Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0291614
Help
Entry
DDB_G0291614 CDS
T00245
Symbol
pks40
Name
(RefSeq) beta-ketoacyl synthase family protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ketoacyl-synt
Acyl_transf_1
Ketoacyl-synt_C
KR
Methyltransf_12
KAsynt_C_assoc
Methyltransf_23
ADH_N
PS-DH
ADH_zinc_N
ADH_zinc_N_2
PP-binding
Methyltransf_11
Methyltransf_25
Methyltransf_31
PKS_DH_N
Thiolase_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8628247
NCBI-ProteinID:
XP_635303
dictyBase:
DDB_G0291614
UniProt:
Q54ED7
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(536394..544131)
Genome browser
AA seq
2552 aa
AA seq
DB search
MDYKNKYQSNENCNKVAIIGIGFRFPNLKGDLTPNGLWSQLLNKYDGIVKNDRWNESFYK
TGDIPTKYAGLIPFEELKSFDPLFFGINPSEVIHMCPQQRILLKCTWEALEDSGIDPIEI
RDSNTSVFLGCSNFDYQNLNKNNNKIQQNIFASSSHSVSNRISYCFDLHGESMTIDTACS
SSSNAIRRGYKSIIDGSSNISVVGGINILLDPNTSKSYSQLNMLGKDGKCKTFDADADGY
VRSESAGIAILKNLNDAIKDGNNIYCVIDGSASNVDGNGFSDKSNFYSPSKSSQVECIRL
ALESTNGGVNENDIVYFEAHGTGTPTGDPIELESVSIALKTSENRSSNNPLLIGSFKPNI
GHSECASGISSLIKCCLILKNQCFVPNINYNKPNPNIKFNQWNLKVVTDPIDFSTLKLSN
KPISIAINNFGVTGSNCCLIVSSFKGNQTNNNNNKSKSPKQYLIPFSTNSIKSLDLYKSR
IDNNVEFKEFAENQIKSKSKKLIQRSVAIASNWDEFNLKSNTINTSNDKLTSNMLVSSNK
KNATMVFVFCGQGAQYSTMAKNLYDNEPIFKKSMDKIDSKLSEYYGFSILEKLRSFNEND
LKGIQYSIIAQPSTCMVQISLFELYCHWGIKPSIIVGHSLGEISSSYCSGMIDLDTFCYL
IYHRSMVQSKTNGLGRMLSISIGENEYNSKYSSRYPELEIACYNSPSSIVIAGKELILNE
IIKELKQDGVFCTILGSPTSFHTSSQIPVKDEILKISFKSKQSTYPIFSTVTTNLYDEMN
PFDTKYVYDNIINPVRFTNTISNIYKHIELNYSVNNNSNEIIFIEIAPHPTLSFYLKQMV
PEDKKQSVSIFSPLSKKKSNDLFEIQKLISELYCLGYNGIGFNIQLSNLNENDNIQTSLS
LPLYQWEEQEYWKLDSLYQHHLSNGPSINHLGISNSNHTPYIKSYQTHIDIQKKPFQWLK
GHQIKGKYYFPGCGYIDNILKIFGDNSESTTNPNKELPDILISFIEFKTPLIFMDGVNQC
LQTNIHSTGKKEYKALFHFKDEKSSSDWVQTSTANFQLFSRGQGLNEDDEESLFKYNIND
LISNQCNLTKLSKQELYSHIKTKCGLNYSGDFQRVEKCYFGNNCSLSELSLSQGVNENRS
TFFDSSIIDCCLHGSIGLIDENCQLVFEKLEGLTYYSSKVPTTTSQHSKIYVYSKLKPRI
GDSYSASIIVMLENGTVLFEMENASFKSTTKIKDSLAMEYPTNEIYSCYLQSKDSLIPSL
SSFDHIFKRKITDEYVDQIKIYESFIPKLLFSNINKRCPEITIAEIQSSEIEQLLLKYYK
IKEDNDNKWLSRLFTFAFESIKQWYHNEDYDFENVLSPHNFKIFSKSTKIISKLLFPLEN
DNDEDSPQSLFEGGLLDKFYSSGFSAQNELVGEIIQESIKPILNEKLVFRILEFGGGVGS
LSLLVLEKINSLLIQYPNYQIDIEYTWSDISPSFITEAKAKFEKFNDRVNIIYKALNLEQ
PLIGEKQGLKPQYFDYIIMFNVLHVIKDVKYGVEQIYQLLVPNGHLLFIEPIYKSIVGDG
IFGVFDQWWSFQDTEIRKDRCCMNQQTWYKLLKSVNFNDDIKMTPELTCFVIQAQKPSIS
NLSFSKSETTNYNNIIVFGNKDDSNLSNNFIKSIDNGNLQFISTIEEFNKMTKYISNESI
IYFIKSIDELSVDNFVNITHEYTQINQKLMELNSKCKHVLITNDSTTTNYLSSSLIGAAR
YYHECPLELFILNFDTPSIIENQNLFKTIEPLINSSINIQREFIINNHKVYYERIKNETK
LKSIFKNSSSFESLEQVDNFMISLTPNLEYKVKVKPTSILKENEVEIKVMSTGLNYKDYL
IYAGLVESVEPIFGIEFSGIITNIGSGNKEFKVGDSVYGTGKSTTSSHIITDIDVISHKP
SNISHSEASSIPVVYLTSYHSLYNIGALKNNETILIHSATGGVGLSTLEILKWKGHSGLI
FVTVGSNEKEEYLRENYGDMISGIYSTRNKNFVKQIKSKISKLNPFGKSGVDFILNTLSS
SDYMDSNFKCLNMSGRIVDLSITHLNSNEFTDNKKFKYNYGYHNIELQYVDKKIIKSTLS
