DDB_G0280541 CDS
T00245
Symbol
abcC1
Name
(RefSeq) ABC transporter C family protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
AAA_29
TsaE
RsgA_GTPase
MMR_HSR1
FAM60A
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8622608
NCBI-ProteinID:
XP_641050
dictyBase:
DDB_G0280541
UniProt:
Q8T6H8
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(3500769..3505118)
Genome browser
AA seq
1359 aa
AA seq
DB search
MLKNLRNKIKEKLTYSLLSSQEFDNNKDYYQQPCPEDNANLWSRLTFGWAQRMLISGYFN
GPLEMSDINDLPKDIKVQSSIQLLNNINLNKNNNSRWPLIKHFYKQFLYRNKLTIFLQIL
TNILSILSPLSLKYFIQFIQSTNKERSFLAGIGYCILLLIASFSYTFSQQLLMWFAMKSS
LEIKGCLSIKVYEKTLKLTTCGGKNYNPGSIMNLLSVDVGIISNFFWIEHMGIFAFSSQM
IGLLALLCWVIGWSGLVGFAIMVITFPINTYIGSKIGKNLKESMGYSDKRTNLTSEFING
IRFLKMYAWEKLFLDRIEEQRSLQLKYLYKRMIFWIFAEMMKQAVNAIVLVLTFIVYSIN
NEITLEVAFTTISIFVSLRIPLLRLPNSIQQLQSLIPIAKRVEDFLKSPEIQQNHSSNRE
EEEEDEYDDDINSDGDISIHNGSFNWNQVDSNGSGNGNGNQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ
QSYTLNNINFKAPAGKLTIICGVVGSGKTSLVSGLIGEIYKVSGRVNTPNKISFTTQQSF
LLSTSLRENILFGNEMNLERYKKVIEACCLAPDLLQLAAKDLTEIGERGINLSGGQKQRI
SLARALYANSDCYILDEPLSAVDPEVATHLFNHCIQGMMNDKTRILITHQLQFIPSADHI
VVVDNGKLVQGTYSELKSKGIDFESIMKTKKLNIDNQQQQQQHEKENDIVLSDEDSNNSI
KNNNNISNLIDIDEVISDENDSNLIERSKLLVDEDRNEGSVNLRVYKEYFKHGSSIPLFI
MTCIVYMISQIIYQMSDFWLSTWSQRSIPDKTDKYYISIYLLFIVGFIIFLVIRYFMMAH
VTFSASKNLHQSLLKSVGFASCQFFDTNPSGRILNRFSKDISDVDLLLFDLFSDVLYCGS
TVLVSIGIMIYISPLIIIPFLLLIGIYYFIQRLYTESSRELKRLEAISRSPIFSLLQESF
NGLVTIRSYKQQNKFISMMQDRINTNHRLSYYGFSVHRWVAVRLEFISSIVVFLAAFFSL
FNSNAGFSVLSVTTALGMCSYLNWTVRQMVELEVKMNSVERIESYLNIPKEGNSKINFFR
NEQQEEEEEEEEEFDFDNDDYDGFKLSKKWLTKGEIEFRNVEIKYGHSGESSLKNFTLKI
NQKDHIGIVGRTGAGKSTIGNGLFRMVECSKGSILIDGVDISKIGLHELRSSLGIVPQDP
FIFSGTIRLNIDPFNKYTDSEIWVALEKVKLKSTISSMPLKLETMIEEGGDGLSFGQKQL
LCLSRTILKNSKVVLMDEATSGIDYVTSDLIKQTINNCFKNCTMLTIAHRLDTIIDSTKI
AVIDKGKLIEYDTPNNLIENQESRFSKLVKHHHNLFKEK
NT seq
4080 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttaaaaacttaagaaataaaataaaagaaaaattaacttattctttgttatcatca
caagagtttgataataataaggattattatcaacaaccatgtccagaggataatgcaaat
ttatggtcaaggctaacatttggatgggctcaaagaatgctaatttctggttatttcaat
ggtccacttgaaatgagtgatatcaatgatcttccaaaagatattaaagttcaatcatct
attcaattattaaataatattaatttaaataaaaataataatagtagatggcctttaatt
aaacatttttataaacaatttttatatagaaataaattaacaatattcttacaaatccta
acaaacattctatctatactatcaccattatctttaaaatattttattcaatttattcaa
tcaacaaataaagagagatcatttttagctggaattggatattgtatattattattgata
gcatcattttcatatacattttctcaacaacttttaatgtggtttgcaatgaagagttca
cttgaaattaaaggatgtttatcaataaaagtttatgaaaaaacattaaaacttacaact
tgtggaggaaagaattataatccaggttcaattatgaatttattatcagttgacgttgga
attatttcaaatttcttttggattgaacatatgggtatatttgcattctcttcacaaatg
attggattacttgcattattatgttgggtaattggttggagtggtttagttggttttgct
attatggttataacatttccaataaatacatatattggatcaaaaattggtaaaaattta
aaagaatcaatgggatattcagataaaagaacaaatttaacaagtgaatttataaatggt
attagatttttaaaaatgtatgcatgggaaaaattgtttttagatagaattgaagagcag
agatcattgcaattaaagtatctttataagagaatgattttttggatttttgctgaaatg
atgaaacaagctgttaatgcaatcgttttggttttaacttttatagtttattcaattaat
aatgaaatcacattagaggttgcttttacaaccattagcattttcgttagtttaagaatt
