Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0286559
Help
Entry
DDB_G0286559 CDS
T00245
Symbol
abcC5
Name
(RefSeq) ABC transporter C family protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
AAA_29
AAA_22
AAA_16
nSTAND1
ATP_bind_1
AAA_PrkA
AAA_18
AAA_7
TsaE
PduV-EutP
AAA_21
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8625755
NCBI-ProteinID:
XP_637615
dictyBase:
DDB_G0286559
UniProt:
Q54LE6
LinkDB
All DBs
Position
4:complement(4828905..4833706)
Genome browser
AA seq
1460 aa
AA seq
DB search
MKYNNLENDDSDIHNNNNNNESEGDSLIELEEINLEGNNNNDINNNNNINNNNDSLDYEN
NKGSKKKNNKKYVILNEEEDINDKKVENGENETSSFTYGHDNEFKDLPLPKKGFGGLKSL
EENANFLSSMTYLWADKFVLYCFKNILQLDEIWELASYDKSSYLFDIMDKNWQNELKNSK
KPNFMKAAFKSFGKHFALSWVHFGLNVISQFIGPIFLKKIVSFVIQYRENPGSVDPNLGY
YYALILFVNSMLGSIFLYQSNMITSRTGNRLKSLIVLYVYKKSLKLTNSSRSKKSNGEIV
NLMSNDAQRLLELFQMVNTLIFAVPMIIVSMILLYDCVGWPSFVALLVMGISLPYSLNRG
SQLSIYRRKLVGFTDQRIKVVNEMFQAIKTIKLYAWEDYFSQKMMSKRGEEIKFLTQFVR
FRYSLIVVVQSIPTIISIFMFTVYYLVNSKLPADKIFAAVAYLNIIRVPFTFLPYGYNIY
IQFKVSIERVVNFLNMDEINQGDDKNNEINVNVCDQQKQQQTDIGIYMDNTTFSWAIKPQ
TNPPPPRTTPSNDKSSPSGNNSNNEKKEVQVSFSLKNTSCQVKEKGSLLMVIGPVGSGKS
SFCQALLGEMELENNGSLRVVGSIAYVSQSAWIMNASLKDNILFGKEYNKERYEMVLNCC
ALLPDLALFPQGDLIEIGERGINLSGGQKQRVAIARAVYSDSDIYILDDILSAVDAHVGK
HLFYNCIKGILKEKIVVLATNQLNYCPYSTQTLILKTGGEVEQYDTFENIISTINSAYGN
SSLFSELLKQYAHMAGDSDKDSDEIVDDEMIKSKENNNDLYDGKLTTIEEREEGSVSFKH
YMYYVTAGGGFLFLIALLGYCIDTSTSTFTNWWLSNWSSKHTSTGINNNNSSSSNSISSS
SSYIIDSLSSLNINEDGDIENAGEFLGVFIAIGVLTVLLIIVRTIVFFEYSIRATTEIHK
RLFWSILRAPMWFFDTVPLGRILNRFTRDTDIVDMLLTNSLNQFLNFSTNCIAILVIISI
ATPWLLLPMTPIIILFYFIQYFYRRTSIQIQRIESITRSPIFSHFAETLNGVITLRAFRK
MGENVLKNQALLDDNNKCYLTLQAMNQWLGLRLSVLGNLITLLSCIFITVDRSSIAIASV
GLSISYTLSLTTNLNKATQQLAELETKMNSIERISYYTENVPQEPDQIIESNRPPMGWPS
LTNSNHTPPIIFENVVMSYRQGLPAVLKGISFEIKAGEKIGICGRTGSGKSSLLLALFRI
VELSSGRIIIDGLDISKIGLKDLRSQLAIIPQEPVMFTGTLRSNLDSLSEHTDSELWDVL
KEIQLYEHVKKVSVADEGLDLRVNDNWSQGQKQLIGLGRALLKKPKILVCDEATASVDSL
SDELIQRIIREKFKDAIILTIAHRLNTIVESDRIMVLDSGSIVEFNKPSILAQNENSLFN
WLIDETGTQNSQYLRSLIKH
NT seq
4383 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatataacaatttggagaatgatgatagtgacatccacaataacaacaataacaat
gaaagtgaaggagatagtttaattgaattggaggaaataaacttagaaggtaataataat
aatgatattaataataataataatattaataataataatgatagtctagattatgaaaat
aataaaggtagtaaaaaaaagaacaataaaaaatatgtaatattaaatgaagaagaagat
ataaatgataaaaaggtagaaaatggtgagaatgaaacatcatcatttacatatggacat
gataatgagtttaaagatttaccacttcccaaaaaaggatttggaggattaaaatcatta
gaagagaatgcaaatttcttatcgagtatgacatatttatgggcagataaattcgtttta
tattgtttcaaaaatattttacaattggatgaaatttgggaattagcaagttatgataaa
tcaagttacctatttgatataatggataaaaattggcaaaatgaattaaaaaatagtaaa
aaaccaaattttatgaaagcagcatttaaatcatttggaaaacattttgcattaagttgg
gttcattttggattaaatgtaattagtcaatttattggaccaatatttttaaagaaaatt
gtttcattcgtaattcaatatagagagaatcctggatcagttgatccaaatttaggttat
tattatgcgttaattttatttgtaaattcaatgttaggttcgatattcctttatcaatct
aatatgataacttcaagaactggtaatagattaaaatcattaattgtattatatgtttat
aaaaaatcattaaaattaacaaattcaagtagatcaaaaaaaagtaatggtgaaattgta
aatttaatgagtaacgatgcacaaagattattagagttatttcaaatggttaatacttta
atatttgcagtacctatgattatagtttcaatgatattattatatgattgtgttggatgg
ccatcatttgtagcattattagttatgggtatatcattaccatacagtttaaatagaggt
tcacaattatcaatctatagaagaaaattagttggtttcactgatcaacgtattaaagtt
gttaatgaaatgtttcaagcaattaaaactattaaattatatgcatgggaagattatttc
