Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0280977
Help
Entry
DDB_G0280977 CDS
T00245
Symbol
abcC10
Name
(RefSeq) ABC transporter C family protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
AAA_29
AAA_16
AAA_22
AAA_23
MMR_HSR1
RsgA_GTPase
FtsK_SpoIIIE
nSTAND1
Dynamin_N
AAA_21
AAA_33
cobW
Pex24p
DUF87
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8622997
NCBI-ProteinID:
XP_640934
dictyBase:
DDB_G0280977
UniProt:
Q8ST87
LinkDB
All DBs
Position
3:4347748..4352153
Genome browser
AA seq
1334 aa
AA seq
DB search
MKEIELDRPEEKKKKVKKEKKIGYGGKKSPEENSNFLSNLTFSWADGFVIHCFRNVLQLS
HLWDLASYDKSEYLAKKIAKSWEIEIQKPKPSYLRAGFRAFGKLQLLSIFLYAISVGIQF
VGPEILGRMVTFVVESKLGTSTEDPNMGYYYALIMFGTAMIGSFCTYHANRISFRTGDRL
RSIIVLDVYKKAIKLSNSARSDTSPGQIVNLMSNDAQRMVEVFGMFNNGALALPQIIICL
ALLYKKIGWPTFVGLGLMLAAIPFNGMAAKKLTETRKYLVSLSDSRVKATNEILQAIKII
KLYAWEDSFAKKVIEHRNNEIKLLFSYSRYRTILIVIISALPTAAAILVISSYYGHEKSL
DASRIFSALSYLNLLRLPLGFLPIIIALGIQMQIAGKRVTDFLLLPEMKDIQQIDNPSLP
NGVYMKNSTTTWNKLKEDSFGLKNINFEATGTSLTMVVGSVGSGKSTLVQAMLGELEIID
GEIGIKGSIAYVPQQAWIINATLKENIIFGKELDEERYQKVLEVCALKRDIELFPQGDSV
EIGERGINLSGGQKQRVSIARAVYSDADVYILDDPLSAVDSHVGKHLFHKCFKGILSSKT
VILVANQLNYLPFADNTVVLKSGEIVERGTYYELINSKLEFSSILEKYGVDENVISKKDD
IDEDEDEDQDTIEKVEIDLNKDEKSQPKSKSSNTDGTLISEEESEQGAVAGKVYWKYVTA
GGGLLFLVSMIFFLLETGSKTFSDWWLSHWQTESSERMESILLGEEPTGLTDDQNLGIYI
GLGMAAVFISVCKNFIYYEYSVYASRAIHHELFNALLKKPMYFFDQTPIGRIINRFTRDL
DGIDNLIATSISTFLTLMLTVIATIILVSIIVPFLLIPLAPISIIFFFLQYFYRYTSRGL
QRIEAITRSPIFNHFSETLNGVVSIRAYKKQQENILINQKRLDDNNNCYLTLQAMNRWLG
LRLDFLANLITFFACIFITIDKDTISPANVGLALGYALSLTGNLNYAALQAADTETKMNS
VERISQYIRGAVEAPQIIDDCRPSPDWPINGSIKFDNLVMRYREGLDPVLKGITCEIKAK
EKIGIVGRTGAGKSSIVLALFRLIEASEGSISIDGENIAKFGLKDLRRNLAIIPQDPVLF
SGTLRENLDPFNERSEEDLFSTIEDIQMSAVVKSLEGGLDSKVTENGENFSVGQRQLIVL
ARALLRKPKILVLDEATASVDGQSDSLIQATIRNKFSNCTILTIAHRLNTIMDSDRIMVL
DAGKISEFDEPWTLLQNQNGLLTWLVDETGPQNAIYLRKLAEAKKNGIDINEIMPIDNET
TPKDNINTPPPPPQ
NT seq
4005 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagaaatagaactggataggccagaagaaaagaaaaaaaaagtgaaaaaagaaaaa
aagattggatatggcggtaaaaaatcaccagaagaaaattcaaactttttatcaaattta
acattttcatgggccgatggatttgtaattcattgttttagaaatgttttacaattatca
catctttgggatcttgcatcatatgataaatctgaatatttagccaaaaaaatcgcaaaa
tcatgggaaatcgaaattcaaaaaccaaaaccatcatatttaagggctggatttagagca
tttggaaaattacaattattaagtatttttttatatgcaataagtgttggaatccaattt
gttggaccagaaattttaggtagaatggttacatttgtagttgaatcaaaattaggaaca
tccacagaagatccaaatatgggatactattatgcattgattatgtttgggactgcgatg
attggttcattttgtacataccatgctaatagaatttcatttagaactggcgatcgttta
agatcaatcattgttttagatgtttataaaaaagcaattaaattatcaaattcagcaaga
tcagatacatcaccaggccaaattgtaaatttgatgagtaatgatgctcaaagaatggtt
gaagtatttggaatgtttaataatggcgcacttgcattaccacaaattattatttgtctt
gcattattatataaaaagattggttggccaacatttgtaggattgggtttaatgttagct
gcaattccattcaatggaatggctgcaaagaaattaactgaaactagaaaatatttagtc
tcactttcagatagtcgtgttaaagctacaaatgaaattttacaagctattaaaattata
aaattatatgcatgggaagatagttttgctaaaaaggttattgaacatcgtaataatgaa
attaaattattattttcatatagtcgttatagaactattttaattgttattattagtgct
ttaccaactgctgctgctattttagtaatttcatcatattatggacatgagaaatcttta
