Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0287095
Help
Entry
DDB_G0287095 CDS
T00245
Symbol
pks25
Name
(RefSeq) beta-ketoacyl synthase family protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ketoacyl-synt
Acyl_transf_1
Ketoacyl-synt_C
KR
KAsynt_C_assoc
ADH_zinc_N_2
PS-DH
PKS_DH_N
ADH_N
Anamorsin_N
Thiolase_N
Methyltransf_12
Methyltransf_31
PP-binding
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8625960
NCBI-ProteinID:
XP_637427
dictyBase:
DDB_G0287095
UniProt:
Q54KU3
LinkDB
All DBs
Position
4:5330551..5337779
Genome browser
AA seq
2380 aa
AA seq
DB search
MDNSYLNNPQFDINNGNKEVTDDDNNKNNQDNLVAIVGVGFRLPSGENERNNTPQALWNN
LINGFDGVVKTSERFNDNFFKNHEIANNYSGLLPLDEVKSFDPLFFGITPNEAQTIDPHQ
RLLLKCTWEALEDSLIDPISIKGTDTSVFIGSSTNDYLTLNRNEVKSNVFGSMAHSIANR
VSYCYDLHGNSITLDTACSSSLNAIALGYDSIKNKKSKMSIVGGVNILLDPYPYKAFSIL
NMLSKSNGRCKSFDASADGFVRGECIGVVILKNLKDAIKDGNRIYCTINGASANVDGIGY
SDKSNFYSPSSISQSENLKNAIQSTNGTVKPSDIDYVEAHGTGTPNGDPVETEGISKVFK
DTRSTDTPLLIGSFKSNIGHCEAASGIASLIKCCLMYKNKCFAPNIHFKTPNPAIKFKEW
NLKVVTEPIPFNENKNTSMIINNFGVTGSNCCLVLSQFNNTNKQKQQMKTKINNYLIPFS
ANSVESLKKYQSLIINSKENELKYSFEEFVKNQVFIKPTSLYQRSVIVAKDWNDFNNVEN
QVKYQTSSSTSSNITITNKNNNPITVFVFCGQGSQYNTMALELYKNEKVFRNSMDMLDNK
MKNYFGYSILEKLRAIQDSDKRSVHEQTMAQPSTVIIQVSLYELYKHWGIKASFMLGHSL
GEVTTAYCSGMIDIDQLCYLIYHRSTLQIRTNGLGKMLSINISSDEYKTNYMSRYPTIEI
ACYNSPSSIVIAGNEQILNEISKELKEKEIFSAMLGSLSSFHTSSQNIIKDDILNLNIQS
SQPVIPTFSTVTSNLFNESTIFDSEYFFDNISKPVSFTQTISNLYKHIEDNQIGSNIVFI
EIAPHPTLSFYLKQMIPKQSQYFRNGESISVYSTLHKKKNDVEEFQKSISQLFCDDAYDI
NFKCQFNNINSNIEAISNFNLPLYQWDDQHYWLNKSIEHKNNLIGPPISILGNSMQDSNP
FIKSYQTIIDTGKDAFKYLKGHNVSDKCYFPGAGYIDNLLKLYPNQDLTINSIEFKTPLI
LSDDNGQFLQTNVYQTGKSDYRAQFHFKDNRTNVWVQTCTANFQLYNNGKVDKLNLEEIK
STKCNLSSIPWDKFYPHIKNRTGLNYKDKFQNTIECYLGDNCSLTEISLELPENFHDQES
FFNTPILDICFHGSIVLIKDNCKLVLDKIDGFKLYTSNIPKNRFDHLSIFVYTTMKSTKS
NSYNSTYTVMLEDGTVILEVENLICTSLTPVKDPLLIEIPTDMYYTPYLQSKDSQIQSPL
EFKSIYQNNQDNDSLLIPNVVLETIKPLINEQMEFRILEFGGNNLSNSTLLLNSINSLLE
ENPHYEIDIEYTWSDNNSSILKDAKLELSKVDKGYLSILYRSLGLDVDNSLLEKQKLNPS
YYDLIIVSNISNLTKDIKYSLNQIYQILTPNGNLIINEQQPNNENNENNEDSLKNLLVNC
NFNSDIMMKSSSVSDSDIKSIIIQAQKPSLKLQPKTINTFDQVILYCNQDEQFQQQQQLI
NKFESHYNNNCKIIKVSTIEEFYKLSTTITNNSIIYFIKSIEQLTLENFKSITFEYVQIN
QKLYEFKSKCTHVLITYDSQSSNYLSSSILGAARYFDEIPTLQLFTFDFDKDSLINLDIS
VIDHLIDPKQNTLIEFFIKKNGKVYFERFKKGLKKNSFKSESYHQITNEQEILISKLDEN
LDYQLKSKDSILKPYDIEVEIKATGLNYKDYLVYSGLIKLKGDSVDFGLDFSGRVSRVGI
KSSKEFKVGDEVYGIGQSTSSSHIIIDSMHACHKPSKITHVQAASIPAVYATSIHSLYNI
GNLREGESILIHSGSGGVGLSALEILKSNNHSSPIFVTVGSEEKKQYLINTYGNLITGIY
STRDTNYQKQIKNKLIELGYETHGVDLIINTLSSEFMDSNFKCLNPEGRIVDLTITHLNP
NEFIDNNKFKYNFGYHNIELYYCEKPTIKKLLQSISKSIENNTLNYLIPITEFSNSNIKK