cctttactcagattaccaaattcaattcaacaacttcaaagtttaattccaattgcaaaa
agagttgaagattttcttaaatctcctgaaattcaacaaaatcattcttctaatagagag
gaggaagaggaagatgaatatgatgatgatataaattcagatggtgatatctcaattcat
aatggatcatttaattggaatcaagttgatagtaatggtagtggtaatggtaatggtaat
caacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaa
caatcatacactttaaataatattaattttaaagcaccagcaggtaaattaacaataatt
tgtggtgtagttggtagtggtaaaactagtttagttagtggtttaattggtgaaatttat
aaagttagtggtagagttaatactccaaataaaatttcatttacaactcaacaatcattt
ttattaagtacatcattaagagagaatattttatttggtaatgaaatgaatttagaacgt
tataaaaaagtaattgaagcatgttgtctcgcaccagatttattacaattagcagctaaa
gatttaacagagattggtgaacgtggtattaatttatcaggtggtcaaaaacaacgtata
tcattagcacgtgcattatatgcaaattcagattgttatattttagatgaacctttatca
gctgttgatccagaagttgcaactcatttattcaatcattgtattcaaggtatgatgaat
gataaaacacgtatactaattacacaccaacttcaattcattccatcagctgatcatata
gttgttgttgataatggtaaattagttcaaggtacttattcagaattaaaatcaaaaggt
attgatttcgaatcaattatgaaaacaaagaaattaaatattgataatcaacaacaacag
caacagcacgaaaaagaaaatgatatagttttaagtgatgaagatagtaataatagtatt
aagaataataataatatttcaaatttaatagatattgatgaagttataagtgatgaaaat
gattcaaatttaattgagagatcaaaattattagtagatgaggatagaaatgaaggatca
gttaatttaagagtttataaagaatattttaaacatggttcatctataccattgtttatt
atgacatgcatagtttatatgattagccaaatcatttatcaaatgtcagatttttggtta
tcaacatggtcacaacgttcaatacctgataaaacagataaatattatatatcaatttat
ttattgtttatagtgggttttataattttcttggtaattagatattttatgatggcacat
gttacattttcagcatcaaagaatttacatcaatcgttattaaaatcggttggttttgca
agttgtcaattctttgatacgaatccatcaggtcgtatattaaatagatttagtaaggat
attagtgatgtggatttattattattcgatttattctctgatgtgctttattgtggttca
acagtgctggtttcaattggtataatgatttatattagtccattaataattataccattt
ctattattgattggtatttattatttcattcaaagattatatacagaatcatcaagagaa
ttgaaacgtttagaagcaatttcaagaagtccaatattttcattgttacaagaatctttt
aatggattggttacaattagaagttataaacaacaaaataaattcatttcaatgatgcaa
gatcgtataaacactaatcatcgtttatcatattatggattttcagttcatagatgggta
gcagttcgtttggaattcatttcttcaattgtagtttttttggctgcattcttctcccta
ttcaattcaaatgctggtttctctgttttatctgttacaactgcattgggaatgtgtagt
tatttaaattggacagttagacaaatggttgaacttgaagttaaaatgaattcagttgaa
agaattgaaagttatttaaatattccaaaagaaggtaattctaaaattaactttttcaga
aatgaacaacaagaagaagaagaagaagaagaggaggaatttgattttgataatgatgat
tatgatggttttaaattatcaaagaaatggcttactaaaggtgaaattgaatttagaaat
gttgaaattaaatatggtcattcaggagaatcaagtttaaaaaatttcacattaaaaata
aatcaaaaagatcatattggtattgttggtagaactggtgcaggtaagagtacaattggt
aatggtttgtttcgtatggttgaatgttctaaaggttcaattttaattgatggcgttgac
atttcaaagattggattacacgagttaagaagttcacttggtattgtcccacaagatcca
ttcattttctctggtactattcgtttaaatatcgatccatttaataaatacactgatagt
gaaatttgggtagctttagaaaaggttaaattaaaatcaacaatttcatcaatgccatta
aaattagaaactatgatagaagaaggtggtgacggtttatcgtttggtcaaaagcaatta
ctttgtttatcaagaacaattttaaagaattctaaagtagtcctaatggatgaagctacc
tctggtatagattatgtaacaagtgatttaattaaacaaactattaataattgttttaaa
aattgtacaatgctaacaattgcacatagactcgatacaatcattgatagtactaaaatc
gctgttattgataaaggtaaattaatagaatatgatacaccaaataatctcattgaaaat
caagaatcaagattcagtaaattagtaaaacatcatcataatctatttaaagaaaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