IISNAVSSNDLQLIPITEYSIENVKDSIEFINERVHMGKIVVDHENQDSIINELIEKQKS
IDKFDQSIFKQNYKLEPSLLGKNILITGQSGIVLEILKWILRNSENNSIDNIIILSKSSI
KWEMELLINKTKLLNSNSINSMGNYLNKIKFHFKSVDISDSGLTDKGIHELLIENPDINN
IDSIFHFAYTQATCNSDEVDLHHLTQSHSAKSMGAINLHNQSIKRNWKIINFIMSSSITS
KTSSANQCGYISSNNVLDALSKYRISIGLPTICTNYGLIQSTGFVSRNESVAALLSGEGL
LPISTNLILGTLDLQLQNQAQSSNLILSNFNFTSLNGLPQKSLISKFDYQININEENEKS
KSLLKDDNVELTVDQLITFKISELLSTDILKLNKDIILVDYGVDSLVIIQLKNWVDKEFS
IPNALTIQQVQNSTINSFIQLVKNSIDKKNKK
NT seq
7659 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattataaaaataaatatcaaagtaatgaaaattgtaataaagttgcaataatcgga
ataggttttagatttccaaatttaaaaggtgatttaacacccaatggattatggagtcaa
ttattaaataagtatgatggaattgttaaaaatgatagatggaatgaaagtttttataaa
acaggtgatattccaacaaaatatgctggattaataccatttgaagaattgaaatcattt
gatccattattttttggaattaatccatcggaagttattcacatgtgcccacaacaaaga
attttattaaaatgtacttgggaagcattagaagactctggaattgatccaattgaaatt
cgtgattccaatacttcggttttccttggttgcagtaattttgattatcaaaatttaaat
aaaaataataataaaattcaacaaaacattttcgcttcatcttctcattctgtatcaaat
cgtatctcttattgttttgatttacatggtgaatcaatgacaattgatactgcatgttca
tcatcatcaaatgcaatcagaagaggttataaatcaattattgatggttcaagtaatatt
tctgttgttggtggtattaatattttattagatccaaacacatcaaaatcatattcacaa
ttaaatatgttaggtaaagatggaaaatgtaaaacatttgatgctgatgcagatggttat
gttagatcagagtctgcaggtattgcaattttgaagaatttaaatgatgcaatcaaagat
ggtaacaatatttattgtgtaattgatggttcagcatcaaatgtcgatggtaatggattt
tcagataaatcaaatttttattcaccttcaaaatcatcacaagttgaatgtattcgtttg
gcattggaatctacaaatgggggagtcaatgaaaatgatatcgtttattttgaagctcat
ggcactggtacaccaactggtgatccaattgaattggaaagtgtttcaatagctttgaaa
accagtgaaaatcgttcatccaataatccattattaattggttcatttaaaccaaatatt
ggccatagcgaatgtgcatccggtatatcatcattaattaaatgttgtttaattttaaaa
aatcaatgttttgttccaaatataaattataataaaccaaatccaaatattaaatttaat
caatggaatttaaaggttgtgacagacccaatagatttttctactttaaaattatcaaat
aaaccaatttcaattgccattaataatttcggtgttactggttcaaattgttgtttaatt
gtatcaagtttcaaaggaaatcaaactaataataataataataaatcaaaatcaccaaaa
caatatttaatcccattttcaacaaattcaattaaatcattagatttatataaatcaaga
attgataataatgttgaatttaaagaatttgcagaaaatcaaataaaatcaaaatctaaa
aaattaattcaacgttcagttgccattgcaagtaattgggatgaatttaatttaaaatca
aacactatcaatacatcaaatgataaattaacatcaaatatgttagtatcatcaaataaa
aagaatgcaacaatggtatttgtattctgtggtcaaggagctcaatattcaacaatggca
aagaatttatatgataatgaaccaattttcaaaaaatcaatggacaaaattgattcaaaa
ttaagtgaatattatggattttcaattttagaaaaattaagatcatttaatgaaaatgat
ttaaaaggtattcaatattcaataattgcacaaccatcaacttgtatggtacaaatttca
ttatttgaattatactgtcattggggtattaaaccatcaattatcgtcggtcatagttta
ggtgaaatttcatcatcatattgttctggtatgattgatttagatactttttgttattta
atttatcacagatcaatggtacaatcaaaaacaaatggtctcggtagaatgttatcaatt
tcaattggcgagaatgaatataattcaaaatactcttcaagatatccagaattagaaatt
gcatgttacaattcaccatcatcaattgttattgctggtaaagaattaatcttgaatgaa
attattaaagaattaaaacaagatggtgtattttgtacaatattaggttctcctacttca