AIEYINERKHVGKIVISHDTDITNKLIENQPKIDYSLLKSNYKIKNLGKNVLVTGQTGLI
LDIINWIMKYNSTVENIIILSKSSMKWEMEFLINNNKTKIKFYYKRCDIGGDSDSINKTF
DKLFTENPTITNIDSIFHFAVVQITRKVKDIDMKSLNISHDAKTIGAINLHNQSIKRDWK
LSNFILASSILSKVGSLDQCGYVSACCVLDSFSKYRLSIGLPALSINIGAMGGSGMVARS
ELVETVLNGQGYNLTSTNQLLGTIDLLIQNPGQESNNLMVGNFNFPVFNNFKQKIHQKFD
FIFNALDSNSENGDGSNIKNSTNIKDKFLNKVSEFLSIDSSKINNDIKLMNYGADSLITV
QLKNWVDKEWSPNLITIHQIQSNSIGMVCQIINDNFEKKK
NT seq
7143 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataatagttatttaaataatccccaatttgatattaataatggtaataaagaagtt
acagatgatgataataataaaaataatcaagataatttagtagcaattgttggtgttggt
tttagattaccaagtggtgaaaatgaaagaaataatacacctcaagcattatggaataat
ttaataaatggtttcgatggtgtagtgaaaacatcggaaagattcaatgataactttttc
aaaaatcatgaaatagcaaataactattcaggactattaccattggatgaagttaaatca
tttgatccactcttttttggtattactcctaatgaagcacaaactatagatcctcatcaa
agattattattaaaatgtacatgggaagcattagaagattcattaattgatccaatatca
atcaaaggtactgatacttctgttttcattggctcttcaacaaatgattatcttacatta
aatagaaatgaagtaaaatcaaatgtgtttggtagtatggctcattcaattgcaaataga
gtatcctattgttatgatcttcatggtaattcaataactctagatactgcatgttcatca
tctttaaatgcaatcgcattaggatatgattcaatcaaaaataaaaaatcaaaaatgtca
attgttggtggtgttaatatattacttgacccatatccatataaggcattctcaattttg
aatatgttaagtaaatcaaatggtagatgtaaatcatttgatgcatcagctgatggattt
gttagaggtgaatgtattggtgttgttattttaaagaatttaaaagatgcaattaaagat
ggtaatagaatttattgtacaataaatggtgcaagtgcaaatgttgatggtattggttat
tctgataaatcaaatttctattcaccatcatcaatttcacaatctgaaaatttaaaaaat
gcaattcaatcaaccaatggaactgttaaaccatctgatatagattatgttgaagcacat
ggcactggtacaccaaatggtgatcctgtagaaaccgaaggtatatcaaaagtttttaaa
gatactcgttcaactgatactccattattaattggatcatttaaatcaaatattggtcat
tgtgaagctgcttctggtattgcttcattaatcaaatgttgtttaatgtataaaaataaa
tgttttgcaccaaatattcattttaaaacaccaaatccagcaattaaatttaaagaatgg
aatttaaaagttgtaactgaaccaattccatttaatgaaaataaaaatacttcaatgatt
attaataactttggtgttactggttcaaattgttgtttagtattatctcaatttaataat
acaaataaacaaaaacaacaaatgaaaacaaaaataaataattatttaattccattttca
gcaaattcagttgaatcattaaaaaaatatcaatcattaattataaatagtaaagaaaat
gaattaaaatatagttttgaagaatttgttaaaaaccaagtatttattaaaccaacatca
ctttatcaaagatctgtaattgttgcaaaagattggaatgattttaataatgttgaaaat
caagttaaatatcaaacttcaagtagtacttcttcaaatattacaattacaaataaaaat
aataatccaataactgtatttgtattttgtggtcaaggatcacaatataatacaatggca
ttagaattatataaaaatgaaaaagtatttagaaattcgatggatatgctagataataaa
atgaaaaattattttggatattcaattttagagaaattaagagcaattcaagatagtgat
aaacgttcagttcatgaacaaacaatggcacaaccatcaactgtaattattcaagtatca
ttatatgaactttataaacattggggtataaaagcatcatttatgttgggtcatagtctt
ggtgaagtaacaactgcttattgttcaggtatgattgatattgaccaattatgttattta
atttatcatagatcaacattacaaataagaacaaatgggttaggtaaaatgttatcaatt
