Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0280973
Help
Entry
DDB_G0280973 CDS
T00245
Symbol
abcC12
Name
(RefSeq) ABC transporter C family protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
AAA_29
AAA_22
AAA_21
AAA_16
RsgA_GTPase
MMR_HSR1
AAA_23
FtsK_SpoIIIE
nSTAND1
DUF87
T2SSE
Dynamin_N
AAA_33
ATP_bind_1
AAA_27
cobW
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8622995
NCBI-ProteinID:
XP_640932
dictyBase:
DDB_G0280973
UniProt:
Q54U44
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(4340141..4344573)
Genome browser
AA seq
1323 aa
AA seq
DB search
MEDIELNSVDNLETKGGKEIKKKEKKIGYGGKKSPEENSNFLSNLTFSWADGFVIHCFRN
VLQLSHLWDLASYDKSEYLAKKIAKSWEIEIQKPKPSYLRAGFRAFGKLHCISLFFYSIY
VGSQFVGPEILSRMVTFVVESKLGTSTEDPNMGYYYALIMFGTAMIGSFCNYQANRVTVR
TGDRLRSIIVLDVYKKAIKLSNSARSNTSPGQIVNLISNDAQRMIEVFGILNNGLFALPQ
IIICLALLYEKIGWPTFVGLGLMLAAIPFNGLAAKKLTETRRILIGHTDGRVKVTSEILQ
AMKIIKLYAWEDSFAKKVLDRRNNEIKLLFSFTRYRTILIAMIGAIPTAASILVFSTYYG
YNGSLDAGKIFSALSYLNLLKIPLGFLPILIALGIQMQIASKRVTDFLLLPEMKEVQQID
NPSLPNGVYMKNSTTTWNKEKEDSFGLKNINFEAKGQSLTMVVGSVGSGKSTLVQAMLGE
LETIDGEIGIKGSIAYVPQQAWIINATLKENIIFGKELDEERYQKVLEVCALKRDIELFP
QGDSVEIGERGINLSGGQKQRVSIARAVYSDADVYILDDPLSAVDSHVGKHLFHKCFKGI
LSSKTVILVANQINYLPFADNTVVLKSGEIVERGTYYELINAKLEFASLLQEYGVDENTK
GDDSDDDDDKKDDDKKEEKVEKPKQSDKDGTLISEEEAEQGAVAGKVYWKYVTAGGGLLF
LFAMILFLLETGSKTFTDWWLSHWQTESSERMESILLGEEPTGLTDDQNLGIYIGVGMAS
IIVTVVRTFSFFEYAVRAAHSIHHELFNALLKKPMSFFDQTPLGRIINRFTRDLDIIDNL
IATSIAQFFTLMLSVLATLILISIIVPWLLIPLAPICILFFILQYFYRYTSRGLQRIEAI
TRSPIFNHFSETLNGVVSIRAYKKQQENILKNQKRLDDNNNCYLTLQAMNRWLGLRLDFL
GNLIVFFSCIFITLKKDTISPSDVGLVLSYALSITSNLNQGVLQAADTETKMNSVERISQ
YIRGAVEAPQIIDDCRPSPDWPINGSIKFDNLVMRYREGLDPVLKGITCEIKAKEKIGIV
GRTGAGKSSIVLALFRLIEASEGSISIDGENIAKFGLKDLRRNLAIIPQDPVLFSGTLRE
NLDPFNECPDHELWSILDDIQLSKVFKSTEEGLNSKVTENGENFSVGQRQLIVLARALLR
KPKILVLDEATASVDGQSDSLIQATIRNKFSNCTILTIAHRLNTIMDSDKIMVLDAGKIS
EFDEPWTLLQNQNGLLTWLVNETGPQNAIYLRKLAEAKKSGLNINEITQIDQQNDNLNTP
PRL
NT seq
3972 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagatatagaattaaattcagtggacaacttggaaactaagggaggaaaagaaata
aaaaaaaaagaaaaaaagataggatatgggggtaaaaaatcaccagaagaaaattcaaat
tttttatcaaatttaacattttcatgggctgatggatttgtaattcattgttttagaaat
gttttacaattatcacatctttgggatcttgcatcatatgataaatctgaatatttagcc
aaaaaaatcgcaaaatcatgggaaatcgaaattcaaaaaccaaaaccatcatatttaagg
gctggatttagagcatttggaaaattacattgtataagtttatttttttattcaatctat
gttggatctcaatttgttgggccggaaatattaagtagaatggttacatttgtagttgaa
tcaaagttgggaacatcaacagaagatccaaatatgggatactattatgcattgattatg
tttggaactgcaatgattggttcattttgtaactatcaagccaatagagtcactgttaga
actggtgatcgtttaagatcaatcattgttttagatgtttataaaaaagcaattaaatta
tcaaattcagcaagatcaaatacatcaccaggtcaaattgtaaatttaattagtaatgat
gctcaaagaatgattgaagtatttggaattttaaataatggtttatttgcattaccacaa
attattatttgtcttgcattattatatgaaaagattggttggccaacatttgtaggattg
ggtttaatgttagctgcaattccattcaatggattagctgcaaagaaattaactgaaact
agaagaatattaattggtcatacagatggtcgtgttaaagttacaagtgaaattttacaa
gcaatgaaaattataaaattatatgcatgggaagatagttttgctaaaaaggttttggat
cgtcgtaataatgaaattaaattattattttcgttcactcgttatagaactattttaatt