gatgcaagtagaatttttagtgcactttcatatttaaatttattaagacttccattaggt
ttcttaccaattataattgcattgggtattcaaatgcaaattgcaggtaaaagagttact
gattttctattattaccagaaatgaaagatattcaacaaattgataatccttcattacca
aatggtgtttatatgaaaaattcaacaacaacttggaataaacttaaagaagattcattt
ggtttaaaaaatattaattttgaagctactggaacatcattaacaatggttgttggttca
gtcggatcgggtaaatcaacattggtacaggcaatgttgggagagttagagattattgat
ggagaaatcggtattaaaggctcaattgcttatgtacctcaacaagcatggattatcaat
gcaacattaaaagagaatattatttttggtaaagaattggatgaagaaaggtatcaaaaa
gtattagaagtttgtgcattaaaacgtgatattgaattatttccacaaggtgattcagta
gaaattggtgaacgtggtattaacctttcaggtggtcaaaaacaaagagtttcaattgct
cgtgcagtatattcagatgcagatgtttatattttagatgatccattatcagcagtggac
tcacatgttggtaaacatttattccataaatgttttaaaggtattctatcaagtaaaaca
gttattttagtagcaaatcaattaaattatttaccatttgctgataatacagttgtatta
aaatcaggagaaatcgttgaaagaggtacctattatgaattaattaattctaaattagaa
ttttcaagtattcttgaaaagtatggtgttgatgaaaatgttatatccaaaaaagatgac
attgatgaagatgaagatgaagatcaagatactattgaaaaggttgaaatagatttaaat
aaagatgaaaagtctcaaccaaaatcaaaatcatcaaatactgacggaacattaatatca
gaggaagaaagtgaacaaggagctgttgcgggaaaggtatattggaaatatgtcacagct
ggtggtggtttattattcttggtttcaatgatattctttttattagaaactggttcaaaa
acattttcagattggtggttatcacattggcaaacagagtcatcagaaagaatggaatca
atattactaggtgaggaacctactggtttaactgatgatcaaaatttaggtatttatatt
ggtcttggtatggcagctgttttcatttcagtttgtaagaattttatttattatgaatat
tcagtgtatgcatcacgtgcaattcatcatgagttgttcaatgcattattaaagaaacca
atgtatttctttgaccaaacaccaattggtagaattataaatcgtttcactagagattta
gatggtattgataatttaatcgcaacttcaatatcaacatttttaactttaatgttaact
gtaattgcaactattatccttgtttcaatcattgttccattccttttaattccattggca
ccaattagtataatattcttctttttacaatacttttatagatatacatcaagaggttta
caaagaattgaagctattacacgttcaccaattttcaatcatttctctgaaactttaaat
ggtgtagtttcaattagagcatataaaaaacaacaagagaatatattaataaatcaaaaa
cgtttagatgataataataattgttatttaacactacaagcaatgaatagatggttaggt
ttgcgtttagattttttagcaaatttaattacattttttgcttgtattttcattacaatc
gataaggatacaattagtcctgcaaatgttggtttagcattaggttatgcactttcatta
actggtaatttaaattatgcagcacttcaagcagccgatactgaaactaaaatgaattca
gttgaacgtatttcacaatatattagaggagcagttgaagcaccacaaattattgatgat
tgtcgtccatcaccagattggccaataaatgggtcaattaaatttgataatttagtaatg
cgttatcgtgaaggattagatccagtattaaaaggtataacatgtgaaattaaagcaaaa
gaaaagattggtattgtaggccgtactggtgcaggtaaaagttcaatcgttttagcattg
ttccgtttaattgaagcttcagaaggttcaatttcaattgatggtgaaaatattgccaaa
ttcggattaaaagatttacgtagaaatttagcaatcattccacaagatccagtattattc
agtggtacacttcgtgaaaatttagatccattcaatgaacgttctgaagaggatttattt
tcaacaattgaagatattcaaatgagtgcagttgttaaatctttagagggtggtttagac
tcaaaagtaacagaaaatggtgaaaacttttcagttggacaaagacaattaattgtatta
gctcgtgcattattaagaaaaccaaagattttagttttagacgaagcaactgcctctgtc
gatggtcaaagtgattcattaattcaagcaacaattcgtaataagtttagtaattgtaca
attttaacaattgctcatagacttaatacaattatggatagtgataggattatggtactt
gatgcaggtaaaattagtgaatttgatgaaccatggacattattacaaaatcaaaatggt
ttattaacatggttagtagatgaaactggtcctcaaaatgcaatttatttacgtaaatta
gctgaagcaaagaaaaatggtatagatataaatgaaattatgccaattgataatgaaaca
actccaaaggataatatcaatacaccaccaccaccacctcaataa
DBGET
integrated database retrieval system