Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0287593
Help
Entry
DDB_G0287593 CDS
T00245
Symbol
abcC6
Name
(RefSeq) ABC transporter C family protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
nSTAND3
AAA_24
DO-GTPase2
NB-ARC
AAA_23
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8626236
NCBI-ProteinID:
XP_637141
dictyBase:
DDB_G0287593
UniProt:
Q8T6H3
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(525231..529373)
Genome browser
AA seq
1351 aa
AA seq
DB search
MFTKILKKFFSSYEKLKDNEDENEPSSNSTNNFYKTCPEDNSSKWSKISFNWVTKLIMKG
YLKESLEMNDIYDLPELNKVQTTSKLLEDIDLSNNSNYTLIKHIYKKFLPKNKYALVSNL
FIIIFTFLSPICLKFLINYISIQDENEKSILKGILLCCLLCLCVLGQSISQELFYWFGIK
NGFDVRGALAAKIFEKTLKLSNASRKEYKSGKIMNIMSIDVANISEYFWTHHINIVSHFI
QILSLVGLLCYVVGPSGLVGFGVMVIALPINAMLCAKSSNYLEKSLEYSDSRTNLTSELI
TNIRPFKMYAWENFFINKIDGQRKQELKNIFLRIFYSILDHMMIETNATLVLVSTFATYS
LNGNTMSLDVTFTAMTIFSKLEVPLIRLPYDIFKAIGLIPSVKRVQNFLKSSESLKYNKN
FKNENQKITTTKENNNQHGQDNDIIVENCTFQWNEPENNNIFELNYGDNEEEENQDESIN
KKENDNEEFNYKLKDINLIVPKGKLTMICGVVGSGKTSLIFGLIGEIYKLNGSVSGVPNN
ISFTSQQPFLLSASLRENILFGNEFDIERYKKVIESTALTKDIVNLAGLDLTEIGERGIN
LSGGQKQRISLARALYANSDCFIFDEPLSAVDPEVASHLFDHCIQGELMRNKTRILVTHQ
LQFIPYADHIIVLNSNGQLIQGTYQELNEKGIDFKSILKTKEIKKNVENETDSEELIKNE
IEIENEIIDVNNAISDKNDPNLIEKAKLLVKEDKNEGEVEFNVYKKYFSYGSSGVTLFIT
ISLFFVGQAIFKVSDFWLTIWTERSIEGKSDSFYIGYYLLIFGTFVVILMIRILLLCRIT
FNVGKNLHSALLKSVTYASCRFFDTNPSGRILNRFSKDTSDIDIHMFDILTEVSMCFSEL
TIGLISIVFIIPIMVIPLIILSIAYYILQRLYRPSARELNRWESITVSPIFSLLQECYNG
LLTIRTYKQESRFIKEMFDNININLGCFFYSFAVHRWVSMRLEVMGWIMVFFTSLIATLF
ISNNGLAALSVTTALSLNGYLSWGIRRIVDLEVKMNSFQRIQSYIEIPKEGNKLVSTNSN
EVDNHTIKDADLVNWPNKGIIEFKNVEIKYRPNSEPNLKDLSFKVQSSEKIGIVGRTGAG
KTTIASSLFRMVECSKGLILIDGIDISKVQLQKLRSSIGIVPQDPFIFTGTIRSNIDPFN
EFTDFEIWESVEKVKLKDAINSMPLKLETALQENGDNGFSYGQKQLLCLCRTILKNFKII
LMDEATSSIDYHTAQLIKQTIQENFKDCTTLTIAHRLETIIDCNKIAVIDSGQLIEFDTP
SNLMNIPNSKFNKLIKSQTDYNNNEKTIINK
NT seq
4056 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttcactaaaattttaaaaaagtttttttcgtcctatgaaaaactaaaagataatgaa
gatgaaaatgaaccatcatcaaattcaacaaataatttttataaaacatgtccagaagat
aattcatcaaaatggtcaaaaattagttttaattgggtaacgaaattaataatgaaaggt
tatttaaaagagtcattagaaatgaacgatatttatgatttaccagagttaaataaagtc
caaaccacatcaaaactattggaagatatagatttatcaaataattctaattatacatta
ataaaacatatttataaaaaatttttaccaaaaaataaatatgctttagtttcaaattta
tttataataatttttacatttttatcaccaatttgtttaaaatttttaataaattatatt
tcaatacaagatgaaaatgaaaaatccattttaaaaggaattttattatgttgtttatta
tgtttatgtgttttaggacaatcaatttcacaagaattattttattggtttggtattaaa
aatggatttgatgttagaggtgcattagcagcaaagatatttgaaaaaacattaaaatta
tcaaatgcatcaagaaaggaatacaagtctggaaaaattatgaatattatgtcaattgat
gttgcaaacatatctgaatacttttggacacatcatattaatatagtgtcccatttcatc
caaatattaagtttagtgggattattatgttatgtagttggtccaagtggtttagttgga
tttggtgtaatggtaattgcattaccaatcaatgcaatgttatgcgcaaaatctagtaat
tatttagagaaatcattggaatattcagattcaagaactaatttaaccagtgaattaata
accaatattagaccatttaaaatgtatgcatgggagaatttctttataaataaaattgat
ggacaaagaaaacaagaattaaagaatatattcctacgtattttttactcaatacttgat
catatgatgattgaaaccaatgcaaccttagtattagtatcaacatttgcaacttattca
