Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0293436
Help
Entry
DDB_G0293436 CDS
T00245
Symbol
abcA3
Name
(RefSeq) ABC transporter A family protein
KO
K05643
ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 3
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
ddi02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
DDB_G0293436 (abcA3)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ddi02000
]
DDB_G0293436 (abcA3)
Transporters [BR:
ddi02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCA (ABC1) subfamily
ABCA1, 2, 3, 4, 7, 12, 13 subgroups
DDB_G0293436 (abcA3)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
ABC2_membrane_3
AAA_21
SMC_N
AAA_29
RsgA_GTPase
AAA_23
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8629224
NCBI-ProteinID:
XP_629134
dictyBase:
DDB_G0293436
UniProt:
Q54BT5
LinkDB
All DBs
Position
6:2880255..2885774
Genome browser
AA seq
1702 aa
AA seq
DB search
MGEFKFQLVTLLKKNSLLKGKSKIKFIGEILAPMIVIGILFGLLYLSAIIQPDFSPRYAS
GFTEVVGRLKKLLVATNGPLVPYQQTIVNNLRKQIKLAHPDYTNEYIDQCFEIFQDFESM
QGYFLDPENYRGVMGGLWFDENDYRYNAPKVLKYSISVDADYTNDNNIQISPRSDSQIYL
RHYFTQIQTAVDQAIFMAQNVEIPMVVTGQRFPNPYIHLWQTWTDGRNMILKETGGIFIT
AAIFVGLFTTITNMVMEKESKILEAMKIMGLHSLPYYVSIAISSCYTIIPSTIIVIVVLK
GSQLIWTTQWYILTIILILFSISLILLAFILSKFFNRSKFAGLVCFLIVLIMAGIGIAVN
HINVSTTVKLIFCLLSPVAISLANYSMSMKDLELVKIVNPDWSIIVSENQVIGMLILDVV
LYAALVWYIDNIISGEFGQSKPFYFFLTKSYWCKKNANENDLVDLSKAIESPLYLRKKDL
DYNNSQDFELNEIHSSKATIQIRKLRKEFKTGDGKRVAVDDLSIDMYQDRIHCFLGPNGS
GKSTTIGMLTGLITCTRGSALINGLDINQNIDLIRKNIGVVLQQDIIWDNLTVLEHLIFY
AQLKGYSNLKEAKTEAKKMGIEVGLELKLHNKAGTLSGGQKRKLCLGIAFIGPNSNILFL
DEVSSGLDPLSRSEVQDFIISKKKGKTIILSTHYMDEADLLGDTISIIAHGKLKCNGSPL
FLKNRFGVGYLLTITKKSTEFNKDSVMEITNKYIKQAHILSDAGTELSIRLPMESLPMFS
QYFKHLEDCKNQLLIDSYGISISTLEEVFLKIGQETLKSTPNFNDPAVKEALSTKSSGVK
VGQQLKGLLIKRICTTKKDFKSFMFSIVVPLIILALGLVMYKNMRTIETFNDVTTPLTFS
IDDYGDNIYVPWSISGQNQAIDLRIKNSIGKSNHSKLLPADELEDYLTLNYEGNPGAFAF
GKTIIEDIEMLSFKVYYNRDYLHALPIYINFVDNLMLSNLGGVGIQTTSRPFQHIKSKFE
LATEKINFSAIIFFIILTLAAFALVVASHAGNIAQERAARIKRLLYISGLKKYVYWLSNL
IWDYVLTFIMVIFLAVVVVIIDSKFRNQFPLFICALVLFVTAIIPLSYLFSYCWSSHGKA
TGFIFGIHFGIGLLMTVTCFILRIWVIKDDNDILQTITDIIDLVFFFFSPFYCFSKVMVI
ISNFPGTTRLGESYIANYWGIKFGLPPVCFLALHTLVWTIWIMVLDYYPELRGKYRKGRN
EKSSPPPPSDEDSDVSHERSKVLSFETSNDPIIMRDFFKLYKGKGKAKDNLAVYNTSLSI
PKGQTFGLLGLNGAGKSTTLGCLSGEVIPSGGEIFVNGFNIQTQRLDALRSVGFCHQYNS
LIGLLSAREQIRLYCRIKGIEESKIQETVEAFIKMMDLGSIGNSNVAGYSGGNKRKVALS
VAIVGNPSVCFLDEVSAGVDPVVARFMWNVITELKKDKVIILTTHSMLECSAVCDRLTIM
KSGKMMCLGSIQHIKDKFGSGYSIDVKFKKEYLLSGINLFQKELPNAKLVDHHDLSASFE
LPNSLDSPIQLSKIFSIIERNLKPILNDYSVGQTSIDHIFLKLTNLNQQKIKNQQKESIE
NHIIDINNNNNNNNNNSYLKNHKKTTSNNSILTNNSTTKNFGSSNFLDLESDNTYLNNLK
YLEDDDFNIEMPPYQNSLKKSF