tctcaaaaaatgatgtcaaaacgtggtgaagaaattaaatttttaacacaatttgttaga
tttagatatagtttaattgttgttgttcaatcaattccaacaattatttcaatatttatg
tttacagtttattatttagttaatagtaaattaccagcggataaaatatttgcagctgtt
gcatatttaaatattattcgtgttccattcactttcttaccatatggttataatatttac
attcaatttaaggtttcaattgaacgtgttgttaattttttaaatatggatgaaattaat
caaggtgatgataaaaataatgaaattaatgttaatgtttgtgatcaacaaaaacaacaa
caaactgatattgggatttatatggataatactactttttcttgggcaattaaacctcaa
actaatccaccaccaccaagaacaacaccaagtaatgataaaagttcacctagtggcaat
aatagtaataatgaaaaaaaagaagttcaagtatcattttcattaaaaaatacaagttgt
caagttaaagaaaaaggatcattattaatggtaatcggaccagttggtagtggtaaatca
tcattttgtcaagcattgttaggtgagatggaattagagaataatggatctttaagagtg
gttggtagtattgcatatgtttcacagagtgcatggattatgaatgcatcgttaaaggat
aatattctatttggtaaagagtataataaggagagatatgaaatggtattgaattgttgt
gcacttttacccgatcttgcattattcccacaaggtgatcttattgagattggtgaacgt
ggtattaatttatctggtggtcaaaaacaacgtgtcgcaattgcacgtgcagtttactct
gattcagatatctatattttagatgatattttatcagctgtcgatgcacatgttggtaaa
caccttttctataattgtatcaaaggtattctaaaggagaaaatagtagtattagcaacg
aatcagttaaactattgtccatattcaactcaaactttaatattgaaaactggtggtgaa
gtcgaacaatatgatacctttgaaaatataatttcaacaatcaattctgcttatggtaat
agtagtttattcagcgaacttttaaaacaatatgctcacatggctggtgatagtgataaa
gatagtgatgaaatcgttgatgatgaaatgataaaatcaaaagaaaacaacaatgatctt
tacgatggtaaattaacaacaatcgaagaaagagaagaaggttcggtatcttttaaacat
tatatgtattatgtaactgctggtggtggtttcttatttttaattgcactacttggttat
tgtattgatacttcaacttcaacatttacaaattggtggttaagtaattggtcatcaaaa
catacatcaacaggtattaataataataatagtagtagtagtaatagtattagtagtagt
agtagttatattattgatagtttaagtagtttaaatataaatgaagatggtgatattgaa
aatgcaggtgaatttcttggagtatttattgcaattggtgtacttacagttttattaatt
attgttcgtacaattgtattctttgaatattcaattagagcaacaacagaaattcataag
agattattttggtcaattcttagagcaccaatgtggttctttgatactgtaccattggga
cgtattttaaatagatttacaagagataccgatattgtggatatgttgttaacaaattct
ttaaatcaatttttaaatttttcaaccaattgtatagcgattttagtaatcatatcgata
gcaacaccttggttattattaccaatgacaccaattataattttattctactttattcaa
tacttttatagaagaacttcaattcaaattcaaagaatcgaatcaattactagatcacca
attttctcacattttgcagagacattgaatggtgtgatcactttaagagcgtttagaaaa
atgggtgaaaatgttttaaagaatcaagcattgttggatgataataataaatgttattta
acattacaagcaatgaatcaatggttaggtttacgtttaagtgtacttggtaatttaatt
acactccttagttgtatttttattacggtcgatcgttcaagtattgcaattgcaagtgta
ggtttatcaattagttatacacttagtcttacaaccaatttaaataaagcaactcaacaa
ttggcagaattagaaactaaaatgaactctatcgaaagaattagctattacactgaaaat
gtaccacaggaacccgatcaaatcattgaatcaaatagaccaccaatgggttggccatca
cttacaaattcaaatcatactccacccatcattttcgaaaatgttgtaatgagttatcgt
caaggtttacctgcagtattgaaaggtatttcatttgaaattaaagcaggtgaaaagatt
ggaatttgtggtagaacaggtagtggtaagagtagtttattgttggcattgtttcgtatc
gtagagttatcaagtggtagaattatcattgatggccttgatatatcaaagattggttta
aaagatttacgtagtcaattggctattatccctcaagaaccagtaatgttcactggtact
ctcagaagtaatttagatagtttatcagagcatacagattcagagttatgggatgtccta
aaagagattcagttatatgaacatgttaaaaaggtatcggtcgctgatgagggtttagat
cttagggttaatgataattggtcacaaggtcaaaaacaactcattggtcttggtcgtgca
ttattaaagaaacctaaaattttagtatgcgacgaagcaacagcaagtgtcgattctcta
agtgatgaattaattcaaagaattattcgtgaaaagtttaaggatgcaatcattttaaca
atcgctcatagactaaacaccattgttgaaagtgatagaattatggttttagattctggt
tcaatcgtcgaatttaataaaccatcaatattggctcaaaatgaaaatagtttattcaat
tggttaattgatgaaactggtactcaaaactctcaatatttaagatctttaatcaaacat
taa
DBGET
integrated database retrieval system