ttccatacctcaagtcaaatacccgtaaaagatgaaattttaaaaatttcattcaaatca
aaacaatcaacctatccaattttctcaacagttacaacaaatttatatgatgaaatgaat
ccatttgataccaaatatgtttatgataatatcattaatcctgtaagatttacaaataca
atttcaaatatttataaacatattgaattaaattattcagttaataataatagtaatgaa
attatatttattgaaattgcaccacatccaactttatcattttatttaaaacaaatggta
ccagaggataaaaaacaatcagtttcaatcttttcaccactttcaaaaaagaaatcaaat
gatttatttgaaattcaaaaattaatttcagaattatattgtttgggttataatggtatc
ggatttaatattcaattatctaacctaaatgaaaatgataatattcaaacttcattaagt
ttaccattatatcaatgggaagaacaagaatattggaaacttgatagtctctatcaacat
catctttcaaatggtccatcaatcaatcatcttggtatttcaaattcaaatcatacacca
tatattaaatcatatcaaactcatattgatattcaaaagaaaccattccaatggttaaaa
ggacatcaaattaaaggaaagtattatttcccaggttgtggttacattgataatatttta
aaaatatttggtgataatagtgaatcaacaacaaacccaaataaagagttaccagatata
ttaattagttttattgaatttaaaactccattgatttttatggatggtgtcaatcaatgt
ttacaaaccaacattcattcaactggtaaaaaagaatataaagcattattccattttaaa
gatgaaaaatcatcaagcgattgggtacaaacatcaactgcaaatttccaattattttca
agaggccaaggtttaaatgaagatgatgaagaatcactatttaaatataatataaatgat
ttaatttcaaatcaatgtaaccttacaaaattatcaaaacaagaattatattctcatatt
aaaacaaaatgtggtttaaattattctggtgatttccaaagagttgagaaatgttatttt
ggaaataattgttcattatctgaattatcactaagccaaggtgttaatgaaaatagatca
accttttttgattcatcaattattgattgttgtttacatggttcaattggtttaattgat
gagaattgtcaattggtatttgaaaaacttgaaggattaacctattattcatcaaaagtt
ccaacaaccacaagtcaacattctaaaatatatgtttattcaaaattaaaaccaagaatt
ggtgattcatattctgcatcaattattgtaatgttagaaaatggtactgttttatttgaa
atggaaaacgcatcatttaaatcaactacaaaaattaaagattcattggcaatggaatat
ccaacaaatgaaatttattcatgctatcttcaatcaaaagattcattaattccatcacta
tcatcatttgatcatattttcaaaagaaaaataactgatgaatatgttgaccaaattaaa
atttatgaatcatttattccaaaattattattttcaaatatcaataaaagatgtccagaa
attacaattgctgaaattcaatcaagtgaaattgaacaattattattaaaatattataaa
attaaagaagataatgataataaatggctttcaagattatttacatttgcatttgaatca
ataaaacaatggtaccataatgaagattatgattttgaaaatgttttaagtcctcataat
tttaagatattctcaaagtcaacaaagataatttcaaagttattattcccattagaaaat
gataatgatgaagattcaccacaatcattattcgaaggcggtttattagataaattctat
tcaagtggtttttctgctcaaaatgaattggtgggtgaaatcattcaagaatccatcaaa
ccaatattaaatgaaaaattagtatttagaatattagaatttggaggtggtgttggatca
ttatcattattagtacttgaaaaaatcaattcattattaattcaatatccaaattatcaa
attgatattgaatatacatggtcagatatatcaccatcttttattaccgaagcaaaagct
aaatttgaaaagtttaatgatagagttaatataatttataaagcattaaatttagaacaa
ccattgattggtgaaaaacaaggattgaaaccacaatactttgattatataattatgttt
aatgtattacatgtcattaaagatgttaaatatggtgttgaacaaatttatcaattatta
gtaccaaatggtcatttattattcattgaaccaatttataaatcaattgtaggtgatggt
atttttggtgtttttgatcaatggtggtctttccaagatactgaaattagaaaagataga
tgttgtatgaatcaacaaacttggtataagttattaaaatcagtaaattttaatgatgat
attaaaatgacaccagaattaacatgttttgtaattcaagcacaaaaaccatcaatttca
aatctttcattttcaaaatctgaaaccacaaattataataatattattgtttttggcaat
aaagatgattcaaacttatcaaataattttataaaatcaattgataatggaaatttacaa