ttaaacggtaatacaatgagtttagatgtaactttcacagcaatgacaatattttcaaaa
ttagaagtgcctttaattcgtctaccttatgatatttttaaagctattggtttaatacca
tcagtcaaaagggttcaaaactttttaaaatcttctgaatctttaaaatataataaaaat
tttaaaaatgaaaatcaaaaaataacaacaacaaaagaaaataataatcaacatggccaa
gataatgatattatagttgaaaattgtacatttcaatggaatgaacctgaaaataataat
atatttgaattaaattatggtgacaatgaagaagaagaaaatcaagatgaatcaattaat
aaaaaagaaaatgataatgaagaatttaattataaattaaaggatattaatttaatagta
ccaaaaggtaaattaactatgatttgtggtgttgttggtagtggtaaaacaagtttaatt
tttggtttaattggtgaaatttataaattaaatggtagtgttagtggtgtaccaaataat
atttcatttacaagtcaacaaccatttttattaagtgcatcattaagagagaatattcta
tttggaaatgaatttgatatagaaagatataaaaaagttattgaatcaacagcattaaca
aaagatatagtaaatttagcaggattggatttaacagagattggagaacgtggtattaac
ctttcaggaggtcaaaaacagcgtatatcattagcacgtgcactttatgcaaattcagat
tgttttatttttgatgaacctttatcagctgtagatcctgaagtcgcatcacatttattc
gatcattgtattcaaggagaattaatgagaaataaaacacgaattttagtaactcatcaa
cttcaattcattccatatgcagatcatattatagttttaaattcgaatggtcaattaatt
caaggtacatatcaagaattaaatgaaaaaggtattgattttaaatcaattttaaaaaca
aaagaaattaaaaaaaatgttgaaaatgaaactgatagtgaagagttaataaaaaatgaa
attgaaatcgaaaatgaaattattgatgttaataatgctattagtgataagaatgatcca
aatttaatcgagaaagcaaaattattagttaaagaagataaaaatgagggagaggtagaa
tttaatgtttataaaaaatactttagttatggatcatcaggtgtaacacttttcatcact
atttcattatttttcgttggtcaagccatttttaaagtttcagatttttggttaacaatt
tggacagaaagatcaattgaaggcaaaagtgattcattttacattggttactatttatta
atttttggtacttttgttgtaatcttgatgatacgtattttactattgtgtcgtattaca
ttcaacgttggtaaaaatttacattcagcactattaaaatcagtaacatatgcatcatgt
agattctttgatacaaatccatcaggtagaattttaaatagattcagtaaagatactagt
gatattgatattcatatgtttgatatattaaccgaggtttcaatgtgtttctctgaatta
acaattggtttaatttctattgttttcattattccaattatggtaattccattaattatt
ttatccattgcctactatatacttcaaagattatatagaccatcagcaagagaattaaat
agatgggaatctattacagttagcccaattttttcattacttcaagagtgctataatggt
ttacttacaattagaacttataaacaagaatctagatttattaaagaaatgtttgacaat
atcaatattaatttaggttgttttttttatagtttcgcagttcatagatgggtttctatg
agattggaagttatgggttggataatggtattttttacctcattaattgcaacattattc
atttcaaacaatggactcgctgcgttatcagtcacaactgctttgagtttaaatggttat
ctaagttggggaatccgtagaatcgttgacttagaagttaaaatgaactcattccaaaga
attcaaagttatattgaaattccaaaagaaggaaataaactcgtatcaacaaactcaaat
gaagttgataatcatacaattaaggatgctgatttagttaattggccaaataaaggtatt
atagagtttaaaaatgtggaaattaaatatcgaccaaattcagaaccaaatttaaaagat
ttatcatttaaagttcaatccagcgaaaagattggaatagttggtagaactggtgccggt
aaaacaactatcgcttcatcattatttagaatggtagaatgttcaaaaggtttaatatta
attgatggtattgatatatcaaaggttcaattacaaaaactaagatcatcaataggtatt
gtacctcaagatccattcattttcacaggtacaattcgttcaaacattgacccattcaat
gaattcactgattttgaaatttgggaatcagttgaaaaagttaaattaaaggatgcaatc
aattcaatgccattaaaattagagacagcactacaagagaatggtgataatggtttctca
tatggtcaaaaacaattattatgcctttgtagaacgattttaaaaaattttaaaatcatt
ttaatggacgaagccacaagttcaattgattaccatacagctcaattaatcaaacaaaca
attcaagaaaactttaaagattgtacaaccttaacaattgctcacagacttgaaacaatt
attgattgtaataaaatagcagtaatagatagtggtcaattaatagaattcgatactcct
tcaaacttaatgaatattccaaattccaaatttaataaattaattaaatctcaaactgat
tataataacaatgaaaaaacaataataaacaaataa
DBGET
integrated database retrieval system