aacattagttcagatgaatataaaactaactatatgtcacgttatccaaccattgaaatt
gcatgttataattcaccatcatcaattgtaatcgcaggtaatgaacaaattttaaatgaa
atttcaaaagaattaaaagaaaaagaaattttctcagcaatgttaggaagtttatcaagt
tttcatacaagtagtcaaaatataattaaagatgatattttaaatttaaatatccaatca
agtcaacctgttattccaacattttcaacagttacatcaaatttatttaatgaatcaact
atttttgattctgaatatttctttgataatatttcaaaaccagtttcattcactcaaaca
atttcaaatttatataaacatattgaagataatcaaatcggttcaaatattgtattcatt
gaaattgcaccacatccaacattatcattttatttaaaacaaatgattccaaaacaatca
caatactttagaaatggtgaatcaatatcagtttattcaacacttcataagaaaaagaat
gatgttgaagaatttcaaaaatcaatttcacaattattttgtgatgatgcttatgatatt
aattttaaatgtcaatttaataatataaatagcaatattgaggctattagtaattttaat
ttaccattatatcaatgggatgatcaacattattggttaaataaatcaattgaacataaa
aataatttaattggaccaccaatttcaattctcggtaattcaatgcaagattcaaatcca
tttattaaatcatatcaaacaataattgatactggaaaagatgcattcaaatatttaaaa
ggtcataatgtatctgataaatgttatttcccaggtgcaggttatattgataatctttta
aaattatatccaaatcaagatttaacaattaattcaattgaatttaaaacacctttaata
ttatcagatgataatggtcaatttttacaaacaaatgtttatcaaactggtaaaagtgat
tatagagctcaatttcattttaaagataatagaacaaatgtatgggttcaaacatgtact
gctaattttcaattatataataatggtaaagttgataaattaaatttagaagaaattaaa
tcaacaaaatgtaatttatcatcaataccatgggataaattttatccacatataaaaaat
agaactggtttaaactataaagacaaatttcaaaatacaattgaatgctatcttggtgat
aattgttcattaactgaaatatcattagaattaccagaaaactttcatgatcaagaatca
ttttttaatacaccaattttagatatttgcttccatggttcaattgttttaattaaggat
aattgtaaacttgttttggataaaattgatggttttaaattatatacatcaaacattcca
aaaaatagatttgatcatttaagtatttttgtatatacaactatgaaatcaacaaaatca
aattcatacaattcaacatacacagtaatgttagaagatggtactgttatacttgaagtt
gaaaatttaatatgtacatcattaacaccagttaaagatccattattaattgaaattcca
actgatatgtattatactccatatcttcaatcaaaagattcacaaattcaatcaccatta
gaatttaaatcaatttatcaaaacaatcaagataatgatagcttattaattccaaatgtt
gttttagaaacaattaaaccattaattaatgagcaaatggaatttagaattttagaattt
ggtggtaataatttatcaaattcaactttattattgaattcaatcaattcattacttgaa
gaaaatccacattatgaaattgatattgaatatacatggagtgataataattcatcaatt
ttaaaagatgctaaattagaattatcaaaagtagataaaggttatttaagtattctttat
cgttcattaggtttagatgttgataattcattattagaaaaacaaaaattaaatccatca
tattatgatttaattattgtttcaaatatttcaaatttaacaaaagatattaaatattca
ttaaatcaaatttatcaaattttaacaccaaatggtaatttaataataaatgaacaacaa
ccaaacaatgaaaataatgaaaataatgaagattcattgaaaaacttattggttaattgt
aatttcaattctgatataatgatgaaatcttcaagtgtatctgatagtgatattaaatca
attattattcaagctcaaaaaccatcattaaaattacaaccaaaaacaataaacactttt
gatcaagtcattttatattgtaatcaagatgaacaattccaacaacaacaacaattaatt
aataaatttgaaagtcattataataataattgtaaaataataaaagtatcaacaattgaa
gaattttataaattatcaacaacaattacaaataattcaatcatttattttataaaatca