NT seq
5109 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggagaattcaaatttcaactagttactttattaaaaaaaaactctttgctaaagggt
aaatcaaaaataaaatttattggggagatattggctccaatgattgtaattggcatttta
tttggattactttatttatctgctataattcaaccagatttttcaccaagatatgctagt
ggttttacagaggttgttggtaggttaaagaaattgttggttgcaactaatggtcctttg
gttccatatcaacaaactattgtaaataatttaaggaaacaaattaagctggctcatccc
gattatacaaacgaatatattgaccaatgctttgaaatatttcaagattttgaatcaatg
caaggttattttcttgatccagaaaattatagaggagtaatgggaggattatggtttgat
gaaaatgattatcgttataatgcaccaaaagttttaaagtatagtattagtgttgatgca
gattatacaaatgataataatatacaaatttctccaagatcagattcacaaatttatctt
agacattattttacacaaattcaaacagcagttgatcaagcaatttttatggcacaaaat
gttgaaataccaatggttgtaactggacaaagatttccaaacccttatatacatttatgg
caaacttggaccgatggtagaaatatgattttaaaagaaactggtggtatttttataact
gcagctatattcgttggtttatttacaacaattacaaatatggtaatggaaaaagagtca
aagattctcgaagcaatgaaaatcatgggattacattcacttccatattatgtttcaatt
gcaatttcatcatgttatacaattattccatcaacgataattgtaattgtagtattaaaa
ggttcacaattaatttggacaacacaatggtatattttaacgataattttaatactattt
tcaatttcattgattttattggcatttattttatcaaaatttttcaatcgttcaaaattt
gcaggtcttgtttgttttttaattgttttaattatggcaggaattggtattgctgtaaat
catatcaatgtttcaactaccgttaaattaattttttgtttactttcaccggttgcaatc
tctttagcaaattattcaatgtcaatgaaagatttagaattagtaaaaattgttaatcca
gattggtcaattatcgtctcagaaaatcaagtaattggtatgttaattttagatgtagtt
ttatatgctgcattagtttggtatattgataatattatctctggtgaatttggtcaatca
aaaccattttatttctttttaactaaaagttattggtgtaagaaaaatgccaatgaaaat
gatttggtcgatttatcaaaagcaattgaatcacctttatatttaagaaaaaaggattta
gattataataatagtcaagattttgaattaaatgaaattcattcaagtaaagcaacaatc
caaattagaaaattaagaaaagaatttaaaactggtgatggtaaaagagttgctgttgat
gatctttcaattgatatgtatcaagatagaattcattgttttttaggcccaaatggttct
ggtaaatcaactacaattggaatgttaactggattaataacatgtactagaggtagtgca
ttaattaatggattggatattaatcaaaacattgatttaattagaaagaatattggtgtt
gttttacaacaagatattatttgggataatttaacagtattagaacatttaatattttat
gcacaattaaaaggttattcaaatttaaaagaagcgaaaaccgaagcaaagaaaatgggt
attgaagttggtttagaattaaaattacataataaagctggaactttatcaggtggtcaa
aaaagaaaattatgtcttggtattgcatttattggtccaaattcaaatattcttttcctt
gatgaagtttcaagtggtttagatccattatcaagatcagaggttcaagattttataatt
agtaaaaaaaaaggtaaaacaattatactttcaactcattatatggatgaagcagattta
cttggtgatacaatatcaattattgcacatggtaaattaaaatgtaatggttcaccatta
tttttaaagaatagatttggtgttggttatttattaacaataacaaagaaatccactgaa
tttaataaggattctgttatggaaattacaaataaatatataaaacaagcacatatttta
tcagatgcaggtacagagcttagtattagattaccaatggaatcattaccaatgttttca
caatattttaaacatttagaagattgtaaaaatcaacttttaattgatagttatggtatt
tcaatttcgacattggaagaggtattcttaaagattggtcaagaaacattaaaatcaaca
ccaaatttcaatgatccagcagtaaaagaagcattatcaaccaaaagtagtggagttaaa