tttatatcaacaattgaagagtttaataaaatgacaaaatatatttcaaatgaatcaatt
atttacttcattaaatcaattgatgaattatctgttgataatttcgtaaacattacacat
gaatatactcaaatcaatcaaaaattaatggaattgaatagtaaatgtaagcatgtttta
attacaaatgattcgacaacaaccaattatttaagttcatcattaattggtgctgcaaga
tattatcatgaatgtcctttagagttgtttatattaaatttcgataccccatcaattatt
gaaaatcaaaatttatttaaaacaattgaaccattaattaattcatcaattaatatacaa
agagagtttataattaataatcataaggtttattatgaaagaattaaaaatgaaacaaaa
ttaaaatcaattttcaagaactcaagttcatttgaatcattagaacaagttgataacttt
atgatatcattaacaccaaatttagaatataaagtaaaagtaaaaccaacatcaatatta
aaagaaaatgaagttgaaattaaagtaatgtcaacaggtttaaattataaagattattta
atatatgcaggtttagtagagagtgttgaaccaattttcggtatagagttttctggaata
attactaatatcggaagtggaaataaagaatttaaagttggtgatagtgtttatggtact
ggaaaaagtacaacatcatctcatattattacagatattgatgtaataagtcataaacca
tcaaacatatctcattcagaagcatcatcaattccagttgtttatttaacttcatatcat
tcactttataatattggtgcattaaaaaataatgaaacaatattaattcattctgcaact
ggtggtgttggtttatcaactttagaaatattaaaatggaaaggccattctggtttaatt
tttgtaactgttggttcaaatgaaaaagaagagtatttaagagaaaattatggtgatatg
atttcaggtatatattcaacaagaaataaaaatttcgttaaacaaattaaatcaaaaatt
agtaaattaaatccatttggtaaaagtggtgttgactttatattgaatacattatcatca
agtgattatatggattcaaatttcaaatgtttaaatatgagtggtagaattgttgattta
tcaattactcatttaaattcaaatgaatttactgataataagaaatttaaatataattat
ggttatcataatattgaattacaatatgttgataagaaaattataaaatcaacattatca
ataatttcaaatgcagtttcatcaaatgatttacaattaatcccaattactgagtattca
attgaaaatgttaaagactcaattgaatttataaatgaaagagttcatatgggtaaaatt
gttgtcgatcatgaaaatcaagattcaataattaatgaattaattgaaaaacaaaaatca
attgataaatttgatcaatcaatttttaaacaaaattataaacttgaaccatcattatta
ggtaaaaacatattaataacaggtcaatcaggtatagttttagaaattttaaaatggata
ttaagaaattctgaaaataattcaattgacaatataatcattttatcaaaatcatcaatt
aaatgggaaatggaattattaattaacaagacaaagttactaaattcaaattcaattaat
agtatgggtaattatttaaataaaattaaattccatttcaagagtgttgatattagtgat
tctggattaacagataagggaattcatgaattattaattgaaaatccagatattaataat
atcgattcaatattccatttcgcatacactcaagccacttgtaattctgatgaagttgat
ttacatcatttaacacaatctcatagtgcaaaatcaatgggtgcaattaatttacataat
caatcaattaaaagaaattggaaaataatcaattttataatgtcatcaagtataacaagt
aaaacaagttctgcaaatcaatgtggttacatctcatctaataatgttttagatgcttta
tcaaaatatagaatttcaattggtttaccaacaatttgtacaaattatggtttaattcaa
tcaacaggtttcgtttcaagaaatgaaagtgttgcagcattattaagtggtgaaggtctt
ttaccaatatcaaccaatttaattttaggtacattggatttacaattacaaaatcaagca
caatcatcaaatttaattttatcaaatttcaatttcacctcgttgaatggattacctcaa
aaatcattaatatctaaatttgattaccaaattaatataaatgaagaaaatgaaaaatca
aaatcattattaaaagatgacaatgttgaattaactgttgaccaattaataacatttaaa
atttcagagttattatcaactgatattttaaaacttaataaagatatcattttagttgat
tatggtgtagattctttagttatcattcaattaaagaattgggtagataaagaattttca
attccaaatgcattaacaattcaacaagtccaaaatagtacaatcaattcatttattcaa
cttgttaaaaattctattgataaaaaaaataaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