attgaacaattaacattggaaaactttaaatcaataacatttgaatatgttcaaattaat
caaaaattatatgaatttaaatcaaaatgtactcacgttttaattacatatgattctcaa
tcaagtaattatttatcatcatcaattttaggtgcagcaagatactttgatgaaattcca
actttacaattatttacatttgattttgataaagattcattaattaatttagacatttcg
gttatagatcatttgatagatccaaaacaaaatacattgattgaattctttattaaaaaa
aatggtaaagtttattttgaaagatttaaaaaaggtttaaagaaaaattcttttaaatca
gaatcatatcatcaaattacaaatgaacaagaaattttaatttcaaaattagatgaaaat
ttagattatcaattaaaatcaaaagattcaattttaaaaccatatgatattgaagtagaa
attaaagcaactggtttaaattataaagattatttagtatatagtggtttaataaaatta
aaaggtgatagtgttgattttggtcttgatttttctggtagagttagtcgtgttggaatt
aaatcatcaaaagaatttaaagttggtgatgaagtttatggtattggacaatcaacatca
tcatctcatattattattgattcaatgcatgcatgtcataaaccatcaaagattacacat
gttcaagcagcttcaattccagcagtttatgcaacttcaattcattctttatataatatt
ggtaatttaagagaaggagaatcaattttaattcattcaggatctggtggtgttggatta
tcagcattggaaatattaaaatcaaataatcattcatctccaatatttgttacagttgga
tcagaagaaaagaaacaatatctaattaatacctatggtaatttaatcactggaatttat
tcaacaagagatacaaattatcaaaaacaaattaaaaacaaattaattgaattaggttat
gaaactcatggtgttgatttaattattaatactttatcaagtgaatttatggatagcaat
ttcaaatgtttaaatccagaaggtagaattgtagatttaacaattactcatttaaatcca
aatgaatttattgataataataaatttaaatataattttggttatcataatattgaatta
tattattgtgaaaagccaacaattaagaaactattacagtcaatttcaaaatcaattgaa
aataatacattaaattatttaattccaattacagaattttcaaattcaaatattaaaaaa
gcaattgaatacattaatgaacgtaaacatgttggaaaaattgtaatttctcatgataca
gatattactaataaattaattgaaaatcaacctaaaattgattactctttattgaaatca
aattataaaattaaaaatcttggtaaaaatgtattggttacaggtcaaactggtctaatt
ttagatattataaattggattatgaaatataattcaactgttgaaaatataattattctt
tcaaaatcatcaatgaaatgggaaatggaatttttaattaacaacaataagacaaaaatt
aaattctattataaaagatgtgatattggtggtgattcagattcaattaataaaacattt
gataaattgtttacagaaaatccaacaattacaaacattgattcaatattccattttgca
gttgtacaaattacaagaaaagtaaaagatattgatatgaaatcattaaatatttcacat
gatgcaaaaacaattggtgcaattaatttacataatcaatcaattaaaagagattggaaa
ttaagtaatttcatattagcatcttcaattctttcaaaagttggttcattagatcaatgt
ggatatgtttcagcatgttgtgtacttgactcattttcaaaatatcgtttatctattgga
ttacctgcattatcaattaatattggtgctatgggtggaagtggaatggttgcaagaagt
gaacttgttgaaactgtacttaatggtcaaggttataatttaacctcaacaaaccaacta
ttaggtacaattgatttattaattcaaaatcctggtcaagaatcaaataatttaatggtt
ggtaattttaatttcccagtttttaataatttcaaacaaaagattcatcaaaaatttgat
tttatttttaatgctcttgattcaaactctgaaaatggtgatggtagtaatatcaaaaat
tcaacaaatattaaagataaatttttaaacaaagtatcagaatttctttcaattgattca
tctaaaattaataatgatattaaattaatgaattatggtgctgattcattaattactgtt
caattaaagaattgggttgataaagaatggtctccaaatttaattacaattcatcaaatt
caatcaaattcaattggtatggtttgtcaaattataaatgataattttgaaaaaaaaaaa
taa
DBGET
integrated database retrieval system