gttggtcaacaattaaaaggtttattaataaaacgtatttgtacaactaaaaaagatttt
aaatcatttatgttttcaatagttgtaccattgatcatattggctttgggattggttatg
tataaaaatatgagaactattgaaacatttaatgatgttacaacaccattaacattttca
attgatgattatggtgataatatttatgttccatggtcaatttctggtcaaaatcaagct
attgatttaagaattaaaaattcaattggtaaatcaaatcattcaaaattattaccagct
gatgagctagaagattatttaacattaaattatgaaggtaatccaggtgcatttgcattt
ggtaaaaccattatagaagatattgaaatgttaagttttaaagtttattataatagagat
tatttacatgcacttccaatttatataaatttcgttgataatttaatgcttagtaattta
ggtggagttggtattcaaactacatcaagaccatttcaacatattaaaagtaaatttgaa
ttagcaactgaaaaaattaattttagtgcaattattttctttataattttaacattggcc
gcttttgctttggttgttgcatcacatgctggtaatatcgctcaagaaagagctgcacgt
attaaacgtttactttatatatcaggtttaaaaaaatatgtttattggttatcaaattta
atttgggattatgttttaacctttataatggtgattttccttgcagttgtagttgtaatt
attgattcaaaatttagaaaccaattcccattattcatttgtgctttggttttattcgtt
actgcaattatacctctaagttatttattttcttattgttggagttcacatggtaaagca
actggttttatatttggtattcattttggtattggtttattaatgacagttacatgtttt
attcttagaatttgggtaattaaagatgataatgatattttacaaacaataacagatatt
atcgatttagtattctttttcttttcaccattttattgtttctcaaaagtgatggtaatt
atttcaaatttcccaggtacaactagattgggtgaatcttatattgcaaattattggggt
attaaatttggtttaccaccagtttgcttcctcgcacttcatacattggtttggacaatt
tggattatggtattagattattatccagaattacgtggtaaatatagaaaaggtagaaat
gaaaaatcatcaccaccacctccatcagatgaagattcagatgtgtctcatgaaagatca
aaagttttatcatttgaaacttcaaatgatccaattataatgcgtgatttctttaaactt
tataaaggaaaaggtaaagcaaaagataatcttgcagtttataatacatcattatcaatt
ccaaaaggtcaaacatttggccttttaggtttaaatggtgctggtaaatcaaccacactt
ggttgtcttagtggtgaagttataccttctggtggtgaaatttttgtaaatggtttcaat
attcaaactcaaagattagatgctcttcgtagtgttggtttttgtcatcaatataatagt
ttaattggtttattaagtgctcgtgaacaaattagactttattgtagaattaaaggtatt
gaagagagtaaaatccaagaaacagtggaagcttttataaaaatgatggatctaggatca
attggtaattcaaatgtcgctggttattcaggtggtaataaaagaaaagttgctctaagt
gttgcaatcgttggtaatccatcagtttgctttttggatgaagttagtgctggtgttgat
ccagttgttgcaagattcatgtggaatgttatcactgagttgaaaaaagataaagttatc
attttaactacacactcaatgttggaatgttcagcagtatgtgatagattaactataatg
aaatcaggtaaaatgatgtgtcttggttcaattcaacatattaaagataaatttggttca
ggttattcaatcgatgttaaatttaaaaaagaatatcttttatctggtataaatttattc
caaaaagaattaccaaatgcaaaattagttgatcatcatgatttatccgcaagttttgaa
ttaccaaattctttagattcaccaattcaattatcaaaaatattttcaattattgaaaga
aatttaaaaccaattttaaatgattattctgttggtcaaacttcaattgatcatatattt
ttaaaattaacaaatttaaatcaacaaaaaattaaaaatcaacaaaaagaatcaattgaa
aatcatataattgatattaataataataataataataataataataatagttatttaaag
aatcataaaaaaactacaagtaacaatagtatattaaccaataatagtacaactaaaaat
tttggttcttcaaactttttagatcttgaatcagataatacatatttaaataatttaaaa
tatttagaagatgatgattttaacattgaaatgccaccataccaaaattcacttaaaaaa
tcattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