gcaatgattggtgcaattccaacagcagcttcaatattagtattttcaacctattatgga
tacaatggaagtttggatgctggtaaaatttttagtgcactctcttatttaaatttattg
aaaatcccattaggtttcttaccaattttaattgcattgggtattcaaatgcaaattgca
agtaaaagagttactgattttctattattaccagaaatgaaagaagttcaacaaattgat
aatccttcattaccaaatggtgtttatatgaaaaattcaacaacaacttggaataaagag
aaagaagattcatttggtttaaaaaatattaattttgaagcaaaaggtcaatcattaaca
atggttgttggttcagtcggatcgggtaaatcgacattggtacaggcaatgttgggagag
ttagagactattgatggagaaatcggtattaaaggctcaattgcttatgtacctcaacaa
gcatggattatcaatgcaacattaaaagagaatattatttttggtaaagaattggatgaa
gaaaggtatcaaaaagtattagaagtttgtgcattaaaacgtgatattgaattatttcca
cagggtgattcagtagaaattggtgaacgtggtattaacctttcaggtggtcaaaaacaa
agagtttcaattgctcgtgcagtatattcagatgcagatgtttatattttagatgatcca
ttatcagcagtggactcacatgttggtaaacatttattccataaatgttttaaaggtatt
ctatcaagtaaaacagttattttagtagcaaatcaaataaattatttaccatttgctgat
aatacagttgtattaaaatcaggagaaatcgttgaaagaggtacctattatgaattaatt
aatgctaaattagaatttgcatcattactacaagaatatggtgttgatgaaaatacaaaa
ggtgatgatagtgatgatgatgatgataagaaagatgatgataaaaaagaagaaaaagtt
gaaaaacctaaacaatcagataaagatggaacattgatatcagaggaagaagcggaacaa
ggagctgttgcaggaaaagtatattggaaatatgttacagctggtggtggtttattattc
ttatttgcaatgattttgtttttattagaaactggttcaaaaacatttacagattggtgg
ttatcacattggcaaacagagtcatcagaaagaatggaatcaatattattaggtgaagaa
cctactggtttaactgatgatcaaaatttaggtatttacataggtgttggtatggcatcg
attattgtgactgtggtacgtacattctcattctttgaatatgcagttcgtgcagctcat
tcaattcatcatgaattgttcaatgcattattaaagaaaccaatgtcattctttgaccaa
acaccacttggtagaattatcaatcgtttcacaagagatttagatattattgataattta
attgctacttcaattgcacaattcttcactttaatgctatcagtattggctacattaatt
ttaatttcaatcattgttccatggcttttaattccattggcacctatttgtattttattc
tttattttacaatacttttatagatatacatcaagaggtttacaaagaattgaagcaatt
acacgttcaccaattttcaatcatttctctgaaactttaaatggcgtagtttcaattaga
gcatataaaaaacaacaagagaatatattaaagaatcaaaaacgtttagatgataataat
aattgttatttaacactacaagcaatgaatagatggttaggtttacgtttagatttttta
ggtaaccttattgtgttcttttcatgtattttcatcactttaaaaaaggatacaattagt
ccatctgatgttggtctagttttaagttatgcactttcaatcacaagtaatttaaatcaa
ggtgtgcttcaagcagccgatactgaaactaaaatgaattcagttgaacgtatttcacaa
tatattagaggagcagttgaagcaccacaaattattgatgattgtcgtccatcaccagat
tggccaataaatgggtcaattaaatttgataatttagtaatgcgttatcgtgaaggatta
gatccagtattaaaaggtataacatgtgaaattaaagcaaaagaaaagattggtattgta
ggccgtactggtgcaggtaaaagttcaatcgttttagcattgttccgtttaattgaagct
tcagaaggttcaatttcaattgatggtgaaaatattgccaaattcggattaaaagattta
cgtagaaatttagcaatcattccacaagatccagtattattcagtggtacacttcgtgaa
aatttagatccattcaatgaatgtccagatcatgaattatggtcaattttagatgatatt
caattatcaaaagtatttaaatcaactgaagaaggcttaaattccaaagtaacagaaaat
ggtgaaaacttttcagttggacaaagacaattaattgtattagctcgtgcattattaaga
aaaccaaagattttagttttagatgaagcaactgcttctgtcgatggtcaaagtgattca
ttaattcaagcaacaattcgtaataagtttagtaattgtacaattttaacaattgctcat
agacttaatacaattatggatagtgataagattatggtacttgatgcaggtaaaattagt
gaatttgatgaaccatggacattattacaaaatcaaaatggtttattaacatggttagta
aatgaaactggtcctcaaaatgcaatttatttacgtaaattagctgaagcaaagaaaagt
ggtttaaatataaatgaaataacgcaaattgatcaacaaaatgataatttaaatacacca
cctcgtttataa
DBGET
integrated database retrieval system
