Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0290623
Help
Entry
DDB_G0290623 CDS
T00245
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K00784
ribonuclease Z [EC:
3.1.26.11
]
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
ddi03016
]
DDB_G0290623
Enzymes [BR:
ddi01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.26 Endoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.26.11 tRNase Z
DDB_G0290623
Transfer RNA biogenesis [BR:
ddi03016
]
Eukaryotic type
3'processing and CCA adding factors
3'processing factors
DDB_G0290623
Prokaryotic type
DDB_G0290623
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Lactamase_B_2
Lactamase_B_4
Lactamase_B
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8627770
NCBI-ProteinID:
XP_635699
dictyBase:
DDB_G0290623
UniProt:
Q54FR8
LinkDB
All DBs
Position
5:4387215..4389650
Genome browser
AA seq
811 aa
AA seq
DB search
MKSFLEITGENGDTPTTSYLFSDSDRYFFDCGDGFQRFIKGRSNITFGKIKSIFITSLSW
DCIGGLIGLFLTMAELNIKVRLYGPKGLHKLFTSSREFQYQLNVEIYEVDSTIIQTIKDD
SFTFYTLPITNKNNKDDDNDEIKSIIDESKTPTLAYYGRNPQPIPTTIENDYEYEESSIV
CYIGMTKDFKGKFYPEKAVALGVPKGISFKHLQDGKSVTNKDGVTITPDQVMDKSIKGTK
FAIIRCPSIEYLPSLKSHLSMFTDIHIVNHIVPNEVLSNLNYIKFMEDINQQSTAAAINT
KHIIVNNENCERVSGCQSSDNQILKLQKFIPSLFPMKQQSSEHDSLVKSIEFLNDSKILK
DQINVFPCKETTNLILGPPQNAGDIEFLPLNNNNNGEGGVDSNENEGSSDNKSMEEFINT
EQGQLFKKQLDQQVEQLESNPNKCCHPKILFTGTGSAIPSKYRNVTGNFITLADDQNILL
DAGEGTFGQLYRFFGPIEVKKQLINLKMIWLSHLHADHHLGIPNICEKRQQYAQELGLKD
NELEPLIIIGPEALIQWVNELSVIVNLKFIGIAINGNHSNQLVQTCKKLNIKSFSMVPVI
HCNYAFGLVIEWNDGFKLTYSGDTRPCKFLSEMGKDSCVQIHEATFEDEKQMDAVSKRHS
TVGEALEVGRLMNCKFSLLTHFSQRYPNLKMGTYKDTNYGLAIDLLQISPYQYPLVYKMI
EPFSLLFENEAQKKLDKKSTQPTTTSKSKSTKTEDENNTIEKDAKRLEKYQNKYKDEVIL
PAYVYNIDSNSLTLIENTFDDLSSQPQFEDD
NT seq
2436 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatcatttttagaaattacaggagaaaatggtgatacaccaacaacaagttattta
ttttcagattctgatagatatttttttgattgtggtgatggatttcaaagattcattaaa
ggaaggtcaaatataacatttggtaaaattaaatcaatattcataacatcattatcatgg
gattgtattggtgggttaattggtctattcttaactatggcagaattgaatattaaagtt
cgtttatatggtccaaaaggtttacataaattatttacatcatcaagagaatttcaatat
caattgaatgtagaaatttatgaagttgattcaacaataattcaaactattaaagatgat
tcatttacattttatacattaccaattactaataaaaacaataaagatgatgataatgat
gaaattaaatcgattattgatgaaagtaaaactccaactttagcatattatggtagaaat
ccacaacctataccaacaactattgagaatgattatgaatatgaagaaagttcaatagtt
tgttatattggtatgacaaaagattttaaaggtaaattctatccagagaaagctgtagca
ttaggtgtaccaaaaggtatttcatttaaacatttacaagatggcaaatctgtgacaaat
aaagatggagttacaattacacctgatcaagttatggataaatcgattaaaggtacaaaa
tttgcaatcattagatgtccatcaattgaatatttaccaagtttaaaatcacatctttca
atgtttacagatattcatattgtaaatcatatagttccaaatgaagttttatcaaattta
aattatattaaatttatggaagatattaatcaacaatcaacagcagcagcaattaataca
aaacatattattgtaaataatgaaaattgtgaaagggtttcaggttgtcaatcatctgat
aatcaaattttaaaacttcaaaaatttataccatcattatttccaatgaaacaacaatct
agtgaacatgatagtttagttaaatcaattgaatttttaaatgattcaaaaatattaaaa
gatcaaattaatgttttcccatgtaaagaaactacaaatttaatattaggtccaccacaa
aatgcaggtgatattgaatttttaccattaaataataataataatggcgaaggtggtgtt
gattcaaatgaaaatgaaggttcttctgataataaatcaatggaagaatttataaataca
gaacaaggtcaattatttaaaaaacaattagatcaacaagttgaacaattagaatcaaat
ccaaataaatgttgtcatccaaaaatattattcacaggtacaggttcagcaataccaagt
aaatatagaaatgttacaggtaatttcataacattggcagatgatcaaaatattctatta
gatgcaggtgaaggtacatttggtcaattgtatcgtttctttggtccaattgaagtgaaa
aagcaattaattaatttgaaaatgatttggttatcacatttacatgctgatcatcattta
ggtataccaaatatttgtgaaaaaagacaacaatatgctcaagaattaggtttaaaagat
aatgaattagagccattaattataattggaccagaggcattgattcaatgggttaatgaa
ttatcagttattgtaaatttaaaattcattggtattgctatcaatggtaatcattcaaat
caattggtacaaacttgtaagaaattaaatattaaatcattttcaatggtacctgtaatt
cattgtaattatgcttttggtttagttattgaatggaatgatggattcaaattaacttat
tcaggtgatactcgtccttgtaaattcctatctgaaatgggtaaagattcatgtgtacaa
attcatgaagcaacttttgaagatgaaaaacaaatggatgctgtctcaaaaagacattca
actgttggtgaagctttagaagttggtagattaatgaattgtaaattctctttattaact
cattttagtcaacgttatccaaatttaaaaatgggtacatataaagatacaaattatggt
ttggcaattgatttacttcaaatttcaccttatcaatatccattagtttataaaatgatt
gaaccattttctttattatttgaaaatgaagctcaaaagaaattagataaaaaatcaact
caaccaacaacaacaagtaaatcaaaatctacaaaaacagaagatgaaaataatacaatt
gaaaaagatgctaaaagattagagaaatatcaaaataaatataaagatgaagtaatatta
ccagcttatgtatataatattgattcaaattctttaactttaatagaaaatacatttgat
gatttatcaagtcaacctcaatttgaagatgattaa
DBGET
integrated database retrieval system
